EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000014365 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 65237 bases
Position: chr9:28642179-28707415
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSACLP00000021127	zf-C2H2	PF00096.26	7.9e-44	3	9
ENSACLP00000021127	zf-C2H2	PF00096.26	7.9e-44	4	9
ENSACLP00000021127	zf-C2H2	PF00096.26	7.9e-44	5	9
ENSACLP00000021127	zf-C2H2	PF00096.26	7.9e-44	6	9
ENSACLP00000021127	zf-C2H2	PF00096.26	7.9e-44	7	9
ENSACLP00000021127	zf-C2H2	PF00096.26	7.9e-44	8	9
ENSACLP00000021127	zf-C2H2	PF00096.26	7.9e-44	9	9
ENSACLP00000021151	zf-C2H2	PF00096.26	4.6e-18	1	4
ENSACLP00000021151	zf-C2H2	PF00096.26	4.6e-18	2	4
ENSACLP00000021151	zf-C2H2	PF00096.26	4.6e-18	3	4
ENSACLP00000021151	zf-C2H2	PF00096.26	4.6e-18	4	4
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ENSACLP00000021127	zf-met	PF12874.7	5.1e-11	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
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Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000014365	-	99	42.636	ENSACLG00000019318	-	97	42.636
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ENSACLG00000014365	-	91	42.661	ENSACLG00000017939	-	96	46.154
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ENSACLG00000014365	-	99	40.741	ENSACLG00000022505	-	90	41.341
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ENSACLG00000014365	-	99	48.254	ENSACLG00000028002	-	91	58.824
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ENSACLG00000014365	-	98	35.789	ENSACLG00000006702	-	78	40.310
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ENSACLG00000014365	-	90	41.549	ENSTGUG00000018254	-	99	43.220	Taeniopygia_guttata
ENSACLG00000014365	-	98	38.012	ENSTRUG00000023491	-	77	38.012	Takifugu_rubripes
ENSACLG00000014365	-	97	40.323	ENSTNIG00000002344	-	100	47.788	Tetraodon_nigroviridis
ENSACLG00000014365	-	90	42.763	ENSXCOG00000013306	-	60	42.763	Xiphophorus_couchianus
ENSACLG00000014365	-	95	39.815	ENSXCOG00000020769	-	96	37.000	Xiphophorus_couchianus
ENSACLG00000014365	-	97	38.043	ENSXCOG00000011372	-	76	38.043	Xiphophorus_couchianus
ENSACLG00000014365	-	97	48.235	ENSXCOG00000012064	-	56	48.235	Xiphophorus_couchianus
ENSACLG00000014365	-	91	36.806	ENSXMAG00000024378	-	69	36.806	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000014365	-	97	49.558	ENSXMAG00000024973	-	74	42.291	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000014365	-	90	38.798	ENSXMAG00000025174	-	51	38.798	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000014365	-	81	41.135	ENSXMAG00000022894	-	51	41.135	Xiphophorus_maculatus