EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000017621 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2042 bases
Position: chr9:31012355-31014396
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000025892	zf-C2H2	PF00096.26	4.7e-13	1	2
ENSACLP00000025892	zf-C2H2	PF00096.26	4.7e-13	2	2
ENSACLP00000025892	zf-met	PF12874.7	1.6e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000026506	-	903	-	ENSACLP00000025892	300 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000017621	-	55	38.849	ENSACLG00000017576	-	88	39.735
ENSACLG00000017621	-	68	39.568	ENSACLG00000017321	-	70	39.568
ENSACLG00000017621	-	52	36.364	ENSACLG00000020579	znf319b	80	36.364
ENSACLG00000017621	-	75	33.813	ENSACLG00000019167	-	80	35.878
ENSACLG00000017621	-	66	36.957	ENSACLG00000023941	-	89	35.862
ENSACLG00000017621	-	74	37.681	ENSACLG00000018701	-	84	37.681
ENSACLG00000017621	-	50	33.951	ENSACLG00000014600	-	72	33.951
ENSACLG00000017621	-	50	44.898	ENSACLG00000018746	-	88	36.641
ENSACLG00000017621	-	70	36.986	ENSACLG00000024308	-	92	37.086
ENSACLG00000017621	-	52	36.957	ENSACLG00000008606	-	87	36.957
ENSACLG00000017621	-	57	36.957	ENSACLG00000019499	-	88	36.957
ENSACLG00000017621	-	58	43.478	ENSACLG00000015989	-	86	43.478
ENSACLG00000017621	-	55	43.307	ENSACLG00000023979	-	96	43.307
ENSACLG00000017621	-	53	36.054	ENSACLG00000019291	-	88	36.054
ENSACLG00000017621	-	52	37.956	ENSACLG00000021045	-	78	37.956
ENSACLG00000017621	-	56	38.406	ENSACLG00000020615	-	58	38.406
ENSACLG00000017621	-	74	42.336	ENSACLG00000020610	-	77	42.336
ENSACLG00000017621	-	55	37.143	ENSACLG00000019482	-	82	37.143
ENSACLG00000017621	-	60	39.568	ENSACLG00000025251	-	93	37.956
ENSACLG00000017621	-	53	39.130	ENSACLG00000003229	-	93	39.130
ENSACLG00000017621	-	53	35.507	ENSACLG00000017329	-	80	35.507
ENSACLG00000017621	-	50	38.406	ENSACLG00000013935	-	83	38.406
ENSACLG00000017621	-	62	39.130	ENSACLG00000023963	-	96	39.130
ENSACLG00000017621	-	59	38.000	ENSACLG00000011237	-	100	34.532
ENSACLG00000017621	-	52	38.655	ENSACLG00000014365	-	87	33.333
ENSACLG00000017621	-	74	37.143	ENSACLG00000026538	-	91	37.143
ENSACLG00000017621	-	50	40.146	ENSACLG00000027424	-	61	40.146
ENSACLG00000017621	-	61	35.211	ENSACLG00000022482	-	77	35.211
ENSACLG00000017621	-	53	45.455	ENSACLG00000001368	-	86	45.455
ENSACLG00000017621	-	76	39.200	ENSACLG00000022383	-	90	39.200
ENSACLG00000017621	-	71	37.226	ENSACLG00000012251	-	61	37.226
ENSACLG00000017621	-	55	34.507	ENSACLG00000022360	-	90	34.507
ENSACLG00000017621	-	57	40.288	ENSACLG00000001003	-	89	40.288
ENSACLG00000017621	-	71	32.298	ENSACLG00000022439	-	92	32.298
ENSACLG00000017621	-	60	36.957	ENSACLG00000022302	-	98	36.957
ENSACLG00000017621	-	50	34.899	ENSACLG00000023305	-	70	34.899
ENSACLG00000017621	-	51	38.406	ENSACLG00000014176	-	85	38.406
ENSACLG00000017621	-	60	36.957	ENSACLG00000015843	-	94	36.957
ENSACLG00000017621	-	51	32.099	ENSACLG00000006870	-	63	35.714
ENSACLG00000017621	-	54	35.948	ENSACLG00000005594	ZNF319	83	35.948
ENSACLG00000017621	-	65	40.146	ENSACLG00000020393	-	92	41.304
ENSACLG00000017621	-	77	35.766	ENSACLG00000024957	-	96	35.766
ENSACLG00000017621	-	50	40.816	ENSACLG00000020268	-	61	40.816
ENSACLG00000017621	-	55	39.130	ENSACLG00000007749	-	78	39.130
ENSACLG00000017621	-	86	39.773	ENSACLG00000017487	-	99	39.773
ENSACLG00000017621	-	74	32.117	ENSACLG00000017925	-	78	35.766
ENSACLG00000017621	-	57	38.095	ENSACLG00000001045	-	97	37.410
ENSACLG00000017621	-	54	38.356	ENSACLG00000019318	-	90	38.356
ENSACLG00000017621	-	56	35.227	ENSACLG00000003679	-	82	35.227
ENSACLG00000017621	-	74	32.298	ENSACLG00000023513	-	98	32.298
ENSACLG00000017621	-	70	32.143	ENSACLG00000017939	-	96	36.154
ENSACLG00000017621	-	72	38.776	ENSACLG00000015462	-	74	38.776
ENSACLG00000017621	-	59	34.437	ENSACLG00000005708	-	61	36.879
ENSACLG00000017621	-	53	35.766	ENSACLG00000024647	-	94	34.211
ENSACLG00000017621	-	51	38.406	ENSACLG00000000537	-	97	36.957
ENSACLG00000017621	-	77	35.443	ENSACLG00000024459	-	92	35.443
ENSACLG00000017621	-	53	37.143	ENSACLG00000022505	-	94	36.242
ENSACLG00000017621	-	59	33.813	ENSACLG00000022475	-	90	33.813
ENSACLG00000017621	-	54	34.783	ENSACLG00000022499	-	86	34.783
ENSACLG00000017621	-	62	34.946	ENSACLG00000005795	-	68	34.946
ENSACLG00000017621	-	69	35.971	ENSACLG00000020975	-	87	35.971
ENSACLG00000017621	-	50	44.604	ENSACLG00000020260	-	99	44.604
ENSACLG00000017621	-	59	39.416	ENSACLG00000003332	-	96	39.416
ENSACLG00000017621	-	61	36.620	ENSACLG00000008821	-	87	37.589
ENSACLG00000017621	-	56	36.522	ENSACLG00000006702	-	68	36.522
ENSACLG00000017621	-	51	35.766	ENSACLG00000025866	GZF1	50	35.766
ENSACLG00000017621	-	51	36.232	ENSACLG00000005615	-	50	36.232
ENSACLG00000017621	-	59	37.063	ENSACLG00000022497	-	86	37.063
ENSACLG00000017621	-	69	41.096	ENSACLG00000021343	-	95	40.000
ENSACLG00000017621	-	63	41.026	ENSACLG00000020231	-	94	41.026
ENSACLG00000017621	-	59	35.503	ENSACLG00000006697	-	63	35.503
ENSACLG00000017621	-	51	37.273	ENSACLG00000017941	-	61	37.273

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000017621	-	65	41.606	ENSAPOG00000021980	-	96	41.606	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000017621	-	57	43.165	ENSAPOG00000005259	-	81	42.553	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000017621	-	67	32.609	ENSAPOG00000022174	-	88	36.364	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000017621	-	52	45.614	ENSACIG00000009717	-	89	45.614	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000017621	-	56	39.437	ENSACIG00000023212	-	79	39.437	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000017621	-	87	43.165	ENSAOCG00000013978	-	87	40.146	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000017621	-	50	35.065	ENSAOCG00000007388	-	55	35.065	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000017621	-	75	37.671	ENSAPEG00000013550	-	99	37.671	Amphiprion_percula
ENSACLG00000017621	-	64	43.165	ENSAPEG00000012217	-	64	42.446	Amphiprion_percula
ENSACLG00000017621	-	50	34.868	ENSAMXG00000029059	-	63	36.364	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017621	-	56	38.406	ENSCSAVG00000000690	-	99	38.406	Ciona_savignyi
ENSACLG00000017621	-	61	35.811	ENSCSAVG00000006650	-	99	33.125	Ciona_savignyi
ENSACLG00000017621	-	54	43.038	ENSCSAVG00000006141	-	99	43.038	Ciona_savignyi
ENSACLG00000017621	-	59	39.041	ENSCSAVG00000006608	-	100	38.400	Ciona_savignyi
ENSACLG00000017621	-	65	32.374	ENSCSAVG00000006745	-	78	32.374	Ciona_savignyi
ENSACLG00000017621	-	50	34.043	ENSCVAG00000018485	-	94	34.043	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000017621	-	98	51.980	ENSCVAG00000013048	-	80	51.980	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000017621	-	72	45.455	ENSCVAG00000002506	-	93	45.455	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000017621	-	65	37.209	ENSCVAG00000002500	-	86	37.324	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000017621	-	56	35.507	FBgn0020309	crol	55	34.737	Drosophila_melanogaster
ENSACLG00000017621	-	57	35.758	ENSFHEG00000013792	-	98	35.758	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000017621	-	59	43.066	ENSFHEG00000015571	-	74	43.066	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000017621	-	57	44.755	ENSFHEG00000013486	-	81	44.755	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000017621	-	55	43.262	ENSFHEG00000007396	-	78	43.262	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000017621	-	52	40.876	ENSFHEG00000006765	-	57	40.876	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000017621	-	56	43.796	ENSFHEG00000005993	-	78	40.625	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000017621	-	55	45.890	ENSFHEG00000003405	-	71	45.890	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000017621	-	59	40.288	ENSFHEG00000013820	-	65	40.288	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000017621	-	80	40.136	ENSFHEG00000013302	-	92	40.136	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000017621	-	66	38.202	ENSFHEG00000013625	-	76	38.202	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000017621	-	66	40.146	ENSFHEG00000016540	-	82	41.525	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000017621	-	53	41.606	ENSFHEG00000013803	-	73	41.606	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000017621	-	54	46.429	ENSFHEG00000017989	-	70	46.429	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000017621	-	72	42.466	ENSFHEG00000021003	-	75	42.466	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000017621	-	52	39.310	ENSGAFG00000011278	-	59	39.310	Gambusia_affinis
ENSACLG00000017621	-	74	40.146	ENSGAFG00000014188	-	97	42.105	Gambusia_affinis
ENSACLG00000017621	-	71	36.691	ENSGAFG00000011999	-	93	36.691	Gambusia_affinis
ENSACLG00000017621	-	97	64.444	ENSGAFG00000003119	-	83	64.444	Gambusia_affinis
ENSACLG00000017621	-	73	40.146	ENSGAFG00000012733	-	57	40.146	Gambusia_affinis
ENSACLG00000017621	-	53	34.109	ENSHCOG00000008601	-	77	34.109	Hippocampus_comes
ENSACLG00000017621	-	53	39.865	ENSHCOG00000020972	-	94	39.865	Hippocampus_comes
ENSACLG00000017621	-	68	36.752	ENSHCOG00000010332	-	75	36.752	Hippocampus_comes
ENSACLG00000017621	-	76	42.143	ENSKMAG00000020025	-	87	42.143	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000017621	-	52	39.416	ENSKMAG00000008316	-	83	39.416	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000017621	-	50	55.376	ENSLBEG00000027993	-	78	49.091	Labrus_bergylta
ENSACLG00000017621	-	61	36.232	ENSLACG00000017381	-	82	35.772	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000017621	-	63	35.766	ENSLOCG00000016466	-	98	35.766	Lepisosteus_oculatus
ENSACLG00000017621	-	53	37.063	ENSMAMG00000000789	-	67	37.063	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000017621	-	54	37.063	ENSMALG00000009834	-	93	35.593	Monopterus_albus
ENSACLG00000017621	-	54	33.065	ENSNBRG00000024294	-	63	33.065	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000017621	-	51	31.452	ENSNBRG00000006757	-	75	31.013	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000017621	-	64	44.526	ENSONIG00000019044	-	99	44.526	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000017621	-	69	40.146	ENSONIG00000018058	-	100	41.606	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000017621	-	51	42.336	ENSONIG00000018045	-	99	42.336	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000017621	-	54	38.760	ENSORLG00000025717	-	98	37.956	Oryzias_latipes
ENSACLG00000017621	-	67	37.956	ENSORLG00000000253	-	90	40.260	Oryzias_latipes
ENSACLG00000017621	-	73	35.897	ENSORLG00000027822	-	97	32.026	Oryzias_latipes
ENSACLG00000017621	-	54	38.686	ENSORLG00000027982	-	96	38.686	Oryzias_latipes
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