EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000017241 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1812 bases
Position: chr13:18197995-18199806
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000025334	RVT_1	PF00078.27	4.6e-46	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000025941	-	1812	-	ENSACLP00000025334	603 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000017241	-	70	30.536	ENSACLG00000017363	-	98	30.536
ENSACLG00000017241	-	58	30.601	ENSACLG00000007318	-	94	30.601
ENSACLG00000017241	-	85	60.194	ENSACLG00000027127	-	69	60.194
ENSACLG00000017241	-	53	35.385	ENSACLG00000018945	-	55	35.385
ENSACLG00000017241	-	83	30.040	ENSACLG00000021814	-	90	30.435
ENSACLG00000017241	-	75	30.704	ENSACLG00000006014	-	100	30.704
ENSACLG00000017241	-	98	57.770	ENSACLG00000019498	-	83	57.770
ENSACLG00000017241	-	52	30.745	ENSACLG00000022219	-	84	30.745
ENSACLG00000017241	-	83	30.040	ENSACLG00000025376	-	56	30.435
ENSACLG00000017241	-	83	30.040	ENSACLG00000023557	-	79	30.435
ENSACLG00000017241	-	83	30.178	ENSACLG00000000182	-	90	30.572
ENSACLG00000017241	-	61	32.533	ENSACLG00000015507	-	69	32.533
ENSACLG00000017241	-	99	57.454	ENSACLG00000016551	-	59	57.454
ENSACLG00000017241	-	100	99.005	ENSACLG00000017200	-	59	99.005
ENSACLG00000017241	-	56	30.704	ENSACLG00000011440	-	96	30.704
ENSACLG00000017241	-	74	31.111	ENSACLG00000006327	-	91	30.786
ENSACLG00000017241	-	58	65.909	ENSACLG00000000505	-	100	65.909
ENSACLG00000017241	-	65	32.323	ENSACLG00000013844	-	51	32.323
ENSACLG00000017241	-	83	30.237	ENSACLG00000001405	-	75	30.632
ENSACLG00000017241	-	85	59.608	ENSACLG00000023788	-	99	59.608
ENSACLG00000017241	-	66	32.195	ENSACLG00000002614	-	57	32.195
ENSACLG00000017241	-	74	62.806	ENSACLG00000010366	-	99	62.806
ENSACLG00000017241	-	53	33.634	ENSACLG00000024268	-	97	30.280
ENSACLG00000017241	-	75	31.398	ENSACLG00000015704	-	74	31.398
ENSACLG00000017241	-	78	99.149	ENSACLG00000021942	-	69	99.149
ENSACLG00000017241	-	83	30.196	ENSACLG00000001758	-	75	30.040
ENSACLG00000017241	-	92	58.409	ENSACLG00000016956	-	99	58.409
ENSACLG00000017241	-	81	30.101	ENSACLG00000014915	-	76	30.505
ENSACLG00000017241	-	65	30.250	ENSACLG00000022277	-	97	30.750
ENSACLG00000017241	-	97	58.763	ENSACLG00000018002	-	68	58.763
ENSACLG00000017241	-	82	30.375	ENSACLG00000017297	-	91	30.375
ENSACLG00000017241	-	93	59.147	ENSACLG00000027577	-	91	59.147
ENSACLG00000017241	-	74	31.004	ENSACLG00000006688	-	96	31.004
ENSACLG00000017241	-	98	52.115	ENSACLG00000007954	-	88	52.115
ENSACLG00000017241	-	58	30.641	ENSACLG00000010775	-	81	30.641
ENSACLG00000017241	-	83	30.040	ENSACLG00000000536	-	75	30.435
ENSACLG00000017241	-	79	97.468	ENSACLG00000001773	-	63	97.468
ENSACLG00000017241	-	54	34.234	ENSACLG00000015324	-	86	34.234
ENSACLG00000017241	-	83	30.648	ENSACLG00000005662	-	56	31.041
ENSACLG00000017241	-	70	30.070	ENSACLG00000020601	-	98	30.536
ENSACLG00000017241	-	74	30.454	ENSACLG00000000230	-	97	30.454
ENSACLG00000017241	-	98	52.951	ENSACLG00000001858	-	82	52.951
ENSACLG00000017241	-	72	92.184	ENSACLG00000009848	-	99	92.184
ENSACLG00000017241	-	59	33.240	ENSACLG00000002725	-	96	33.240
ENSACLG00000017241	-	98	61.760	ENSACLG00000004427	-	73	61.760
ENSACLG00000017241	-	70	30.070	ENSACLG00000008572	-	98	30.536
ENSACLG00000017241	-	98	57.770	ENSACLG00000007650	-	57	57.770
ENSACLG00000017241	-	98	52.623	ENSACLG00000013374	-	68	52.623
ENSACLG00000017241	-	60	33.602	ENSACLG00000026286	-	98	33.602
ENSACLG00000017241	-	75	31.410	ENSACLG00000009011	-	97	31.410
ENSACLG00000017241	-	99	51.684	ENSACLG00000000579	-	90	51.684
ENSACLG00000017241	-	51	65.574	ENSACLG00000016290	-	98	65.574
ENSACLG00000017241	-	59	33.696	ENSACLG00000013521	-	93	33.696
ENSACLG00000017241	-	92	58.602	ENSACLG00000018778	-	55	58.602
ENSACLG00000017241	-	65	31.078	ENSACLG00000008836	-	75	31.078
ENSACLG00000017241	-	79	63.808	ENSACLG00000023590	-	96	63.808
ENSACLG00000017241	-	83	30.196	ENSACLG00000015650	-	56	30.040
ENSACLG00000017241	-	63	34.465	ENSACLG00000021422	-	96	34.465
ENSACLG00000017241	-	68	31.616	ENSACLG00000012094	-	85	31.616
ENSACLG00000017241	-	58	30.055	ENSACLG00000011570	-	95	30.055
ENSACLG00000017241	-	55	33.731	ENSACLG00000020388	-	94	33.918
ENSACLG00000017241	-	61	32.105	ENSACLG00000005642	-	63	32.105
ENSACLG00000017241	-	61	59.401	ENSACLG00000026307	-	100	59.401
ENSACLG00000017241	-	74	31.556	ENSACLG00000000395	-	55	30.769
ENSACLG00000017241	-	78	65.180	ENSACLG00000008558	-	100	65.180
ENSACLG00000017241	-	63	30.227	ENSACLG00000022656	-	90	30.227
ENSACLG00000017241	-	83	54.473	ENSACLG00000008551	-	91	54.473
ENSACLG00000017241	-	57	33.708	ENSACLG00000021583	-	85	33.708
ENSACLG00000017241	-	99	57.119	ENSACLG00000003707	-	72	57.119
ENSACLG00000017241	-	53	33.642	ENSACLG00000005259	-	99	33.642
ENSACLG00000017241	-	65	32.250	ENSACLG00000001556	-	85	32.250
ENSACLG00000017241	-	60	30.541	ENSACLG00000025310	-	82	30.541
ENSACLG00000017241	-	99	57.286	ENSACLG00000008988	-	65	57.286
ENSACLG00000017241	-	60	30.000	ENSACLG00000015445	-	97	30.000
ENSACLG00000017241	-	80	32.049	ENSACLG00000007200	-	83	30.102
ENSACLG00000017241	-	73	50.569	ENSACLG00000019219	-	97	50.569
ENSACLG00000017241	-	75	30.519	ENSACLG00000019420	-	92	30.952
ENSACLG00000017241	-	67	33.413	ENSACLG00000021937	-	98	32.068
ENSACLG00000017241	-	61	32.800	ENSACLG00000005746	-	85	32.800
ENSACLG00000017241	-	98	52.108	ENSACLG00000002312	-	59	52.108
ENSACLG00000017241	-	83	30.040	ENSACLG00000012014	-	56	30.435
ENSACLG00000017241	-	89	30.109	ENSACLG00000006988	-	79	30.109
ENSACLG00000017241	-	83	30.040	ENSACLG00000025119	-	56	30.435
ENSACLG00000017241	-	59	32.869	ENSACLG00000025525	-	88	32.869
ENSACLG00000017241	-	64	61.358	ENSACLG00000020009	-	65	61.358
ENSACLG00000017241	-	54	31.515	ENSACLG00000021775	-	84	31.515
ENSACLG00000017241	-	55	30.523	ENSACLG00000019413	-	76	30.523
ENSACLG00000017241	-	65	99.744	ENSACLG00000010907	-	100	99.744
ENSACLG00000017241	-	83	30.000	ENSACLG00000010900	-	56	30.392
ENSACLG00000017241	-	98	52.284	ENSACLG00000005489	-	88	52.284
ENSACLG00000017241	-	58	31.653	ENSACLG00000004754	-	83	31.653
ENSACLG00000017241	-	75	32.051	ENSACLG00000012219	-	97	32.051
ENSACLG00000017241	-	99	57.286	ENSACLG00000020849	-	91	57.286
ENSACLG00000017241	-	65	30.075	ENSACLG00000012447	-	86	30.075
ENSACLG00000017241	-	52	31.288	ENSACLG00000016027	-	79	31.288
ENSACLG00000017241	-	51	36.364	ENSACLG00000027256	-	78	36.364
ENSACLG00000017241	-	61	53.699	ENSACLG00000027508	-	80	53.699
ENSACLG00000017241	-	61	33.067	ENSACLG00000009903	-	66	33.067
ENSACLG00000017241	-	61	32.718	ENSACLG00000021354	-	99	32.718
ENSACLG00000017241	-	65	34.243	ENSACLG00000004613	-	95	34.243
ENSACLG00000017241	-	57	32.764	ENSACLG00000025851	-	88	32.764
ENSACLG00000017241	-	70	30.254	ENSACLG00000013944	-	98	30.716
ENSACLG00000017241	-	57	51.143	ENSACLG00000005509	-	77	51.143
ENSACLG00000017241	-	85	30.344	ENSACLG00000016231	-	88	30.344
ENSACLG00000017241	-	73	60.820	ENSACLG00000026433	-	98	60.820
ENSACLG00000017241	-	83	30.099	ENSACLG00000010664	-	90	30.495

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000017241	-	74	54.566	ENSAPEG00000014494	-	99	54.566	Amphiprion_percula
ENSACLG00000017241	-	81	39.879	ENSAMXG00000035582	-	98	39.723	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017241	-	65	32.581	ENSCPBG00000024353	-	78	32.581	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017241	-	55	32.934	ENSCPBG00000013338	-	87	32.934	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017241	-	55	33.333	ENSCPBG00000003199	-	98	33.333	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017241	-	81	30.980	ENSCPBG00000001489	-	89	30.980	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017241	-	62	32.105	ENSCPBG00000001408	-	86	32.105	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017241	-	59	30.791	ENSCPBG00000004450	-	95	30.791	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017241	-	59	32.486	ENSCPBG00000001455	-	95	32.486	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017241	-	72	30.752	ENSCPBG00000022715	-	93	30.752	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017241	-	69	30.569	ENSCPBG00000022940	-	64	30.569	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017241	-	64	31.566	ENSCPBG00000010408	-	78	31.566	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017241	-	54	32.827	ENSCPBG00000013207	-	71	32.827	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017241	-	59	30.791	ENSCPBG00000002205	-	97	30.791	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017241	-	61	30.189	ENSCPBG00000006651	-	97	30.189	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017241	-	60	31.956	ENSCPBG00000005177	-	92	31.956	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017241	-	57	32.378	ENSCPBG00000019838	-	94	32.378	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017241	-	52	33.230	ENSCPBG00000011561	-	82	33.230	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017241	-	67	32.187	ENSCPBG00000004252	-	98	32.187	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017241	-	59	31.956	ENSCPBG00000002764	-	65	31.956	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017241	-	56	31.751	ENSCPBG00000015885	-	97	31.751	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017241	-	50	33.553	ENSCPBG00000001898	-	97	33.553	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017241	-	53	32.923	ENSCPBG00000003209	-	98	32.923	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017241	-	58	31.373	ENSFHEG00000011635	-	86	31.373	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000017241	-	53	32.716	ENSGAGG00000012597	-	88	32.716	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000017241	-	62	32.011	ENSGAGG00000002004	-	82	32.011	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000017241	-	64	31.969	ENSGAGG00000017850	-	89	31.969	Gopherus_agassizii
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