EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000017925 (Gene tree)
Gene ID: 113036126
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: zinc finger protein 708-like
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4777 bases
Position: chr14:4853979-4858755
Accession: 113036126
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000026355	zf-C2H2	PF00096.26	5.5e-50	1	8
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ENSACLP00000026355	zf-C2H2	PF00096.26	5.5e-50	3	8
ENSACLP00000026355	zf-C2H2	PF00096.26	5.5e-50	4	8
ENSACLP00000026355	zf-C2H2	PF00096.26	5.5e-50	5	8
ENSACLP00000026355	zf-C2H2	PF00096.26	5.5e-50	6	8
ENSACLP00000026355	zf-C2H2	PF00096.26	5.5e-50	7	8
ENSACLP00000026355	zf-C2H2	PF00096.26	5.5e-50	8	8
ENSACLP00000026363	zf-C2H2	PF00096.26	1.9e-49	1	8
ENSACLP00000026363	zf-C2H2	PF00096.26	1.9e-49	2	8
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ENSACLP00000026363	zf-C2H2	PF00096.26	1.9e-49	8	8
ENSACLP00000026355	zf-met	PF12874.7	6.2e-12	1	2
ENSACLP00000026355	zf-met	PF12874.7	6.2e-12	2	2
ENSACLP00000026363	zf-met	PF12874.7	1.6e-11	1	2
ENSACLP00000026363	zf-met	PF12874.7	1.6e-11	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000026977	-	2868	-	ENSACLP00000026355	677 (aa)	XP_026048003	UPI000E4202C1
ENSACLT00000026984	-	2310	-	ENSACLP00000026363	728 (aa)	XP_026048002	UPI000E3F8FFE

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000017925	-	69	36.036	ENSACLG00000022360	-	98	36.036
ENSACLG00000017925	-	69	33.884	ENSACLG00000022287	-	59	32.819
ENSACLG00000017925	-	65	42.342	ENSACLG00000013033	-	81	42.342
ENSACLG00000017925	-	69	41.121	ENSACLG00000021846	-	90	36.719
ENSACLG00000017925	-	76	39.860	ENSACLG00000020268	-	64	40.493
ENSACLG00000017925	-	69	39.819	ENSACLG00000020260	-	100	39.819
ENSACLG00000017925	-	69	49.123	ENSACLG00000018707	-	92	49.123
ENSACLG00000017925	-	69	40.708	ENSACLG00000013935	-	86	40.708
ENSACLG00000017925	-	50	45.122	ENSACLG00000011658	-	87	45.122
ENSACLG00000017925	-	81	38.115	ENSACLG00000020393	-	87	40.782
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ENSACLG00000017925	-	77	42.776	ENSACLG00000025251	-	93	43.478
ENSACLG00000017925	-	72	37.600	ENSACLG00000019291	-	88	37.600
ENSACLG00000017925	-	74	40.640	ENSACLG00000006528	-	97	40.640
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ENSACLG00000017925	-	71	42.012	ENSACLG00000024308	-	98	43.234
ENSACLG00000017925	-	65	41.667	ENSACLG00000004663	-	75	41.667
ENSACLG00000017925	-	69	37.850	ENSACLG00000001003	-	92	36.768
ENSACLG00000017925	-	78	47.222	ENSACLG00000006718	-	80	47.222
ENSACLG00000017925	-	72	42.058	ENSACLG00000000411	-	95	41.573
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ENSACLG00000017925	-	65	41.818	ENSACLG00000024294	-	78	46.809
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ENSACLG00000017925	-	69	47.500	ENSACLG00000022302	-	98	46.061
ENSACLG00000017925	-	68	34.400	ENSACLG00000022305	-	89	33.200
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ENSACLG00000017925	-	69	41.892	ENSACLG00000014176	-	89	41.704
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ENSACLG00000017925	-	77	44.056	ENSACLG00000027692	-	85	39.801
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ENSACLG00000017925	-	69	39.957	ENSACLG00000000487	-	88	42.029
ENSACLG00000017925	-	69	38.110	ENSACLG00000022475	-	93	38.110
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ENSACLG00000017925	-	69	39.030	ENSACLG00000007888	-	75	39.121
ENSACLG00000017925	-	65	45.536	ENSACLG00000014365	-	93	37.589
ENSACLG00000017925	-	68	36.076	ENSACLG00000017411	-	89	36.076
ENSACLG00000017925	-	69	43.798	ENSACLG00000008606	-	88	43.462
ENSACLG00000017925	-	67	45.699	ENSACLG00000005615	-	51	45.699
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ENSACLG00000017925	-	67	40.078	ENSACLG00000001507	-	82	40.078
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Orthologs

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ENSACLG00000017925	-	69	38.053	ENSHBUG00000012007	-	72	37.758	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000017925	-	100	99.725	ENSMZEG00005024424	-	100	99.725	Maylandia_zebra
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ENSACLG00000017925	-	65	45.528	ENSSLDG00000010390	-	87	45.528	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000017925	-	100	68.142	ENSSLDG00000002776	-	100	67.627	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000017925	-	72	38.776	ENSSPAG00000008958	-	92	37.805	Stegastes_partitus
ENSACLG00000017925	-	68	41.304	ENSTGUG00000015090	-	100	41.304	Taeniopygia_guttata