EuRBPDB

  • Home
  • Cancer
  • Family
  • Species
  • RBPredictor
  • Search
  • Download
  • Submit
  • Help
  • Contact

  • Description
  • RBDs
  • Transcripts
  • Gene Model
  • PPI
  • Paralogs
  • Orthologs
Description
Ensembl ID
ENSACLG00000017449 (Gene tree)
Gene ID
-
Gene Symbol
-
Alias
-
Full Name
-
Gene Type
protein_coding
Species
Astatotilapia_calliptera
Status
putative
Strand
Minus strand
Length
94404 bases
Position
chrLS419803.1:111795-206198
Accession
-
RBP type
canonical RBP
Summary
-
RNA binding domains(RBDs)
Protein IDDomain Pfam IDE-value Domain number Total number
ENSACLP00000025641zf-C2H2PF00096.267.9e-2815
ENSACLP00000025641zf-C2H2PF00096.267.9e-2825
ENSACLP00000025641zf-C2H2PF00096.267.9e-2835
ENSACLP00000025641zf-C2H2PF00096.267.9e-2845
ENSACLP00000025641zf-C2H2PF00096.267.9e-2855
ENSACLP00000025641zf-metPF12874.71.2e-0712
ENSACLP00000025641zf-metPF12874.71.2e-0722
Transcripts
Transcript IDNameLengthRefSeq ID Protein IDLengthRefSeq IDUniportKB ID
ENSACLT00000026251-1308-ENSACLP00000025641435 (aa)--
Gene Model
Click here to download ENSACLG00000017449's gene model file
Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACLG00000017449's network
Paralogs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy ParalogGene SymbolCoverageIdentiy
ENSACLG00000017449-6236.296ENSACLG00000016841-6837.190
ENSACLG00000017449-7352.646ENSACLG00000017411-9759.516
ENSACLG00000017449-6441.279ENSACLG00000013935-8441.279
ENSACLG00000017449-6336.667ENSACLG00000017941-6237.037
ENSACLG00000017449-5840.465ENSACLG00000020339-5540.465
ENSACLG00000017449-6137.059ENSACLG00000027692-7437.059
ENSACLG00000017449-6946.193ENSACLG00000001507-9346.193
ENSACLG00000017449-6236.145ENSACLG00000015989-8636.726
ENSACLG00000017449-6538.672ENSACLG00000024491-9438.672
ENSACLG00000017449-6543.939ENSACLG00000011237-9943.939
ENSACLG00000017449-5941.791ENSACLG00000020393-8540.625
ENSACLG00000017449-6062.385ENSACLG00000014336-9662.385
ENSACLG00000017449-6034.831ENSACLG00000027424-6037.696
ENSACLG00000017449-5846.988ENSACLG00000025251-9341.036
ENSACLG00000017449-7446.108ENSACLG00000017329-9546.108
ENSACLG00000017449-6033.061ENSACLG00000005594ZNF3198933.061
ENSACLG00000017449-5841.104ENSACLG00000020260-10041.104
ENSACLG00000017449-5843.182ENSACLG00000001368-8743.182
ENSACLG00000017449-6440.860ENSACLG00000011239-7840.860
ENSACLG00000017449-5840.884ENSACLG00000017321-7940.884
ENSACLG00000017449-5844.444ENSACLG00000021343-9738.298
ENSACLG00000017449-5934.395ENSACLG00000017925-6632.765
ENSACLG00000017449-6542.697ENSACLG00000015843-9445.418
ENSACLG00000017449-9053.986ENSACLG00000014167-9557.468
ENSACLG00000017449-6851.515ENSACLG00000000487-8951.515
ENSACLG00000017449-5936.296ENSACLG00000005694-5033.613
ENSACLG00000017449-5834.783ENSACLG00000019424-9634.783
ENSACLG00000017449-5739.171ENSACLG00000018746-9337.566
ENSACLG00000017449-5974.031ENSACLG00000014600-9174.031
ENSACLG00000017449-6541.176ENSACLG00000023941-9941.897
ENSACLG00000017449-6253.759ENSACLG00000022475-9853.759
ENSACLG00000017449-6642.063ENSACLG00000022497-9642.063
ENSACLG00000017449-5840.097ENSACLG00000020615-5640.097
ENSACLG00000017449-7139.114ENSACLG00000007888-8742.453
ENSACLG00000017449-5738.068ENSACLG00000021045-7938.068
ENSACLG00000017449-6236.508ENSACLG00000017849-6436.508
ENSACLG00000017449-5737.778ENSACLG00000003679-8337.778
ENSACLG00000017449-6441.200ENSACLG00000019499-9541.200
ENSACLG00000017449-6245.029ENSACLG00000000411-9344.800
ENSACLG00000017449-6541.667ENSACLG00000023979-9641.667
ENSACLG00000017449-5858.659ENSACLG00000014365-9058.659
ENSACLG00000017449-5935.484ENSACLG00000017996prdm56935.484
ENSACLG00000017449-5739.623ENSACLG00000025163-8140.323
ENSACLG00000017449-5834.981ENSACLG00000020231-9434.981
ENSACLG00000017449-6541.429ENSACLG00000019270-8341.429
ENSACLG00000017449-6340.659ENSACLG00000019482-8643.671
ENSACLG00000017449-6052.381ENSACLG00000022482-8052.381
ENSACLG00000017449-5842.512ENSACLG00000001045-9742.512
ENSACLG00000017449-8433.668ENSACLG00000003546-8040.486
ENSACLG00000017449-6146.400ENSACLG00000023963-9646.400
ENSACLG00000017449-6640.571ENSACLG00000020975-8840.571
ENSACLG00000017449-6332.057ENSACLG00000020579znf319b8332.922
ENSACLG00000017449-5845.455ENSACLG00000005708-6545.455
ENSACLG00000017449-6340.845ENSACLG00000019318-9839.431
ENSACLG00000017449-5734.764ENSACLG00000008606-8835.955
ENSACLG00000017449-6854.313ENSACLG00000007749-8360.075
ENSACLG00000017449-6045.455ENSACLG00000012251-5145.455
ENSACLG00000017449-6543.548ENSACLG00000017336-9243.548
ENSACLG00000017449-6234.483ENSACLG00000026103znf5265034.483
ENSACLG00000017449-6942.745ENSACLG00000000473-8842.745
ENSACLG00000017449-5746.078ENSACLG00000018716-7846.078
ENSACLG00000017449-7142.604ENSACLG00000008821-9741.209
ENSACLG00000017449-5935.263ENSACLG00000006870-5635.263
ENSACLG00000017449-5875.510ENSACLG00000002844-8247.500
ENSACLG00000017449-6440.580ENSACLG00000017576-9239.655
ENSACLG00000017449-5742.424ENSACLG00000024459-8742.424
ENSACLG00000017449-5936.158ENSACLG00000017487-7136.316
ENSACLG00000017449-6255.660ENSACLG00000015816-9355.660
ENSACLG00000017449-6342.748ENSACLG00000003229-9643.496
ENSACLG00000017449-6939.245ENSACLG00000024308-9940.323
ENSACLG00000017449-5933.173ENSACLG00000000102-6032.620
ENSACLG00000017449-5931.982ENSACLG00000022305-8931.982
ENSACLG00000017449-5844.737ENSACLG00000018701-8145.185
ENSACLG00000017449-5739.333ENSACLG00000018700-9639.333
ENSACLG00000017449-5738.532ENSACLG00000005795-6638.532
ENSACLG00000017449-5842.012ENSACLG00000024957-9142.012
ENSACLG00000017449-5837.576ENSACLG00000005615-5537.576
ENSACLG00000017449-6769.231ENSACLG00000022302-9866.667
ENSACLG00000017449-5741.615ENSACLG00000024294-7241.615
ENSACLG00000017449-5966.102ENSACLG00000000521-9566.102
ENSACLG00000017449-6642.661ENSACLG00000023513-8043.689
ENSACLG00000017449-5738.922ENSACLG00000024670-8738.922
ENSACLG00000017449-6458.159ENSACLG00000022383-9458.159
ENSACLG00000017449-6577.500ENSACLG00000019674-9877.500
ENSACLG00000017449-6239.726ENSACLG00000008624-9539.726
ENSACLG00000017449-5850.617ENSACLG00000019349-7050.617
ENSACLG00000017449-5737.500ENSACLG00000008374-5837.500
ENSACLG00000017449-6544.622ENSACLG00000000537-9845.565
ENSACLG00000017449-6674.377ENSACLG00000013454-6977.509
ENSACLG00000017449-5944.309ENSACLG00000003332-9944.309
ENSACLG00000017449-5939.683ENSACLG00000011642-7837.815
ENSACLG00000017449-7677.465ENSACLG00000001003-9977.465
ENSACLG00000017449-5940.000ENSACLG00000026703-7040.000
ENSACLG00000017449-5739.056ENSACLG00000020474-8739.056
ENSACLG00000017449-6954.762ENSACLG00000006528-9654.762
ENSACLG00000017449-6132.558ENSACLG00000019167-8932.558
ENSACLG00000017449-6139.908ENSACLG00000015462-6139.908
ENSACLG00000017449-5839.674ENSACLG00000022505-8739.674
ENSACLG00000017449-5741.791ENSACLG00000020610-6541.600
ENSACLG00000017449-5834.400ENSACLG00000006702-7634.400
ENSACLG00000017449-6447.710ENSACLG00000022360-9347.710
ENSACLG00000017449-5838.164ENSACLG00000020268-5836.364
ENSACLG00000017449-5339.645ENSACLG00000025196-8239.645
ENSACLG00000017449-5740.373ENSACLG00000024647-9340.373
ENSACLG00000017449-5837.245ENSACLG00000017801-5537.245
ENSACLG00000017449-6644.815ENSACLG00000019291-9643.206
ENSACLG00000017449-6747.550ENSACLG00000021846-9850.000
ENSACLG00000017449-5737.576ENSACLG00000022439-7937.791
ENSACLG00000017449-6339.766ENSACLG00000017939-9839.634
ENSACLG00000017449-6143.548ENSACLG00000001018-8843.775
ENSACLG00000017449-5951.613ENSACLG00000014176-8650.794
ENSACLG00000017449-5884.211ENSACLG00000013531-8984.211
ENSACLG00000017449-6945.556ENSACLG00000022499-9243.083
ENSACLG00000017449-6939.759ENSACLG00000023305-9939.759
ENSACLG00000017449-5740.526ENSACLG00000026538-9640.526
ENSACLG00000017449-5840.323ENSACLG00000006697-6340.323
ENSACLG00000017449-5740.408ENSACLG00000021056-5440.408
ENSACLG00000017449-6679.474ENSACLG00000013033-9979.474
ENSACLG00000017449-5847.090ENSACLG00000028002-9147.090
Orthologs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy OrthologGene SymbolCoverageIdentiy Species
ENSACLG00000017449-5737.849ENSACIG00000000360si:ch211-241b2.18737.849Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000017449-5837.226ENSACIG00000007882-7337.079Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000017449-5760.227ENSACIG00000008886znf11649460.227Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000017449-5935.263ENSATEG00000008683si:ch211-241b2.17535.263Anabas_testudineus
ENSACLG00000017449-5843.750ENSAMXG00000041650-8543.750Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017449-5744.175ENSAMXG00000043291-6444.175Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017449-5932.934ENSCSEG00000015585-7632.934Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000017449-5841.410ENSDARG00000106565CABZ01066720.19141.410Danio_rerio
ENSACLG00000017449-5840.157ENSDARG00000113011zgc:1131028340.157Danio_rerio
ENSACLG00000017449-6338.662ENSDARG00000099890CU207221.29638.662Danio_rerio
ENSACLG00000017449-5842.169ENSDARG00000097521si:dkey-111k8.58742.169Danio_rerio
ENSACLG00000017449-5942.373ENSDARG00000100361znf11747241.520Danio_rerio
ENSACLG00000017449-5943.182ENSDARG00000102401znf10019343.182Danio_rerio
ENSACLG00000017449-6241.290ENSDARG00000111614znf11839141.290Danio_rerio
ENSACLG00000017449-5842.857ENSDARG00000088507znf9828242.857Danio_rerio
ENSACLG00000017449-5939.370ENSDARG00000105074BX000701.28939.370Danio_rerio
ENSACLG00000017449-6039.044ENSDARG00000103530zgc:1131029539.044Danio_rerio
ENSACLG00000017449-6040.726ENSDARG00000099731CABZ01066719.19440.726Danio_rerio
ENSACLG00000017449-6046.269ENSDARG00000100882znf11547546.269Danio_rerio
ENSACLG00000017449-5743.182ENSDARG00000099618si:dkey-1b17.69243.182Danio_rerio
ENSACLG00000017449-5743.750ENSDARG00000109703FO834825.18043.600Danio_rerio
ENSACLG00000017449-5841.420ENSDARG00000101694znf11848241.420Danio_rerio
ENSACLG00000017449-6439.526ENSDARG00000102678znf11817439.526Danio_rerio
ENSACLG00000017449-5840.606ENSDARG00000098248CABZ01081730.19040.606Danio_rerio
ENSACLG00000017449-5844.444ENSDARG00000053165zgc:1133778044.444Danio_rerio
ENSACLG00000017449-6137.778ENSDARG00000099172BX000701.19238.400Danio_rerio
ENSACLG00000017449-5839.442ENSDARG00000098923zgc:1735779639.442Danio_rerio
ENSACLG00000017449-5943.182ENSDARG00000115857znf10019343.182Danio_rerio
ENSACLG00000017449-5847.887ENSDARG00000092605znf10037147.887Danio_rerio
ENSACLG00000017449-5841.921ENSDARG00000078814si:dkey-34m19.37941.921Danio_rerio
ENSACLG00000017449-6039.844ENSDARG00000094736znf11578541.209Danio_rerio
ENSACLG00000017449-5840.606ENSDARG00000100803zgc:1735178940.606Danio_rerio
ENSACLG00000017449-5739.918ENSDARG00000103777znf10019839.918Danio_rerio
ENSACLG00000017449-6240.964ENSDARG00000105056znf45l9140.964Danio_rerio
ENSACLG00000017449-5938.991ENSEBUG00000015073-8638.991Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000017449-5938.983ENSFHEG00000018209-7238.983Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000017449-5837.766ENSFHEG00000013152-6237.766Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000017449-5739.394ENSFHEG00000018009-5139.394Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000017449-5741.176ENSFHEG00000014023-5141.176Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000017449-5739.394ENSHBUG00000018916-6139.053Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000017449-6337.576ENSHBUG00000009953-6937.576Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000017449-5842.424ENSKMAG00000009563-8342.424Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000017449-8534.135ENSLBEG00000028628znf11747933.184Labrus_bergylta
ENSACLG00000017449-6631.660ENSMAMG00000014743-5731.660Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000017449-5737.917ENSMZEG00005007426-6439.053Maylandia_zebra
ENSACLG00000017449-5839.535ENSMZEG00005027793-7439.535Maylandia_zebra
ENSACLG00000017449-5740.698ENSMZEG00005025729-8740.698Maylandia_zebra
ENSACLG00000017449-6839.024ENSMZEG00005027943-9842.149Maylandia_zebra
ENSACLG00000017449-5841.096ENSMZEG00005026470-5541.096Maylandia_zebra
ENSACLG00000017449-5854.128ENSMZEG00005005162-8054.128Maylandia_zebra
ENSACLG00000017449-5883.529ENSMZEG00005022161-8983.529Maylandia_zebra
ENSACLG00000017449-6275.697ENSMZEG00005025568-8475.697Maylandia_zebra
ENSACLG00000017449-6440.094ENSMZEG00005021426-8642.654Maylandia_zebra
ENSACLG00000017449-5937.500ENSMALG00000008638-6037.500Monopterus_albus
ENSACLG00000017449-6037.611ENSMALG00000018074-6140.367Monopterus_albus
ENSACLG00000017449-7243.503ENSNBRG00000000577-9243.503Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000017449-5773.134ENSONIG00000013908-10073.134Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000017449-5856.542ENSONIG00000003363-10056.542Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000017449-5844.891ENSONIG00000006585-9950.901Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000017449-5840.278ENSPKIG00000019848-5140.278Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000017449-5432.143ENSPMGG00000001558znf11745432.143Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000017449-5835.152ENSPFOG00000011766-9935.152Poecilia_formosa
ENSACLG00000017449-5839.474ENSPFOG00000001144-10039.474Poecilia_formosa
ENSACLG00000017449-5840.984ENSPLAG00000016561zgc:1133489836.471Poecilia_latipinna
ENSACLG00000017449-6140.435ENSPMEG00000007573zgc:1133436340.435Poecilia_mexicana
ENSACLG00000017449-6138.532ENSPREG00000001514zgc:1133436338.532Poecilia_reticulata
ENSACLG00000017449-6133.889ENSPREG00000014105-8936.905Poecilia_reticulata
ENSACLG00000017449-6133.133ENSPREG00000005538-7233.133Poecilia_reticulata
ENSACLG00000017449-5873.770ENSPNYG00000024183zgc:1735779873.770Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000017449-5346.250ENSSDUG00000008682-8546.250Seriola_dumerili
ENSACLG00000017449-5736.257ENSSPAG00000013109si:ch211-241b2.16834.361Stegastes_partitus
ENSACLG00000017449-6338.323ENSSPAG00000006539-9738.323Stegastes_partitus
ENSACLG00000017449-5733.143ENSSPAG00000009426-6533.143Stegastes_partitus
ENSACLG00000017449-6134.752ENSTNIG00000000277-9434.752Tetraodon_nigroviridis
ENSACLG00000017449-6138.750ENSXCOG00000017871zgc:1133436638.750Xiphophorus_couchianus
ENSACLG00000017449-6138.750ENSXMAG00000019923zgc:1133436338.750Xiphophorus_maculatus

Copyright © , Bioinformatics Center, Sun Yat-sen Memorial Hospital, Sun Yat-sen University, China. All Rights Reserved.

Any comment and suggestion, please contact us