EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000015324 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1167 bases
Position: chrLS419799.1:38426-39592
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000022561	RVT_1	PF00078.27	2.3e-46	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000023093	-	1167	-	ENSACLP00000022561	388 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000015324	-	100	46.835	ENSACLG00000017297	-	73	46.835
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ENSACLG00000015324	-	53	35.238	ENSACLG00000021775	-	52	35.238
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ENSACLG00000015324	-	86	34.234	ENSACLG00000009848	-	74	34.234
ENSACLG00000015324	-	52	50.000	ENSACLG00000007824	-	56	50.000
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ENSACLG00000015324	-	100	98.196	ENSACLG00000015507	-	71	98.196
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