EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000017411 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4868 bases
Position: chrLS419803.1:20980-25847
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSACLP00000025581	zf-C2H2	PF00096.26	2e-53	10	10
ENSACLP00000025581	zf-met	PF12874.7	8.6e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000026190	-	1197	-	ENSACLP00000025581	398 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

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ENSACLG00000017411	-	88	47.312	ENSACLG00000006718	-	75	47.312
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ENSACLG00000017411	-	90	42.105	ENSVVUG00000002015	-	95	40.000	Vulpes_vulpes
ENSACLG00000017411	-	88	43.253	ENSXETG00000034213	-	98	43.253	Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000017411	-	88	42.424	ENSXETG00000010512	-	99	35.152	Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000017411	-	90	41.038	ENSXETG00000030307	-	100	41.038	Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000017411	-	89	40.525	ENSXMAG00000000617	-	72	40.525	Xiphophorus_maculatus