EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000018325 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4904 bases
Position: chr23:9037884-9042787
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000026934	RVT_1	PF00078.27	7.6e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000027565	-	4904	-	ENSACLP00000026934	1343 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000018325	-	58	36.561	ENSACLG00000022170	-	81	36.561
ENSACLG00000018325	-	55	31.477	ENSACLG00000017671	-	55	33.082
ENSACLG00000018325	-	80	30.357	ENSACLG00000025600	-	98	30.357
ENSACLG00000018325	-	54	30.921	ENSACLG00000008738	-	63	31.176
ENSACLG00000018325	-	56	41.299	ENSACLG00000003361	-	51	41.299
ENSACLG00000018325	-	85	99.648	ENSACLG00000027633	-	100	99.648
ENSACLG00000018325	-	54	31.517	ENSACLG00000005531	-	61	31.517
ENSACLG00000018325	-	52	39.778	ENSACLG00000001282	-	54	39.778
ENSACLG00000018325	-	58	30.662	ENSACLG00000025904	-	64	30.876
ENSACLG00000018325	-	54	32.367	ENSACLG00000010542	-	63	32.367
ENSACLG00000018325	-	53	35.068	ENSACLG00000019989	-	78	35.068
ENSACLG00000018325	-	58	37.688	ENSACLG00000012657	-	74	37.688
ENSACLG00000018325	-	58	37.688	ENSACLG00000000373	-	74	37.688
ENSACLG00000018325	-	60	31.319	ENSACLG00000009118	-	61	31.730
ENSACLG00000018325	-	51	38.819	ENSACLG00000018344	-	60	38.819
ENSACLG00000018325	-	62	35.271	ENSACLG00000001555	-	55	35.271
ENSACLG00000018325	-	61	30.143	ENSACLG00000000384	-	59	30.143
ENSACLG00000018325	-	60	32.890	ENSACLG00000011588	-	95	32.685
ENSACLG00000018325	-	77	46.399	ENSACLG00000005909	-	96	46.399
ENSACLG00000018325	-	89	50.454	ENSACLG00000002238	-	99	50.372
ENSACLG00000018325	-	100	99.777	ENSACLG00000002872	-	100	99.777
ENSACLG00000018325	-	76	30.571	ENSACLG00000005337	-	99	30.406
ENSACLG00000018325	-	56	33.873	ENSACLG00000014688	-	64	34.330
ENSACLG00000018325	-	93	45.440	ENSACLG00000016675	-	94	45.440
ENSACLG00000018325	-	89	31.524	ENSACLG00000016676	-	88	31.697
ENSACLG00000018325	-	58	31.042	ENSACLG00000015880	-	65	31.042
ENSACLG00000018325	-	95	43.196	ENSACLG00000002243	-	96	43.196
ENSACLG00000018325	-	72	32.053	ENSACLG00000017062	-	85	32.998
ENSACLG00000018325	-	95	32.658	ENSACLG00000013242	-	87	33.777
ENSACLG00000018325	-	56	30.588	ENSACLG00000027747	-	57	30.588
ENSACLG00000018325	-	52	33.548	ENSACLG00000027730	-	61	33.909
ENSACLG00000018325	-	61	38.526	ENSACLG00000017452	-	91	38.526
ENSACLG00000018325	-	56	41.067	ENSACLG00000013455	-	51	41.067
ENSACLG00000018325	-	57	30.353	ENSACLG00000024387	-	69	30.353
ENSACLG00000018325	-	52	37.116	ENSACLG00000008010	-	66	37.116
ENSACLG00000018325	-	97	31.236	ENSACLG00000014671	-	97	31.236
ENSACLG00000018325	-	61	31.941	ENSACLG00000006945	-	60	32.251
ENSACLG00000018325	-	56	36.222	ENSACLG00000026879	-	50	36.222
ENSACLG00000018325	-	60	31.099	ENSACLG00000016624	-	62	31.501
ENSACLG00000018325	-	59	48.987	ENSACLG00000004748	-	91	48.883
ENSACLG00000018325	-	59	35.111	ENSACLG00000009628	-	51	35.111
ENSACLG00000018325	-	56	30.178	ENSACLG00000004344	-	55	30.178
ENSACLG00000018325	-	70	34.131	ENSACLG00000008642	-	85	34.446
ENSACLG00000018325	-	76	34.937	ENSACLG00000004561	-	96	34.937
ENSACLG00000018325	-	61	33.725	ENSACLG00000027702	-	97	33.531
ENSACLG00000018325	-	60	33.144	ENSACLG00000003852	-	61	33.607
ENSACLG00000018325	-	95	31.970	ENSACLG00000014813	-	98	31.970
ENSACLG00000018325	-	59	31.846	ENSACLG00000016581	-	71	31.824
ENSACLG00000018325	-	50	48.454	ENSACLG00000027124	-	92	48.454
ENSACLG00000018325	-	50	32.895	ENSACLG00000024556	-	77	34.255
ENSACLG00000018325	-	53	32.798	ENSACLG00000023206	-	92	32.798
ENSACLG00000018325	-	50	37.358	ENSACLG00000007343	-	75	37.358
ENSACLG00000018325	-	60	36.080	ENSACLG00000017161	-	51	36.080
ENSACLG00000018325	-	84	32.140	ENSACLG00000007713	-	98	32.140
ENSACLG00000018325	-	59	36.000	ENSACLG00000025719	-	51	36.000
ENSACLG00000018325	-	74	32.740	ENSACLG00000018225	-	82	32.740
ENSACLG00000018325	-	61	35.271	ENSACLG00000013171	-	55	35.271
ENSACLG00000018325	-	60	32.540	ENSACLG00000013947	-	79	33.294
ENSACLG00000018325	-	91	31.040	ENSACLG00000015817	-	94	30.787
ENSACLG00000018325	-	90	31.533	ENSACLG00000026192	-	87	32.286
ENSACLG00000018325	-	54	31.200	ENSACLG00000022094	-	67	31.800
ENSACLG00000018325	-	59	32.251	ENSACLG00000003799	-	60	32.251
ENSACLG00000018325	-	53	51.939	ENSACLG00000002535	-	99	51.939
ENSACLG00000018325	-	95	32.583	ENSACLG00000007417	-	86	33.694
ENSACLG00000018325	-	95	32.708	ENSACLG00000002701	-	96	32.708
ENSACLG00000018325	-	63	32.907	ENSACLG00000027627	-	68	33.855
ENSACLG00000018325	-	59	35.333	ENSACLG00000024091	-	51	35.333
ENSACLG00000018325	-	97	31.163	ENSACLG00000008224	-	97	31.163
ENSACLG00000018325	-	92	33.639	ENSACLG00000024627	-	94	33.639
ENSACLG00000018325	-	63	33.514	ENSACLG00000020048	-	58	33.514

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000018325	-	54	48.977	ENSAPOG00000012937	-	97	48.840	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000018325	-	50	47.507	ENSAPOG00000021580	-	92	47.507	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000018325	-	99	79.030	ENSAPOG00000007435	-	99	79.030	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000018325	-	99	44.938	ENSCSEG00000010440	-	99	44.938	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000018325	-	97	44.724	ENSFHEG00000022554	-	99	44.508	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000018325	-	93	37.411	ENSLACG00000014947	-	97	43.953	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000018325	-	62	51.313	ENSLACG00000007131	-	99	51.313	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000018325	-	84	38.576	ENSLACG00000003314	-	98	38.434	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000018325	-	57	96.330	ENSONIG00000020960	-	100	96.330	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000018325	-	81	45.234	ENSOMEG00000023951	-	90	45.317	Oryzias_melastigma