EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000016956 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2033 bases
Position: chr18:15061243-15063275
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000024938	RVT_1	PF00078.27	6.7e-47	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000025533	-	2033	-	ENSACLP00000024938	559 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000016956	-	92	98.830	ENSACLG00000023788	-	100	98.830
ENSACLG00000016956	-	66	30.239	ENSACLG00000021583	-	90	30.239
ENSACLG00000016956	-	65	31.099	ENSACLG00000013992	-	92	31.099
ENSACLG00000016956	-	81	65.055	ENSACLG00000010366	-	100	65.055
ENSACLG00000016956	-	56	66.879	ENSACLG00000000505	-	89	66.879
ENSACLG00000016956	-	62	97.965	ENSACLG00000020009	-	59	97.965
ENSACLG00000016956	-	63	31.405	ENSACLG00000005746	-	82	31.405
ENSACLG00000016956	-	99	55.676	ENSACLG00000002312	-	55	55.676
ENSACLG00000016956	-	60	30.294	ENSACLG00000002314	-	83	30.294
ENSACLG00000016956	-	100	98.211	ENSACLG00000007650	-	54	98.211
ENSACLG00000016956	-	99	54.480	ENSACLG00000020849	-	85	54.480
ENSACLG00000016956	-	58	32.229	ENSACLG00000025525	-	81	32.229
ENSACLG00000016956	-	63	30.919	ENSACLG00000010775	-	82	30.919
ENSACLG00000016956	-	59	31.268	ENSACLG00000012094	-	70	31.268
ENSACLG00000016956	-	75	31.787	ENSACLG00000012352	-	86	31.787
ENSACLG00000016956	-	50	32.509	ENSACLG00000024587	-	74	32.509
ENSACLG00000016956	-	55	32.063	ENSACLG00000012982	-	78	32.063
ENSACLG00000016956	-	68	55.526	ENSACLG00000010907	-	97	55.526
ENSACLG00000016956	-	81	51.542	ENSACLG00000019219	-	100	51.542
ENSACLG00000016956	-	70	30.051	ENSACLG00000022277	-	97	30.051
ENSACLG00000016956	-	94	54.198	ENSACLG00000027577	-	85	54.198
ENSACLG00000016956	-	55	30.892	ENSACLG00000027578	-	81	30.892
ENSACLG00000016956	-	99	55.676	ENSACLG00000013374	-	64	55.676
ENSACLG00000016956	-	70	34.171	ENSACLG00000004613	-	94	34.171
ENSACLG00000016956	-	78	61.149	ENSACLG00000009848	-	99	61.149
ENSACLG00000016956	-	65	30.563	ENSACLG00000008836	-	70	30.563
ENSACLG00000016956	-	51	34.364	ENSACLG00000005642	-	50	34.364
ENSACLG00000016956	-	83	30.149	ENSACLG00000025009	-	99	30.149
ENSACLG00000016956	-	82	30.638	ENSACLG00000000230	-	99	30.638
ENSACLG00000016956	-	89	64.329	ENSACLG00000023590	-	99	64.329
ENSACLG00000016956	-	54	54.545	ENSACLG00000005509	-	68	54.545
ENSACLG00000016956	-	50	30.137	ENSACLG00000022104	-	82	30.421
ENSACLG00000016956	-	99	63.243	ENSACLG00000004427	-	68	63.243
ENSACLG00000016956	-	60	30.000	ENSACLG00000017836	-	83	30.000
ENSACLG00000016956	-	82	31.210	ENSACLG00000006688	-	99	31.210
ENSACLG00000016956	-	65	30.458	ENSACLG00000008424	-	91	30.458
ENSACLG00000016956	-	61	30.747	ENSACLG00000015507	-	63	30.747
ENSACLG00000016956	-	99	59.601	ENSACLG00000000579	-	85	58.855
ENSACLG00000016956	-	83	30.021	ENSACLG00000022853	-	88	30.021
ENSACLG00000016956	-	66	30.504	ENSACLG00000015704	-	62	30.504
ENSACLG00000016956	-	60	30.588	ENSACLG00000024504	-	83	30.588
ENSACLG00000016956	-	79	30.357	ENSACLG00000025576	-	60	30.357
ENSACLG00000016956	-	58	31.231	ENSACLG00000013213	-	93	31.231
ENSACLG00000016956	-	60	30.058	ENSACLG00000016058	-	77	30.058
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ENSACLG00000016956	-	60	30.523	ENSACLG00000013281	-	84	30.523
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ENSACLG00000016956	-	99	58.409	ENSACLG00000017241	-	92	58.409
ENSACLG00000016956	-	81	30.952	ENSACLG00000022841	-	59	30.952
ENSACLG00000016956	-	77	61.449	ENSACLG00000021942	-	62	61.449
ENSACLG00000016956	-	51	32.192	ENSACLG00000021947	-	95	32.192
ENSACLG00000016956	-	66	33.246	ENSACLG00000012447	-	81	33.246
ENSACLG00000016956	-	70	30.273	ENSACLG00000017297	-	74	30.273
ENSACLG00000016956	-	60	30.294	ENSACLG00000019298	-	80	30.294
ENSACLG00000016956	-	98	98.901	ENSACLG00000018002	-	64	98.901
ENSACLG00000016956	-	65	30.831	ENSACLG00000013955	-	91	30.831
ENSACLG00000016956	-	66	58.583	ENSACLG00000026307	-	100	58.583
ENSACLG00000016956	-	60	30.294	ENSACLG00000003179	-	83	30.294
ENSACLG00000016956	-	60	30.294	ENSACLG00000020957	-	83	30.294
ENSACLG00000016956	-	62	30.000	ENSACLG00000002725	-	95	30.000
ENSACLG00000016956	-	50	36.491	ENSACLG00000019046	-	92	36.491
ENSACLG00000016956	-	99	55.315	ENSACLG00000007954	-	83	55.315
ENSACLG00000016956	-	57	31.988	ENSACLG00000005259	-	99	31.988
ENSACLG00000016956	-	100	98.390	ENSACLG00000019498	-	79	98.390
ENSACLG00000016956	-	99	56.216	ENSACLG00000001858	-	77	56.216
ENSACLG00000016956	-	69	30.357	ENSACLG00000001556	-	82	30.357
ENSACLG00000016956	-	50	30.035	ENSACLG00000021692	-	76	30.035
ENSACLG00000016956	-	66	35.904	ENSACLG00000007200	-	71	30.952
ENSACLG00000016956	-	56	97.749	ENSACLG00000016290	-	100	97.749
ENSACLG00000016956	-	97	30.481	ENSACLG00000006988	-	81	30.481
ENSACLG00000016956	-	53	33.660	ENSACLG00000015324	-	78	33.660
ENSACLG00000016956	-	99	55.315	ENSACLG00000005489	-	83	55.315
ENSACLG00000016956	-	54	33.007	ENSACLG00000008218	-	66	33.007
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ENSACLG00000016956	-	51	34.014	ENSACLG00000003644	-	90	34.014
ENSACLG00000016956	-	63	30.495	ENSACLG00000026286	-	96	30.495
ENSACLG00000016956	-	63	30.726	ENSACLG00000022352	-	73	30.726
ENSACLG00000016956	-	65	30.914	ENSACLG00000025310	-	84	30.914
ENSACLG00000016956	-	68	35.171	ENSACLG00000021422	-	96	35.171
ENSACLG00000016956	-	83	30.720	ENSACLG00000014911	-	73	30.720
ENSACLG00000016956	-	97	30.481	ENSACLG00000016231	-	95	30.481
ENSACLG00000016956	-	60	30.588	ENSACLG00000022149	-	83	30.588
ENSACLG00000016956	-	83	64.871	ENSACLG00000008558	-	99	64.871
ENSACLG00000016956	-	91	57.677	ENSACLG00000008551	-	92	57.677
ENSACLG00000016956	-	51	33.904	ENSACLG00000011058	-	61	33.904
ENSACLG00000016956	-	53	34.868	ENSACLG00000018945	-	51	34.868
ENSACLG00000016956	-	60	30.383	ENSACLG00000005668	-	83	30.383
ENSACLG00000016956	-	63	30.447	ENSACLG00000013867	-	59	30.447
ENSACLG00000016956	-	66	31.316	ENSACLG00000021775	-	96	31.316
ENSACLG00000016956	-	61	31.897	ENSACLG00000009903	-	61	31.897
ENSACLG00000016956	-	60	30.000	ENSACLG00000014503	-	83	30.000
ENSACLG00000016956	-	64	31.215	ENSACLG00000015445	-	95	31.215
ENSACLG00000016956	-	63	30.168	ENSACLG00000004866	-	59	30.168
ENSACLG00000016956	-	99	54.480	ENSACLG00000016551	-	55	54.480
ENSACLG00000016956	-	99	58.228	ENSACLG00000017200	-	54	58.228
ENSACLG00000016956	-	59	32.743	ENSACLG00000027256	-	83	32.743
ENSACLG00000016956	-	62	30.899	ENSACLG00000005242	-	90	30.899
ENSACLG00000016956	-	61	32.378	ENSACLG00000020388	-	94	31.977
ENSACLG00000016956	-	65	56.044	ENSACLG00000027508	-	80	56.044
ENSACLG00000016956	-	60	30.678	ENSACLG00000002058	-	83	30.678
ENSACLG00000016956	-	78	97.032	ENSACLG00000026433	-	98	97.032
ENSACLG00000016956	-	60	30.000	ENSACLG00000001469	-	83	30.000
ENSACLG00000016956	-	99	54.480	ENSACLG00000003707	-	67	54.480
ENSACLG00000016956	-	55	32.381	ENSACLG00000025611	-	78	32.381
ENSACLG00000016956	-	63	30.447	ENSACLG00000002880	-	74	30.447
ENSACLG00000016956	-	99	54.480	ENSACLG00000008988	-	60	54.480
ENSACLG00000016956	-	86	55.649	ENSACLG00000027127	-	64	55.649
ENSACLG00000016956	-	53	52.703	ENSACLG00000001254	-	99	52.703
ENSACLG00000016956	-	92	97.856	ENSACLG00000018778	-	51	97.856
ENSACLG00000016956	-	58	30.330	ENSACLG00000009484	-	81	30.330
ENSACLG00000016956	-	50	31.119	ENSACLG00000020587	-	71	31.119
ENSACLG00000016956	-	84	30.658	ENSACLG00000009807	-	67	30.658

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000016956	-	80	54.343	ENSAPEG00000014494	-	99	54.343	Amphiprion_percula
ENSACLG00000016956	-	89	38.067	ENSAMXG00000035582	-	98	37.992	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000016956	-	70	31.343	ENSCPBG00000010408	-	78	31.343	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000016956	-	67	31.414	ENSCPBG00000022715	-	83	31.414	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000016956	-	59	34.132	ENSCPBG00000006651	-	87	34.132	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000016956	-	56	33.642	ENSCPBG00000011561	-	81	33.642	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000016956	-	60	35.484	ENSCPBG00000004450	-	90	35.484	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000016956	-	70	34.596	ENSCPBG00000025030	-	95	31.361	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000016956	-	58	31.722	ENSCPBG00000003209	-	99	31.722	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000016956	-	63	34.561	ENSCPBG00000019838	-	97	34.561	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000016956	-	54	36.364	ENSCPBG00000015885	-	88	36.364	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000016956	-	64	32.153	ENSCPBG00000022940	-	56	32.153	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000016956	-	70	32.080	ENSCPBG00000024353	-	77	32.080	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000016956	-	58	37.048	ENSCPBG00000003199	-	95	37.048	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000016956	-	67	30.628	ENSCPBG00000001408	-	87	30.628	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000016956	-	59	35.714	ENSCPBG00000002205	-	90	35.714	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000016956	-	64	31.129	ENSCPBG00000002764	-	65	31.129	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000016956	-	55	38.585	ENSCPBG00000013338	-	81	38.585	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000016956	-	57	33.639	ENSCPBG00000005177	-	83	33.639	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000016956	-	60	36.657	ENSCPBG00000001455	-	90	36.657	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000016956	-	66	36.096	ENSCPBG00000004252	-	89	36.096	Chrysemys_picta_bellii
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