EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000017849 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6284 bases
Position: chr14:4846793-4853076
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000026271	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-26	1	4
ENSACLP00000026271	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-26	2	4
ENSACLP00000026271	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-26	3	4
ENSACLP00000026271	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-26	4	4
ENSACLP00000026341	zf-C2H2	PF00096.26	7.6e-13	1	2
ENSACLP00000026341	zf-C2H2	PF00096.26	7.6e-13	2	2
ENSACLP00000026309	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-10	1	2
ENSACLP00000026309	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-10	2	2
ENSACLP00000026271	zf-met	PF12874.7	6.3e-11	1	1
ENSACLP00000026309	zf-met	PF12874.7	3.7e-07	1	2
ENSACLP00000026309	zf-met	PF12874.7	3.7e-07	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
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ENSACLT00000026960	-	858	-	ENSACLP00000026341	285 (aa)	-	-
ENSACLT00000026927	-	456	-	ENSACLP00000026309	151 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000017849	-	61	44.167	ENSACLG00000001258	-	97	44.167
ENSACLG00000017849	-	53	44.068	ENSACLG00000014349	znf341	51	31.667
ENSACLG00000017849	-	75	45.000	ENSACLG00000017336	-	96	51.852
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ENSACLG00000017849	-	90	45.238	ENSACLG00000008374	-	57	42.708
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ENSACLG00000017849	-	66	44.898	ENSACLG00000026130	-	50	41.237
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ENSACLG00000017849	-	75	50.000	ENSACLG00000020610	-	65	50.000
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ENSACLG00000017849	-	87	54.321	ENSACLG00000000487	-	92	54.321
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ENSACLG00000017849	-	80	57.317	ENSACLG00000003229	-	92	49.451
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ENSACLG00000017849	-	81	54.237	ENSACLG00000011237	-	98	60.526
ENSACLG00000017849	-	77	50.617	ENSACLG00000011239	-	76	50.617
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ENSACLG00000017849	-	66	42.857	ENSACLG00000027053	gfi1b	51	46.970
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