EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000015446 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: rpl9
Alias: ab02c03|fa93a01|mg:ab02c03|wu:fa93a01|zgc:103730
Full Name: ribosomal protein L9
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8167 bases
Position: chr6:19902698-19910864
Accession: ZDB-GENE-030131-8646
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000022756	Ribosomal_L6	PF00347.23	1e-31	1	2
ENSACLP00000022756	Ribosomal_L6	PF00347.23	1e-31	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000023291	-	2182	-	ENSACLP00000022756	260 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000015446	rpl9	74	87.500	ENSG00000163682	RPL9	100	90.265	Homo_sapiens
ENSACLG00000015446	rpl9	75	94.845	ENSAPOG00000007833	rpl9	99	94.845	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000015446	rpl9	74	72.917	ENSAMEG00000003670	-	100	72.917	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000015446	rpl9	74	86.979	ENSAMEG00000003187	RPL9	100	86.979	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000015446	rpl9	74	63.021	ENSAMEG00000005164	-	100	63.021	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000015446	rpl9	74	97.396	ENSACIG00000010516	rpl9	100	97.396	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000015446	rpl9	74	94.271	ENSAOCG00000013751	rpl9	100	94.271	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000015446	rpl9	74	94.271	ENSAPEG00000019426	rpl9	100	94.271	Amphiprion_percula
ENSACLG00000015446	rpl9	74	94.792	ENSATEG00000019735	rpl9	100	94.792	Anabas_testudineus
ENSACLG00000015446	rpl9	67	88.571	ENSAPLG00000011712	RPL9	99	88.571	Anas_platyrhynchos
ENSACLG00000015446	rpl9	74	86.458	ENSACAG00000007317	RPL9	100	86.458	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000015446	rpl9	74	81.250	ENSANAG00000023940	-	100	81.250	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000015446	rpl9	74	87.500	ENSANAG00000027218	RPL9	100	87.500	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000015446	rpl9	72	72.581	ENSANAG00000028192	-	98	72.581	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000015446	rpl9	62	83.750	ENSANAG00000025368	-	90	83.544	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000015446	rpl9	62	82.716	ENSANAG00000036273	-	90	82.716	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000015446	rpl9	63	71.779	ENSANAG00000024659	-	99	71.779	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000015446	rpl9	73	90.576	ENSAMXG00000041237	rpl9	99	90.576	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000015446	rpl9	74	84.896	ENSBTAG00000045566	-	100	84.896	Bos_taurus
ENSACLG00000015446	rpl9	74	85.417	ENSBTAG00000045678	-	100	85.417	Bos_taurus
ENSACLG00000015446	rpl9	74	87.500	ENSBTAG00000014518	RPL9	100	87.500	Bos_taurus
ENSACLG00000015446	rpl9	74	85.417	ENSBTAG00000048225	-	100	85.417	Bos_taurus
ENSACLG00000015446	rpl9	74	85.938	ENSBTAG00000024608	-	100	85.938	Bos_taurus
ENSACLG00000015446	rpl9	74	86.979	ENSBTAG00000030281	-	100	86.979	Bos_taurus
ENSACLG00000015446	rpl9	72	60.638	WBGene00004420	rpl-9	98	60.638	Caenorhabditis_elegans
ENSACLG00000015446	rpl9	82	82.075	ENSCJAG00000000723	RPL9	100	87.500	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000015446	rpl9	64	83.832	ENSCJAG00000022754	-	92	83.832	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000015446	rpl9	74	78.646	ENSCAFG00000015886	-	100	78.646	Canis_familiaris
ENSACLG00000015446	rpl9	74	78.125	ENSCAFG00000000653	-	100	78.125	Canis_familiaris
ENSACLG00000015446	rpl9	74	87.500	ENSCAFG00000016008	RPL9	100	87.500	Canis_familiaris
ENSACLG00000015446	rpl9	74	87.500	ENSCAFG00020002170	RPL9	100	87.500	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000015446	rpl9	74	78.125	ENSCAFG00020002963	-	100	78.125	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000015446	rpl9	63	80.368	ENSCAFG00020013873	-	91	80.368	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000015446	rpl9	77	71.357	ENSCHIG00000008212	-	90	71.357	Capra_hircus
ENSACLG00000015446	rpl9	74	86.458	ENSCHIG00000011028	-	100	86.458	Capra_hircus
ENSACLG00000015446	rpl9	74	87.500	ENSCHIG00000011416	-	100	87.500	Capra_hircus
ENSACLG00000015446	rpl9	74	84.375	ENSCHIG00000009159	-	100	84.375	Capra_hircus
ENSACLG00000015446	rpl9	74	86.458	ENSCHIG00000010457	-	100	86.458	Capra_hircus
ENSACLG00000015446	rpl9	78	70.936	ENSTSYG00000027256	-	99	72.289	Carlito_syrichta
ENSACLG00000015446	rpl9	78	71.429	ENSTSYG00000035529	-	99	72.892	Carlito_syrichta
ENSACLG00000015446	rpl9	74	81.250	ENSTSYG00000036944	-	100	81.250	Carlito_syrichta
ENSACLG00000015446	rpl9	74	88.021	ENSTSYG00000033916	-	100	88.021	Carlito_syrichta
ENSACLG00000015446	rpl9	74	72.917	ENSTSYG00000025699	-	100	72.917	Carlito_syrichta
ENSACLG00000015446	rpl9	74	88.021	ENSCPOG00000004543	RPL9	100	88.021	Cavia_porcellus
ENSACLG00000015446	rpl9	74	75.000	ENSCCAG00000000333	RPL9	100	75.000	Cebus_capucinus
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ENSACLG00000015446	rpl9	74	71.875	ENSCCAG00000019338	-	100	71.875	Cebus_capucinus
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ENSACLG00000015446	rpl9	67	83.237	ENSCCAG00000019506	-	98	83.237	Cebus_capucinus
ENSACLG00000015446	rpl9	63	76.970	ENSCATG00000031517	-	100	76.970	Cercocebus_atys
ENSACLG00000015446	rpl9	74	74.479	ENSCATG00000034300	-	100	74.479	Cercocebus_atys
ENSACLG00000015446	rpl9	74	87.500	ENSCATG00000031890	RPL9	100	87.500	Cercocebus_atys
ENSACLG00000015446	rpl9	73	82.011	ENSCATG00000035764	-	100	82.011	Cercocebus_atys
ENSACLG00000015446	rpl9	75	76.020	ENSCATG00000034132	-	97	76.020	Cercocebus_atys
ENSACLG00000015446	rpl9	74	63.021	ENSCLAG00000015869	-	100	63.021	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000015446	rpl9	61	74.843	ENSCLAG00000009325	-	96	74.843	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000015446	rpl9	74	69.271	ENSCLAG00000000776	-	100	69.271	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000015446	rpl9	74	88.021	ENSCLAG00000001418	-	100	88.021	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000015446	rpl9	62	73.016	ENSCSAG00000016932	RPL9	98	73.016	Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000015446	rpl9	74	86.458	ENSCPBG00000013796	RPL9	100	86.458	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000015446	rpl9	73	68.063	ENSCING00000009310	-	99	68.063	Ciona_intestinalis
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ENSACLG00000015446	rpl9	74	73.438	ENSCGRG00000013050	-	100	73.438	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACLG00000015446	rpl9	73	93.684	ENSCSEG00000004845	rpl9	99	93.684	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000015446	rpl9	74	96.875	ENSCVAG00000007241	rpl9	100	96.875	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000015446	rpl9	73	93.717	ENSDARG00000037350	rpl9	99	93.717	Danio_rerio
ENSACLG00000015446	rpl9	75	86.082	ENSDNOG00000045361	-	97	86.082	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000015446	rpl9	66	59.770	ENSDNOG00000004245	-	91	59.770	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000015446	rpl9	72	60.317	ENSDNOG00000035065	-	100	63.584	Dasypus_novemcinctus
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ENSACLG00000015446	rpl9	77	85.427	ENSDNOG00000007411	-	99	85.427	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000015446	rpl9	74	87.500	ENSDORG00000001088	-	100	87.500	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000015446	rpl9	74	62.371	ENSDORG00000026634	-	100	62.371	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000015446	rpl9	74	60.406	ENSDORG00000028406	-	100	60.406	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000015446	rpl9	73	62.827	FBgn0015756	RpL9	99	62.827	Drosophila_melanogaster
ENSACLG00000015446	rpl9	74	85.492	ENSETEG00000019049	-	100	85.492	Echinops_telfairi
ENSACLG00000015446	rpl9	69	58.101	ENSETEG00000009761	-	97	58.101	Echinops_telfairi
ENSACLG00000015446	rpl9	71	64.674	ENSETEG00000019917	-	96	64.674	Echinops_telfairi
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ENSACLG00000015446	rpl9	73	52.880	ENSETEG00000002415	-	99	52.880	Echinops_telfairi
ENSACLG00000015446	rpl9	72	65.775	ENSEBUG00000007378	rpl9	98	65.775	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000015446	rpl9	74	87.500	ENSEASG00005008233	RPL9	100	87.500	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000015446	rpl9	74	87.500	ENSECAG00000016489	RPL9	100	87.500	Equus_caballus
ENSACLG00000015446	rpl9	60	87.261	ENSEEUG00000004394	RPL9	100	87.261	Erinaceus_europaeus
ENSACLG00000015446	rpl9	73	89.529	ENSELUG00000007202	rpl9	99	89.529	Esox_lucius
ENSACLG00000015446	rpl9	74	87.500	ENSFCAG00000012284	RPL9	100	87.500	Felis_catus
ENSACLG00000015446	rpl9	74	86.979	ENSFALG00000009256	RPL9	100	86.979	Ficedula_albicollis
ENSACLG00000015446	rpl9	74	60.714	ENSFDAG00000015251	-	100	60.714	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000015446	rpl9	74	69.792	ENSFDAG00000020084	-	100	69.792	Fukomys_damarensis
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ENSACLG00000015446	rpl9	74	96.354	ENSFHEG00000008785	rpl9	100	96.354	Fundulus_heteroclitus
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ENSACLG00000015446	rpl9	74	86.458	ENSGALG00000000150	RPL9	100	86.458	Gallus_gallus
ENSACLG00000015446	rpl9	74	94.271	ENSGAFG00000020607	rpl9	100	94.271	Gambusia_affinis
ENSACLG00000015446	rpl9	74	92.188	ENSGACG00000016153	rpl9	100	92.188	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000015446	rpl9	74	85.417	ENSGAGG00000011775	RPL9	100	85.417	Gopherus_agassizii
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ENSACLG00000015446	rpl9	81	93.810	ENSORLG00020006036	rpl9	98	93.651	Oryzias_latipes_hni
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