EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000017422 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2360 bases
Position: chr3:24191111-24193470
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000025590	MMR_HSR1	PF01926.23	1.3e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000026199	-	1071	-	ENSACLP00000025590	356 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000017422	-	65	38.889	ENSACLG00000024857	-	54	38.889
ENSACLG00000017422	-	64	38.362	ENSACLG00000024854	-	74	38.362
ENSACLG00000017422	-	52	33.511	ENSACLG00000023509	-	78	33.511
ENSACLG00000017422	-	58	37.019	ENSACLG00000023502	-	84	37.019
ENSACLG00000017422	-	56	38.806	ENSACLG00000003401	-	79	38.806
ENSACLG00000017422	-	62	40.639	ENSACLG00000001954	-	94	37.184
ENSACLG00000017422	-	72	47.955	ENSACLG00000001892	-	77	39.402
ENSACLG00000017422	-	58	38.942	ENSACLG00000011578	-	83	38.942
ENSACLG00000017422	-	58	36.538	ENSACLG00000023600	-	83	36.538
ENSACLG00000017422	-	58	39.130	ENSACLG00000023525	-	67	39.130
ENSACLG00000017422	-	66	35.743	ENSACLG00000005659	-	78	35.743
ENSACLG00000017422	-	59	36.493	ENSACLG00000021959	-	80	34.221
ENSACLG00000017422	-	56	36.275	ENSACLG00000003276	-	74	36.275
ENSACLG00000017422	-	75	37.269	ENSACLG00000001968	-	92	37.269
ENSACLG00000017422	-	67	87.179	ENSACLG00000017459	-	97	87.179
ENSACLG00000017422	-	76	52.399	ENSACLG00000001790	-	90	52.399
ENSACLG00000017422	-	67	36.585	ENSACLG00000005066	-	81	36.585
ENSACLG00000017422	-	66	34.043	ENSACLG00000003290	-	86	34.043
ENSACLG00000017422	-	65	39.831	ENSACLG00000005232	-	85	39.831
ENSACLG00000017422	-	65	38.627	ENSACLG00000027607	-	68	38.627
ENSACLG00000017422	-	60	35.681	ENSACLG00000008006	-	57	35.681
ENSACLG00000017422	-	73	39.768	ENSACLG00000001976	-	92	38.095
ENSACLG00000017422	-	88	47.619	ENSACLG00000001800	-	85	46.538
ENSACLG00000017422	-	76	35.294	ENSACLG00000008592	-	97	35.294
ENSACLG00000017422	-	68	38.618	ENSACLG00000005220	-	56	38.618
ENSACLG00000017422	-	70	37.443	ENSACLG00000008397	-	92	37.443
ENSACLG00000017422	-	63	36.564	ENSACLG00000003262	-	83	36.564
ENSACLG00000017422	-	58	37.500	ENSACLG00000023760	-	83	37.500
ENSACLG00000017422	-	59	36.493	ENSACLG00000023555	-	85	36.493
ENSACLG00000017422	-	63	32.301	ENSACLG00000011921	-	73	32.301
ENSACLG00000017422	-	61	38.249	ENSACLG00000016904	-	87	36.709
ENSACLG00000017422	-	61	36.530	ENSACLG00000005669	-	80	35.294
ENSACLG00000017422	-	77	50.730	ENSACLG00000001896	-	76	50.730
ENSACLG00000017422	-	87	88.462	ENSACLG00000006534	-	84	88.462
ENSACLG00000017422	-	56	32.323	ENSACLG00000003393	-	75	32.323
ENSACLG00000017422	-	60	35.648	ENSACLG00000025976	-	83	34.420
ENSACLG00000017422	-	60	39.070	ENSACLG00000023766	zgc:113625	85	39.070
ENSACLG00000017422	-	74	50.566	ENSACLG00000001886	-	85	50.566
ENSACLG00000017422	-	72	51.751	ENSACLG00000001927	-	92	51.751
ENSACLG00000017422	-	58	36.538	ENSACLG00000023747	-	83	36.538
ENSACLG00000017422	-	59	37.089	ENSACLG00000011905	-	81	36.866
ENSACLG00000017422	-	73	36.364	ENSACLG00000026926	-	86	36.704
ENSACLG00000017422	-	65	37.872	ENSACLG00000009780	-	69	37.872
ENSACLG00000017422	-	66	37.238	ENSACLG00000009774	-	62	37.238
ENSACLG00000017422	-	81	48.110	ENSACLG00000001777	-	70	46.984
ENSACLG00000017422	-	88	39.269	ENSACLG00000010048	-	93	39.269
ENSACLG00000017422	-	92	93.293	ENSACLG00000003763	-	97	93.293
ENSACLG00000017422	-	79	45.035	ENSACLG00000017433	-	97	45.035
ENSACLG00000017422	-	61	40.553	ENSACLG00000016872	-	80	39.574
ENSACLG00000017422	-	61	39.726	ENSACLG00000016933	-	98	34.114
ENSACLG00000017422	-	60	38.532	ENSACLG00000004543	-	87	38.636
ENSACLG00000017422	-	73	37.548	ENSACLG00000001936	-	96	37.091
ENSACLG00000017422	-	67	30.290	ENSACLG00000014795	-	76	30.290
ENSACLG00000017422	-	77	51.095	ENSACLG00000001869	-	75	51.095
ENSACLG00000017422	-	54	37.949	ENSACLG00000005319	-	85	37.949
ENSACLG00000017422	-	79	45.745	ENSACLG00000003776	-	97	45.745
ENSACLG00000017422	-	65	37.344	ENSACLG00000024836	-	84	37.344
ENSACLG00000017422	-	67	38.819	ENSACLG00000016235	-	64	38.819
ENSACLG00000017422	-	75	45.714	ENSACLG00000001909	-	81	47.015
ENSACLG00000017422	-	59	37.736	ENSACLG00000021967	-	83	34.201
ENSACLG00000017422	-	66	39.091	ENSACLG00000011804	-	95	39.091
ENSACLG00000017422	-	61	33.180	ENSACLG00000011913	-	62	33.180
ENSACLG00000017422	-	67	37.449	ENSACLG00000008599	-	76	37.449
ENSACLG00000017422	-	60	38.710	ENSACLG00000011599	-	86	38.710
ENSACLG00000017422	-	76	41.525	ENSACLG00000004980	-	52	41.525
ENSACLG00000017422	-	61	30.876	ENSACLG00000016222	-	74	30.876
ENSACLG00000017422	-	58	38.835	ENSACLG00000021976	-	66	35.833
ENSACLG00000017422	-	58	36.058	ENSACLG00000011572	-	83	36.058
ENSACLG00000017422	-	87	47.335	ENSACLG00000001833	-	61	47.678

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000017422	-	58	40.097	ENSAPOG00000018915	-	85	40.097	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000017422	-	61	41.553	ENSAPOG00000002337	-	68	40.167	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000017422	-	58	38.942	ENSAPOG00000001075	-	91	38.942	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000017422	-	68	51.867	ENSAPOG00000002527	-	97	47.403	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000017422	-	57	31.068	ENSAPOG00000008819	-	86	31.884	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000017422	-	76	54.244	ENSAPOG00000000444	-	53	50.794	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000017422	-	58	38.647	ENSAPOG00000007123	-	73	38.647	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000017422	-	60	34.434	ENSAPOG00000020108	-	65	33.761	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000017422	-	68	35.391	ENSAPOG00000010738	-	75	35.391	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000017422	-	65	35.931	ENSAPOG00000021365	-	73	35.931	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000017422	-	67	36.555	ENSAPOG00000000066	-	64	36.555	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000017422	-	55	39.674	ENSAPOG00000009059	-	89	40.230	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000017422	-	57	49.020	ENSAPOG00000002517	-	71	49.020	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000017422	-	59	56.190	ENSAPOG00000009288	-	78	56.190	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000017422	-	58	39.524	ENSACIG00000007178	-	69	39.524	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000017422	-	61	36.530	ENSACIG00000012714	-	70	36.530	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000017422	-	65	38.462	ENSACIG00000022355	-	77	38.462	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000017422	-	64	37.069	ENSACIG00000022222	-	71	37.931	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000017422	-	50	38.547	ENSACIG00000000631	-	62	38.547	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000017422	-	66	35.417	ENSACIG00000016313	-	72	35.417	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000017422	-	58	38.756	ENSACIG00000012707	-	76	38.756	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000017422	-	73	47.710	ENSACIG00000005587	-	91	47.710	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000017422	-	60	39.908	ENSACIG00000002950	-	61	38.333	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000017422	-	52	32.447	ENSACIG00000019509	-	82	32.447	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000017422	-	61	53.456	ENSACIG00000005573	-	89	53.456	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000017422	-	68	36.437	ENSACIG00000005780	-	72	36.437	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000017422	-	66	37.603	ENSACIG00000019149	-	70	37.500	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000017422	-	60	37.156	ENSACIG00000006478	-	77	37.156	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000017422	-	57	41.176	ENSACIG00000007158	-	62	40.991	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000017422	-	63	35.622	ENSACIG00000012159	-	58	35.622	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000017422	-	70	37.209	ENSACIG00000006484	-	76	37.209	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000017422	-	65	39.744	ENSACIG00000016635	-	81	40.807	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000017422	-	72	48.249	ENSACIG00000012061	-	70	48.249	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000017422	-	56	56.219	ENSAOCG00000016099	-	89	56.219	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000017422	-	65	36.207	ENSAOCG00000015984	-	73	36.207	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000017422	-	59	35.849	ENSAOCG00000013326	-	72	35.849	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000017422	-	81	48.845	ENSAOCG00000016082	-	79	46.567	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000017422	-	56	56.219	ENSAPEG00000002121	-	89	56.219	Amphiprion_percula
ENSACLG00000017422	-	65	35.498	ENSAPEG00000003513	-	79	41.228	Amphiprion_percula
ENSACLG00000017422	-	60	34.742	ENSAPEG00000013508	-	86	34.742	Amphiprion_percula
ENSACLG00000017422	-	64	30.151	ENSAPEG00000008662	-	53	30.151	Amphiprion_percula
ENSACLG00000017422	-	58	55.072	ENSAPEG00000002163	-	71	55.072	Amphiprion_percula
ENSACLG00000017422	-	62	39.189	ENSAPEG00000021653	si:dkey-73p2.1	87	37.917	Amphiprion_percula
ENSACLG00000017422	-	56	35.323	ENSAPEG00000013532	-	98	35.323	Amphiprion_percula
ENSACLG00000017422	-	60	36.449	ENSAPEG00000019003	-	80	36.449	Amphiprion_percula
ENSACLG00000017422	-	69	37.549	ENSATEG00000011789	-	74	37.549	Anabas_testudineus
ENSACLG00000017422	-	84	48.675	ENSATEG00000010942	-	51	52.030	Anabas_testudineus
ENSACLG00000017422	-	57	40.291	ENSATEG00000011979	-	92	40.291	Anabas_testudineus
ENSACLG00000017422	-	57	54.902	ENSATEG00000010978	-	78	54.902	Anabas_testudineus
ENSACLG00000017422	-	65	32.068	ENSATEG00000019504	-	71	34.529	Anabas_testudineus
ENSACLG00000017422	-	61	38.636	ENSATEG00000011814	-	76	39.113	Anabas_testudineus
ENSACLG00000017422	-	70	42.248	ENSATEG00000010951	-	53	42.248	Anabas_testudineus
ENSACLG00000017422	-	58	35.714	ENSATEG00000011712	-	77	35.714	Anabas_testudineus
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ENSACLG00000017422	-	66	39.623	ENSATEG00000011931	-	84	39.623	Anabas_testudineus
ENSACLG00000017422	-	59	43.868	ENSATEG00000011820	-	73	43.868	Anabas_testudineus
ENSACLG00000017422	-	62	41.892	ENSATEG00000011953	-	65	41.322	Anabas_testudineus
ENSACLG00000017422	-	62	40.000	ENSATEG00000011635	-	74	38.430	Anabas_testudineus
ENSACLG00000017422	-	72	55.859	ENSATEG00000010991	-	98	55.859	Anabas_testudineus
ENSACLG00000017422	-	65	41.667	ENSATEG00000011594	-	75	41.667	Anabas_testudineus
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