EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000017093 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1323 bases
Position: chr20:21401539-21402861
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000025104	RVT_1	PF00078.27	1.5e-44	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000025707	-	1323	-	ENSACLP00000025104	440 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
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ENSACLG00000017093	-	71	61.342	ENSPNAG00000001796	-	59	61.342	Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000017093	-	72	59.365	ENSPNAG00000003449	-	93	59.223	Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000017093	-	56	56.452	ENSPNAG00000013203	-	93	57.692	Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000017093	-	67	38.176	ENSSFOG00015008653	-	75	38.176	Scleropages_formosus
ENSACLG00000017093	-	72	40.506	ENSSFOG00015016391	-	88	40.506	Scleropages_formosus
ENSACLG00000017093	-	68	60.535	ENSSDUG00000000707	-	94	60.535	Seriola_dumerili
ENSACLG00000017093	-	84	36.148	ENSSPAG00000002518	-	75	36.148	Stegastes_partitus
ENSACLG00000017093	-	58	58.268	ENSTRUG00000025266	-	88	57.317	Takifugu_rubripes
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ENSACLG00000017093	-	100	50.339	ENSXMAG00000027740	-	80	50.339	Xiphophorus_maculatus