EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000015989 (Gene tree)
Gene ID: 113019438
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: zinc finger protein 883-like
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8946 bases
Position: chr3:37304575-37313520
Accession: 113019438
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000023513	zf-C2H2	PF00096.26	1.9e-46	1	7
ENSACLP00000023513	zf-C2H2	PF00096.26	1.9e-46	2	7
ENSACLP00000023513	zf-C2H2	PF00096.26	1.9e-46	3	7
ENSACLP00000023513	zf-C2H2	PF00096.26	1.9e-46	4	7
ENSACLP00000023513	zf-C2H2	PF00096.26	1.9e-46	5	7
ENSACLP00000023513	zf-C2H2	PF00096.26	1.9e-46	6	7
ENSACLP00000023513	zf-C2H2	PF00096.26	1.9e-46	7	7
ENSACLP00000023550	zf-C2H2	PF00096.26	6.4e-39	1	8
ENSACLP00000023550	zf-C2H2	PF00096.26	6.4e-39	2	8
ENSACLP00000023550	zf-C2H2	PF00096.26	6.4e-39	3	8
ENSACLP00000023550	zf-C2H2	PF00096.26	6.4e-39	4	8
ENSACLP00000023550	zf-C2H2	PF00096.26	6.4e-39	5	8
ENSACLP00000023550	zf-C2H2	PF00096.26	6.4e-39	6	8
ENSACLP00000023550	zf-C2H2	PF00096.26	6.4e-39	7	8
ENSACLP00000023550	zf-C2H2	PF00096.26	6.4e-39	8	8
ENSACLP00000023513	zf-met	PF12874.7	2.4e-08	1	1
ENSACLP00000023550	zf-met	PF12874.7	3.4e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000024075	-	4621	-	ENSACLP00000023513	655 (aa)	XP_026018949	UPI000E416E0C
ENSACLT00000024115	-	1218	-	ENSACLP00000023550	405 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000015989	-	89	35.338	ENSACLG00000007162	scrt1b	59	36.364
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ENSACLG00000015989	-	87	46.296	ENSACLG00000006870	-	56	46.296
ENSACLG00000015989	-	92	38.140	ENSACLG00000022499	-	89	37.190
ENSACLG00000015989	-	91	42.211	ENSACLG00000015843	-	89	42.211
ENSACLG00000015989	-	97	34.236	ENSACLG00000017941	-	88	33.422
ENSACLG00000015989	-	87	50.980	ENSACLG00000017487	-	70	50.980
ENSACLG00000015989	-	98	41.892	ENSACLG00000014176	-	86	42.105
ENSACLG00000015989	-	91	42.642	ENSACLG00000023941	-	87	42.642
ENSACLG00000015989	-	91	40.260	ENSACLG00000022482	-	87	40.260
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ENSACLG00000015989	-	90	40.807	ENSACLG00000027692	-	86	40.807
ENSACLG00000015989	-	92	42.629	ENSACLG00000003332	-	99	43.491
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ENSACLG00000015989	-	85	41.026	ENSACLG00000008624	-	92	39.355
ENSACLG00000015989	-	89	36.667	ENSACLG00000005594	ZNF319	88	36.667
ENSACLG00000015989	-	85	41.250	ENSACLG00000016405	zbtb17	66	40.625
ENSACLG00000015989	-	89	33.735	ENSACLG00000022305	-	91	37.079
ENSACLG00000015989	-	87	50.943	ENSACLG00000023513	-	80	50.943
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ENSACLG00000015989	-	96	40.288	ENSACLG00000012712	znf646	89	42.636
ENSACLG00000015989	-	93	50.000	ENSACLG00000021343	-	99	46.250
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ENSACLG00000015989	-	92	40.278	ENSACLG00000022497	-	99	40.278
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ENSACLG00000015989	-	93	43.673	ENSACLG00000000473	-	85	43.673
ENSACLG00000015989	-	86	39.881	ENSACLG00000005694	-	51	35.246
ENSACLG00000015989	-	92	40.000	ENSACLG00000017925	-	69	40.000
ENSACLG00000015989	-	92	43.621	ENSACLG00000024491	-	86	43.621
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Orthologs

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ENSACLG00000015989	-	90	42.534	ENSCSEG00000001771	-	63	42.675	Cynoglossus_semilaevis
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ENSACLG00000015989	-	91	42.991	ENSXETG00000030967	-	98	42.991	Xenopus_tropicalis
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