EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000017692 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2354 bases
Position: chr13:5257279-5259632
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000026010	RVT_1	PF00078.27	1.9e-44	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000026626	-	2354	-	ENSACLP00000026010	718 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000017692	-	88	46.948	ENSACLG00000014911	-	98	46.948
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ENSACLG00000017692	-	53	65.000	ENSACLG00000009983	-	99	65.000
ENSACLG00000017692	-	99	55.056	ENSACLG00000012019	-	95	55.056
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