EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000014234 (Gene tree)
Gene ID: 113027193
Gene Symbol: cnot1
Alias: cdc39-like|im:7141761|kiaa1007l|wu:fc58h04|zgc:152902
Full Name: CCR4-NOT transcription complex%2C subunit 1
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 28523 bases
Position: chr7:67512772-67541294
Accession: ZDB-GENE-040915-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000021248	Not1	PF04054.15	4.6e-153	1	1
ENSACLP00000021173	Not1	PF04054.15	4.6e-153	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000021739	-	6930	-	ENSACLP00000021248	2309 (aa)	-	-
ENSACLT00000021662	-	7206	-	ENSACLP00000021173	2335 (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.055	ENSG00000125107	CNOT1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSACLG00000014234	cnot1	100	96.762	ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.762	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.055	ENSAMEG00000017298	CNOT1	97	97.055	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000014234	cnot1	90	98.177	ENSACIG00000016003	cnot1	97	98.177	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000014234	cnot1	100	94.031	ENSAPEG00000022342	cnot1	100	94.031	Amphiprion_percula
ENSACLG00000014234	cnot1	100	96.936	ENSATEG00000012892	cnot1	100	96.936	Anabas_testudineus
ENSACLG00000014234	cnot1	100	96.078	ENSAPLG00000007162	CNOT1	97	97.059	Anas_platyrhynchos
ENSACLG00000014234	cnot1	91	87.465	ENSACAG00000001602	CNOT1	98	87.315	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000014234	cnot1	100	87.845	ENSANAG00000038198	CNOT1	100	86.119	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000014234	cnot1	100	94.231	ENSAMXG00000013170	cnot1	100	94.530	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.055	ENSBTAG00000020782	CNOT1	100	96.407	Bos_taurus
ENSACLG00000014234	cnot1	76	44.202	WBGene00002845	let-711	92	54.008	Caenorhabditis_elegans
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.055	ENSCJAG00000011318	CNOT1	97	97.055	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000014234	cnot1	100	96.100	ENSCAFG00000008426	CNOT1	97	96.100	Canis_familiaris
ENSACLG00000014234	cnot1	100	94.825	ENSCAFG00020010156	CNOT1	100	93.241	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.055	ENSCHIG00000010452	CNOT1	97	97.055	Capra_hircus
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.055	ENSTSYG00000006888	CNOT1	97	97.055	Carlito_syrichta
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.195	ENSCPOG00000013026	CNOT1	97	97.195	Cavia_porcellus
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.055	ENSCCAG00000026333	CNOT1	97	97.055	Cebus_capucinus
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.055	ENSCATG00000032625	CNOT1	97	97.055	Cercocebus_atys
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.195	ENSCLAG00000006289	CNOT1	97	97.195	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.055	ENSCSAG00000004731	CNOT1	97	97.055	Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000014234	cnot1	81	97.727	ENSCHOG00000009712	CNOT1	82	97.527	Choloepus_hoffmanni
ENSACLG00000014234	cnot1	98	96.914	ENSCPBG00000026222	CNOT1	98	95.842	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000014234	cnot1	100	56.930	ENSCING00000009149	-	100	56.971	Ciona_intestinalis
ENSACLG00000014234	cnot1	89	77.019	ENSCSAVG00000002414	-	97	77.019	Ciona_savignyi
ENSACLG00000014234	cnot1	100	96.111	ENSCANG00000040534	CNOT1	97	96.111	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000014234	cnot1	100	96.914	ENSCGRG00001016365	Cnot1	97	96.914	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000014234	cnot1	100	96.914	ENSCGRG00000001714	Cnot1	97	96.914	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACLG00000014234	cnot1	97	99.158	ENSCVAG00000018930	cnot1	100	99.158	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000014234	cnot1	100	92.024	ENSDARG00000004174	cnot1	100	91.688	Danio_rerio
ENSACLG00000014234	cnot1	100	94.258	ENSDNOG00000013250	CNOT1	97	94.258	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000014234	cnot1	99	46.099	FBgn0085436	Not1	99	47.611	Drosophila_melanogaster
ENSACLG00000014234	cnot1	86	94.880	ENSETEG00000012806	CNOT1	84	94.880	Echinops_telfairi
ENSACLG00000014234	cnot1	83	76.042	ENSEBUG00000011534	cnot1	95	76.042	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.055	ENSEASG00005005819	CNOT1	100	96.407	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.055	ENSECAG00000009889	CNOT1	97	97.055	Equus_caballus
ENSACLG00000014234	cnot1	87	98.667	ENSEEUG00000006015	CNOT1	85	98.667	Erinaceus_europaeus
ENSACLG00000014234	cnot1	100	96.866	ENSELUG00000014085	cnot1	97	96.866	Esox_lucius
ENSACLG00000014234	cnot1	100	96.111	ENSFCAG00000025155	CNOT1	97	97.055	Felis_catus
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.055	ENSFALG00000007285	CNOT1	97	97.055	Ficedula_albicollis
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.195	ENSFDAG00000013399	CNOT1	97	97.195	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000014234	cnot1	100	93.417	ENSFHEG00000020574	cnot1	100	93.375	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000014234	cnot1	90	99.385	ENSGMOG00000012864	cnot1	99	99.385	Gadus_morhua
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.055	ENSGALG00000002301	CNOT1	97	97.055	Gallus_gallus
ENSACLG00000014234	cnot1	100	99.018	ENSGAFG00000015005	cnot1	97	99.018	Gambusia_affinis
ENSACLG00000014234	cnot1	90	94.112	ENSGACG00000002606	cnot1	100	99.394	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000014234	cnot1	100	96.914	ENSGAGG00000022646	CNOT1	97	96.914	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.055	ENSGGOG00000009547	CNOT1	97	97.055	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000014234	cnot1	100	99.914	ENSHBUG00000001729	cnot1	100	99.914	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.195	ENSHGLG00000014322	CNOT1	97	97.195	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000014234	cnot1	100	93.210	ENSHCOG00000006501	cnot1	100	93.210	Hippocampus_comes
ENSACLG00000014234	cnot1	100	90.478	ENSIPUG00000011915	cnot1	100	90.478	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.195	ENSSTOG00000005490	CNOT1	97	97.195	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACLG00000014234	cnot1	100	96.494	ENSJJAG00000000633	Cnot1	97	96.494	Jaculus_jaculus
ENSACLG00000014234	cnot1	100	94.083	ENSKMAG00000006149	cnot1	100	94.335	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000014234	cnot1	95	98.802	ENSLBEG00000004740	cnot1	100	98.802	Labrus_bergylta
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.055	ENSLACG00000010869	CNOT1	99	97.055	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000014234	cnot1	100	99.439	ENSLOCG00000006324	cnot1	97	99.439	Lepisosteus_oculatus
ENSACLG00000014234	cnot1	100	96.914	ENSLAFG00000000098	CNOT1	97	96.914	Loxodonta_africana
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.055	ENSMFAG00000035888	CNOT1	97	97.055	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.055	ENSMMUG00000014625	CNOT1	97	97.055	Macaca_mulatta
ENSACLG00000014234	cnot1	100	96.111	ENSMNEG00000031820	CNOT1	97	97.055	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000014234	cnot1	100	92.500	ENSMLEG00000040933	CNOT1	97	92.500	Mandrillus_leucophaeus
ENSACLG00000014234	cnot1	100	92.055	ENSMAMG00000016524	cnot1	100	92.224	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000014234	cnot1	100	98.138	ENSMZEG00005016210	cnot1	100	98.138	Maylandia_zebra
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.055	ENSMGAG00000001908	CNOT1	97	97.055	Meleagris_gallopavo
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.055	ENSMICG00000007071	CNOT1	97	97.055	Microcebus_murinus
ENSACLG00000014234	cnot1	100	96.914	ENSMOCG00000017969	Cnot1	97	96.914	Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000014234	cnot1	100	95.509	ENSMMOG00000019134	cnot1	100	95.509	Mola_mola
ENSACLG00000014234	cnot1	100	96.078	ENSMODG00000014199	CNOT1	97	97.059	Monodelphis_domestica
ENSACLG00000014234	cnot1	100	92.812	ENSMALG00000008645	cnot1	100	92.812	Monopterus_albus
ENSACLG00000014234	cnot1	98	96.190	MGP_CAROLIEiJ_G0031430	Cnot1	92	96.190	Mus_caroli
ENSACLG00000014234	cnot1	100	96.914	ENSMUSG00000036550	Cnot1	97	96.914	Mus_musculus
ENSACLG00000014234	cnot1	100	96.914	MGP_PahariEiJ_G0023028	Cnot1	97	96.914	Mus_pahari
ENSACLG00000014234	cnot1	100	96.914	MGP_SPRETEiJ_G0032549	Cnot1	97	96.914	Mus_spretus
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.055	ENSMPUG00000004830	CNOT1	97	97.055	Mustela_putorius_furo
ENSACLG00000014234	cnot1	100	96.914	ENSMLUG00000003728	CNOT1	97	96.914	Myotis_lucifugus
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.055	ENSNGAG00000018628	Cnot1	97	97.055	Nannospalax_galili
ENSACLG00000014234	cnot1	97	96.439	ENSNBRG00000019358	cnot1	100	96.439	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.055	ENSNLEG00000003566	CNOT1	97	97.055	Nomascus_leucogenys
ENSACLG00000014234	cnot1	87	91.121	ENSMEUG00000006145	CNOT1	88	90.972	Notamacropus_eugenii
ENSACLG00000014234	cnot1	85	97.778	ENSOPRG00000005604	CNOT1	84	97.778	Ochotona_princeps
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.195	ENSODEG00000016337	CNOT1	97	97.195	Octodon_degus
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.685	ENSONIG00000007358	cnot1	100	97.685	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000014234	cnot1	90	96.107	ENSOANG00000012109	CNOT1	97	96.774	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.055	ENSOCUG00000006911	CNOT1	97	97.055	Oryctolagus_cuniculus
ENSACLG00000014234	cnot1	100	93.627	ENSORLG00000013734	cnot1	100	93.543	Oryzias_latipes
ENSACLG00000014234	cnot1	100	91.894	ENSORLG00020017012	cnot1	100	91.810	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000014234	cnot1	100	91.768	ENSORLG00015007091	cnot1	100	91.684	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000014234	cnot1	100	90.871	ENSOMEG00000015124	cnot1	100	91.237	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.055	ENSOGAG00000000543	CNOT1	97	97.055	Otolemur_garnettii
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.055	ENSOARG00000001567	CNOT1	97	97.055	Ovis_aries
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.055	ENSPPAG00000022013	CNOT1	97	97.055	Pan_paniscus
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.055	ENSPPRG00000004867	CNOT1	97	97.055	Panthera_pardus
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.055	ENSPTIG00000012589	CNOT1	97	97.055	Panthera_tigris_altaica
ENSACLG00000014234	cnot1	100	96.111	ENSPTRG00000008183	CNOT1	97	96.111	Pan_troglodytes
ENSACLG00000014234	cnot1	100	85.762	ENSPANG00000020901	CNOT1	100	86.247	Papio_anubis
ENSACLG00000014234	cnot1	99	88.385	ENSPKIG00000002914	CNOT1	99	88.543	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000014234	cnot1	100	98.457	ENSPKIG00000023538	CNOT1	97	98.457	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.055	ENSPSIG00000005499	CNOT1	97	97.055	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000014234	cnot1	100	77.968	ENSPMAG00000009381	cnot1	100	78.075	Petromyzon_marinus
ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.195	ENSPCIG00000007343	CNOT1	100	96.607	Phascolarctos_cinereus
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ENSACLG00000014234	cnot1	100	96.111	ENSPCOG00000027139	CNOT1	97	96.111	Propithecus_coquereli
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