EuRBPDB

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RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000017996 (Gene tree)
Gene ID: 113016478
Gene Symbol: prdm5
Alias: un-named hi61|unm hi61
Full Name: PR domain containing 5
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 45841 bases
Position: chr23:8798232-8844072
Accession: ZDB-GENE-040708-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000026500	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-62	1	11
ENSACLP00000026500	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-62	2	11
ENSACLP00000026500	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-62	3	11
ENSACLP00000026500	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-62	4	11
ENSACLP00000026500	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-62	5	11
ENSACLP00000026500	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-62	6	11
ENSACLP00000026500	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-62	7	11
ENSACLP00000026500	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-62	8	11
ENSACLP00000026500	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-62	9	11
ENSACLP00000026500	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-62	10	11
ENSACLP00000026500	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-62	11	11
ENSACLP00000026500	zf-met	PF12874.7	6.8e-23	1	3
ENSACLP00000026500	zf-met	PF12874.7	6.8e-23	2	3
ENSACLP00000026500	zf-met	PF12874.7	6.8e-23	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000027121	-	1770	-	ENSACLP00000026500	589 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000017996	prdm5	72	38.462	ENSACLG00000019291	-	91	38.462
ENSACLG00000017996	prdm5	73	35.061	ENSACLG00000020615	-	72	35.061
ENSACLG00000017996	prdm5	72	37.459	ENSACLG00000000411	-	89	37.459
ENSACLG00000017996	prdm5	78	37.349	ENSACLG00000019094	-	91	37.349
ENSACLG00000017996	prdm5	73	35.470	ENSACLG00000022305	-	90	34.979
ENSACLG00000017996	prdm5	68	41.284	ENSACLG00000001258	-	91	41.284
ENSACLG00000017996	prdm5	73	39.819	ENSACLG00000006870	-	55	39.819
ENSACLG00000017996	prdm5	73	35.347	ENSACLG00000017941	-	63	35.347
ENSACLG00000017996	prdm5	74	39.423	ENSACLG00000019674	-	92	39.423
ENSACLG00000017996	prdm5	77	32.500	ENSACLG00000022287	-	61	32.500
ENSACLG00000017996	prdm5	79	33.071	ENSACLG00000014349	znf341	56	32.824
ENSACLG00000017996	prdm5	82	39.764	ENSACLG00000015462	-	66	39.764
ENSACLG00000017996	prdm5	75	34.727	ENSACLG00000014167	-	64	34.686
ENSACLG00000017996	prdm5	76	42.667	ENSACLG00000019270	-	79	42.667
ENSACLG00000017996	prdm5	68	37.113	ENSACLG00000019482	-	79	37.113
ENSACLG00000017996	prdm5	76	37.255	ENSACLG00000000102	-	55	37.255
ENSACLG00000017996	prdm5	96	41.379	ENSACLG00000011876	prdm12b	68	40.909
ENSACLG00000017996	prdm5	74	33.110	ENSACLG00000022360	-	99	33.333
ENSACLG00000017996	prdm5	83	37.500	ENSACLG00000020393	-	90	38.636
ENSACLG00000017996	prdm5	68	30.226	ENSACLG00000022191	znf407	65	30.226
ENSACLG00000017996	prdm5	82	43.787	ENSACLG00000024459	-	87	40.237
ENSACLG00000017996	prdm5	72	42.373	ENSACLG00000014365	-	92	37.278
ENSACLG00000017996	prdm5	75	37.864	ENSACLG00000018701	-	76	37.864
ENSACLG00000017996	prdm5	75	40.000	ENSACLG00000014176	-	88	38.182
ENSACLG00000017996	prdm5	69	43.558	ENSACLG00000018700	-	97	40.397
ENSACLG00000017996	prdm5	74	36.275	ENSACLG00000001045	-	98	36.275
ENSACLG00000017996	prdm5	73	40.206	ENSACLG00000001368	-	93	40.206
ENSACLG00000017996	prdm5	74	44.330	ENSACLG00000024294	-	84	44.330
ENSACLG00000017996	prdm5	76	36.752	ENSACLG00000028002	-	86	36.752
ENSACLG00000017996	prdm5	75	38.889	ENSACLG00000022499	-	84	38.889
ENSACLG00000017996	prdm5	73	37.898	ENSACLG00000022475	-	91	37.273
ENSACLG00000017996	prdm5	72	34.582	ENSACLG00000002844	-	84	34.582
ENSACLG00000017996	prdm5	74	38.889	ENSACLG00000022302	-	98	38.889
ENSACLG00000017996	prdm5	76	33.962	ENSACLG00000014600	-	92	33.181
ENSACLG00000017996	prdm5	74	38.550	ENSACLG00000008606	-	88	38.550
ENSACLG00000017996	prdm5	58	38.235	ENSACLG00000012046	-	51	38.235
ENSACLG00000017996	prdm5	76	42.731	ENSACLG00000021056	-	73	41.748
ENSACLG00000017996	prdm5	78	35.115	ENSACLG00000022505	-	87	42.079
ENSACLG00000017996	prdm5	74	35.484	ENSACLG00000000487	-	85	35.484
ENSACLG00000017996	prdm5	72	32.593	ENSACLG00000006702	-	75	32.593
ENSACLG00000017996	prdm5	68	41.935	ENSACLG00000018716	-	89	41.935
ENSACLG00000017996	prdm5	68	36.769	ENSACLG00000011642	-	78	36.283
ENSACLG00000017996	prdm5	84	43.056	ENSACLG00000021184	-	52	43.056
ENSACLG00000017996	prdm5	72	36.637	ENSACLG00000019499	-	97	36.637
ENSACLG00000017996	prdm5	72	38.868	ENSACLG00000003546	-	63	38.868
ENSACLG00000017996	prdm5	69	38.288	ENSACLG00000022482	-	84	38.288
ENSACLG00000017996	prdm5	74	36.452	ENSACLG00000000537	-	98	38.188
ENSACLG00000017996	prdm5	82	38.158	ENSACLG00000017849	-	80	44.048
ENSACLG00000017996	prdm5	79	36.000	ENSACLG00000024491	-	84	36.893
ENSACLG00000017996	prdm5	78	39.111	ENSACLG00000020474	-	84	39.111
ENSACLG00000017996	prdm5	80	34.906	ENSACLG00000019349	-	72	34.796
ENSACLG00000017996	prdm5	78	44.571	ENSACLG00000021045	-	75	44.571
ENSACLG00000017996	prdm5	73	41.463	ENSACLG00000027053	gfi1b	54	41.463
ENSACLG00000017996	prdm5	68	42.515	ENSACLG00000008374	-	52	42.515
ENSACLG00000017996	prdm5	70	35.573	ENSACLG00000022439	-	79	35.573
ENSACLG00000017996	prdm5	69	33.158	ENSACLG00000020579	znf319b	85	31.127
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ENSACLG00000017996	prdm5	63	43.860	ENSACLG00000017801	-	52	43.860
ENSACLG00000017996	prdm5	74	36.994	ENSACLG00000019424	-	95	40.698
ENSACLG00000017996	prdm5	73	35.648	ENSACLG00000001003	-	89	35.648
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ENSACLG00000017996	prdm5	74	33.577	ENSACLG00000020231	-	93	34.524
ENSACLG00000017996	prdm5	83	40.909	ENSACLG00000023305	-	80	40.909
ENSACLG00000017996	prdm5	80	45.771	ENSACLG00000024957	-	94	37.000
ENSACLG00000017996	prdm5	74	34.856	ENSACLG00000017336	-	93	34.856
ENSACLG00000017996	prdm5	73	37.458	ENSACLG00000006528	-	98	37.458
ENSACLG00000017996	prdm5	76	44.118	ENSACLG00000020860	snai1a	63	44.118
ENSACLG00000017996	prdm5	84	35.922	ENSACLG00000026538	-	82	35.922
ENSACLG00000017996	prdm5	70	35.673	ENSACLG00000017411	-	87	35.673
ENSACLG00000017996	prdm5	78	38.119	ENSACLG00000001507	-	79	37.811
ENSACLG00000017996	prdm5	79	36.090	ENSACLG00000015843	-	93	34.541
ENSACLG00000017996	prdm5	84	43.719	ENSACLG00000017939	-	94	39.655
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ENSACLG00000017996	prdm5	82	37.500	ENSACLG00000007162	scrt1b	59	37.500
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ENSACLG00000017996	prdm5	72	38.206	ENSACLG00000003229	-	92	38.462
ENSACLG00000017996	prdm5	72	42.647	ENSACLG00000020333	-	52	42.647
ENSACLG00000017996	prdm5	73	35.811	ENSACLG00000020339	-	64	35.811
ENSACLG00000017996	prdm5	73	44.330	ENSACLG00000008821	-	96	44.330
ENSACLG00000017996	prdm5	86	36.253	ENSACLG00000025251	-	96	38.367
ENSACLG00000017996	prdm5	77	37.209	ENSACLG00000027692	-	76	37.209
ENSACLG00000017996	prdm5	86	38.261	ENSACLG00000007888	-	75	40.606
ENSACLG00000017996	prdm5	79	37.413	ENSACLG00000017576	-	85	41.202
ENSACLG00000017996	prdm5	78	42.073	ENSACLG00000017321	-	78	42.211
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ENSACLG00000017996	prdm5	82	41.964	ENSACLG00000005708	-	66	41.964
ENSACLG00000017996	prdm5	69	38.562	ENSACLG00000013033	-	92	38.562
ENSACLG00000017996	prdm5	76	38.158	ENSACLG00000023941	-	89	38.158
ENSACLG00000017996	prdm5	72	36.975	ENSACLG00000004663	-	82	36.975
ENSACLG00000017996	prdm5	86	38.251	ENSACLG00000016841	-	75	38.251
ENSACLG00000017996	prdm5	73	39.179	ENSACLG00000021846	-	86	39.179
ENSACLG00000017996	prdm5	84	32.773	ENSACLG00000026703	-	71	34.240
ENSACLG00000017996	prdm5	87	36.527	ENSACLG00000026187	-	55	36.628
ENSACLG00000017996	prdm5	73	39.381	ENSACLG00000017487	-	71	38.095
ENSACLG00000017996	prdm5	74	37.931	ENSACLG00000013454	-	64	37.931
ENSACLG00000017996	prdm5	72	35.979	ENSACLG00000022497	-	90	35.979
ENSACLG00000017996	prdm5	81	32.692	ENSACLG00000026103	znf526	52	32.692
ENSACLG00000017996	prdm5	85	44.978	ENSACLG00000023513	-	81	46.759
ENSACLG00000017996	prdm5	74	35.526	ENSACLG00000003679	-	79	35.526
ENSACLG00000017996	prdm5	73	36.790	ENSACLG00000003332	-	100	41.000
ENSACLG00000017996	prdm5	75	36.404	ENSACLG00000019167	-	89	40.000
ENSACLG00000017996	prdm5	62	43.114	ENSACLG00000024647	-	79	43.114
ENSACLG00000017996	prdm5	74	39.409	ENSACLG00000024670	-	77	39.409
ENSACLG00000017996	prdm5	80	44.898	ENSACLG00000025196	-	79	44.898
ENSACLG00000017996	prdm5	84	45.562	ENSACLG00000024308	-	98	45.930
ENSACLG00000017996	prdm5	56	47.059	ENSACLG00000018707	-	95	47.059
ENSACLG00000017996	prdm5	73	38.835	ENSACLG00000027424	-	60	38.870
ENSACLG00000017996	prdm5	80	42.254	ENSACLG00000005795	-	67	42.254
ENSACLG00000017996	prdm5	77	38.545	ENSACLG00000022383	-	98	38.545
ENSACLG00000017996	prdm5	69	35.484	ENSACLG00000017449	-	59	35.484
ENSACLG00000017996	prdm5	72	38.762	ENSACLG00000000473	-	83	38.762
ENSACLG00000017996	prdm5	80	36.364	ENSACLG00000016405	zbtb17	58	36.757
ENSACLG00000017996	prdm5	79	42.000	ENSACLG00000013935	-	83	43.636
ENSACLG00000017996	prdm5	76	33.416	ENSACLG00000017925	-	65	33.416
ENSACLG00000017996	prdm5	75	35.079	ENSACLG00000005594	ZNF319	90	35.079
ENSACLG00000017996	prdm5	71	38.860	ENSACLG00000011239	-	69	38.860
ENSACLG00000017996	prdm5	84	41.872	ENSACLG00000019318	-	97	37.405
ENSACLG00000017996	prdm5	75	40.876	ENSACLG00000018551	snai2	64	40.876
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Orthologs

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