EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000017161 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5832 bases
Position: chr6:38522938-38528769
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000025211	RVT_1	PF00078.27	2.9e-31	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000025817	-	5832	-	ENSACLP00000025211	1494 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000017161	-	51	36.080	ENSACLG00000002872	-	60	36.080
ENSACLG00000017161	-	59	34.064	ENSACLG00000009118	-	63	35.021
ENSACLG00000017161	-	58	33.626	ENSACLG00000013455	-	61	33.626
ENSACLG00000017161	-	57	35.249	ENSACLG00000021546	-	61	35.815
ENSACLG00000017161	-	71	45.129	ENSACLG00000027730	-	93	44.945
ENSACLG00000017161	-	55	35.020	ENSACLG00000021770	-	59	35.020
ENSACLG00000017161	-	54	35.518	ENSACLG00000018454	-	73	35.124
ENSACLG00000017161	-	50	36.384	ENSACLG00000013242	-	55	36.384
ENSACLG00000017161	-	50	36.384	ENSACLG00000007417	-	54	36.384
ENSACLG00000017161	-	96	49.220	ENSACLG00000026879	-	98	49.220
ENSACLG00000017161	-	84	39.072	ENSACLG00000018060	-	86	38.889
ENSACLG00000017161	-	50	34.667	ENSACLG00000005909	-	65	34.667
ENSACLG00000017161	-	97	39.601	ENSACLG00000019876	-	95	39.402
ENSACLG00000017161	-	56	33.626	ENSACLG00000003361	-	58	33.626
ENSACLG00000017161	-	58	35.772	ENSACLG00000004344	-	59	35.772
ENSACLG00000017161	-	55	34.669	ENSACLG00000002182	-	63	34.669
ENSACLG00000017161	-	61	39.832	ENSACLG00000018181	-	99	39.832
ENSACLG00000017161	-	98	65.604	ENSACLG00000024091	-	98	65.536
ENSACLG00000017161	-	52	35.516	ENSACLG00000001267	-	74	35.516
ENSACLG00000017161	-	56	40.733	ENSACLG00000013947	-	81	40.733
ENSACLG00000017161	-	61	34.600	ENSACLG00000005531	-	68	34.600
ENSACLG00000017161	-	57	39.619	ENSACLG00000027747	-	57	39.619
ENSACLG00000017161	-	50	36.080	ENSACLG00000027633	-	65	36.080
ENSACLG00000017161	-	51	39.506	ENSACLG00000008738	-	68	39.506
ENSACLG00000017161	-	54	39.683	ENSACLG00000003799	-	59	40.592
ENSACLG00000017161	-	58	38.901	ENSACLG00000014688	-	75	38.901
ENSACLG00000017161	-	88	34.520	ENSACLG00000017808	-	87	34.448
ENSACLG00000017161	-	53	34.267	ENSACLG00000002238	-	64	34.267
ENSACLG00000017161	-	72	39.011	ENSACLG00000010042	-	94	36.693
ENSACLG00000017161	-	56	42.008	ENSACLG00000003852	-	63	42.008
ENSACLG00000017161	-	61	34.659	ENSACLG00000000384	-	62	35.189
ENSACLG00000017161	-	98	65.807	ENSACLG00000025719	-	98	65.739
ENSACLG00000017161	-	53	42.058	ENSACLG00000027627	-	68	42.058
ENSACLG00000017161	-	88	34.841	ENSACLG00000002180	-	90	34.786
ENSACLG00000017161	-	51	34.690	ENSACLG00000026192	-	59	34.690
ENSACLG00000017161	-	51	39.753	ENSACLG00000022094	-	74	39.753
ENSACLG00000017161	-	50	34.667	ENSACLG00000016675	-	52	34.667
ENSACLG00000017161	-	66	46.394	ENSACLG00000001563	-	100	46.327
ENSACLG00000017161	-	53	34.211	ENSACLG00000025904	-	56	34.211
ENSACLG00000017161	-	60	43.311	ENSACLG00000000367	-	96	43.593
ENSACLG00000017161	-	56	37.876	ENSACLG00000017671	-	75	37.876
ENSACLG00000017161	-	94	31.968	ENSACLG00000013572	-	91	31.770
ENSACLG00000017161	-	56	35.375	ENSACLG00000027618	-	56	35.375
ENSACLG00000017161	-	97	39.601	ENSACLG00000014619	-	96	39.402
ENSACLG00000017161	-	53	36.245	ENSACLG00000001282	-	58	36.245
ENSACLG00000017161	-	54	33.686	ENSACLG00000013171	-	56	33.686
ENSACLG00000017161	-	54	39.683	ENSACLG00000006945	-	59	40.592
ENSACLG00000017161	-	52	35.885	ENSACLG00000008010	-	71	35.885
ENSACLG00000017161	-	88	35.398	ENSACLG00000027291	-	87	35.282
ENSACLG00000017161	-	56	43.115	ENSACLG00000016581	-	77	42.670
ENSACLG00000017161	-	55	33.610	ENSACLG00000020048	-	59	33.610
ENSACLG00000017161	-	54	36.160	ENSACLG00000015735	-	99	36.160
ENSACLG00000017161	-	54	30.655	ENSACLG00000017755	-	59	30.655
ENSACLG00000017161	-	88	34.520	ENSACLG00000000499	-	87	34.448
ENSACLG00000017161	-	50	36.150	ENSACLG00000024627	-	54	36.150
ENSACLG00000017161	-	57	34.244	ENSACLG00000020275	-	55	34.244
ENSACLG00000017161	-	55	34.870	ENSACLG00000019658	-	63	34.870
ENSACLG00000017161	-	50	36.384	ENSACLG00000002701	-	55	36.384
ENSACLG00000017161	-	54	33.898	ENSACLG00000001555	-	56	33.898
ENSACLG00000017161	-	52	35.837	ENSACLG00000012963	-	52	35.837
ENSACLG00000017161	-	57	35.057	ENSACLG00000013669	-	61	35.614
ENSACLG00000017161	-	50	36.150	ENSACLG00000017452	-	79	36.150
ENSACLG00000017161	-	98	65.739	ENSACLG00000009628	-	98	65.672
ENSACLG00000017161	-	88	34.520	ENSACLG00000014870	-	87	34.448
ENSACLG00000017161	-	51	36.080	ENSACLG00000018325	-	60	36.080
ENSACLG00000017161	-	54	35.294	ENSACLG00000010542	-	63	35.294
ENSACLG00000017161	-	58	38.933	ENSACLG00000015880	-	66	38.933
ENSACLG00000017161	-	54	77.228	ENSACLG00000007343	-	99	77.228
ENSACLG00000017161	-	57	34.810	ENSACLG00000016624	-	64	34.810

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000017161	-	63	57.598	ENSAPOG00000008045	-	98	57.598	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000017161	-	75	50.572	ENSAPOG00000012135	-	99	50.484	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000017161	-	88	33.404	ENSAMXG00000030902	-	94	33.404	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017161	-	96	33.658	ENSAMXG00000031698	-	93	33.463	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017161	-	82	41.355	ENSAMXG00000038169	-	95	41.242	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017161	-	87	33.694	ENSAMXG00000038578	-	99	33.694	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017161	-	88	35.495	ENSAMXG00000040892	-	87	35.424	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017161	-	88	40.383	ENSAMXG00000030987	-	89	40.533	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017161	-	55	34.083	ENSAMXG00000041112	-	82	32.729	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017161	-	54	42.754	ENSCPBG00000011626	-	99	42.788	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017161	-	52	40.876	ENSCVAG00000009912	-	99	40.777	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000017161	-	72	35.764	ENSELUG00000000948	-	99	35.167	Esox_lucius
ENSACLG00000017161	-	65	43.644	ENSFHEG00000000971	-	89	43.301	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000017161	-	54	45.320	ENSGAGG00000012039	-	99	45.443	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000017161	-	54	45.320	ENSGAGG00000020521	-	99	45.443	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000017161	-	90	43.511	ENSGAGG00000022240	-	88	43.617	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000017161	-	62	45.531	ENSGAGG00000014450	-	85	45.100	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000017161	-	67	42.428	ENSGAGG00000025282	-	89	42.553	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000017161	-	56	47.790	ENSIPUG00000000601	-	93	47.613	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000017161	-	50	41.899	ENSKMAG00000018163	-	98	41.899	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000017161	-	58	38.998	ENSMAMG00000018393	-	84	38.755	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000017161	-	57	43.672	ENSMZEG00005000633	-	82	43.330	Maylandia_zebra
ENSACLG00000017161	-	99	65.889	ENSORLG00000024233	-	99	65.533	Oryzias_latipes
ENSACLG00000017161	-	97	46.319	ENSORLG00000030265	-	97	46.319	Oryzias_latipes
ENSACLG00000017161	-	99	69.339	ENSORLG00000030542	-	100	69.339	Oryzias_latipes
ENSACLG00000017161	-	97	46.252	ENSORLG00000024220	-	97	46.252	Oryzias_latipes
ENSACLG00000017161	-	95	50.000	ENSORLG00000027831	-	97	49.765	Oryzias_latipes
ENSACLG00000017161	-	59	43.154	ENSORLG00000028632	-	86	42.716	Oryzias_latipes
ENSACLG00000017161	-	88	33.898	ENSORLG00000029874	-	87	33.898	Oryzias_latipes
ENSACLG00000017161	-	97	46.386	ENSORLG00000025739	-	97	46.386	Oryzias_latipes
ENSACLG00000017161	-	51	77.807	ENSORLG00000025478	-	99	77.807	Oryzias_latipes
ENSACLG00000017161	-	94	34.070	ENSORLG00000026629	-	92	34.203	Oryzias_latipes
ENSACLG00000017161	-	60	41.132	ENSORLG00000026676	-	95	41.239	Oryzias_latipes
ENSACLG00000017161	-	94	34.247	ENSORLG00000023181	-	92	34.314	Oryzias_latipes
ENSACLG00000017161	-	92	68.782	ENSORLG00000022369	-	98	68.782	Oryzias_latipes
ENSACLG00000017161	-	97	46.386	ENSORLG00000027568	-	97	46.386	Oryzias_latipes
ENSACLG00000017161	-	99	69.339	ENSORLG00000028795	-	100	69.339	Oryzias_latipes
ENSACLG00000017161	-	99	65.667	ENSORLG00000026546	-	99	65.310	Oryzias_latipes
ENSACLG00000017161	-	88	34.255	ENSORLG00000029675	-	87	34.255	Oryzias_latipes
ENSACLG00000017161	-	99	66.089	ENSORLG00000026665	-	99	65.733	Oryzias_latipes
ENSACLG00000017161	-	94	34.247	ENSORLG00000026873	-	92	34.314	Oryzias_latipes
ENSACLG00000017161	-	99	69.339	ENSORLG00000028609	-	100	69.339	Oryzias_latipes
ENSACLG00000017161	-	89	47.707	ENSORLG00000024904	-	91	47.707	Oryzias_latipes
ENSACLG00000017161	-	89	49.480	ENSORLG00020001422	-	89	49.480	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017161	-	89	47.707	ENSORLG00020014203	-	98	45.144	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017161	-	97	46.386	ENSORLG00020008293	-	97	46.386	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017161	-	89	47.707	ENSORLG00020003869	-	98	45.144	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017161	-	88	47.731	ENSORLG00020020268	-	98	45.113	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017161	-	99	69.493	ENSORLG00015017778	-	100	69.493	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000017161	-	99	69.405	ENSORLG00015018878	-	100	69.405	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000017161	-	88	34.915	ENSOMEG00000009987	-	90	35.068	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000017161	-	99	69.452	ENSOMEG00000003712	-	100	69.452	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000017161	-	87	42.379	ENSPSIG00000000994	-	94	42.467	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000017161	-	86	42.227	ENSPSIG00000000767	-	94	42.227	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000017161	-	54	51.098	ENSPSIG00000001658	-	94	50.730	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000017161	-	74	45.075	ENSPSIG00000000353	-	93	45.075	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000017161	-	88	43.200	ENSPSIG00000000489	-	91	43.212	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000017161	-	50	52.527	ENSPSIG00000013781	-	100	52.042	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000017161	-	52	59.974	ENSPMEG00000019585	-	99	59.974	Poecilia_mexicana
ENSACLG00000017161	-	78	50.740	ENSPMEG00000016355	-	99	50.657	Poecilia_mexicana
ENSACLG00000017161	-	88	35.152	ENSPREG00000004954	-	90	35.223	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000017161	-	93	34.310	ENSPREG00000000390	-	92	34.242	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000017161	-	55	42.857	ENSPNAG00000022277	-	96	42.958	Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000017161	-	81	50.756	ENSSDUG00000002460	-	99	50.756	Seriola_dumerili
ENSACLG00000017161	-	61	45.295	ENSSLDG00000004385	-	98	45.398	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000017161	-	84	48.087	ENSXMAG00000030100	-	96	46.187	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000017161	-	88	35.083	ENSXMAG00000023503	-	89	34.989	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000017161	-	97	33.639	ENSXMAG00000021213	-	98	33.508	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000017161	-	63	39.232	ENSXMAG00000030089	-	92	39.029	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000017161	-	89	49.232	ENSXMAG00000026031	-	95	47.228	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000017161	-	88	34.798	ENSXMAG00000023319	-	86	34.894	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000017161	-	88	35.273	ENSXMAG00000023079	-	89	35.180	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000017161	-	88	34.583	ENSXMAG00000021298	-	86	34.678	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000017161	-	97	33.922	ENSXMAG00000026594	-	98	33.791	Xiphophorus_maculatus