EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000018688 (Gene tree)
Gene ID: 113035844
Gene Symbol: tyw1
Alias: im:6898509|wu:fb74d01|zgc:153368
Full Name: S-adenosyl-L-methionine-dependent tRNA 4-demethylwyosine synthase-like
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 58511 bases
Position: chr14:5549852-5608362
Accession: 113035844
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000027555	Wyosine_form	PF08608.12	2.6e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000028200	-	6001	-	ENSACLP00000027555	746 (aa)	XP_026047398	UPI000E3FB98E

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000018688	tyw1	86	64.264	ENSG00000277149	TYW1B	93	65.123	Homo_sapiens
ENSACLG00000018688	tyw1	95	67.818	ENSG00000198874	TYW1	98	68.370	Homo_sapiens
ENSACLG00000018688	tyw1	100	84.421	ENSAPOG00000014391	tyw1	100	84.687	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000018688	tyw1	96	86.667	ENSACIG00000007325	tyw1	100	86.667	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000018688	tyw1	100	84.421	ENSAOCG00000016792	tyw1	100	84.421	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000018688	tyw1	100	84.820	ENSAPEG00000015939	tyw1	100	84.820	Amphiprion_percula
ENSACLG00000018688	tyw1	90	83.994	ENSATEG00000006856	tyw1	94	83.994	Anabas_testudineus
ENSACLG00000018688	tyw1	97	66.349	ENSANAG00000037051	-	99	66.349	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000018688	tyw1	97	74.523	ENSAMXG00000004157	tyw1	99	75.510	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000018688	tyw1	95	68.326	ENSBTAG00000008446	TYW1	98	68.326	Bos_taurus
ENSACLG00000018688	tyw1	97	66.349	ENSCJAG00000004295	-	99	66.349	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000018688	tyw1	97	67.439	ENSCAFG00000010867	-	99	68.071	Canis_familiaris
ENSACLG00000018688	tyw1	93	62.931	ENSCAFG00020005367	-	99	63.754	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000018688	tyw1	95	68.516	ENSCHIG00000019510	-	98	68.516	Capra_hircus
ENSACLG00000018688	tyw1	88	65.919	ENSTSYG00000008236	-	99	65.919	Carlito_syrichta
ENSACLG00000018688	tyw1	85	65.109	ENSCAPG00000013569	-	100	65.109	Cavia_aperea
ENSACLG00000018688	tyw1	95	65.569	ENSCPOG00000011182	-	99	65.489	Cavia_porcellus
ENSACLG00000018688	tyw1	97	66.485	ENSCCAG00000026643	-	99	66.757	Cebus_capucinus
ENSACLG00000018688	tyw1	97	66.395	ENSCATG00000043677	-	99	66.939	Cercocebus_atys
ENSACLG00000018688	tyw1	96	65.937	ENSCLAG00000006321	-	99	66.257	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000018688	tyw1	89	70.073	ENSCSAG00000018274	-	99	70.803	Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000018688	tyw1	99	67.017	ENSCPBG00000014896	-	99	67.454	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000018688	tyw1	79	59.259	ENSCING00000004125	-	97	58.754	Ciona_intestinalis
ENSACLG00000018688	tyw1	88	54.136	ENSCSAVG00000005712	-	100	55.251	Ciona_savignyi
ENSACLG00000018688	tyw1	97	66.576	ENSCANG00000033209	-	99	67.120	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000018688	tyw1	67	76.869	ENSCGRG00001003679	Tyw1	89	74.945	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000018688	tyw1	99	80.027	ENSCSEG00000005810	tyw1	98	80.965	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000018688	tyw1	90	80.265	ENSCVAG00000001054	tyw1	96	80.265	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000018688	tyw1	99	73.082	ENSDARG00000062987	tyw1	99	74.232	Danio_rerio
ENSACLG00000018688	tyw1	99	66.490	ENSDNOG00000024165	-	98	68.421	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000018688	tyw1	83	63.694	ENSDORG00000014772	Tyw1	91	64.013	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000018688	tyw1	58	73.611	ENSEBUG00000004494	tyw1	91	73.611	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000018688	tyw1	95	68.326	ENSEASG00005008818	-	98	68.880	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000018688	tyw1	95	62.901	ENSECAG00000023164	-	98	62.968	Equus_caballus
ENSACLG00000018688	tyw1	58	79.381	ENSEEUG00000005950	-	60	78.571	Erinaceus_europaeus
ENSACLG00000018688	tyw1	99	73.628	ENSELUG00000008449	tyw1	98	72.948	Esox_lucius
ENSACLG00000018688	tyw1	95	67.590	ENSFCAG00000014262	-	98	67.590	Felis_catus
ENSACLG00000018688	tyw1	95	64.454	ENSFALG00000013810	-	98	65.193	Ficedula_albicollis
ENSACLG00000018688	tyw1	97	66.076	ENSFDAG00000013270	-	98	67.170	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000018688	tyw1	81	80.945	ENSFHEG00000020824	tyw1	81	80.945	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000018688	tyw1	97	64.993	ENSGALG00000001110	-	99	66.532	Gallus_gallus
ENSACLG00000018688	tyw1	97	78.747	ENSGACG00000012692	tyw1	99	78.747	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000018688	tyw1	97	67.790	ENSGAGG00000022393	-	99	68.102	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000018688	tyw1	87	58.921	ENSGGOG00000001473	TYW1	99	59.578	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000018688	tyw1	100	99.598	ENSHBUG00000002640	tyw1	100	99.598	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000018688	tyw1	86	67.344	ENSHGLG00000012093	-	100	67.344	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000018688	tyw1	97	65.578	ENSHGLG00100011743	TYW1	98	66.255	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000018688	tyw1	97	68.741	ENSHCOG00000019949	tyw1	97	68.741	Hippocampus_comes
ENSACLG00000018688	tyw1	99	71.372	ENSIPUG00000016330	tyw1	99	72.908	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000018688	tyw1	96	65.199	ENSSTOG00000004067	-	90	65.612	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACLG00000018688	tyw1	95	65.734	ENSJJAG00000022959	Tyw1	98	66.390	Jaculus_jaculus
ENSACLG00000018688	tyw1	100	80.267	ENSKMAG00000018599	tyw1	100	80.267	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000018688	tyw1	99	64.032	ENSLACG00000018917	tyw1	99	65.212	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000018688	tyw1	99	71.466	ENSLOCG00000004035	tyw1	99	71.466	Lepisosteus_oculatus
ENSACLG00000018688	tyw1	97	66.667	ENSMFAG00000035457	-	99	67.211	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000018688	tyw1	97	66.667	ENSMMUG00000030374	-	99	67.211	Macaca_mulatta
ENSACLG00000018688	tyw1	97	66.531	ENSMNEG00000041992	-	99	70.985	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000018688	tyw1	97	66.531	ENSMLEG00000039741	-	99	67.075	Mandrillus_leucophaeus
ENSACLG00000018688	tyw1	98	84.563	ENSMAMG00000016089	tyw1	99	83.845	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000018688	tyw1	92	98.099	ENSMZEG00005024386	tyw1	100	98.099	Maylandia_zebra
ENSACLG00000018688	tyw1	95	66.252	ENSMGAG00000002176	-	98	66.713	Meleagris_gallopavo
ENSACLG00000018688	tyw1	96	66.343	ENSMAUG00000002959	Tyw1	98	66.805	Mesocricetus_auratus
ENSACLG00000018688	tyw1	97	67.847	ENSMICG00000014374	-	99	67.847	Microcebus_murinus
ENSACLG00000018688	tyw1	96	64.641	ENSMOCG00000017720	Tyw1	98	66.022	Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000018688	tyw1	97	76.066	ENSMMOG00000005064	tyw1	99	76.754	Mola_mola
ENSACLG00000018688	tyw1	96	65.484	ENSMODG00000025697	-	98	67.260	Monodelphis_domestica
ENSACLG00000018688	tyw1	100	84.000	ENSMALG00000010238	tyw1	100	84.000	Monopterus_albus
ENSACLG00000018688	tyw1	96	66.482	MGP_CAROLIEiJ_G0027801	Tyw1	99	67.036	Mus_caroli
ENSACLG00000018688	tyw1	96	66.898	ENSMUSG00000056310	Tyw1	99	67.358	Mus_musculus
ENSACLG00000018688	tyw1	96	65.742	MGP_PahariEiJ_G0024383	Tyw1	99	66.852	Mus_pahari
ENSACLG00000018688	tyw1	96	66.482	MGP_SPRETEiJ_G0028799	Tyw1	99	66.943	Mus_spretus
ENSACLG00000018688	tyw1	89	70.633	ENSMPUG00000016191	-	96	70.633	Mustela_putorius_furo
ENSACLG00000018688	tyw1	95	65.337	ENSMLUG00000013582	-	98	65.750	Myotis_lucifugus
ENSACLG00000018688	tyw1	96	66.435	ENSNGAG00000002742	Tyw1	99	66.620	Nannospalax_galili
ENSACLG00000018688	tyw1	92	92.733	ENSNBRG00000016996	tyw1	99	92.733	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000018688	tyw1	97	65.900	ENSNLEG00000013210	-	98	66.576	Nomascus_leucogenys
ENSACLG00000018688	tyw1	88	55.105	ENSOPRG00000008734	-	87	55.105	Ochotona_princeps
ENSACLG00000018688	tyw1	88	63.939	ENSODEG00000014729	-	95	64.091	Octodon_degus
ENSACLG00000018688	tyw1	100	96.247	ENSONIG00000005872	tyw1	100	96.247	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000018688	tyw1	95	66.897	ENSOCUG00000003173	-	98	66.895	Oryctolagus_cuniculus
ENSACLG00000018688	tyw1	100	79.357	ENSORLG00000001393	tyw1	99	80.321	Oryzias_latipes
ENSACLG00000018688	tyw1	100	78.954	ENSORLG00020019361	tyw1	100	79.920	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000018688	tyw1	100	79.011	ENSORLG00015008095	tyw1	99	79.973	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000018688	tyw1	89	71.791	ENSOGAG00000016555	-	98	68.399	Otolemur_garnettii
ENSACLG00000018688	tyw1	95	68.182	ENSOARG00000010673	-	98	68.182	Ovis_aries
ENSACLG00000018688	tyw1	95	68.201	ENSPPRG00000004945	-	98	68.201	Panthera_pardus
ENSACLG00000018688	tyw1	95	67.967	ENSPTIG00000019545	-	98	67.967	Panthera_tigris_altaica
ENSACLG00000018688	tyw1	97	61.694	ENSPTRG00000023076	TYW1B	98	62.432	Pan_troglodytes
ENSACLG00000018688	tyw1	97	66.259	ENSPANG00000019053	-	99	66.712	Papio_anubis
ENSACLG00000018688	tyw1	99	67.204	ENSPKIG00000006545	tyw1	99	67.383	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000018688	tyw1	94	78.612	ENSPMGG00000004240	tyw1	100	78.754	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000018688	tyw1	96	66.343	ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	66.989	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACLG00000018688	tyw1	100	78.752	ENSPFOG00000015855	tyw1	99	80.247	Poecilia_formosa
ENSACLG00000018688	tyw1	100	78.411	ENSPLAG00000000838	tyw1	100	78.808	Poecilia_latipinna
ENSACLG00000018688	tyw1	100	78.619	ENSPMEG00000019437	tyw1	100	79.017	Poecilia_mexicana
ENSACLG00000018688	tyw1	98	75.136	ENSPREG00000018773	tyw1	99	75.543	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000018688	tyw1	97	67.120	ENSPPYG00000017514	TYW1	99	67.391	Pongo_abelii
ENSACLG00000018688	tyw1	97	52.097	ENSPCOG00000015294	-	99	52.097	Propithecus_coquereli
ENSACLG00000018688	tyw1	100	99.866	ENSPNYG00000022381	tyw1	100	99.866	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000018688	tyw1	96	74.861	ENSPNAG00000009001	tyw1	98	76.349	Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000018688	tyw1	96	66.022	ENSRNOG00000024352	Tyw1	98	66.205	Rattus_norvegicus
ENSACLG00000018688	tyw1	97	66.440	ENSRBIG00000039619	-	99	66.984	Rhinopithecus_bieti
ENSACLG00000018688	tyw1	97	66.440	ENSRROG00000039780	-	99	66.984	Rhinopithecus_roxellana
ENSACLG00000018688	tyw1	92	40.510	YPL207W	-	76	40.510	Saccharomyces_cerevisiae
ENSACLG00000018688	tyw1	95	65.789	ENSSBOG00000025873	-	98	66.066	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACLG00000018688	tyw1	97	65.989	ENSSHAG00000010346	-	99	67.448	Sarcophilus_harrisii
ENSACLG00000018688	tyw1	99	70.267	ENSSFOG00015001054	tyw1	98	71.598	Scleropages_formosus
ENSACLG00000018688	tyw1	98	83.604	ENSSMAG00000020514	tyw1	100	82.933	Scophthalmus_maximus
ENSACLG00000018688	tyw1	100	85.809	ENSSDUG00000001552	tyw1	100	85.942	Seriola_dumerili
ENSACLG00000018688	tyw1	100	85.544	ENSSLDG00000003554	tyw1	100	85.676	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000018688	tyw1	96	65.837	ENSSPUG00000002715	-	98	66.667	Sphenodon_punctatus
ENSACLG00000018688	tyw1	95	67.127	ENSSSCG00000007733	-	98	67.586	Sus_scrofa
ENSACLG00000018688	tyw1	88	66.667	ENSTGUG00000003428	-	99	67.463	Taeniopygia_guttata
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ENSACLG00000018688	tyw1	88	84.281	ENSTNIG00000018999	tyw1	100	84.281	Tetraodon_nigroviridis
ENSACLG00000018688	tyw1	96	67.215	ENSUMAG00000015343	-	100	67.960	Ursus_maritimus
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