EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000013685 (Gene tree)
Gene ID: 113024141
Gene Symbol: polr1e
Alias: zgc:112501
Full Name: RNA polymerase I subunit E
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4865 bases
Position: chr6:19439535-19444399
Accession: 113024141
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000020142	RNA_pol_I_A49	PF06870.12	3.4e-115	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000020604	-	2193	-	ENSACLP00000020142	420 (aa)	XP_026026690	UPI000E414BCC

Gene Model

Click here to download ENSACLG00000013685's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACLG00000013685's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000013685	polr1e	99	44.524	ENSG00000137054	POLR1E	99	44.524	Homo_sapiens
ENSACLG00000013685	polr1e	99	73.077	ENSAPOG00000012452	polr1e	100	73.077	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000013685	polr1e	99	39.958	ENSAMEG00000010193	POLR1E	97	39.958	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000013685	polr1e	94	83.715	ENSACIG00000009884	polr1e	99	83.715	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000013685	polr1e	99	80.048	ENSAOCG00000005665	polr1e	100	80.048	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000013685	polr1e	99	80.529	ENSAPEG00000020581	polr1e	100	80.529	Amphiprion_percula
ENSACLG00000013685	polr1e	99	77.885	ENSATEG00000020609	polr1e	100	77.885	Anabas_testudineus
ENSACLG00000013685	polr1e	80	40.000	ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	40.000	Anas_platyrhynchos
ENSACLG00000013685	polr1e	99	44.418	ENSANAG00000038046	POLR1E	99	44.418	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000013685	polr1e	99	57.108	ENSAMXG00000018181	polr1e	99	57.108	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000013685	polr1e	99	44.418	ENSBTAG00000012243	POLR1E	99	44.418	Bos_taurus
ENSACLG00000013685	polr1e	93	42.857	ENSCJAG00000010512	POLR1E	94	45.646	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000013685	polr1e	99	43.529	ENSCAFG00000002377	POLR1E	99	43.529	Canis_familiaris
ENSACLG00000013685	polr1e	99	43.294	ENSCAFG00020017851	POLR1E	99	43.294	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000013685	polr1e	98	44.928	ENSCHIG00000019479	POLR1E	98	44.928	Capra_hircus
ENSACLG00000013685	polr1e	99	44.706	ENSTSYG00000002075	POLR1E	99	44.706	Carlito_syrichta
ENSACLG00000013685	polr1e	69	42.761	ENSCAPG00000015653	POLR1E	99	42.761	Cavia_aperea
ENSACLG00000013685	polr1e	99	44.860	ENSCPOG00000009965	POLR1E	100	44.860	Cavia_porcellus
ENSACLG00000013685	polr1e	99	40.573	ENSCCAG00000029460	POLR1E	99	40.573	Cebus_capucinus
ENSACLG00000013685	polr1e	99	44.762	ENSCATG00000031732	POLR1E	99	44.762	Cercocebus_atys
ENSACLG00000013685	polr1e	87	46.448	ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	46.448	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000013685	polr1e	99	44.762	ENSCSAG00000010782	POLR1E	99	44.762	Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000013685	polr1e	94	37.437	ENSCHOG00000013024	POLR1E	83	37.437	Choloepus_hoffmanni
ENSACLG00000013685	polr1e	99	46.635	ENSCPBG00000006923	POLR1E	99	46.635	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000013685	polr1e	99	45.238	ENSCANG00000036112	POLR1E	99	45.238	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000013685	polr1e	100	42.891	ENSCGRG00001006197	Polr1e	97	42.891	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000013685	polr1e	100	42.654	ENSCGRG00000006430	Polr1e	97	42.654	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACLG00000013685	polr1e	99	68.434	ENSCSEG00000005121	polr1e	99	68.434	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000013685	polr1e	99	76.442	ENSCVAG00000019759	polr1e	100	76.442	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000013685	polr1e	96	57.778	ENSDARG00000006434	polr1e	100	57.794	Danio_rerio
ENSACLG00000013685	polr1e	99	40.211	ENSDNOG00000010257	POLR1E	99	39.789	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000013685	polr1e	84	42.061	ENSETEG00000018204	POLR1E	99	42.340	Echinops_telfairi
ENSACLG00000013685	polr1e	99	43.943	ENSEASG00005000675	POLR1E	99	43.943	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000013685	polr1e	99	43.943	ENSECAG00000014669	POLR1E	99	43.943	Equus_caballus
ENSACLG00000013685	polr1e	99	38.702	ENSEEUG00000011928	POLR1E	86	38.702	Erinaceus_europaeus
ENSACLG00000013685	polr1e	99	66.348	ENSELUG00000008150	polr1e	99	66.348	Esox_lucius
ENSACLG00000013685	polr1e	99	43.705	ENSFCAG00000013081	POLR1E	99	43.705	Felis_catus
ENSACLG00000013685	polr1e	94	45.250	ENSFALG00000012950	POLR1E	99	45.250	Ficedula_albicollis
ENSACLG00000013685	polr1e	99	46.047	ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	46.047	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000013685	polr1e	99	75.060	ENSFHEG00000009801	polr1e	100	75.060	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000013685	polr1e	98	55.000	ENSGMOG00000003336	POLR1E	99	55.000	Gadus_morhua
ENSACLG00000013685	polr1e	99	45.238	ENSGALG00000005395	POLR1E	99	45.238	Gallus_gallus
ENSACLG00000013685	polr1e	99	72.596	ENSGAFG00000004850	polr1e	100	72.596	Gambusia_affinis
ENSACLG00000013685	polr1e	99	70.406	ENSGACG00000016087	polr1e	100	70.406	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000013685	polr1e	96	43.032	ENSGAGG00000001659	POLR1E	99	42.721	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000013685	polr1e	99	44.762	ENSGGOG00000001882	POLR1E	99	45.865	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000013685	polr1e	100	99.286	ENSHBUG00000002559	polr1e	100	99.286	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000013685	polr1e	99	44.965	ENSHGLG00000002036	POLR1E	100	44.965	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000013685	polr1e	99	45.199	ENSHGLG00100012784	POLR1E	100	45.199	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000013685	polr1e	99	70.673	ENSHCOG00000002774	polr1e	100	70.673	Hippocampus_comes
ENSACLG00000013685	polr1e	99	56.250	ENSIPUG00000003019	polr1e	99	56.250	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000013685	polr1e	99	44.019	ENSSTOG00000009810	POLR1E	99	44.019	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACLG00000013685	polr1e	97	44.282	ENSJJAG00000020731	Polr1e	94	44.282	Jaculus_jaculus
ENSACLG00000013685	polr1e	99	76.683	ENSKMAG00000000046	polr1e	100	76.683	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000013685	polr1e	99	77.088	ENSLBEG00000003104	polr1e	99	77.088	Labrus_bergylta
ENSACLG00000013685	polr1e	85	51.099	ENSLACG00000003416	POLR1E	99	51.099	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000013685	polr1e	99	54.157	ENSLOCG00000012859	polr1e	99	54.157	Lepisosteus_oculatus
ENSACLG00000013685	polr1e	99	44.366	ENSLAFG00000012831	POLR1E	99	44.366	Loxodonta_africana
ENSACLG00000013685	polr1e	99	44.762	ENSMFAG00000045465	POLR1E	99	44.361	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000013685	polr1e	99	44.762	ENSMMUG00000017892	POLR1E	99	44.762	Macaca_mulatta
ENSACLG00000013685	polr1e	99	41.395	ENSMNEG00000040283	POLR1E	99	41.395	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000013685	polr1e	99	44.762	ENSMLEG00000031135	POLR1E	99	44.762	Mandrillus_leucophaeus
ENSACLG00000013685	polr1e	99	76.134	ENSMAMG00000001260	polr1e	99	76.134	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000013685	polr1e	100	99.524	ENSMZEG00005021536	polr1e	100	99.524	Maylandia_zebra
ENSACLG00000013685	polr1e	99	43.468	ENSMAUG00000021044	Polr1e	96	43.468	Mesocricetus_auratus
ENSACLG00000013685	polr1e	99	44.706	ENSMICG00000003673	POLR1E	99	44.706	Microcebus_murinus
ENSACLG00000013685	polr1e	100	42.417	ENSMOCG00000012920	Polr1e	97	42.417	Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000013685	polr1e	99	74.820	ENSMMOG00000007391	polr1e	100	74.820	Mola_mola
ENSACLG00000013685	polr1e	90	46.825	ENSMODG00000002884	POLR1E	92	46.825	Monodelphis_domestica
ENSACLG00000013685	polr1e	100	76.667	ENSMALG00000002665	polr1e	100	76.667	Monopterus_albus
ENSACLG00000013685	polr1e	98	42.029	MGP_CAROLIEiJ_G0025967	Polr1e	98	41.960	Mus_caroli
ENSACLG00000013685	polr1e	98	43.301	ENSMUSG00000028318	Polr1e	97	43.284	Mus_musculus
ENSACLG00000013685	polr1e	98	44.096	MGP_PahariEiJ_G0024114	Polr1e	98	44.110	Mus_pahari
ENSACLG00000013685	polr1e	98	43.780	MGP_SPRETEiJ_G0026930	Polr1e	98	43.781	Mus_spretus
ENSACLG00000013685	polr1e	99	39.158	ENSMPUG00000006040	POLR1E	99	37.263	Mustela_putorius_furo
ENSACLG00000013685	polr1e	99	44.656	ENSMLUG00000012688	POLR1E	96	44.656	Myotis_lucifugus
ENSACLG00000013685	polr1e	97	45.255	ENSNGAG00000002520	Polr1e	94	45.255	Nannospalax_galili
ENSACLG00000013685	polr1e	100	99.048	ENSNBRG00000016822	polr1e	100	99.048	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000013685	polr1e	99	44.762	ENSNLEG00000003616	POLR1E	99	45.113	Nomascus_leucogenys
ENSACLG00000013685	polr1e	73	49.778	ENSMEUG00000015372	-	80	49.778	Notamacropus_eugenii
ENSACLG00000013685	polr1e	85	39.011	ENSOPRG00000014206	POLR1E	99	39.011	Ochotona_princeps
ENSACLG00000013685	polr1e	97	46.324	ENSODEG00000014565	POLR1E	94	46.324	Octodon_degus
ENSACLG00000013685	polr1e	100	98.571	ENSONIG00000008921	polr1e	100	98.571	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000013685	polr1e	99	43.529	ENSOCUG00000024773	POLR1E	99	43.765	Oryctolagus_cuniculus
ENSACLG00000013685	polr1e	99	73.798	ENSORLG00000005143	polr1e	100	73.798	Oryzias_latipes
ENSACLG00000013685	polr1e	92	72.021	ENSORLG00020007271	polr1e	99	72.021	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000013685	polr1e	99	73.798	ENSORLG00015000137	polr1e	100	73.798	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000013685	polr1e	99	71.122	ENSOMEG00000013264	polr1e	99	71.122	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000013685	polr1e	99	43.468	ENSOGAG00000012981	POLR1E	97	43.468	Otolemur_garnettii
ENSACLG00000013685	polr1e	98	45.169	ENSOARG00000011465	POLR1E	95	45.169	Ovis_aries
ENSACLG00000013685	polr1e	99	44.524	ENSPPAG00000034566	POLR1E	99	45.113	Pan_paniscus
ENSACLG00000013685	polr1e	99	44.524	ENSPPRG00000005649	POLR1E	99	44.524	Panthera_pardus
ENSACLG00000013685	polr1e	99	44.524	ENSPTIG00000009774	POLR1E	99	44.524	Panthera_tigris_altaica
ENSACLG00000013685	polr1e	99	44.524	ENSPTRG00000020944	POLR1E	99	45.113	Pan_troglodytes
ENSACLG00000013685	polr1e	99	44.762	ENSPANG00000025563	POLR1E	99	44.762	Papio_anubis
ENSACLG00000013685	polr1e	99	58.195	ENSPKIG00000003562	polr1e	99	58.195	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000013685	polr1e	97	44.010	ENSPSIG00000003274	POLR1E	95	44.743	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000013685	polr1e	94	66.667	ENSPMGG00000024169	polr1e	96	66.667	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000013685	polr1e	99	37.470	ENSPEMG00000022300	-	96	37.470	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACLG00000013685	polr1e	99	44.181	ENSPEMG00000019151	-	96	44.181	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACLG00000013685	polr1e	95	46.914	ENSPCIG00000014798	POLR1E	98	46.914	Phascolarctos_cinereus
ENSACLG00000013685	polr1e	99	69.820	ENSPFOG00000019627	polr1e	99	69.820	Poecilia_formosa
ENSACLG00000013685	polr1e	99	73.798	ENSPLAG00000022679	polr1e	100	73.798	Poecilia_latipinna
ENSACLG00000013685	polr1e	86	75.278	ENSPMEG00000022123	polr1e	93	75.278	Poecilia_mexicana
ENSACLG00000013685	polr1e	99	72.837	ENSPREG00000009470	polr1e	100	72.837	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000013685	polr1e	99	44.524	ENSPPYG00000019061	POLR1E	99	44.524	Pongo_abelii
ENSACLG00000013685	polr1e	52	38.565	ENSPCAG00000004891	POLR1E	72	38.565	Procavia_capensis
ENSACLG00000013685	polr1e	99	45.000	ENSPCOG00000027448	POLR1E	99	45.000	Propithecus_coquereli
ENSACLG00000013685	polr1e	95	43.392	ENSPVAG00000007940	POLR1E	84	43.392	Pteropus_vampyrus
ENSACLG00000013685	polr1e	100	99.524	ENSPNYG00000001032	polr1e	100	99.524	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000013685	polr1e	99	57.452	ENSPNAG00000006987	polr1e	99	57.452	Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000013685	polr1e	99	42.959	ENSRNOG00000012664	Polr1e	95	43.237	Rattus_norvegicus
ENSACLG00000013685	polr1e	98	44.819	ENSRBIG00000034214	POLR1E	99	46.316	Rhinopithecus_bieti
ENSACLG00000013685	polr1e	99	44.762	ENSRROG00000031986	POLR1E	99	44.762	Rhinopithecus_roxellana
ENSACLG00000013685	polr1e	96	44.634	ENSSBOG00000021415	POLR1E	97	44.634	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACLG00000013685	polr1e	82	47.126	ENSSHAG00000016084	POLR1E	95	47.126	Sarcophilus_harrisii
ENSACLG00000013685	polr1e	99	60.671	ENSSFOG00015002293	polr1e	99	60.671	Scleropages_formosus
ENSACLG00000013685	polr1e	99	77.088	ENSSMAG00000011672	polr1e	94	77.088	Scophthalmus_maximus
ENSACLG00000013685	polr1e	100	78.571	ENSSDUG00000022279	polr1e	100	78.571	Seriola_dumerili
ENSACLG00000013685	polr1e	100	77.857	ENSSLDG00000024918	polr1e	100	77.857	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000013685	polr1e	55	40.948	ENSSARG00000009810	-	58	40.948	Sorex_araneus
ENSACLG00000013685	polr1e	99	43.437	ENSSPUG00000009499	POLR1E	100	43.437	Sphenodon_punctatus
ENSACLG00000013685	polr1e	99	80.048	ENSSPAG00000021240	polr1e	100	80.048	Stegastes_partitus
ENSACLG00000013685	polr1e	99	43.059	ENSSSCG00000005347	POLR1E	99	43.059	Sus_scrofa
ENSACLG00000013685	polr1e	94	38.565	ENSTGUG00000007169	POLR1E	100	38.565	Taeniopygia_guttata
ENSACLG00000013685	polr1e	99	70.574	ENSTRUG00000020779	polr1e	99	70.574	Takifugu_rubripes
ENSACLG00000013685	polr1e	99	71.394	ENSTNIG00000017812	polr1e	99	71.394	Tetraodon_nigroviridis
ENSACLG00000013685	polr1e	94	44.836	ENSTBEG00000013786	POLR1E	84	44.750	Tupaia_belangeri
ENSACLG00000013685	polr1e	98	43.062	ENSTTRG00000008294	POLR1E	87	43.062	Tursiops_truncatus
ENSACLG00000013685	polr1e	99	44.444	ENSUAMG00000012474	POLR1E	100	46.757	Ursus_americanus
ENSACLG00000013685	polr1e	99	44.444	ENSUMAG00000011496	POLR1E	99	44.444	Ursus_maritimus
ENSACLG00000013685	polr1e	81	41.691	ENSVPAG00000009048	POLR1E	81	41.691	Vicugna_pacos
ENSACLG00000013685	polr1e	99	43.059	ENSVVUG00000019954	POLR1E	99	43.059	Vulpes_vulpes
ENSACLG00000013685	polr1e	99	42.417	ENSXETG00000006533	polr1e	99	42.417	Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000013685	polr1e	99	69.952	ENSXCOG00000013706	polr1e	100	69.952	Xiphophorus_couchianus
ENSACLG00000013685	polr1e	99	74.760	ENSXMAG00000012484	polr1e	100	74.760	Xiphophorus_maculatus