EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000018252 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2364 bases
Position: chr15:28191647-28194010
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000026817	RVT_1	PF00078.27	9.8e-44	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000027447	-	2364	-	ENSACLP00000026817	787 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000018252	-	68	30.309	ENSACLG00000007200	-	77	30.309
ENSACLG00000018252	-	98	98.182	ENSACLG00000025119	-	85	98.182
ENSACLG00000018252	-	69	95.604	ENSACLG00000009903	-	96	95.604
ENSACLG00000018252	-	92	98.345	ENSACLG00000013844	-	95	98.345
ENSACLG00000018252	-	88	42.957	ENSACLG00000008391	-	83	42.957
ENSACLG00000018252	-	60	42.553	ENSACLG00000008218	-	100	42.553
ENSACLG00000018252	-	69	94.128	ENSACLG00000018945	-	93	94.128
ENSACLG00000018252	-	97	40.337	ENSACLG00000017412	-	82	40.442
ENSACLG00000018252	-	53	47.368	ENSACLG00000022994	-	99	47.368
ENSACLG00000018252	-	98	45.161	ENSACLG00000008383	-	93	45.161
ENSACLG00000018252	-	98	98.442	ENSACLG00000025376	-	85	98.442
ENSACLG00000018252	-	54	97.424	ENSACLG00000006327	-	82	97.424
ENSACLG00000018252	-	63	47.515	ENSACLG00000003670	-	78	47.515
ENSACLG00000018252	-	88	42.678	ENSACLG00000002468	-	83	42.678
ENSACLG00000018252	-	50	45.524	ENSACLG00000018107	-	73	44.282
ENSACLG00000018252	-	53	97.356	ENSACLG00000010664	-	75	97.356
ENSACLG00000018252	-	66	46.947	ENSACLG00000022841	-	66	46.947
ENSACLG00000018252	-	98	98.831	ENSACLG00000022844	-	85	98.831
ENSACLG00000018252	-	64	95.842	ENSACLG00000023557	-	79	95.842
ENSACLG00000018252	-	77	39.384	ENSACLG00000012019	-	81	39.384
ENSACLG00000018252	-	98	98.442	ENSACLG00000012014	-	85	98.442
ENSACLG00000018252	-	98	95.325	ENSACLG00000005662	-	85	95.325
ENSACLG00000018252	-	71	42.215	ENSACLG00000005642	-	99	42.215
ENSACLG00000018252	-	53	45.000	ENSACLG00000010082	-	75	45.000
ENSACLG00000018252	-	88	43.096	ENSACLG00000021287	-	83	43.096
ENSACLG00000018252	-	77	96.865	ENSACLG00000012279	-	98	96.865
ENSACLG00000018252	-	68	97.207	ENSACLG00000014915	-	82	97.207
ENSACLG00000018252	-	64	47.379	ENSACLG00000014911	-	78	47.379
ENSACLG00000018252	-	69	43.015	ENSACLG00000014413	-	80	43.015
ENSACLG00000018252	-	55	96.998	ENSACLG00000005746	-	98	96.998
ENSACLG00000018252	-	98	38.540	ENSACLG00000003857	-	69	38.540
ENSACLG00000018252	-	81	42.185	ENSACLG00000002614	-	92	42.185
ENSACLG00000018252	-	63	46.918	ENSACLG00000014746	-	78	46.918
ENSACLG00000018252	-	59	44.350	ENSACLG00000022169	-	78	44.350
ENSACLG00000018252	-	81	43.656	ENSACLG00000027996	-	82	43.656
ENSACLG00000018252	-	58	45.690	ENSACLG00000011058	-	96	45.690
ENSACLG00000018252	-	79	40.600	ENSACLG00000019194	-	82	40.600
ENSACLG00000018252	-	77	40.787	ENSACLG00000004144	-	83	40.787
ENSACLG00000018252	-	88	43.472	ENSACLG00000023885	-	83	43.472
ENSACLG00000018252	-	54	44.550	ENSACLG00000012447	-	91	44.550
ENSACLG00000018252	-	50	45.113	ENSACLG00000027256	-	98	45.113
ENSACLG00000018252	-	66	48.496	ENSACLG00000013805	-	63	48.496
ENSACLG00000018252	-	54	45.024	ENSACLG00000004754	-	99	45.024
ENSACLG00000018252	-	68	96.248	ENSACLG00000005212	-	80	96.248
ENSACLG00000018252	-	59	44.989	ENSACLG00000012094	-	97	44.989
ENSACLG00000018252	-	65	44.660	ENSACLG00000005570	-	79	44.660
ENSACLG00000018252	-	98	39.040	ENSACLG00000027511	-	67	39.040
ENSACLG00000018252	-	52	47.711	ENSACLG00000021583	-	99	47.711
ENSACLG00000018252	-	50	44.388	ENSACLG00000001035	-	99	44.388
ENSACLG00000018252	-	91	98.462	ENSACLG00000009850	-	81	98.462
ENSACLG00000018252	-	77	39.222	ENSACLG00000020248	-	81	39.222
ENSACLG00000018252	-	54	98.126	ENSACLG00000021814	-	76	98.126
ENSACLG00000018252	-	63	48.024	ENSACLG00000005547	-	78	48.024
ENSACLG00000018252	-	88	42.957	ENSACLG00000004826	-	83	42.957
ENSACLG00000018252	-	98	98.442	ENSACLG00000010900	-	85	98.442
ENSACLG00000018252	-	69	43.015	ENSACLG00000005017	-	80	43.015
ENSACLG00000018252	-	52	97.052	ENSACLG00000025525	-	100	97.052
ENSACLG00000018252	-	87	96.221	ENSACLG00000017448	-	83	96.221
ENSACLG00000018252	-	98	98.442	ENSACLG00000015650	-	85	98.442
ENSACLG00000018252	-	70	46.931	ENSACLG00000000736	-	78	46.931
ENSACLG00000018252	-	94	41.957	ENSACLG00000000734	-	84	41.957
ENSACLG00000018252	-	88	40.432	ENSACLG00000009590	-	82	40.432
ENSACLG00000018252	-	68	98.138	ENSACLG00000001405	-	80	98.138
ENSACLG00000018252	-	65	46.318	ENSACLG00000008859	-	76	46.318
ENSACLG00000018252	-	68	98.696	ENSACLG00000020183	-	80	98.696
ENSACLG00000018252	-	54	98.361	ENSACLG00000000182	-	76	98.361
ENSACLG00000018252	-	60	42.827	ENSACLG00000012352	-	95	42.827
ENSACLG00000018252	-	58	30.172	ENSACLG00000007954	-	64	30.172
ENSACLG00000018252	-	98	98.571	ENSACLG00000015667	-	85	98.571
ENSACLG00000018252	-	68	97.952	ENSACLG00000001758	-	80	97.952
ENSACLG00000018252	-	50	46.036	ENSACLG00000025957	-	73	46.036
ENSACLG00000018252	-	81	42.944	ENSACLG00000020864	-	82	42.944
ENSACLG00000018252	-	68	98.510	ENSACLG00000008571	-	80	98.510
ENSACLG00000018252	-	98	97.922	ENSACLG00000000393	-	85	97.922
ENSACLG00000018252	-	98	98.442	ENSACLG00000000395	-	88	98.442
ENSACLG00000018252	-	73	42.142	ENSACLG00000013061	-	79	42.142
ENSACLG00000018252	-	73	45.769	ENSACLG00000015704	-	94	45.769
ENSACLG00000018252	-	59	44.563	ENSACLG00000015659	-	78	44.563
ENSACLG00000018252	-	94	40.915	ENSACLG00000015331	-	93	40.915
ENSACLG00000018252	-	54	40.515	ENSACLG00000007654	-	92	40.515
ENSACLG00000018252	-	88	40.057	ENSACLG00000021051	-	82	40.057
ENSACLG00000018252	-	68	97.952	ENSACLG00000000536	-	80	97.952
ENSACLG00000018252	-	95	39.357	ENSACLG00000019519	-	91	39.357
ENSACLG00000018252	-	60	42.585	ENSACLG00000014642	-	77	42.585
ENSACLG00000018252	-	54	98.361	ENSACLG00000001556	-	91	98.361
ENSACLG00000018252	-	63	47.826	ENSACLG00000017297	-	93	47.826
ENSACLG00000018252	-	64	39.571	ENSACLG00000008832	-	99	39.571
ENSACLG00000018252	-	97	39.871	ENSACLG00000009939	-	77	39.871
ENSACLG00000018252	-	69	40.801	ENSACLG00000009807	-	75	40.801
ENSACLG00000018252	-	73	42.142	ENSACLG00000017692	-	79	42.142
ENSACLG00000018252	-	97	40.077	ENSACLG00000007643	-	72	40.077
ENSACLG00000018252	-	69	98.349	ENSACLG00000015507	-	100	98.349

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000018252	-	98	33.333	ENSATEG00000012907	-	79	33.590	Anabas_testudineus
ENSACLG00000018252	-	68	35.568	ENSATEG00000023197	-	83	35.940	Anabas_testudineus
ENSACLG00000018252	-	91	42.700	ENSATEG00000010674	-	84	42.700	Anabas_testudineus
ENSACLG00000018252	-	91	32.964	ENSATEG00000005707	-	87	33.241	Anabas_testudineus
ENSACLG00000018252	-	91	42.700	ENSATEG00000019512	-	84	42.700	Anabas_testudineus
ENSACLG00000018252	-	61	45.851	ENSATEG00000002739	-	77	45.851	Anabas_testudineus
ENSACLG00000018252	-	55	38.747	ENSATEG00000004798	-	75	38.747	Anabas_testudineus
ENSACLG00000018252	-	61	45.643	ENSATEG00000015490	-	77	45.643	Anabas_testudineus
ENSACLG00000018252	-	56	35.586	ENSAMXG00000035505	-	92	35.586	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000018252	-	98	46.373	ENSAMXG00000033551	-	92	46.373	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000018252	-	51	35.941	ENSAMXG00000040733	-	91	36.430	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000018252	-	52	36.957	ENSAMXG00000031910	-	97	37.440	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000018252	-	51	41.637	ENSAMXG00000041299	-	98	39.604	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000018252	-	86	55.882	ENSAMXG00000039914	-	83	55.882	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000018252	-	50	37.280	ENSAMXG00000032548	-	84	36.765	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000018252	-	59	35.169	ENSAMXG00000037974	-	89	35.169	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000018252	-	98	32.152	ENSAMXG00000036646	-	86	33.418	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000018252	-	57	35.022	ENSAMXG00000035634	-	94	35.022	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000018252	-	70	34.347	ENSAMXG00000041363	-	94	34.347	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000018252	-	69	51.371	ENSAMXG00000040860	-	98	51.371	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000018252	-	66	59.195	ENSAMXG00000032588	-	79	59.195	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000018252	-	86	55.800	ENSAMXG00000043574	-	83	55.800	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000018252	-	78	46.677	ENSAMXG00000043096	-	82	46.677	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000018252	-	98	32.564	ENSAMXG00000040053	-	79	33.333	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000018252	-	83	31.711	ENSAMXG00000033415	-	88	33.133	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000018252	-	70	34.403	ENSAMXG00000030246	-	77	34.759	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000018252	-	52	34.038	ENSAMXG00000031724	-	99	34.038	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000018252	-	64	57.988	ENSAMXG00000041791	-	75	57.988	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000018252	-	63	64.329	ENSFHEG00000008959	-	100	64.329	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000018252	-	59	43.534	ENSHBUG00000015916	-	98	43.534	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000018252	-	74	40.000	ENSHBUG00000016298	-	99	40.000	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000018252	-	50	40.712	ENSIPUG00000024068	-	72	40.712	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000018252	-	68	36.685	ENSIPUG00000009483	-	99	37.058	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000018252	-	79	34.494	ENSIPUG00000013060	-	74	34.755	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000018252	-	61	40.947	ENSKMAG00000009759	-	98	40.947	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000018252	-	84	42.411	ENSLBEG00000004554	-	96	42.411	Labrus_bergylta
ENSACLG00000018252	-	60	45.929	ENSLBEG00000008169	-	93	45.929	Labrus_bergylta
ENSACLG00000018252	-	84	58.434	ENSMAMG00000000974	-	89	58.434	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000018252	-	68	60.367	ENSMAMG00000005648	-	77	60.367	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000018252	-	70	58.942	ENSMAMG00000009292	-	96	58.942	Mastacembelus_armatus
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