EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000014413 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2031 bases
Position: chr18:25895176-25897206
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000021178	RVT_1	PF00078.27	1.2e-40	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000021667	-	2031	-	ENSACLP00000021178	676 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000014413	-	77	49.520	ENSACLG00000022853	-	97	49.520
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ENSACLG00000014413	-	51	56.395	ENSPREG00000009264	-	100	56.395	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000014413	-	82	49.640	ENSPNYG00000010678	-	99	49.640	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000014413	-	98	45.291	ENSPNYG00000008434	-	99	45.142	Pundamilia_nyererei
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ENSACLG00000014413	-	55	49.330	ENSPNYG00000008746	-	99	49.330	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000014413	-	77	43.833	ENSPNAG00000001796	-	99	43.833	Pygocentrus_nattereri
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ENSACLG00000014413	-	57	38.974	ENSSFOG00015008653	-	97	38.974	Scleropages_formosus
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ENSACLG00000014413	-	99	46.481	ENSXMAG00000021735	-	60	46.481	Xiphophorus_maculatus