EuRBPDB

  • Home
  • Cancer
  • Family
  • Species
  • RBPredictor
  • Search
  • Download
  • Submit
  • Help
  • Contact

  • Description
  • RBDs
  • Transcripts
  • Gene Model
  • PPI
  • Paralogs
  • Orthologs
Description
Ensembl ID
ENSACLG00000017329 (Gene tree)
Gene ID
-
Gene Symbol
-
Alias
-
Full Name
-
Gene Type
protein_coding
Species
Astatotilapia_calliptera
Status
putative
Strand
Plus strand
Length
5649 bases
Position
chrLS419877.1:20949-26597
Accession
-
RBP type
canonical RBP
Summary
-
RNA binding domains(RBDs)
Protein IDDomain Pfam IDE-value Domain number Total number
ENSACLP00000025455zf-C2H2PF00096.262.1e-67112
ENSACLP00000025455zf-C2H2PF00096.262.1e-67212
ENSACLP00000025455zf-C2H2PF00096.262.1e-67312
ENSACLP00000025455zf-C2H2PF00096.262.1e-67412
ENSACLP00000025455zf-C2H2PF00096.262.1e-67512
ENSACLP00000025455zf-C2H2PF00096.262.1e-67612
ENSACLP00000025455zf-C2H2PF00096.262.1e-67712
ENSACLP00000025455zf-C2H2PF00096.262.1e-67812
ENSACLP00000025455zf-C2H2PF00096.262.1e-67912
ENSACLP00000025455zf-C2H2PF00096.262.1e-671012
ENSACLP00000025455zf-C2H2PF00096.262.1e-671112
ENSACLP00000025455zf-C2H2PF00096.262.1e-671212
ENSACLP00000025455zf-metPF12874.79.9e-3414
ENSACLP00000025455zf-metPF12874.79.9e-3424
ENSACLP00000025455zf-metPF12874.79.9e-3434
ENSACLP00000025455zf-metPF12874.79.9e-3444
Transcripts
Transcript IDNameLengthRefSeq ID Protein IDLengthRefSeq IDUniportKB ID
ENSACLT00000026065-1251-ENSACLP00000025455416 (aa)--
Gene Model
Click here to download ENSACLG00000017329's gene model file
Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACLG00000017329's network
Paralogs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy ParalogGene SymbolCoverageIdentiy
ENSACLG00000017329-8437.662ENSACLG00000020231-9337.260
ENSACLG00000017329-8144.949ENSACLG00000005615-5044.949
ENSACLG00000017329-9069.437ENSACLG00000019499-9769.437
ENSACLG00000017329-8185.567ENSACLG00000018716-7385.567
ENSACLG00000017329-8160.268ENSACLG00000015843-8860.268
ENSACLG00000017329-8339.394ENSACLG00000020268-6239.394
ENSACLG00000017329-8548.387ENSACLG00000022482-8048.387
ENSACLG00000017329-8443.979ENSACLG00000008606-8843.979
ENSACLG00000017329-8866.953ENSACLG00000019349-7666.953
ENSACLG00000017329-8142.697ENSACLG00000021022-7242.697
ENSACLG00000017329-8248.606ENSACLG00000014336-9348.606
ENSACLG00000017329-8644.221ENSACLG00000019318-10044.795
ENSACLG00000017329-9840.000ENSACLG00000016841-8539.423
ENSACLG00000017329-8234.597ENSACLG00000016648-7432.734
ENSACLG00000017329-8154.924ENSACLG00000017411-8754.924
ENSACLG00000017329-8636.170ENSACLG00000018551snai26436.170
ENSACLG00000017329-8640.102ENSACLG00000027692-7940.306
ENSACLG00000017329-8245.058ENSACLG00000020610-6445.058
ENSACLG00000017329-8243.860ENSACLG00000005708-6643.860
ENSACLG00000017329-9071.747ENSACLG00000001045-9968.602
ENSACLG00000017329-8157.095ENSACLG00000006528-9657.095
ENSACLG00000017329-8446.667ENSACLG00000023305-8246.667
ENSACLG00000017329-8143.367ENSACLG00000017801-6343.367
ENSACLG00000017329-9644.574ENSACLG00000017939-9646.541
ENSACLG00000017329-8762.992ENSACLG00000022475-9662.992
ENSACLG00000017329-9848.413ENSACLG00000025251-9747.059
ENSACLG00000017329-8152.174ENSACLG00000001368-8752.174
ENSACLG00000017329-8559.773ENSACLG00000007749-7859.773
ENSACLG00000017329-8340.146ENSACLG00000019094-7340.146
ENSACLG00000017329-8043.706ENSACLG00000020260-9943.706
ENSACLG00000017329-8147.619ENSACLG00000024491-8247.619
ENSACLG00000017329-8143.558ENSACLG00000026458gfi1ab5043.558
ENSACLG00000017329-8478.869ENSACLG00000017336-9378.869
ENSACLG00000017329-8332.937ENSACLG00000022287-6032.937
ENSACLG00000017329-8236.909ENSACLG00000017996prdm57036.909
ENSACLG00000017329-8249.398ENSACLG00000019424-9748.438
ENSACLG00000017329-8841.944ENSACLG00000017925-6941.944
ENSACLG00000017329-8263.393ENSACLG00000023963-9163.393
ENSACLG00000017329-9277.455ENSACLG00000011239-8377.455
ENSACLG00000017329-8248.413ENSACLG00000011237-9946.053
ENSACLG00000017329-8456.466ENSACLG00000022360-9756.466
ENSACLG00000017329-9937.500ENSACLG00000020975-8944.615
ENSACLG00000017329-8536.364ENSACLG00000026103znf5265136.364
ENSACLG00000017329-8643.519ENSACLG00000016405zbtb175843.972
ENSACLG00000017329-9264.305ENSACLG00000022383-9567.552
ENSACLG00000017329-8948.214ENSACLG00000024308-9948.214
ENSACLG00000017329-8643.590ENSACLG00000017321-8443.590
ENSACLG00000017329-8745.455ENSACLG00000008624-7845.455
ENSACLG00000017329-8035.507ENSACLG00000017621-5335.507
ENSACLG00000017329-8469.444ENSACLG00000019482-7569.444
ENSACLG00000017329-8555.856ENSACLG00000007888-7755.856
ENSACLG00000017329-8843.403ENSACLG00000017576-9443.403
ENSACLG00000017329-8156.711ENSACLG00000021846-8656.711
ENSACLG00000017329-8153.234ENSACLG00000023979-9753.234
ENSACLG00000017329-8844.400ENSACLG00000015462-7244.400
ENSACLG00000017329-9546.108ENSACLG00000017449-7446.108
ENSACLG00000017329-8634.711ENSACLG00000012712znf6469842.254
ENSACLG00000017329-8643.293ENSACLG00000006718-5346.479
ENSACLG00000017329-8441.304ENSACLG00000027053gfi1b7041.304
ENSACLG00000017329-8638.318ENSACLG00000006697-7238.318
ENSACLG00000017329-8441.667ENSACLG00000026538-8341.667
ENSACLG00000017329-8132.661ENSACLG00000022305-8833.597
ENSACLG00000017329-8144.706ENSACLG00000027424-6044.706
ENSACLG00000017329-8476.488ENSACLG00000001018-8876.488
ENSACLG00000017329-9740.312ENSACLG00000018746-8950.000
ENSACLG00000017329-8537.908ENSACLG00000000102-5937.908
ENSACLG00000017329-8444.737ENSACLG00000006702-7544.737
ENSACLG00000017329-9048.000ENSACLG00000023513-9448.000
ENSACLG00000017329-8144.928ENSACLG00000005795-5744.928
ENSACLG00000017329-9378.906ENSACLG00000000537-9778.409
ENSACLG00000017329-9177.273ENSACLG00000000411-9579.211
ENSACLG00000017329-8546.429ENSACLG00000024670-7844.231
ENSACLG00000017329-8354.424ENSACLG00000001003-9254.155
ENSACLG00000017329-8143.147ENSACLG00000006870-6043.147
ENSACLG00000017329-9266.082ENSACLG00000022302-9969.737
ENSACLG00000017329-8654.780ENSACLG00000003229-9560.870
ENSACLG00000017329-8134.286ENSACLG00000020579znf319b8734.286
ENSACLG00000017329-8147.857ENSACLG00000024459-8446.154
ENSACLG00000017329-8548.193ENSACLG00000024647-8046.914
ENSACLG00000017329-8693.694ENSACLG00000000521-9393.694
ENSACLG00000017329-8258.671ENSACLG00000023941-8658.671
ENSACLG00000017329-8145.455ENSACLG00000020339-5345.455
ENSACLG00000017329-8143.506ENSACLG00000018700-9843.506
ENSACLG00000017329-8278.274ENSACLG00000018701-7578.274
ENSACLG00000017329-8848.472ENSACLG00000008821-9948.472
ENSACLG00000017329-8148.214ENSACLG00000013531-9648.214
ENSACLG00000017329-8646.842ENSACLG00000021343-9946.842
ENSACLG00000017329-8647.664ENSACLG00000017941-6547.664
ENSACLG00000017329-9264.048ENSACLG00000002844-8664.048
ENSACLG00000017329-8437.956ENSACLG00000019167-8936.963
ENSACLG00000017329-9773.964ENSACLG00000022499-9373.964
ENSACLG00000017329-9174.468ENSACLG00000022497-9874.468
ENSACLG00000017329-8643.293ENSACLG00000020333-5346.479
ENSACLG00000017329-8240.415ENSACLG00000022439-7740.415
ENSACLG00000017329-8567.200ENSACLG00000014167-6067.200
ENSACLG00000017329-9936.087ENSACLG00000020393-8743.713
ENSACLG00000017329-9552.968ENSACLG00000014176-8358.683
ENSACLG00000017329-8456.164ENSACLG00000003332-9756.164
ENSACLG00000017329-8242.138ENSACLG00000011642-7842.138
ENSACLG00000017329-8334.054ENSACLG00000014349znf3415134.054
ENSACLG00000017329-8549.603ENSACLG00000026703-7349.603
ENSACLG00000017329-9278.419ENSACLG00000000487-9178.419
ENSACLG00000017329-8141.234ENSACLG00000020615-7041.234
ENSACLG00000017329-8143.396ENSACLG00000001258-8843.396
ENSACLG00000017329-8141.892ENSACLG00000017487-7041.892
ENSACLG00000017329-8741.975ENSACLG00000015989-9240.741
ENSACLG00000017329-9273.177ENSACLG00000000473-8976.341
ENSACLG00000017329-8048.305ENSACLG00000020474-8348.305
ENSACLG00000017329-8247.826ENSACLG00000019674-9047.534
ENSACLG00000017329-8248.485ENSACLG00000013033-8148.485
ENSACLG00000017329-8650.220ENSACLG00000019270-8150.220
ENSACLG00000017329-8338.281ENSACLG00000011658-9538.281
ENSACLG00000017329-9755.799ENSACLG00000015816-9855.799
ENSACLG00000017329-8152.601ENSACLG00000024294-7452.601
ENSACLG00000017329-8648.857ENSACLG00000024957-9648.857
ENSACLG00000017329-8650.617ENSACLG00000017849-7950.617
ENSACLG00000017329-8544.828ENSACLG00000003679-8144.828
ENSACLG00000017329-7946.061ENSACLG00000013935-7846.061
ENSACLG00000017329-8473.913ENSACLG00000028002-8873.913
ENSACLG00000017329-8143.701ENSACLG00000021056-6043.701
ENSACLG00000017329-8444.030ENSACLG00000022505-8444.030
ENSACLG00000017329-8447.619ENSACLG00000019291-9447.619
ENSACLG00000017329-8635.693ENSACLG00000005594ZNF3199235.693
ENSACLG00000017329-8147.179ENSACLG00000025196-8147.179
ENSACLG00000017329-8561.279ENSACLG00000003546-5861.765
ENSACLG00000017329-8561.940ENSACLG00000014365-9748.503
ENSACLG00000017329-8676.923ENSACLG00000001507-7476.923
ENSACLG00000017329-8146.753ENSACLG00000018707-8746.753
ENSACLG00000017329-7945.977ENSACLG00000011710-5450.769
ENSACLG00000017329-8443.299ENSACLG00000021045-7943.299
ENSACLG00000017329-8349.749ENSACLG00000013454-6349.749
ENSACLG00000017329-8155.172ENSACLG00000004663-8255.172
ENSACLG00000017329-9941.966ENSACLG00000025163-9941.966
ENSACLG00000017329-8535.664ENSACLG00000026187-7035.664
ENSACLG00000017329-8548.148ENSACLG00000014600-9044.350
Orthologs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy OrthologGene SymbolCoverageIdentiy Species
ENSACLG00000017329-8644.910ENSACIG00000019791-8944.776Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000017329-8152.308ENSACIG00000011153-6948.252Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000017329-8555.418ENSAMXG00000031501-8955.418Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017329-8553.074ENSAMXG00000038324-7553.074Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017329-8651.064ENSAMXG00000039162-9751.064Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017329-8553.304ENSAMXG00000031646-9653.304Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017329-8150.949ENSAMXG00000036849-7950.949Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017329-8151.335ENSAMXG00000039770-7951.335Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017329-8552.158ENSAMXG00000031844-9252.158Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017329-8355.949ENSAMXG00000010078-8655.949Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017329-8547.253ENSCHIG00000015741-9547.253Capra_hircus
ENSACLG00000017329-8146.552ENSCCAG00000035188-8346.552Cebus_capucinus
ENSACLG00000017329-8140.719ENSCPBG00000001258-9640.719Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017329-8748.944ENSDNOG00000048084-10048.944Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000017329-8443.919ENSETEG00000002865-8143.919Echinops_telfairi
ENSACLG00000017329-8138.961ENSEBUG00000011582-7238.961Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000017329-8145.294ENSEBUG00000012748-7245.294Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000017329-8147.368ENSEBUG00000008157-9647.368Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000017329-9243.831ENSEBUG00000011479-6943.831Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000017329-9142.222ENSECAG00000035557-8142.222Equus_caballus
ENSACLG00000017329-8237.143ENSFHEG00000016184-7537.143Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000017329-8140.529ENSGMOG00000004315-9540.529Gadus_morhua
ENSACLG00000017329-8335.920ENSGACG00000019863-9935.920Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000017329-8147.518ENSGAGG00000007230-9647.518Gopherus_agassizii
ENSACLG00000017329-8144.156ENSGAGG00000013851-7544.156Gopherus_agassizii
ENSACLG00000017329-8142.793ENSHBUG00000000146-7942.793Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000017329-8046.847ENSHBUG00000019800-8946.847Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000017329-9263.386ENSHBUG00000013264-9663.386Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000017329-8446.179ENSHBUG00000017372-8944.762Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000017329-8650.763ENSHBUG00000006238-9450.763Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000017329-8746.237ENSHBUG00000021028-8346.104Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000017329-8348.718ENSHGLG00000018394-9448.718Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000017329-8149.655ENSIPUG00000021434-9449.655Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000017329-8150.000ENSIPUG00000011073-9850.000Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000017329-8550.000ENSIPUG00000001941-8350.000Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000017329-8147.802ENSIPUG00000003960-8147.802Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000017329-8252.459ENSIPUG00000015233-6552.459Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000017329-8153.922ENSIPUG00000021472-7253.922Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000017329-8150.847ENSIPUG00000021484-9750.847Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000017329-8248.955ENSIPUG00000021518-8348.955Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000017329-8147.917ENSIPUG00000013065-9547.482Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000017329-8549.749ENSIPUG00000006936-9649.749Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000017329-8147.917ENSIPUG00000021527-9247.917Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000017329-8149.359ENSIPUG00000009750-9449.359Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000017329-8353.145ENSIPUG00000022751-9952.581Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000017329-8551.786ENSSTOG00000034297-7251.786Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACLG00000017329-8147.586ENSMFAG00000046052-8447.586Macaca_fascicularis
ENSACLG00000017329-8147.586ENSMNEG00000041636-8447.586Macaca_nemestrina
ENSACLG00000017329-8147.586ENSMLEG00000032640-8447.586Mandrillus_leucophaeus
ENSACLG00000017329-8346.354ENSMAMG00000009051-8446.354Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000017329-8176.667ENSMZEG00005021421-9576.667Maylandia_zebra
ENSACLG00000017329-8157.726ENSMZEG00005027285-8357.726Maylandia_zebra
ENSACLG00000017329-8575.141ENSMZEG00005012737-8375.141Maylandia_zebra
ENSACLG00000017329-8162.937ENSMZEG00005027950-9062.937Maylandia_zebra
ENSACLG00000017329-8352.358ENSMZEG00005019982-9552.358Maylandia_zebra
ENSACLG00000017329-8474.613ENSMZEG00005020736-9174.613Maylandia_zebra
ENSACLG00000017329-8153.737ENSMALG00000004413-9953.737Monopterus_albus
ENSACLG00000017329-8148.936ENSNBRG00000013604-7048.936Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000017329-8746.078ENSNBRG00000015873-9746.809Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000017329-8242.017ENSNBRG00000015652-8442.017Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000017329-8448.254ENSNBRG00000016582-8648.254Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000017329-8350.806ENSNBRG00000016603-9050.806Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000017329-8374.030ENSONIG00000015166-10074.030Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000017329-8654.167ENSONIG00000008953-9954.167Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000017329-8566.800ENSONIG00000000122-9966.800Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000017329-8157.589ENSONIG00000001834-9957.589Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000017329-8652.381ENSONIG00000007931-8952.381Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000017329-8148.276ENSONIG00000020516-9748.276Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000017329-8252.941ENSONIG00000000093-9952.941Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000017329-8157.895ENSONIG00000021124-9957.895Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000017329-8343.662ENSORLG00015012951-8541.007Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000017329-9541.162ENSOGAG00000025289-8348.214Otolemur_garnettii
ENSACLG00000017329-8147.586ENSPANG00000030978-8847.586Papio_anubis
ENSACLG00000017329-8543.396ENSPEMG00000016975Zfp9407343.396Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACLG00000017329-9636.160ENSPMEG00000004595-9141.424Poecilia_mexicana
ENSACLG00000017329-8152.303ENSPPYG00000009906-7052.303Pongo_abelii
ENSACLG00000017329-8650.696ENSPNYG00000024244-9650.696Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000017329-8149.107ENSPNAG00000011625-8949.107Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000017329-8152.614ENSPNAG00000019338-9352.614Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000017329-8147.241ENSSBOG00000029728-8447.241Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACLG00000017329-8247.321ENSSPUG00000010059-8647.321Sphenodon_punctatus

Copyright © , Bioinformatics Center, Sun Yat-sen Memorial Hospital, Sun Yat-sen University, China. All Rights Reserved.

Any comment and suggestion, please contact us