EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000017576 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 78763 bases
Position: chr18:558794-637556
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000025926	zf-C2H2	PF00096.26	2e-85	1	15
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ENSACLP00000025926	zf-C2H2	PF00096.26	2e-85	4	15
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ENSACLP00000025926	zf-C2H2	PF00096.26	2e-85	8	15
ENSACLP00000025926	zf-C2H2	PF00096.26	2e-85	9	15
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ENSACLP00000025926	zf-C2H2	PF00096.26	2e-85	15	15
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ENSACLP00000025859	zf-C2H2	PF00096.26	2.4e-54	2	9
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ENSACLP00000025901	zf-C2H2	PF00096.26	2.6e-52	3	8
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ENSACLP00000025901	zf-C2H2	PF00096.26	2.6e-52	5	8
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ENSACLP00000025901	zf-C2H2	PF00096.26	2.6e-52	7	8
ENSACLP00000025901	zf-C2H2	PF00096.26	2.6e-52	8	8
ENSACLP00000025926	zf-met	PF12874.7	1.3e-15	1	1
ENSACLP00000025859	zf-met	PF12874.7	3e-10	1	1

Transcripts

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Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000017576	-	83	48.201	ENSACLG00000014336	-	93	48.201
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ENSACLG00000017576	-	85	41.935	ENSACLG00000006702	-	78	41.935
ENSACLG00000017576	-	86	41.584	ENSACLG00000012046	-	73	45.205
ENSACLG00000017576	-	89	47.619	ENSACLG00000020339	-	78	46.639
ENSACLG00000017576	-	84	43.275	ENSACLG00000008606	-	88	43.275
ENSACLG00000017576	-	89	44.030	ENSACLG00000015989	-	96	43.657
ENSACLG00000017576	-	93	52.500	ENSACLG00000024294	-	89	52.500
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ENSACLG00000017576	-	87	47.653	ENSACLG00000015462	-	64	47.985
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ENSACLG00000017576	-	92	46.380	ENSOARG00000002896	-	78	49.632	Ovis_aries
ENSACLG00000017576	-	89	48.736	ENSPPAG00000038086	ZNF808	77	48.736	Pan_paniscus
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ENSACLG00000017576	-	86	47.405	ENSPSIG00000008588	-	100	51.449	Pelodiscus_sinensis
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ENSACLG00000017576	-	90	51.724	ENSPCIG00000018929	-	94	52.465	Phascolarctos_cinereus
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ENSACLG00000017576	-	91	52.281	ENSRNOG00000043341	Zfp51	87	48.966	Rattus_norvegicus
ENSACLG00000017576	-	92	50.871	ENSRBIG00000032168	-	81	50.871	Rhinopithecus_bieti
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ENSACLG00000017576	-	96	51.736	ENSUMAG00000024602	-	99	53.261	Ursus_maritimus
ENSACLG00000017576	-	97	53.846	ENSXETG00000016781	-	99	55.160	Xenopus_tropicalis