EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000017941 (Gene tree)
Gene ID: 113036125
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: zinc finger protein 708-like
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6176 bases
Position: chr14:4858841-4865016
Accession: 113036125
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000026377	zf-C2H2	PF00096.26	6.9e-55	1	8
ENSACLP00000026377	zf-C2H2	PF00096.26	6.9e-55	2	8
ENSACLP00000026377	zf-C2H2	PF00096.26	6.9e-55	3	8
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ENSACLP00000026377	zf-C2H2	PF00096.26	6.9e-55	7	8
ENSACLP00000026377	zf-C2H2	PF00096.26	6.9e-55	8	8
ENSACLP00000026377	zf-met	PF12874.7	0.00011	1	2
ENSACLP00000026377	zf-met	PF12874.7	0.00011	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000026996	-	4927	XM_026192214	ENSACLP00000026377	808 (aa)	XP_026047999	UPI000329C0A7

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000017941	-	62	46.667	ENSACLG00000004663	-	75	46.667
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ENSACLG00000017941	-	62	42.172	ENSACLG00000000537	-	98	43.359
ENSACLG00000017941	-	64	35.917	ENSACLG00000019291	-	92	36.145
ENSACLG00000017941	-	66	36.667	ENSACLG00000007749	-	80	34.025
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ENSACLG00000017941	-	66	50.746	ENSACLG00000021045	-	75	49.275
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ENSACLG00000017941	-	61	39.542	ENSACLG00000020260	-	99	40.977
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ENSACLG00000017941	-	61	41.772	ENSACLG00000001258	-	89	41.772
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ENSACLG00000017941	-	69	37.162	ENSACLG00000026187	-	54	37.162
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ENSACLG00000017941	-	61	43.089	ENSXMAG00000025241	-	91	43.089	Xiphophorus_maculatus
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