EuRBPDB

  • Home
  • Cancer
  • Family
  • Species
  • RBPredictor
  • Search
  • Download
  • Submit
  • Help
  • Contact

  • Description
  • RBDs
  • Transcripts
  • Gene Model
  • PPI
  • Paralogs
  • Orthologs
Description
Ensembl ID
ENSACLG00000017671 (Gene tree)
Gene ID
-
Gene Symbol
-
Alias
-
Full Name
-
Gene Type
protein_coding
Species
Astatotilapia_calliptera
Status
putative
Strand
Plus strand
Length
3357 bases
Position
chrLS419803.1:371823-375179
Accession
-
RBP type
canonical RBP
Summary
-
RNA binding domains(RBDs)
Protein IDDomain Pfam IDE-value Domain number Total number
ENSACLP00000025974RVT_1PF00078.272.1e-3011
Transcripts
Transcript IDNameLengthRefSeq ID Protein IDLengthRefSeq IDUniportKB ID
ENSACLT00000026588-3357-ENSACLP000000259741118 (aa)--
Gene Model
Click here to download ENSACLG00000017671's gene model file
Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACLG00000017671's network
Paralogs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy ParalogGene SymbolCoverageIdentiy
ENSACLG00000017671-7136.715ENSACLG00000002180-5236.715
ENSACLG00000017671-5533.233ENSACLG00000027633-5733.034
ENSACLG00000017671-5533.082ENSACLG00000018325-5531.477
ENSACLG00000017671-6735.977ENSACLG00000000373-5135.977
ENSACLG00000017671-7164.500ENSACLG00000001434-9364.500
ENSACLG00000017671-7039.320ENSACLG00000027627-6639.320
ENSACLG00000017671-6939.583ENSACLG00000009628-5338.964
ENSACLG00000017671-6837.628ENSACLG00000007343-9437.423
ENSACLG00000017671-6642.760ENSACLG00000006945-5342.955
ENSACLG00000017671-5631.343ENSACLG00000022170-6931.343
ENSACLG00000017671-5635.731ENSACLG00000008010-5735.731
ENSACLG00000017671-6939.815ENSACLG00000025719-5339.189
ENSACLG00000017671-6932.358ENSACLG00000027618-5432.358
ENSACLG00000017671-7237.269ENSACLG00000013455-5137.269
ENSACLG00000017671-6440.185ENSACLG00000005531-5440.185
ENSACLG00000017671-6137.194ENSACLG00000014688-5937.194
ENSACLG00000017671-6642.760ENSACLG00000003799-6033.956
ENSACLG00000017671-6139.518ENSACLG00000015880-5339.518
ENSACLG00000017671-6435.601ENSACLG00000002182-5535.601
ENSACLG00000017671-6435.601ENSACLG00000019658-5535.601
ENSACLG00000017671-6735.977ENSACLG00000012657-5135.977
ENSACLG00000017671-5234.840ENSACLG00000001267-5334.840
ENSACLG00000017671-6837.838ENSACLG00000018181-8237.838
ENSACLG00000017671-5630.689ENSACLG00000018225-5530.689
ENSACLG00000017671-5936.896ENSACLG00000008862-8836.896
ENSACLG00000017671-7898.292ENSACLG00000025657-10098.292
ENSACLG00000017671-6738.916ENSACLG00000026879-5038.916
ENSACLG00000017671-9054.845ENSACLG00000022094-9955.263
ENSACLG00000017671-6438.851ENSACLG00000001282-5238.851
ENSACLG00000017671-7537.876ENSACLG00000017161-5637.876
ENSACLG00000017671-5437.433ENSACLG00000001563-6037.433
ENSACLG00000017671-8954.785ENSACLG00000008738-9155.068
ENSACLG00000017671-6434.545ENSACLG00000018454-6633.925
ENSACLG00000017671-7237.269ENSACLG00000003361-5137.269
ENSACLG00000017671-6637.978ENSACLG00000016624-5537.978
ENSACLG00000017671-6840.662ENSACLG00000013947-7340.662
ENSACLG00000017671-7334.937ENSACLG00000000384-5334.937
ENSACLG00000017671-5834.977ENSACLG00000027730-6834.824
ENSACLG00000017671-5939.080ENSACLG00000010542-5239.080
ENSACLG00000017671-6939.583ENSACLG00000024091-5338.964
ENSACLG00000017671-6733.405ENSACLG00000013171-5133.191
ENSACLG00000017671-7234.171ENSACLG00000016581-7734.247
ENSACLG00000017671-5836.854ENSACLG00000019876-5236.706
ENSACLG00000017671-6733.405ENSACLG00000001555-5033.405
ENSACLG00000017671-5839.259ENSACLG00000024556-7738.298
ENSACLG00000017671-6637.978ENSACLG00000009118-5437.978
ENSACLG00000017671-5639.310ENSACLG00000018344-5439.310
ENSACLG00000017671-6436.298ENSACLG00000021770-5036.298
ENSACLG00000017671-6340.181ENSACLG00000003852-5340.181
ENSACLG00000017671-6233.333ENSACLG00000024387-6033.333
ENSACLG00000017671-5836.854ENSACLG00000014619-5336.706
ENSACLG00000017671-6136.879ENSACLG00000019989-7736.879
Orthologs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy OrthologGene SymbolCoverageIdentiy Species
ENSACLG00000017671-9059.703ENSATEG00000007261-9959.703Anabas_testudineus
ENSACLG00000017671-9359.793ENSATEG00000018457-9759.623Anabas_testudineus
ENSACLG00000017671-9059.703ENSATEG00000021232-9959.703Anabas_testudineus
ENSACLG00000017671-6143.394ENSACAG00000028272-10043.394Anolis_carolinensis
ENSACLG00000017671-6941.019ENSACAG00000028286-9840.804Anolis_carolinensis
ENSACLG00000017671-6941.019ENSACAG00000029679-9240.438Anolis_carolinensis
ENSACLG00000017671-7138.785ENSACAG00000029570-6438.785Anolis_carolinensis
ENSACLG00000017671-6840.340ENSACAG00000029095-8840.122Anolis_carolinensis
ENSACLG00000017671-7037.605ENSACAG00000028334-6137.605Anolis_carolinensis
ENSACLG00000017671-6537.230ENSACAG00000029297-6037.230Anolis_carolinensis
ENSACLG00000017671-5659.036ENSAMXG00000033786-9359.036Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017671-9848.827ENSAMXG00000033138-7748.833Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017671-9650.366ENSAMXG00000036523-6650.137Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017671-9550.092ENSAMXG00000042521-8549.632Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017671-9552.685ENSAMXG00000040695-7552.337Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017671-6850.573ENSAMXG00000038310-8649.936Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017671-9550.507ENSAMXG00000040104-6550.415Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017671-8951.241ENSAMXG00000031305-9752.818Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017671-7354.337ENSAMXG00000037157-9554.337Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017671-9750.226ENSAMXG00000040149-7049.864Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017671-7567.101ENSCVAG00000020653-9567.101Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000017671-9450.696ENSDARG00000112601FO704673.17650.682Danio_rerio
ENSACLG00000017671-9659.762ENSDARG00000113243BX511224.17659.375Danio_rerio
ENSACLG00000017671-8962.200ENSDARG00000086495BX546500.17462.200Danio_rerio
ENSACLG00000017671-9759.381ENSDARG00000099359CR855320.17658.995Danio_rerio
ENSACLG00000017671-9847.551ENSDARG00000116832CR749164.17647.619Danio_rerio
ENSACLG00000017671-9858.839ENSDARG00000116402CR925755.27759.467Danio_rerio
ENSACLG00000017671-9659.871ENSDARG00000113678BX511082.17660.037Danio_rerio
ENSACLG00000017671-9958.630ENSDARG00000114583BX890543.17759.173Danio_rerio
ENSACLG00000017671-7851.818ENSDARG00000101547CR354395.19951.818Danio_rerio
ENSACLG00000017671-8661.711ENSFHEG00000015797-7563.404Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000017671-9864.079ENSGAFG00000015891-7765.189Gambusia_affinis
ENSACLG00000017671-8466.103ENSGAFG00000020459-9966.103Gambusia_affinis
ENSACLG00000017671-7755.723ENSKMAG00000010098-9955.723Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000017671-9763.891ENSKMAG00000021870-7963.546Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000017671-9556.944ENSKMAG00000006793-7656.997Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000017671-7961.392ENSKMAG00000012888-7162.227Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000017671-8259.935ENSKMAG00000010001-7059.416Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000017671-9265.474ENSKMAG00000017146-9766.369Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000017671-8265.038ENSKMAG00000000229-9865.038Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000017671-9661.883ENSORLG00000028742-9861.974Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9661.167ENSORLG00000024952-7661.287Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9562.024ENSORLG00000023585-7561.447Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-8861.038ENSORLG00000024316-9761.546Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9561.574ENSORLG00000027415-9961.193Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-8859.960ENSORLG00000022683-9859.740Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-8466.423ENSORLG00000025119-9966.220Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9662.098ENSORLG00000023008-7861.156Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9063.383ENSORLG00000027596-9463.091Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9762.432ENSORLG00000023643-7362.466Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9756.577ENSORLG00000030165-7757.195Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9562.210ENSORLG00000022308-7561.630Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-8166.337ENSORLG00000027523-9866.592Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9761.005ENSORLG00000022229-7561.101Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-8959.744ENSORLG00000024925-9959.941Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9359.182ENSORLG00000024198-9959.087Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9861.573ENSORLG00000029873-9961.042Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-7961.521ENSORLG00000029044-6961.932Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9662.716ENSORLG00000025100-9862.557Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9762.352ENSORLG00000025108-7661.991Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9657.117ENSORLG00000026965-7657.455Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-8864.300ENSORLG00000025220-9963.744Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9657.117ENSORLG00000024098-7657.455Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-7760.367ENSORLG00000027932-6561.118Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9761.714ENSORLG00000022696-7661.343Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9762.795ENSORLG00000024838-7362.831Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9760.289ENSORLG00000022552-7660.452Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-8466.527ENSORLG00000024028-9965.808Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9564.153ENSORLG00000022135-10064.246Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9357.678ENSORLG00000027153-7657.949Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9662.431ENSORLG00000024962-7562.271Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9762.795ENSORLG00000023431-7362.831Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9562.651ENSORLG00000030585-7662.066Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9662.340ENSORLG00000025916-7562.179Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9462.477ENSORLG00000026067-7462.289Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9562.303ENSORLG00000030034-7561.743Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-7761.220ENSORLG00000030216-6861.485Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9660.754ENSORLG00000021952-7660.545Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-8466.841ENSORLG00000027753-9966.117Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-8561.338ENSORLG00000027499-7461.338Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9462.079ENSORLG00000022062-9962.629Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9661.454ENSORLG00000027979-8160.799Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9562.488ENSORLG00000023407-9461.905Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9161.501ENSORLG00000025105-9662.907Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9862.186ENSORLG00000022515-7562.729Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9862.007ENSORLG00000029674-7562.546Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-8466.841ENSORLG00000023147-9966.117Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9562.327ENSORLG00000023674-9762.142Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-8060.884ENSORLG00000026506-7261.279Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9862.152ENSORLG00000029259-9462.761Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9857.168ENSORLG00000022632-7757.143Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9762.387ENSORLG00000024912-9862.297Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9063.314ENSORLG00000023596-9763.314Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9562.756ENSORLG00000030436-9662.339Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9656.936ENSORLG00000030124-7657.273Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9560.480ENSORLG00000027877-9760.295Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9860.924ENSORLG00000024848-9662.249Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9562.593ENSORLG00000026705-7562.202Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9063.383ENSORLG00000023151-9463.091Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9462.360ENSORLG00000024241-9962.911Oryzias_latipes
ENSACLG00000017671-9862.007ENSORLG00020003988-7562.546Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017671-9961.989ENSORLG00020011789-9462.899Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017671-9562.210ENSORLG00020000745-7561.630Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017671-9861.918ENSORLG00020020735-7562.454Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017671-9562.210ENSORLG00020013601-7561.630Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017671-9657.117ENSORLG00020000947-7657.455Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017671-9358.349ENSORLG00020009070-7558.790Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017671-9657.507ENSORLG00020011809-7657.507Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017671-9163.565ENSORLG00020003377-8663.941Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017671-7563.282ENSORLG00020001657-9564.199Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017671-8465.687ENSORLG00020021845-9964.979Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017671-9557.024ENSORLG00020003499-7258.806Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017671-9761.831ENSORLG00020004934-9861.685Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017671-9363.112ENSORLG00020005114-9663.851Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017671-8465.690ENSORLG00020013042-9964.985Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017671-8558.048ENSORLG00020017439-8858.048Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017671-9862.007ENSORLG00020021168-7562.546Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017671-9762.352ENSORLG00020005485-9361.991Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017671-9657.117ENSORLG00020008167-7657.455Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017671-9862.242ENSORLG00020011308-9462.852Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017671-7563.152ENSORLG00020014566-6963.102Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017671-9657.808ENSORLG00020001553-7657.636Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017671-9661.987ENSORLG00020005141-7861.826Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000017671-7060.710ENSORLG00015005993-6260.710Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000017671-9761.252ENSORLG00015022083-7561.974Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000017671-8163.181ENSORLG00015021573-9364.254Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000017671-8258.262ENSORLG00015019527-8158.613Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000017671-7159.975ENSORLG00015010438-6959.975Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000017671-8060.663ENSORLG00015009802-7060.710Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000017671-9758.726ENSORLG00015019969-7459.462Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000017671-9562.082ENSORLG00015021482-7561.468Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000017671-9059.015ENSORLG00015001210-9458.904Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000017671-8863.269ENSORLG00015014929-7363.269Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000017671-9163.619ENSORLG00015020941-9962.868Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000017671-9561.746ENSORLG00015008912-7561.172Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000017671-8562.776ENSORLG00015019144-7362.776Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000017671-8060.442ENSORLG00015022412-7260.488Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000017671-9662.648ENSORLG00015006303-7862.252Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000017671-9561.425ENSORLG00015021620-7360.989Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000017671-9461.856ENSORLG00015011577-7761.275Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000017671-8059.845ENSORLG00015018042-7359.889Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000017671-8658.544ENSORLG00015010296-6658.544Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000017671-9357.780ENSORLG00015020866-9757.875Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000017671-9561.989ENSORLG00015016198-7561.376Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000017671-7049.375ENSOMEG00000005417-9349.559Oryzias_melastigma
ENSACLG00000017671-7052.211ENSOMEG00000006056-7652.381Oryzias_melastigma
ENSACLG00000017671-8848.754ENSOMEG00000007684-7548.988Oryzias_melastigma
ENSACLG00000017671-8359.698ENSOMEG00000011861-10059.698Oryzias_melastigma
ENSACLG00000017671-7659.651ENSOMEG00000008259-7159.651Oryzias_melastigma
ENSACLG00000017671-9661.376ENSOMEG00000022422-7561.588Oryzias_melastigma
ENSACLG00000017671-8563.941ENSOMEG00000010967-6963.941Oryzias_melastigma
ENSACLG00000017671-9750.493ENSOMEG00000017119-7450.860Oryzias_melastigma
ENSACLG00000017671-9060.904ENSOMEG00000013280-9960.827Oryzias_melastigma
ENSACLG00000017671-8150.915ENSOMEG00000011112-9251.085Oryzias_melastigma
ENSACLG00000017671-8450.000ENSPKIG00000009885-7551.214Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000017671-9050.098ENSPKIG00000005143-8650.601Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000017671-8164.466ENSPFOG00000022857-10064.466Poecilia_formosa
ENSACLG00000017671-9463.915ENSPMEG00000022292-9964.093Poecilia_mexicana
ENSACLG00000017671-8864.221ENSPREG00000005745-10064.221Poecilia_reticulata
ENSACLG00000017671-7960.517ENSSDUG00000012982-7360.382Seriola_dumerili
ENSACLG00000017671-8964.491ENSSLDG00000016219-9665.278Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000017671-9244.434ENSSPUG00000017371-9044.361Sphenodon_punctatus
ENSACLG00000017671-9759.350ENSXCOG00000000074-7958.988Xiphophorus_couchianus

Copyright © , Bioinformatics Center, Sun Yat-sen Memorial Hospital, Sun Yat-sen University, China. All Rights Reserved.

Any comment and suggestion, please contact us