EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000017062 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3656 bases
Position: chr5:18087538-18091193
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000025064	RVT_1	PF00078.27	2e-14	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000025665	-	3656	-	ENSACLP00000025064	1028 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000017062	-	93	41.158	ENSACLG00000018225	-	81	41.158
ENSACLG00000017062	-	79	38.331	ENSACLG00000005337	-	80	38.331
ENSACLG00000017062	-	70	36.771	ENSACLG00000013905	-	92	36.771
ENSACLG00000017062	-	87	37.980	ENSACLG00000017452	-	99	37.980
ENSACLG00000017062	-	53	36.298	ENSACLG00000001380	-	92	36.298
ENSACLG00000017062	-	62	30.513	ENSACLG00000018181	-	70	30.513
ENSACLG00000017062	-	70	31.386	ENSACLG00000027124	-	97	31.386
ENSACLG00000017062	-	66	31.195	ENSACLG00000009118	-	51	31.195
ENSACLG00000017062	-	94	44.799	ENSACLG00000008642	-	91	44.799
ENSACLG00000017062	-	65	34.048	ENSACLG00000007343	-	87	34.048
ENSACLG00000017062	-	77	38.930	ENSACLG00000025600	-	72	38.930
ENSACLG00000017062	-	74	33.481	ENSACLG00000026879	-	54	33.481
ENSACLG00000017062	-	66	30.973	ENSACLG00000016624	-	51	30.973
ENSACLG00000017062	-	94	35.402	ENSACLG00000014813	-	78	34.700
ENSACLG00000017062	-	97	30.747	ENSACLG00000005909	-	90	30.747
ENSACLG00000017062	-	99	36.130	ENSACLG00000024627	-	77	36.130
ENSACLG00000017062	-	85	32.998	ENSACLG00000018325	-	72	32.053
ENSACLG00000017062	-	97	34.868	ENSACLG00000026192	-	80	34.868
ENSACLG00000017062	-	77	42.447	ENSACLG00000011588	-	96	41.778
ENSACLG00000017062	-	85	32.886	ENSACLG00000002872	-	72	31.850
ENSACLG00000017062	-	98	35.714	ENSACLG00000002701	-	75	35.714
ENSACLG00000017062	-	71	30.000	ENSACLG00000001282	-	53	30.000
ENSACLG00000017062	-	54	35.252	ENSACLG00000008862	-	81	35.252
ENSACLG00000017062	-	67	31.667	ENSACLG00000027730	-	65	31.405
ENSACLG00000017062	-	77	31.936	ENSACLG00000004748	-	92	31.713
ENSACLG00000017062	-	82	43.647	ENSACLG00000022170	-	90	43.647
ENSACLG00000017062	-	82	43.509	ENSACLG00000027702	-	99	43.509
ENSACLG00000017062	-	100	98.833	ENSACLG00000017755	-	78	98.833
ENSACLG00000017062	-	84	33.333	ENSACLG00000027633	-	76	33.333
ENSACLG00000017062	-	50	31.667	ENSACLG00000004062	-	76	31.667
ENSACLG00000017062	-	100	36.053	ENSACLG00000008224	-	77	36.053
ENSACLG00000017062	-	98	35.910	ENSACLG00000013242	-	75	35.910
ENSACLG00000017062	-	86	37.375	ENSACLG00000004561	-	87	37.375
ENSACLG00000017062	-	93	39.715	ENSACLG00000015817	-	74	40.262
ENSACLG00000017062	-	94	44.593	ENSACLG00000016676	-	74	44.593
ENSACLG00000017062	-	97	30.747	ENSACLG00000016675	-	73	30.747
ENSACLG00000017062	-	98	35.812	ENSACLG00000007417	-	75	35.812
ENSACLG00000017062	-	53	45.688	ENSACLG00000018563	-	99	45.688
ENSACLG00000017062	-	64	31.057	ENSACLG00000010542	-	53	31.057
ENSACLG00000017062	-	95	30.030	ENSACLG00000002243	-	72	30.030
ENSACLG00000017062	-	72	30.085	ENSACLG00000005531	-	59	30.085
ENSACLG00000017062	-	98	39.072	ENSACLG00000027304	-	76	39.072
ENSACLG00000017062	-	100	36.148	ENSACLG00000014671	-	77	36.148
ENSACLG00000017062	-	94	35.598	ENSACLG00000007713	-	90	35.048

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000017062	-	76	66.837	ENSAPOG00000012090	-	98	66.837	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000017062	-	99	38.760	ENSAMXG00000041082	-	78	38.760	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017062	-	93	38.673	ENSAMXG00000040613	-	72	38.673	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017062	-	77	41.469	ENSCVAG00000020225	-	79	41.469	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000017062	-	50	45.560	ENSHBUG00000016250	-	95	45.560	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000017062	-	72	42.246	ENSHCOG00000007453	-	78	42.246	Hippocampus_comes
ENSACLG00000017062	-	93	36.810	ENSORLG00000028630	-	80	36.911	Oryzias_latipes
ENSACLG00000017062	-	96	36.578	ENSORLG00000023329	-	72	36.578	Oryzias_latipes
ENSACLG00000017062	-	99	42.802	ENSORLG00000022041	-	77	42.648	Oryzias_latipes
ENSACLG00000017062	-	69	81.919	ENSORLG00000021791	-	71	81.919	Oryzias_latipes
ENSACLG00000017062	-	98	36.210	ENSORLG00000027118	-	75	36.398	Oryzias_latipes
ENSACLG00000017062	-	98	36.116	ENSORLG00000029490	-	75	36.304	Oryzias_latipes
ENSACLG00000017062	-	98	41.142	ENSORLG00000023484	-	76	41.142	Oryzias_latipes
ENSACLG00000017062	-	82	41.274	ENSORLG00000025291	-	89	41.274	Oryzias_latipes
ENSACLG00000017062	-	82	40.515	ENSORLG00000025169	-	90	40.515	Oryzias_latipes
ENSACLG00000017062	-	96	36.775	ENSORLG00000027297	-	72	36.775	Oryzias_latipes
ENSACLG00000017062	-	98	36.467	ENSORLG00020004233	-	81	36.467	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017062	-	56	45.969	ENSORLG00020001172	-	97	45.969	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017062	-	91	41.587	ENSORLG00020008265	-	76	41.124	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017062	-	68	43.000	ENSORLG00020020421	-	91	43.000	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017062	-	73	35.687	ENSORLG00020016480	-	97	35.944	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017062	-	96	36.775	ENSORLG00020010381	-	82	36.775	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017062	-	74	38.060	ENSORLG00020005152	-	77	38.060	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017062	-	90	37.188	ENSORLG00020014275	-	99	36.346	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017062	-	97	41.617	ENSORLG00020005861	-	76	41.617	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017062	-	89	39.381	ENSORLG00020000502	-	74	39.428	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017062	-	66	36.442	ENSORLG00015004212	-	98	36.442	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000017062	-	93	39.754	ENSORLG00015009567	-	72	39.754	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000017062	-	98	40.195	ENSORLG00015011725	-	75	40.195	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000017062	-	68	36.338	ENSORLG00015017638	-	97	35.687	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000017062	-	83	83.781	ENSORLG00015008822	-	99	83.781	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000017062	-	97	40.040	ENSOMEG00000015349	-	73	40.040	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000017062	-	78	33.622	ENSPKIG00000014677	-	70	33.622	Paramormyrops_kingsleyae