EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000017939 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 141572 bases
Position: chr18:669165-810736
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSACLP00000027001	zf-C2H2	PF00096.26	8.8e-63	2	13
ENSACLP00000027001	zf-C2H2	PF00096.26	8.8e-63	3	13
ENSACLP00000027001	zf-C2H2	PF00096.26	8.8e-63	4	13
ENSACLP00000027001	zf-C2H2	PF00096.26	8.8e-63	5	13
ENSACLP00000027001	zf-C2H2	PF00096.26	8.8e-63	6	13
ENSACLP00000027001	zf-C2H2	PF00096.26	8.8e-63	7	13
ENSACLP00000027001	zf-C2H2	PF00096.26	8.8e-63	8	13
ENSACLP00000027001	zf-C2H2	PF00096.26	8.8e-63	9	13
ENSACLP00000027001	zf-C2H2	PF00096.26	8.8e-63	10	13
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ENSACLP00000027001	zf-C2H2	PF00096.26	8.8e-63	13	13
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ENSACLP00000026931	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-54	10	10
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ENSACLP00000026830	zf-C2H2	PF00096.26	5.4e-48	7	8
ENSACLP00000026830	zf-C2H2	PF00096.26	5.4e-48	8	8
ENSACLP00000026714	zf-C2H2	PF00096.26	3.4e-44	1	7
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ENSACLP00000026714	zf-C2H2	PF00096.26	3.4e-44	3	7
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ENSACLP00000026714	zf-C2H2	PF00096.26	3.4e-44	5	7
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ENSACLP00000027114	zf-C2H2	PF00096.26	2.6e-41	1	7
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ENSACLP00000027001	zf-met	PF12874.7	2e-24	2	4
ENSACLP00000027001	zf-met	PF12874.7	2e-24	3	4
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ENSACLP00000026931	zf-met	PF12874.7	2.8e-21	1	3
ENSACLP00000026931	zf-met	PF12874.7	2.8e-21	2	3
ENSACLP00000026931	zf-met	PF12874.7	2.8e-21	3	3
ENSACLP00000027114	zf-met	PF12874.7	5.9e-18	1	2
ENSACLP00000027114	zf-met	PF12874.7	5.9e-18	2	2
ENSACLP00000027231	zf-met	PF12874.7	1.2e-17	1	4
ENSACLP00000027231	zf-met	PF12874.7	1.2e-17	2	4
ENSACLP00000027231	zf-met	PF12874.7	1.2e-17	3	4
ENSACLP00000027231	zf-met	PF12874.7	1.2e-17	4	4
ENSACLP00000026830	zf-met	PF12874.7	6.9e-15	1	4
ENSACLP00000026830	zf-met	PF12874.7	6.9e-15	2	4
ENSACLP00000026830	zf-met	PF12874.7	6.9e-15	3	4
ENSACLP00000026830	zf-met	PF12874.7	6.9e-15	4	4
ENSACLP00000026714	zf-met	PF12874.7	5.4e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
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ENSACLT00000027345	-	984	-	ENSACLP00000026714	327 (aa)	-	-
ENSACLT00000027867	-	975	-	ENSACLP00000027231	324 (aa)	-	-
ENSACLT00000027749	-	945	-	ENSACLP00000027114	314 (aa)	-	-
ENSACLT00000027460	-	1056	-	ENSACLP00000026830	351 (aa)	-	-
ENSACLT00000027562	-	1323	-	ENSACLP00000026931	440 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000017939	-	95	54.348	ENSACLG00000024670	-	96	51.020
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ENSACLG00000017939	-	99	56.934	ENSACLG00000005615	-	79	56.934
ENSACLG00000017939	-	95	54.667	ENSACLG00000011642	-	98	54.911
ENSACLG00000017939	-	96	48.515	ENSACLG00000003229	-	95	48.872
ENSACLG00000017939	-	96	48.201	ENSACLG00000007749	-	80	45.804
ENSACLG00000017939	-	99	43.902	ENSACLG00000017336	-	95	46.538
ENSACLG00000017939	-	99	45.353	ENSACLG00000014167	-	64	45.956
ENSACLG00000017939	-	95	49.505	ENSACLG00000000487	-	88	49.505
ENSACLG00000017939	-	95	60.116	ENSACLG00000024294	-	89	58.896
ENSACLG00000017939	-	96	41.618	ENSACLG00000000521	-	97	47.778
ENSACLG00000017939	-	97	48.031	ENSACLG00000016841	-	84	48.031
ENSACLG00000017939	-	97	46.278	ENSACLG00000018701	-	82	48.148
ENSACLG00000017939	-	94	56.190	ENSACLG00000018700	-	99	56.190
ENSACLG00000017939	-	99	44.828	ENSACLG00000027053	gfi1b	69	46.923
ENSACLG00000017939	-	100	60.099	ENSACLG00000023513	-	94	62.500
ENSACLG00000017939	-	99	43.529	ENSACLG00000006757	-	60	43.529
ENSACLG00000017939	-	96	52.448	ENSACLG00000005795	-	87	52.448
ENSACLG00000017939	-	95	55.172	ENSACLG00000024647	-	96	51.389
ENSACLG00000017939	-	99	47.205	ENSACLG00000005708	-	88	47.917
ENSACLG00000017939	-	96	51.429	ENSACLG00000020393	-	90	51.429
ENSACLG00000017939	-	97	47.138	ENSACLG00000000537	-	98	47.138
ENSACLG00000017939	-	99	45.187	ENSACLG00000019499	-	99	43.574
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ENSACLG00000017939	-	96	48.013	ENSACLG00000015462	-	74	48.148
ENSACLG00000017939	-	94	39.655	ENSACLG00000017996	prdm5	84	43.719
ENSACLG00000017939	-	96	47.619	ENSACLG00000026187	-	69	41.489
ENSACLG00000017939	-	98	47.601	ENSACLG00000015989	-	91	47.410
ENSACLG00000017939	-	94	44.828	ENSACLG00000012046	-	55	45.570
ENSACLG00000017939	-	94	45.000	ENSACLG00000019167	-	95	47.761
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ENSACLG00000017939	-	96	52.245	ENSACLG00000020615	-	98	54.872
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ENSACLG00000017939	-	95	60.000	ENSPNYG00000004923	-	100	59.016	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000017939	-	96	46.586	ENSPNAG00000006821	-	96	46.825	Pygocentrus_nattereri
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ENSACLG00000017939	-	98	49.324	ENSSFOG00015010829	-	77	45.970	Scleropages_formosus
ENSACLG00000017939	-	95	48.295	ENSSMAG00000013676	-	83	48.295	Scophthalmus_maximus
ENSACLG00000017939	-	95	59.296	ENSSDUG00000009553	-	100	54.229	Seriola_dumerili
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ENSACLG00000017939	-	99	42.007	ENSXMAG00000000617	-	82	44.395	Xiphophorus_maculatus