EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000016016 (Gene tree)
Gene ID: 113006999
Gene Symbol: ehd1a
Alias: zgc:77049
Full Name: EH domain-containing protein 1-like
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 16317 bases
Position: chr2:32464085-32480401
Accession: 113006999
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000023565	MMR_HSR1	PF01926.23	1e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000024131	-	4930	-	ENSACLP00000023565	531 (aa)	XP_025999079	UPI00032A198A

Gene Model

Click here to download ENSACLG00000016016's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACLG00000016016's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000016016	ehd1a	72	30.227	ENSACLG00000024674	SRL	52	31.443
ENSACLG00000016016	ehd1a	96	60.618	ENSACLG00000005241	-	95	60.618
ENSACLG00000016016	ehd1a	71	31.795	ENSACLG00000027685	srl	85	31.795
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	70.265	ENSACLG00000021088	ehd2b	98	70.833
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	85.305	ENSACLG00000007581	ehd3	98	85.305
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	76.108	ENSACLG00000017182	ehd4	95	76.108

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	88.077	ENSG00000110047	EHD1	100	94.444	Homo_sapiens
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	95.463	ENSAPOG00000013440	ehd1a	99	95.463	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.308	ENSAMEG00000017785	EHD1	94	87.308	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000016016	ehd1a	100	98.305	ENSACIG00000022182	ehd1a	100	98.305	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	95.652	ENSAOCG00000016322	ehd1a	99	95.652	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	95.652	ENSAPEG00000010363	ehd1a	99	95.652	Amphiprion_percula
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	95.463	ENSATEG00000013980	ehd1a	99	95.463	Anabas_testudineus
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.885	ENSANAG00000034810	EHD1	97	87.885	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	86.069	ENSAMXG00000031892	-	98	86.069	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	91.238	ENSAMXG00000039344	ehd1a	98	91.238	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.885	ENSBTAG00000050712	EHD1	97	87.885	Bos_taurus
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	67.925	WBGene00004373	rme-1	95	67.925	Caenorhabditis_elegans
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.885	ENSCJAG00000002660	EHD1	97	87.885	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000016016	ehd1a	77	88.078	ENSCAFG00000014128	EHD1	90	87.707	Canis_familiaris
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.885	ENSCAFG00020014846	EHD1	97	87.885	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.885	ENSCHIG00000020707	-	97	87.885	Capra_hircus
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.885	ENSCPOG00000008157	EHD1	97	87.885	Cavia_porcellus
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.885	ENSCCAG00000004590	EHD1	97	87.885	Cebus_capucinus
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.885	ENSCATG00000010658	EHD1	95	87.885	Cercocebus_atys
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.885	ENSCLAG00000016412	EHD1	97	87.885	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	88.077	ENSCSAG00000007397	EHD1	97	88.077	Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	86.486	ENSCPBG00000023692	EHD1	96	86.486	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	88.077	ENSCANG00000042123	EHD1	97	88.077	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.885	ENSCGRG00001019701	Ehd1	97	87.885	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000016016	ehd1a	94	87.400	ENSCGRG00000000662	Ehd1	99	87.400	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	93.962	ENSCSEG00000006078	ehd1a	99	93.962	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	96.774	ENSCVAG00000012152	ehd1a	99	96.774	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	92.308	ENSDARG00000014793	ehd1b	98	92.308	Danio_rerio
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	90.769	ENSDARG00000098853	ehd1a	98	90.769	Danio_rerio
ENSACLG00000016016	ehd1a	66	89.685	ENSDNOG00000017834	EHD1	93	89.685	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.885	ENSDORG00000030186	Ehd1	97	87.885	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	70.132	FBgn0016693	Past1	99	70.132	Drosophila_melanogaster
ENSACLG00000016016	ehd1a	58	79.805	ENSEBUG00000010829	EHD1	89	79.805	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	76.775	ENSEBUG00000009968	EHD1	97	76.775	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	88.269	ENSEASG00005018250	EHD1	97	88.269	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	88.269	ENSECAG00000011638	EHD1	97	88.269	Equus_caballus
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	90.702	ENSELUG00000007973	-	99	90.702	Esox_lucius
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	91.082	ENSELUG00000016093	ehd1b	99	91.082	Esox_lucius
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	88.269	ENSFCAG00000027734	EHD1	95	88.269	Felis_catus
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.885	ENSFDAG00000007697	EHD1	97	87.885	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	96.786	ENSFHEG00000002690	ehd1a	99	96.786	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	95.057	ENSGMOG00000012192	ehd1a	100	95.057	Gadus_morhua
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	96.774	ENSGAFG00000000730	ehd1a	99	96.774	Gambusia_affinis
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	96.205	ENSGACG00000017605	ehd1a	99	96.205	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.308	ENSGAGG00000001677	-	90	87.308	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000016016	ehd1a	100	99.812	ENSHBUG00000012087	ehd1a	100	99.812	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.885	ENSHGLG00000010254	EHD1	97	87.885	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.885	ENSHGLG00100014206	EHD1	97	87.885	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	93.195	ENSHCOG00000006825	ehd1a	99	93.195	Hippocampus_comes
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.692	ENSIPUG00000017390	EHD1	97	87.692	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	92.366	ENSIPUG00000002819	ehd1a	98	92.366	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	88.077	ENSSTOG00000009829	EHD1	97	88.077	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.500	ENSJJAG00000022299	Ehd1	97	87.500	Jaculus_jaculus
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	95.472	ENSKMAG00000004764	ehd1a	99	95.472	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	95.652	ENSLBEG00000004390	ehd1a	99	95.652	Labrus_bergylta
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.548	ENSLACG00000018148	EHD1	97	87.548	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	84.321	ENSLOCG00000000924	ehd1b	94	84.321	Lepisosteus_oculatus
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	85.192	ENSLAFG00000011643	EHD1	97	85.192	Loxodonta_africana
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	88.077	ENSMFAG00000032608	EHD1	97	88.077	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	88.077	ENSMMUG00000003972	EHD1	95	88.077	Macaca_mulatta
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	88.077	ENSMNEG00000031673	EHD1	97	88.077	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	88.077	ENSMLEG00000031992	EHD1	97	88.077	Mandrillus_leucophaeus
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	95.841	ENSMAMG00000021737	ehd1a	99	95.841	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000016016	ehd1a	100	100.000	ENSMZEG00005004305	ehd1a	100	100.000	Maylandia_zebra
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.885	ENSMAUG00000013823	Ehd1	97	87.885	Mesocricetus_auratus
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.885	ENSMICG00000001239	EHD1	96	87.963	Microcebus_murinus
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.885	ENSMOCG00000015517	Ehd1	97	87.885	Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	94.340	ENSMMOG00000003005	ehd1a	99	94.340	Mola_mola
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	96.408	ENSMALG00000012679	ehd1a	99	96.408	Monopterus_albus
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.692	MGP_CAROLIEiJ_G0022603	Ehd1	97	87.692	Mus_caroli
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.692	ENSMUSG00000024772	Ehd1	97	87.692	Mus_musculus
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.500	MGP_PahariEiJ_G0014097	Ehd1	97	87.500	Mus_pahari
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.692	MGP_SPRETEiJ_G0023514	Ehd1	97	87.692	Mus_spretus
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	88.077	ENSMPUG00000012497	EHD1	97	88.077	Mustela_putorius_furo
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.885	ENSNGAG00000020358	Ehd1	97	87.885	Nannospalax_galili
ENSACLG00000016016	ehd1a	100	98.682	ENSNBRG00000002933	ehd1a	100	98.682	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	88.077	ENSNLEG00000005375	EHD1	97	88.077	Nomascus_leucogenys
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.500	ENSOPRG00000011350	EHD1	97	87.500	Ochotona_princeps
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	88.077	ENSODEG00000014527	EHD1	97	88.077	Octodon_degus
ENSACLG00000016016	ehd1a	59	91.054	ENSOCUG00000029532	EHD1	92	91.054	Oryctolagus_cuniculus
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	95.094	ENSORLG00000022561	ehd1a	99	95.094	Oryzias_latipes
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	94.906	ENSORLG00020018451	ehd1a	99	94.906	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	94.906	ENSORLG00015017672	ehd1a	99	94.906	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	95.849	ENSOMEG00000019329	ehd1a	99	95.849	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.885	ENSOGAG00000009351	EHD1	97	87.885	Otolemur_garnettii
ENSACLG00000016016	ehd1a	91	88.454	ENSOARG00000010447	EHD1	99	88.454	Ovis_aries
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	88.077	ENSPPAG00000037178	EHD1	97	88.077	Pan_paniscus
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	85.962	ENSPPRG00000006031	EHD1	95	85.962	Panthera_pardus
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	88.077	ENSPTRG00000003851	EHD1	95	88.077	Pan_troglodytes
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	88.077	ENSPANG00000023358	EHD1	95	88.077	Papio_anubis
ENSACLG00000016016	ehd1a	67	95.211	ENSPKIG00000020297	-	86	95.211	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	88.783	ENSPKIG00000023165	-	99	88.783	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.500	ENSPSIG00000005727	EHD1	97	87.500	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	94.677	ENSPMGG00000017810	ehd1a	98	94.677	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.885	ENSPEMG00000010917	Ehd1	97	87.885	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.692	ENSPCIG00000014850	EHD1	97	87.692	Phascolarctos_cinereus
ENSACLG00000016016	ehd1a	72	70.341	ENSPCIG00000017053	-	94	70.341	Phascolarctos_cinereus
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	97.148	ENSPFOG00000010613	ehd1a	98	97.148	Poecilia_formosa
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	97.148	ENSPLAG00000023296	ehd1a	99	97.148	Poecilia_latipinna
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	97.338	ENSPMEG00000003397	ehd1a	99	97.338	Poecilia_mexicana
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	97.148	ENSPREG00000015893	ehd1a	99	97.148	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	88.077	ENSPPYG00000003093	EHD1	97	88.077	Pongo_abelii
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.885	ENSPCOG00000010309	EHD1	97	87.885	Propithecus_coquereli
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.885	ENSPVAG00000007890	EHD1	97	87.885	Pteropus_vampyrus
ENSACLG00000016016	ehd1a	100	99.812	ENSPNYG00000015448	ehd1a	100	99.812	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	91.619	ENSPNAG00000023091	ehd1a	98	91.619	Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	89.905	ENSPNAG00000007408	EHD1	99	89.905	Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.692	ENSRNOG00000043503	Ehd1	97	87.692	Rattus_norvegicus
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	88.077	ENSRBIG00000039111	EHD1	97	88.077	Rhinopithecus_bieti
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	88.077	ENSRROG00000026366	EHD1	97	88.077	Rhinopithecus_roxellana
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.885	ENSSBOG00000023399	EHD1	97	87.885	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACLG00000016016	ehd1a	73	69.487	ENSSHAG00000007430	-	94	67.241	Sarcophilus_harrisii
ENSACLG00000016016	ehd1a	92	91.358	ENSSFOG00015019587	EHD1	99	91.358	Scleropages_formosus
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	93.090	ENSSFOG00015006481	-	98	93.090	Scleropages_formosus
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	95.841	ENSSMAG00000018210	ehd1a	99	95.841	Scophthalmus_maximus
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	97.547	ENSSDUG00000016436	ehd1a	99	97.547	Seriola_dumerili
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	97.547	ENSSLDG00000015328	ehd1a	99	97.547	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	97.164	ENSSPAG00000008682	ehd1a	99	97.164	Stegastes_partitus
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.885	ENSSSCG00000013017	EHD1	97	87.885	Sus_scrofa
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	95.274	ENSTRUG00000025890	ehd1a	99	95.274	Takifugu_rubripes
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	95.627	ENSTNIG00000016792	ehd1a	98	95.627	Tetraodon_nigroviridis
ENSACLG00000016016	ehd1a	76	79.803	ENSTBEG00000007057	EHD1	98	79.803	Tupaia_belangeri
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.115	ENSTTRG00000008887	EHD1	97	87.115	Tursiops_truncatus
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.885	ENSUAMG00000012071	EHD1	97	87.885	Ursus_americanus
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	86.782	ENSUMAG00000007890	EHD1	98	86.782	Ursus_maritimus
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.885	ENSVVUG00000027552	EHD1	82	87.885	Vulpes_vulpes
ENSACLG00000016016	ehd1a	98	86.346	ENSXETG00000001638	ehd1	97	86.346	Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	96.008	ENSXCOG00000001781	ehd1a	99	96.008	Xiphophorus_couchianus
ENSACLG00000016016	ehd1a	99	96.584	ENSXMAG00000005301	ehd1a	99	96.584	Xiphophorus_maculatus