EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000014600 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 68580 bases
Position: chr9:28935527-29004106
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000021464	zf-C2H2	PF00096.26	3.5e-67	1	10
ENSACLP00000021464	zf-C2H2	PF00096.26	3.5e-67	2	10
ENSACLP00000021464	zf-C2H2	PF00096.26	3.5e-67	3	10
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ENSACLP00000021464	zf-C2H2	PF00096.26	3.5e-67	7	10
ENSACLP00000021464	zf-C2H2	PF00096.26	3.5e-67	8	10
ENSACLP00000021464	zf-C2H2	PF00096.26	3.5e-67	9	10
ENSACLP00000021464	zf-C2H2	PF00096.26	3.5e-67	10	10
ENSACLP00000021507	zf-C2H2	PF00096.26	6.8e-31	1	5
ENSACLP00000021507	zf-C2H2	PF00096.26	6.8e-31	2	5
ENSACLP00000021507	zf-C2H2	PF00096.26	6.8e-31	3	5
ENSACLP00000021507	zf-C2H2	PF00096.26	6.8e-31	4	5
ENSACLP00000021507	zf-C2H2	PF00096.26	6.8e-31	5	5
ENSACLP00000021507	zf-met	PF12874.7	0.00028	1	2
ENSACLP00000021507	zf-met	PF12874.7	0.00028	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000022005	-	1131	-	ENSACLP00000021507	376 (aa)	-	-
ENSACLT00000021963	-	1890	-	ENSACLP00000021464	629 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000014600	-	90	46.243	ENSACLG00000011239	-	75	46.243
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ENSACLG00000014600	-	91	41.667	ENSACLG00000026538	-	83	41.667
ENSACLG00000014600	-	91	55.128	ENSACLG00000018716	-	82	55.128
ENSACLG00000014600	-	91	41.568	ENSACLG00000024308	-	99	42.051
ENSACLG00000014600	-	91	34.351	ENSACLG00000014349	znf341	52	34.351
ENSACLG00000014600	-	69	35.795	ENSACLG00000016841	-	76	35.359
ENSACLG00000014600	-	91	44.286	ENSACLG00000024459	-	89	42.424
ENSACLG00000014600	-	90	44.476	ENSACLG00000003546	-	69	47.246
ENSACLG00000014600	-	91	74.031	ENSACLG00000017449	-	59	74.031
ENSACLG00000014600	-	90	45.763	ENSACLG00000008624	-	82	42.105
ENSACLG00000014600	-	90	44.190	ENSACLG00000000411	-	91	48.148
ENSACLG00000014600	-	90	44.201	ENSACLG00000018701	-	79	46.939
ENSACLG00000014600	-	96	43.030	ENSACLG00000018700	-	99	43.030
ENSACLG00000014600	-	90	41.667	ENSACLG00000019094	-	79	35.526
ENSACLG00000014600	-	90	41.758	ENSACLG00000013935	-	87	42.188
ENSACLG00000014600	-	91	41.237	ENSACLG00000024670	-	72	41.237
ENSACLG00000014600	-	90	50.743	ENSACLG00000003332	-	99	52.273
ENSACLG00000014600	-	93	58.383	ENSACLG00000014336	-	97	66.975
ENSACLG00000014600	-	91	36.339	ENSACLG00000017941	-	64	42.537
ENSACLG00000014600	-	91	40.611	ENSACLG00000024491	-	82	40.380
ENSACLG00000014600	-	91	36.827	ENSACLG00000015989	-	92	34.715
ENSACLG00000014600	-	91	84.211	ENSACLG00000013531	-	92	84.211
ENSACLG00000014600	-	90	51.733	ENSACLG00000000537	-	98	51.359
ENSACLG00000014600	-	91	37.037	ENSACLG00000017487	-	78	42.188
ENSACLG00000014600	-	93	41.905	ENSACLG00000021343	-	99	38.197
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ENSACLG00000014600	-	92	54.310	ENSACLG00000017336	-	95	54.310
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ENSACLG00000014600	-	91	47.059	ENSSDUG00000009601	-	95	40.634	Seriola_dumerili
ENSACLG00000014600	-	93	40.751	ENSSLDG00000007756	-	94	42.857	Seriola_lalandi_dorsalis
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ENSACLG00000014600	-	92	37.130	ENSSLDG00000006288	-	99	37.130	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000014600	-	90	48.387	ENSSPAG00000008865	-	94	40.116	Stegastes_partitus
ENSACLG00000014600	-	91	41.319	ENSSSCG00000038009	-	94	41.319	Sus_scrofa
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ENSACLG00000014600	-	91	34.702	ENSXMAG00000000617	-	78	35.765	Xiphophorus_maculatus