EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000017448 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2484 bases
Position: chr12:881248-883731
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000025626	RVT_1	PF00078.27	2.3e-44	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000026238	-	2484	-	ENSACLP00000025626	827 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000017448	-	53	48.174	ENSACLG00000017402	-	94	48.174
ENSACLG00000017448	-	53	97.500	ENSACLG00000025562	-	100	97.500
ENSACLG00000017448	-	78	48.624	ENSACLG00000008859	-	96	48.624
ENSACLG00000017448	-	78	46.894	ENSACLG00000005570	-	99	46.894
ENSACLG00000017448	-	52	43.326	ENSACLG00000004754	-	99	43.326
ENSACLG00000017448	-	50	47.711	ENSACLG00000021583	-	99	47.711
ENSACLG00000017448	-	99	45.196	ENSACLG00000004826	-	97	45.196
ENSACLG00000017448	-	82	44.993	ENSACLG00000013061	-	94	44.993
ENSACLG00000017448	-	68	42.241	ENSACLG00000005642	-	99	42.241
ENSACLG00000017448	-	81	96.552	ENSACLG00000005212	-	100	96.552
ENSACLG00000017448	-	68	97.504	ENSACLG00000000182	-	100	97.504
ENSACLG00000017448	-	56	45.416	ENSACLG00000012094	-	97	45.416
ENSACLG00000017448	-	57	54.622	ENSACLG00000009011	-	99	54.622
ENSACLG00000017448	-	77	96.401	ENSACLG00000023557	-	99	96.401
ENSACLG00000017448	-	99	42.220	ENSACLG00000017412	-	88	42.220
ENSACLG00000017448	-	54	48.993	ENSACLG00000022877	-	99	48.993
ENSACLG00000017448	-	71	45.347	ENSACLG00000015659	-	99	45.347
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ENSACLG00000017448	-	99	97.445	ENSACLG00000009850	-	94	97.445
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ENSACLG00000017448	-	70	50.248	ENSACLG00000013805	-	68	50.248
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ENSACLG00000017448	-	63	46.286	ENSACLG00000013932	-	96	46.286
ENSACLG00000017448	-	64	45.455	ENSACLG00000018107	-	98	44.526
ENSACLG00000017448	-	56	30.603	ENSACLG00000006688	-	97	30.603
ENSACLG00000017448	-	99	97.202	ENSACLG00000022844	-	91	97.202
ENSACLG00000017448	-	78	50.693	ENSACLG00000022841	-	82	50.693
ENSACLG00000017448	-	90	41.278	ENSACLG00000009939	-	75	41.278
ENSACLG00000017448	-	54	97.098	ENSACLG00000001556	-	95	97.098
ENSACLG00000017448	-	99	41.425	ENSACLG00000021051	-	98	41.425
ENSACLG00000017448	-	99	95.134	ENSACLG00000005662	-	91	95.134
ENSACLG00000017448	-	80	40.545	ENSACLG00000015331	-	83	40.000
ENSACLG00000017448	-	83	96.221	ENSACLG00000018252	-	87	96.221
ENSACLG00000017448	-	53	97.955	ENSACLG00000017363	-	100	97.955
ENSACLG00000017448	-	99	96.837	ENSACLG00000025376	-	91	96.837
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ENSACLG00000017448	-	66	96.903	ENSACLG00000010664	-	98	96.903
ENSACLG00000017448	-	93	45.718	ENSACLG00000027996	-	99	46.048
ENSACLG00000017448	-	63	54.511	ENSACLG00000022853	-	97	54.511
ENSACLG00000017448	-	63	95.954	ENSACLG00000006327	-	100	95.954
ENSACLG00000017448	-	63	97.308	ENSACLG00000024400	-	100	97.308
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ENSACLG00000017448	-	81	97.019	ENSACLG00000001758	-	100	97.019
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ENSACLG00000017448	-	55	48.478	ENSACLG00000021937	-	96	48.478
ENSACLG00000017448	-	53	96.818	ENSACLG00000026769	-	100	96.818
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ENSACLG00000017448	-	67	47.197	ENSACLG00000010082	-	98	47.197
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ENSACLG00000017448	-	57	50.422	ENSACLG00000014537	-	99	50.422
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ENSACLG00000017448	-	82	44.993	ENSACLG00000017692	-	94	44.993
ENSACLG00000017448	-	99	45.089	ENSACLG00000008391	-	97	45.089
ENSACLG00000017448	-	65	97.207	ENSACLG00000015507	-	99	97.207
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ENSACLG00000017448	-	77	49.843	ENSACLG00000003670	-	99	49.843
ENSACLG00000017448	-	64	46.023	ENSACLG00000025957	-	99	46.023
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ENSACLG00000017448	-	62	30.545	ENSACLG00000008551	-	92	30.545
ENSACLG00000017448	-	56	48.298	ENSACLG00000014661	-	99	48.298
ENSACLG00000017448	-	53	96.818	ENSACLG00000020601	-	100	96.818
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ENSACLG00000017448	-	81	97.765	ENSACLG00000020183	-	100	97.765
ENSACLG00000017448	-	53	96.789	ENSACLG00000020184	-	95	96.789
ENSACLG00000017448	-	57	57.082	ENSACLG00000025009	-	99	57.082
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ENSACLG00000017448	-	53	97.727	ENSACLG00000004232	-	100	97.727
ENSACLG00000017448	-	99	97.202	ENSACLG00000012014	-	91	97.202
ENSACLG00000017448	-	77	49.373	ENSACLG00000014746	-	99	49.373
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ENSACLG00000017448	-	79	97.235	ENSACLG00000014915	-	100	97.235
ENSACLG00000017448	-	54	48.993	ENSACLG00000004998	-	99	48.993
ENSACLG00000017448	-	57	42.128	ENSACLG00000008218	-	100	42.128
ENSACLG00000017448	-	82	41.545	ENSACLG00000009807	-	94	41.545
ENSACLG00000017448	-	59	35.642	ENSACLG00000016231	-	83	34.827
ENSACLG00000017448	-	60	42.137	ENSACLG00000012352	-	99	42.137
ENSACLG00000017448	-	50	96.377	ENSACLG00000005746	-	94	96.377
ENSACLG00000017448	-	53	97.955	ENSACLG00000017093	-	100	97.955
ENSACLG00000017448	-	53	69.438	ENSACLG00000024587	-	100	78.409
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ENSACLG00000017448	-	66	46.751	ENSACLG00000015704	-	91	46.751
ENSACLG00000017448	-	57	97.034	ENSACLG00000019420	-	99	93.400
ENSACLG00000017448	-	82	44.183	ENSACLG00000005017	-	99	44.183
ENSACLG00000017448	-	99	41.959	ENSACLG00000009590	-	97	41.959
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ENSACLG00000017448	-	90	42.252	ENSACLG00000012019	-	99	42.252
ENSACLG00000017448	-	65	96.834	ENSACLG00000009903	-	95	96.834
ENSACLG00000017448	-	53	97.955	ENSACLG00000008572	-	100	97.955
ENSACLG00000017448	-	81	97.615	ENSACLG00000008571	-	100	97.615
ENSACLG00000017448	-	73	43.729	ENSACLG00000014642	-	99	43.729
ENSACLG00000017448	-	51	47.743	ENSACLG00000024568	-	99	47.743
ENSACLG00000017448	-	57	53.361	ENSACLG00000012219	-	99	53.361
ENSACLG00000017448	-	64	40.761	ENSACLG00000004144	-	72	40.761
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Orthologs

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ENSACLG00000017448	-	99	35.966	ENSATEG00000012907	-	84	36.209	Anabas_testudineus
ENSACLG00000017448	-	74	48.214	ENSATEG00000015490	-	99	48.214	Anabas_testudineus
ENSACLG00000017448	-	67	40.754	ENSATEG00000004798	-	97	40.754	Anabas_testudineus
ENSACLG00000017448	-	99	45.301	ENSATEG00000019512	-	96	45.301	Anabas_testudineus
ENSACLG00000017448	-	61	50.398	ENSATEG00000015931	-	99	50.398	Anabas_testudineus
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