EuRBPDB

  • Home
  • Cancer
  • Family
  • Species
  • RBPredictor
  • Search
  • Download
  • Submit
  • Help
  • Contact

  • Description
  • RBDs
  • Transcripts
  • Gene Model
  • PPI
  • Paralogs
  • Orthologs
Description
Ensembl ID
ENSACLG00000018716 (Gene tree)
Gene ID
-
Gene Symbol
-
Alias
-
Full Name
-
Gene Type
protein_coding
Species
Astatotilapia_calliptera
Status
putative
Strand
Plus strand
Length
51221 bases
Position
chr3:8634204-8685424
Accession
-
RBP type
canonical RBP
Summary
-
RNA binding domains(RBDs)
Protein IDDomain Pfam IDE-value Domain number Total number
ENSACLP00000027562zf-C2H2PF00096.261e-1713
ENSACLP00000027562zf-C2H2PF00096.261e-1723
ENSACLP00000027562zf-C2H2PF00096.261e-1733
ENSACLP00000027562zf-metPF12874.77e-0711
Transcripts
Transcript IDNameLengthRefSeq ID Protein IDLengthRefSeq IDUniportKB ID
ENSACLT00000028207-573-ENSACLP00000027562190 (aa)--
Gene Model
Click here to download ENSACLG00000018716's gene model file
Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACLG00000018716's network
Paralogs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy ParalogGene SymbolCoverageIdentiy
ENSACLG00000018716-8675.258ENSACLG00000022497-8975.258
ENSACLG00000018716-8645.833ENSACLG00000017801-6445.833
ENSACLG00000018716-8871.212ENSACLG00000022499-9371.212
ENSACLG00000018716-7845.161ENSACLG00000006718-5245.161
ENSACLG00000018716-9143.609ENSACLG00000026538-8343.609
ENSACLG00000018716-8559.794ENSACLG00000014167-5759.794
ENSACLG00000018716-8649.231ENSACLG00000017576-8447.368
ENSACLG00000018716-8255.128ENSACLG00000014600-9155.128
ENSACLG00000018716-9739.850ENSACLG00000019167-8739.850
ENSACLG00000018716-9159.322ENSACLG00000015816-8767.708
ENSACLG00000018716-9751.000ENSACLG00000019318-9951.000
ENSACLG00000018716-8748.092ENSACLG00000006870-5648.092
ENSACLG00000018716-9468.142ENSACLG00000022360-9768.142
ENSACLG00000018716-8780.412ENSACLG00000028002-8680.412
ENSACLG00000018716-9540.458ENSACLG00000020231-9340.458
ENSACLG00000018716-9353.901ENSACLG00000008821-9253.901
ENSACLG00000018716-8040.741ENSACLG00000005594ZNF3198740.741
ENSACLG00000018716-9542.857ENSACLG00000027424-6142.857
ENSACLG00000018716-7485.567ENSACLG00000011239-6985.567
ENSACLG00000018716-9549.242ENSACLG00000011237-9947.287
ENSACLG00000018716-7541.844ENSACLG00000027053gfi1b5241.844
ENSACLG00000018716-8248.361ENSACLG00000022482-7948.421
ENSACLG00000018716-8034.400ENSACLG00000007162scrt1b5734.400
ENSACLG00000018716-9053.731ENSACLG00000025196-8353.731
ENSACLG00000018716-7946.970ENSACLG00000017321-7446.970
ENSACLG00000018716-9740.000ENSACLG00000016841-6148.214
ENSACLG00000018716-8883.529ENSACLG00000000537-9883.529
ENSACLG00000018716-7972.165ENSACLG00000019499-8972.165
ENSACLG00000018716-7845.161ENSACLG00000020333-5245.161
ENSACLG00000018716-9146.154ENSACLG00000005708-6246.154
ENSACLG00000018716-7371.852ENSACLG00000001507-7571.852
ENSACLG00000018716-8552.000ENSACLG00000014365-9052.000
ENSACLG00000018716-8050.962ENSACLG00000013454-6550.962
ENSACLG00000018716-9650.382ENSACLG00000023513-8050.000
ENSACLG00000018716-9542.963ENSACLG00000017941-6542.963
ENSACLG00000018716-8337.778ENSACLG00000020579znf319b8437.778
ENSACLG00000018716-7676.744ENSACLG00000003546-5676.744
ENSACLG00000018716-8960.825ENSACLG00000007888-7560.825
ENSACLG00000018716-8245.455ENSACLG00000022305-8845.455
ENSACLG00000018716-7350.633ENSACLG00000013033-8150.633
ENSACLG00000018716-8655.725ENSACLG00000023941-8755.725
ENSACLG00000018716-9342.138ENSACLG00000020268-6242.138
ENSACLG00000018716-8551.145ENSACLG00000020260-9951.145
ENSACLG00000018716-9051.145ENSACLG00000021343-9948.092
ENSACLG00000018716-9744.737ENSACLG00000021045-7944.737
ENSACLG00000018716-9245.161ENSACLG00000017849-6247.619
ENSACLG00000018716-9540.000ENSACLG00000020339-6842.568
ENSACLG00000018716-9648.421ENSACLG00000019270-7548.421
ENSACLG00000018716-8549.242ENSACLG00000022505-8349.242
ENSACLG00000018716-8941.935ENSACLG00000017996prdm56841.935
ENSACLG00000018716-8150.382ENSACLG00000018746-9044.615
ENSACLG00000018716-9539.865ENSACLG00000005795-6042.446
ENSACLG00000018716-6941.176ENSACLG00000019094-7341.176
ENSACLG00000018716-9645.283ENSACLG00000025251-9347.222
ENSACLG00000018716-9140.769ENSACLG00000022439-7739.259
ENSACLG00000018716-7943.478ENSACLG00000008624-7343.478
ENSACLG00000018716-8649.618ENSACLG00000001368-9249.618
ENSACLG00000018716-7451.282ENSACLG00000011710-6351.282
ENSACLG00000018716-8674.046ENSACLG00000018701-7874.046
ENSACLG00000018716-7246.067ENSACLG00000018707-7446.067
ENSACLG00000018716-8750.000ENSACLG00000006697-6650.000
ENSACLG00000018716-9880.412ENSACLG00000002844-8280.412
ENSACLG00000018716-9150.758ENSACLG00000024957-8950.758
ENSACLG00000018716-7044.086ENSACLG00000001258-8744.086
ENSACLG00000018716-7385.567ENSACLG00000017329-8185.567
ENSACLG00000018716-7745.370ENSACLG00000018700-9745.370
ENSACLG00000018716-7533.898ENSACLG00000018551snai26633.898
ENSACLG00000018716-8452.475ENSACLG00000019674-9752.475
ENSACLG00000018716-9161.458ENSACLG00000007749-7661.458
ENSACLG00000018716-9874.227ENSACLG00000022302-9474.227
ENSACLG00000018716-9562.963ENSACLG00000023979-9662.963
ENSACLG00000018716-8652.174ENSACLG00000019291-8552.174
ENSACLG00000018716-7836.134ENSACLG00000016648-7536.842
ENSACLG00000018716-9343.750ENSACLG00000026458gfi1ab5743.750
ENSACLG00000018716-9345.038ENSACLG00000020610-6645.378
ENSACLG00000018716-7360.305ENSACLG00000019349-6466.667
ENSACLG00000018716-9153.846ENSACLG00000017411-8753.846
ENSACLG00000018716-8672.727ENSACLG00000017336-9572.727
ENSACLG00000018716-9156.000ENSACLG00000024308-9651.515
ENSACLG00000018716-7740.323ENSACLG00000021184-5840.323
ENSACLG00000018716-9541.290ENSACLG00000020615-6841.290
ENSACLG00000018716-8254.610ENSACLG00000021846-8654.610
ENSACLG00000018716-8551.579ENSACLG00000023305-7351.579
ENSACLG00000018716-8546.875ENSACLG00000021056-5146.875
ENSACLG00000018716-7259.848ENSACLG00000015843-8459.848
ENSACLG00000018716-9246.753ENSACLG00000024459-8550.365
ENSACLG00000018716-9549.618ENSACLG00000020975-8949.618
ENSACLG00000018716-9653.435ENSACLG00000001003-9253.435
ENSACLG00000018716-7338.931ENSACLG00000005694-5038.931
ENSACLG00000018716-7761.290ENSACLG00000023963-9261.290
ENSACLG00000018716-7846.078ENSACLG00000017449-5746.078
ENSACLG00000018716-9176.289ENSACLG00000000473-8176.289
ENSACLG00000018716-8673.485ENSACLG00000001018-8873.485
ENSACLG00000018716-7462.590ENSACLG00000000521-9862.590
ENSACLG00000018716-9547.826ENSACLG00000017939-9649.007
ENSACLG00000018716-9552.941ENSACLG00000024294-7952.941
ENSACLG00000018716-8632.903ENSACLG00000022287-5732.903
ENSACLG00000018716-7041.818ENSACLG00000003679-8041.818
ENSACLG00000018716-8243.478ENSACLG00000024670-7243.478
ENSACLG00000018716-7737.168ENSACLG00000021022-7437.168
ENSACLG00000018716-7133.636ENSACLG00000020860snai1a5030.833
ENSACLG00000018716-9365.909ENSACLG00000003332-9765.909
ENSACLG00000018716-8547.191ENSACLG00000015462-5747.407
ENSACLG00000018716-8852.500ENSACLG00000014336-9352.500
ENSACLG00000018716-8680.412ENSACLG00000000411-8980.412
ENSACLG00000018716-8967.010ENSACLG00000022475-9167.010
ENSACLG00000018716-9546.565ENSACLG00000020393-9146.565
ENSACLG00000018716-8946.565ENSACLG00000013935-8046.565
ENSACLG00000018716-7747.328ENSACLG00000020474-8246.970
ENSACLG00000018716-8645.455ENSACLG00000011642-7845.802
ENSACLG00000018716-6965.414ENSACLG00000019482-7565.414
ENSACLG00000018716-9266.265ENSACLG00000022383-9466.935
ENSACLG00000018716-8142.537ENSACLG00000027692-7442.537
ENSACLG00000018716-8143.939ENSACLG00000017925-6543.939
ENSACLG00000018716-9745.872ENSACLG00000019424-9648.936
ENSACLG00000018716-6138.462ENSACLG00000011658-6738.462
ENSACLG00000018716-9231.416ENSACLG00000004663-7153.704
ENSACLG00000018716-9444.118ENSACLG00000008606-8746.565
ENSACLG00000018716-9548.701ENSACLG00000026703-7053.435
ENSACLG00000018716-8647.581ENSACLG00000015989-9646.154
ENSACLG00000018716-7844.218ENSACLG00000024647-7144.218
ENSACLG00000018716-9150.382ENSACLG00000024491-8650.000
ENSACLG00000018716-7945.161ENSACLG00000006702-7545.161
ENSACLG00000018716-8643.590ENSACLG00000017487-7643.590
ENSACLG00000018716-7354.737ENSACLG00000014176-8354.737
ENSACLG00000018716-9261.832ENSACLG00000003229-8962.879
ENSACLG00000018716-9174.627ENSACLG00000000487-8874.627
ENSACLG00000018716-7343.200ENSACLG00000013531-8943.200
ENSACLG00000018716-8960.870ENSACLG00000006528-9660.870
ENSACLG00000018716-8850.382ENSACLG00000025163-8150.382
ENSACLG00000018716-9172.269ENSACLG00000001045-9772.269
ENSACLG00000018716-9238.400ENSACLG00000000102-5338.400
Orthologs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy OrthologGene SymbolCoverageIdentiy Species
ENSACLG00000018716-7351.852ENSAPOG00000023008-6051.852Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000018716-6947.436ENSAPOG00000004997-8147.436Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000018716-8146.043ENSAPOG00000009709-5346.043Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000018716-7144.681ENSACIG00000006228-6344.681Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000018716-8748.148ENSACIG00000022738-9745.926Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000018716-8548.092ENSACIG00000007096-7148.092Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000018716-7351.852ENSAOCG00000016409-6051.852Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000018716-7349.194ENSAOCG00000022529-5249.194Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000018716-7351.852ENSAPEG00000008746-5951.852Amphiprion_percula
ENSACLG00000018716-8540.833ENSATEG00000021602-6940.833Anabas_testudineus
ENSACLG00000018716-9542.754ENSATEG00000014684-9645.238Anabas_testudineus
ENSACLG00000018716-8446.154ENSATEG00000022064-9050.000Anabas_testudineus
ENSACLG00000018716-7651.852ENSATEG00000015238-5951.852Anabas_testudineus
ENSACLG00000018716-7342.063ENSAMXG00000034934-8042.063Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000018716-9743.182ENSAMXG00000007973-9743.182Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000018716-7837.079ENSCSEG00000019599-9537.079Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000018716-8248.387ENSCVAG00000019097-6348.387Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000018716-8151.449ENSELUG00000004677-6054.545Esox_lucius
ENSACLG00000018716-7745.038ENSFHEG00000004548-5845.038Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000018716-8642.975ENSFHEG00000013228-5542.975Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000018716-7553.333ENSFHEG00000003460-6453.333Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000018716-8648.000ENSGMOG00000017518-6248.000Gadus_morhua
ENSACLG00000018716-7348.485ENSGMOG00000009187ZNF6267448.485Gadus_morhua
ENSACLG00000018716-9249.367ENSGAFG00000001481-7752.593Gambusia_affinis
ENSACLG00000018716-7045.794ENSGAFG00000007532-7045.794Gambusia_affinis
ENSACLG00000018716-8544.000ENSGAGG00000015232-5944.000Gopherus_agassizii
ENSACLG00000018716-8875.758ENSHBUG00000017251-9875.758Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000018716-9542.697ENSHBUG00000013065-5042.446Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000018716-8545.968ENSHBUG00000011944-5345.968Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000018716-7961.053ENSHBUG00000009274-8353.913Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000018716-8054.867ENSHBUG00000020544-9054.867Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000018716-9447.407ENSHBUG00000019377-5747.407Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000018716-8866.316ENSHBUG00000020527-9166.316Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000018716-9248.201ENSIPUG00000022266ZNF1356150.000Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000018716-9539.456ENSKMAG00000000802-7444.068Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000018716-9146.970ENSKMAG00000015304-6051.111Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000018716-9345.631ENSLBEG00000008909-6845.631Labrus_bergylta
ENSACLG00000018716-9647.826ENSLBEG00000026457-9346.296Labrus_bergylta
ENSACLG00000018716-7049.219ENSLBEG00000008850-5149.219Labrus_bergylta
ENSACLG00000018716-7346.392ENSLOCG00000017422-6946.392Lepisosteus_oculatus
ENSACLG00000018716-9538.312ENSMAMG00000002083-9048.889Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000018716-7750.370ENSMAMG00000010902-5850.370Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000018716-8143.284ENSMAMG00000015434-6743.284Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000018716-9354.305ENSMZEG00005028563-8353.947Maylandia_zebra
ENSACLG00000018716-7280.000ENSMZEG00005023565-6980.000Maylandia_zebra
ENSACLG00000018716-8258.779ENSMZEG00005020568-8158.779Maylandia_zebra
ENSACLG00000018716-8754.878ENSMZEG00005025125-9454.878Maylandia_zebra
ENSACLG00000018716-8367.416ENSMZEG00005022884-9465.909Maylandia_zebra
ENSACLG00000018716-8756.410ENSMZEG00005025725-9156.410Maylandia_zebra
ENSACLG00000018716-9475.000ENSMZEG00005027551-8875.000Maylandia_zebra
ENSACLG00000018716-7765.734ENSMZEG00005012676-9166.142Maylandia_zebra
ENSACLG00000018716-7246.316ENSMZEG00005011431-8350.980Maylandia_zebra
ENSACLG00000018716-8545.161ENSMZEG00005025965-5345.161Maylandia_zebra
ENSACLG00000018716-8641.279ENSMZEG00005003951-6642.331Maylandia_zebra
ENSACLG00000018716-8452.475ENSMZEG00005025006-9752.475Maylandia_zebra
ENSACLG00000018716-8547.191ENSMZEG00005018502-5747.407Maylandia_zebra
ENSACLG00000018716-7343.902ENSMZEG00005027396-5143.902Maylandia_zebra
ENSACLG00000018716-9539.865ENSMZEG00005011812-5442.446Maylandia_zebra
ENSACLG00000018716-7550.370ENSMMOG00000009252-6450.370Mola_mola
ENSACLG00000018716-7447.328ENSMALG00000005696-5047.328Monopterus_albus
ENSACLG00000018716-7348.175ENSMALG00000011756-5948.175Monopterus_albus
ENSACLG00000018716-7957.692ENSMALG00000002956-8957.692Monopterus_albus
ENSACLG00000018716-8745.361ENSMALG00000010959-9548.936Monopterus_albus
ENSACLG00000018716-8840.764ENSNBRG00000019004-6146.617Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000018716-8547.191ENSNBRG00000024179-5747.191Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000018716-9262.887ENSNBRG00000004723-8362.887Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000018716-6968.966ENSONIG00000015024-7878.351Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000018716-7365.789ENSONIG00000008297-9365.789Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000018716-7678.652ENSONIG00000001986-9678.652Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000018716-9264.474ENSONIG00000020667-9764.474Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000018716-9641.429ENSONIG00000012374-9742.336Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000018716-9550.376ENSONIG00000019139-10050.376Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000018716-7461.053ENSONIG00000014012-8353.913Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000018716-7940.260ENSORLG00000012581-5340.260Oryzias_latipes
ENSACLG00000018716-8249.618ENSOMEG00000015179-6449.618Oryzias_melastigma
ENSACLG00000018716-9150.769ENSPKIG00000015951-6650.769Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000018716-8644.068ENSPMGG00000020606-8544.068Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000018716-7641.406ENSPMGG00000008518-9441.406Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000018716-9345.385ENSPFOG00000018771-6245.385Poecilia_formosa
ENSACLG00000018716-8649.242ENSPFOG00000000667-6753.333Poecilia_formosa
ENSACLG00000018716-9349.242ENSPLAG00000013745-9137.838Poecilia_latipinna
ENSACLG00000018716-7940.777ENSPLAG00000005106-7041.584Poecilia_latipinna
ENSACLG00000018716-9340.994ENSPMEG00000022651-5745.455Poecilia_mexicana
ENSACLG00000018716-7747.436ENSPMEG00000020864-9047.436Poecilia_mexicana
ENSACLG00000018716-9465.493ENSPNYG00000020737-8269.072Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000018716-7968.800ENSPNYG00000003834-8568.800Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000018716-8545.968ENSPNYG00000019325-6045.968Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000018716-9542.697ENSPNYG00000011024-5542.446Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000018716-9149.640ENSPNAG00000025882-6451.515Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000018716-7344.961ENSPNAG00000011660-5446.970Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000018716-7443.925ENSPNAG00000010850-7543.925Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000018716-8851.908ENSSFOG00015006083-5951.908Scleropages_formosus
ENSACLG00000018716-7240.594ENSSMAG00000004429-8840.594Scophthalmus_maximus
ENSACLG00000018716-9148.864ENSSMAG00000013663-8950.833Scophthalmus_maximus
ENSACLG00000018716-7250.370ENSSMAG00000013828-6050.370Scophthalmus_maximus
ENSACLG00000018716-7249.180ENSSDUG00000023765-6649.180Seriola_dumerili
ENSACLG00000018716-9748.039ENSSDUG00000023764-9548.855Seriola_dumerili
ENSACLG00000018716-7651.852ENSSDUG00000015013-6051.852Seriola_dumerili
ENSACLG00000018716-7651.852ENSSLDG00000021278-6051.852Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000018716-8642.975ENSSPAG00000007691-7547.967Stegastes_partitus
ENSACLG00000018716-9547.619ENSSPAG00000008950-6842.697Stegastes_partitus
ENSACLG00000018716-8653.333ENSSPAG00000007403-8653.333Stegastes_partitus
ENSACLG00000018716-6944.211ENSTGUG00000018439-10044.211Taeniopygia_guttata
ENSACLG00000018716-7344.186ENSTGUG00000015549-10044.186Taeniopygia_guttata
ENSACLG00000018716-7043.333ENSTGUG00000018254-9943.333Taeniopygia_guttata
ENSACLG00000018716-7244.361ENSTRUG00000023491-5944.361Takifugu_rubripes
ENSACLG00000018716-7351.111ENSTNIG00000002344-9151.111Tetraodon_nigroviridis
ENSACLG00000018716-7542.857ENSXCOG00000020769-8240.476Xiphophorus_couchianus
ENSACLG00000018716-7251.282ENSXCOG00000011372-6051.282Xiphophorus_couchianus
ENSACLG00000018716-7539.370ENSXCOG00000013306-6039.370Xiphophorus_couchianus
ENSACLG00000018716-7541.441ENSXMAG00000024378-5940.476Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000018716-9340.994ENSXMAG00000024973-6045.455Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000018716-7441.880ENSXMAG00000022894-5241.880Xiphophorus_maculatus

Copyright © , Bioinformatics Center, Sun Yat-sen Memorial Hospital, Sun Yat-sen University, China. All Rights Reserved.

Any comment and suggestion, please contact us