EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000017700 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6629 bases
Position: chr19:6890779-6897407
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000026024	MMR_HSR1	PF01926.23	8.4e-07	1	1
ENSACLP00000026052	MMR_HSR1	PF01926.23	9.9e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000026641	-	1110	-	ENSACLP00000026024	369 (aa)	-	-
ENSACLT00000026669	-	1197	-	ENSACLP00000026052	398 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000017700	-	96	60.504	ENSACLG00000008069	-	88	67.788
ENSACLG00000017700	-	94	60.684	ENSACLG00000017785	-	95	59.151
ENSACLG00000017700	-	82	51.815	ENSACLG00000017650	-	86	51.097
ENSACLG00000017700	-	75	63.441	ENSACLG00000017734	-	76	63.441
ENSACLG00000017700	-	55	66.827	ENSACLG00000017575	-	76	63.348
ENSACLG00000017700	-	88	56.037	ENSACLG00000026694	-	78	67.692
ENSACLG00000017700	-	55	63.942	ENSACLG00000026716	-	69	63.942

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000017700	-	97	36.986	ENSG00000124449	IRGC	79	38.441	Homo_sapiens
ENSACLG00000017700	-	96	62.849	ENSAPOG00000008330	irgf3	90	62.500	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000017700	-	94	40.845	ENSAMEG00000004488	-	85	39.946	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000017700	-	94	41.598	ENSAMEG00000018526	-	85	40.633	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000017700	-	91	38.070	ENSAMEG00000018904	-	85	38.070	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000017700	-	79	35.495	ENSAMEG00000001281	-	66	35.495	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000017700	-	79	43.919	ENSAMEG00000019320	-	71	43.377	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000017700	-	93	38.395	ENSAMEG00000018886	-	91	37.028	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000017700	-	89	46.269	ENSAMEG00000004232	IRGC	85	45.575	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000017700	-	96	56.787	ENSACIG00000023724	-	93	57.520	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000017700	-	95	61.798	ENSACIG00000014652	-	99	58.291	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000017700	-	98	57.181	ENSACIG00000017561	-	93	58.713	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000017700	-	97	53.867	ENSACIG00000011491	-	90	54.768	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000017700	-	55	67.805	ENSACIG00000000621	-	80	66.038	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000017700	-	96	58.716	ENSACIG00000010992	-	88	58.485	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000017700	-	96	63.231	ENSACIG00000008165	-	91	68.085	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000017700	-	57	70.507	ENSAOCG00000012267	-	79	70.000	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000017700	-	96	66.201	ENSAOCG00000016549	-	93	65.691	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000017700	-	96	65.363	ENSAPEG00000002637	-	93	60.287	Amphiprion_percula
ENSACLG00000017700	-	97	58.543	ENSATEG00000011665	-	92	58.221	Anabas_testudineus
ENSACLG00000017700	-	96	59.889	ENSATEG00000011805	-	95	59.737	Anabas_testudineus
ENSACLG00000017700	-	95	59.777	ENSATEG00000011733	-	94	61.062	Anabas_testudineus
ENSACLG00000017700	-	96	58.449	ENSATEG00000011621	-	94	58.421	Anabas_testudineus
ENSACLG00000017700	-	97	42.740	ENSACAG00000005249	-	86	43.324	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000017700	-	92	32.295	ENSACAG00000022806	-	84	32.418	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000017700	-	92	37.464	ENSACAG00000027740	-	79	37.640	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000017700	-	97	46.575	ENSACAG00000004461	-	81	46.575	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000017700	-	97	42.308	ENSACAG00000027865	-	86	41.253	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000017700	-	97	38.567	ENSACAG00000027084	-	77	40.456	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000017700	-	97	34.247	ENSAMXG00000003353	-	92	34.483	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017700	-	96	44.231	ENSAMXG00000041276	-	90	43.850	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017700	-	97	40.390	ENSAMXG00000026039	irge4	92	40.000	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017700	-	96	48.219	ENSAMXG00000003336	-	92	47.089	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017700	-	99	47.453	ENSAMXG00000041738	-	98	46.056	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017700	-	96	43.454	ENSAMXG00000025169	-	94	43.288	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017700	-	95	43.662	ENSAMXG00000025551	-	95	43.164	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017700	-	93	43.804	ENSAMXG00000018938	-	96	42.781	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017700	-	97	45.455	ENSAMXG00000003370	-	96	44.503	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017700	-	54	45.685	ENSAMXG00000001283	-	76	45.685	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017700	-	52	55.612	ENSAMXG00000043797	-	79	55.612	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017700	-	93	44.286	ENSAMXG00000031909	-	95	42.971	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017700	-	93	43.188	ENSAMXG00000037767	-	96	43.626	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017700	-	71	36.330	ENSAMXG00000033649	-	75	36.466	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000017700	-	92	40.173	ENSBTAG00000013766	IRGC	75	40.845	Bos_taurus
ENSACLG00000017700	-	90	35.598	ENSBTAG00000015727	IFI47	84	35.598	Bos_taurus
ENSACLG00000017700	-	92	39.595	ENSCJAG00000013464	IRGC	76	40.563	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000017700	-	96	39.429	ENSCAFG00000004727	IRGC	83	40.390	Canis_familiaris
ENSACLG00000017700	-	88	31.092	ENSCAFG00000028829	-	82	31.092	Canis_familiaris
ENSACLG00000017700	-	89	36.667	ENSCAFG00000000502	IFGGC1	83	36.667	Canis_familiaris
ENSACLG00000017700	-	96	38.442	ENSCAFG00000012657	-	85	38.442	Canis_familiaris
ENSACLG00000017700	-	94	39.718	ENSCAFG00000000498	-	84	38.583	Canis_familiaris
ENSACLG00000017700	-	88	31.092	ENSCAFG00020002229	-	89	31.092	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000017700	-	80	40.864	ENSCAFG00020013248	IRGC	73	41.196	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000017700	-	96	38.442	ENSCAFG00020002248	-	85	38.442	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000017700	-	94	39.669	ENSCAFG00020002399	-	81	38.583	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000017700	-	89	36.667	ENSCAFG00020002398	-	83	36.667	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000017700	-	90	35.870	ENSCHIG00000006767	-	84	35.870	Capra_hircus
ENSACLG00000017700	-	92	39.884	ENSCHIG00000007797	IRGC	75	40.845	Capra_hircus
ENSACLG00000017700	-	64	41.736	ENSCHIG00000013605	-	67	41.909	Capra_hircus
ENSACLG00000017700	-	93	37.859	ENSCAPG00000016931	-	86	37.859	Cavia_aperea
ENSACLG00000017700	-	93	39.429	ENSCAPG00000012775	IRGC	77	40.390	Cavia_aperea
ENSACLG00000017700	-	80	32.154	ENSCAPG00000016904	-	71	32.476	Cavia_aperea
ENSACLG00000017700	-	79	43.478	ENSCPOG00000034856	-	71	43.522	Cavia_porcellus
ENSACLG00000017700	-	94	37.760	ENSCPOG00000023450	-	87	37.760	Cavia_porcellus
ENSACLG00000017700	-	92	37.435	ENSCPOG00000037129	-	86	37.435	Cavia_porcellus
ENSACLG00000017700	-	92	37.435	ENSCPOG00000034918	-	86	37.435	Cavia_porcellus
ENSACLG00000017700	-	94	37.222	ENSCPOG00000037314	-	83	36.856	Cavia_porcellus
ENSACLG00000017700	-	93	39.429	ENSCPOG00000000918	IRGC	77	40.390	Cavia_porcellus
ENSACLG00000017700	-	94	36.723	ENSCPOG00000038985	-	83	36.639	Cavia_porcellus
ENSACLG00000017700	-	94	41.193	ENSCPOG00000039847	-	84	39.892	Cavia_porcellus
ENSACLG00000017700	-	92	37.958	ENSCPOG00000037647	-	86	37.958	Cavia_porcellus
ENSACLG00000017700	-	94	41.360	ENSCPOG00000036108	-	84	40.431	Cavia_porcellus
ENSACLG00000017700	-	92	39.306	ENSCATG00000016103	IRGC	76	40.282	Cercocebus_atys
ENSACLG00000017700	-	92	40.173	ENSCLAG00000017638	IRGC	76	41.127	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000017700	-	94	38.244	ENSCLAG00000010051	-	78	38.310	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000017700	-	76	45.139	ENSCLAG00000011265	-	74	44.667	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000017700	-	93	41.261	ENSCLAG00000017811	-	82	41.011	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000017700	-	97	38.544	ENSCLAG00000017958	-	87	37.306	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000017700	-	92	36.729	ENSCLAG00000017791	-	83	36.729	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000017700	-	92	39.306	ENSCSAG00000019621	IRGC	76	40.282	Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000017700	-	72	38.603	ENSCHOG00000005921	-	97	38.971	Choloepus_hoffmanni
ENSACLG00000017700	-	92	41.691	ENSCPBG00000021472	-	90	42.493	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017700	-	95	38.764	ENSCPBG00000021473	-	90	39.178	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017700	-	50	41.799	ENSCPBG00000021470	-	62	41.799	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017700	-	95	39.496	ENSCPBG00000006671	-	94	39.247	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017700	-	97	46.849	ENSCPBG00000022413	-	83	47.027	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017700	-	97	37.190	ENSCPBG00000013089	-	77	39.607	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017700	-	97	41.969	ENSCPBG00000016826	-	89	42.857	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017700	-	94	31.111	ENSCPBG00000013137	-	92	31.250	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017700	-	97	43.681	ENSCPBG00000013135	-	89	44.231	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017700	-	93	43.103	ENSCPBG00000011454	-	88	43.103	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017700	-	96	43.137	ENSCPBG00000017286	-	90	42.969	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017700	-	92	39.017	ENSCPBG00000021468	-	81	39.718	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017700	-	95	39.948	ENSCPBG00000021465	-	88	39.948	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017700	-	94	46.465	ENSCPBG00000021464	-	84	46.465	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017700	-	94	39.474	ENSCPBG00000021467	-	89	39.474	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017700	-	93	43.149	ENSCPBG00000021461	-	79	43.590	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017700	-	93	44.767	ENSCPBG00000002577	-	84	43.207	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017700	-	96	45.682	ENSCPBG00000009182	-	84	45.553	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017700	-	79	47.635	ENSCPBG00000002066	-	70	46.129	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017700	-	92	41.379	ENSCPBG00000000576	-	83	41.737	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017700	-	97	40.921	ENSCPBG00000006148	-	83	41.353	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000017700	-	96	44.216	ENSCPBG00000002666	-	90	44.216	Chrysemys_picta_bellii
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