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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000018852 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5348 bases
Position: chr14:35695653-35701000
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000027762	MMR_HSR1	PF01926.23	5.9e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000028411	-	666	-	ENSACLP00000027762	221 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000018852	-	73	33.133	ENSACLG00000027515	KRAS	93	34.270
ENSACLG00000018852	-	70	38.125	ENSACLG00000003898	rab32b	73	38.125
ENSACLG00000018852	-	73	34.146	ENSACLG00000007804	si:ch73-116o1.2	83	36.313
ENSACLG00000018852	-	73	39.506	ENSACLG00000001646	-	77	39.506
ENSACLG00000018852	-	81	34.254	ENSACLG00000021547	rab33a	65	34.254
ENSACLG00000018852	-	79	41.808	ENSACLG00000022893	-	83	41.808
ENSACLG00000018852	-	86	39.691	ENSACLG00000000860	-	87	39.691
ENSACLG00000018852	-	67	34.228	ENSACLG00000001181	hrasb	84	34.161
ENSACLG00000018852	-	71	36.306	ENSACLG00000019423	rab41	74	36.306
ENSACLG00000018852	-	92	90.640	ENSACLG00000005420	rab11ba	93	90.640
ENSACLG00000018852	-	92	87.685	ENSACLG00000007076	rab11bb	93	87.685
ENSACLG00000018852	-	76	33.529	ENSACLG00000025632	rabl2	73	33.529
ENSACLG00000018852	-	66	40.789	ENSACLG00000010965	-	63	40.789
ENSACLG00000018852	-	79	41.954	ENSACLG00000018721	si:dkey-16l2.16	83	41.954
ENSACLG00000018852	-	71	47.134	ENSACLG00000002706	rab5c	71	47.134
ENSACLG00000018852	-	87	33.333	ENSACLG00000002819	rab23	84	34.314
ENSACLG00000018852	-	71	35.032	ENSACLG00000026487	rab6bb	76	35.526
ENSACLG00000018852	-	97	79.439	ENSACLG00000001775	rab11a	99	79.439
ENSACLG00000018852	-	74	31.098	ENSACLG00000008646	rheb	89	31.098
ENSACLG00000018852	-	71	42.675	ENSACLG00000021470	rab22a	81	42.675
ENSACLG00000018852	-	71	46.497	ENSACLG00000018066	rab5aa	73	46.497
ENSACLG00000018852	-	80	39.665	ENSACLG00000007514	rab42a	82	39.665
ENSACLG00000018852	-	82	36.364	ENSACLG00000024502	-	87	36.364
ENSACLG00000018852	-	72	41.615	ENSACLG00000007696	rab12	74	39.665
ENSACLG00000018852	-	80	49.432	ENSACLG00000006329	-	82	49.432
ENSACLG00000018852	-	77	35.359	ENSACLG00000005720	rab33ba	75	35.359
ENSACLG00000018852	-	50	30.088	ENSACLG00000014417	RAP2B	93	32.800
ENSACLG00000018852	-	91	44.059	ENSACLG00000013668	rab1ba	99	44.059
ENSACLG00000018852	-	92	76.847	ENSACLG00000010268	rab11al	94	76.847
ENSACLG00000018852	-	71	47.134	ENSACLG00000008615	-	71	47.134
ENSACLG00000018852	-	75	49.091	ENSACLG00000003326	-	82	49.091
ENSACLG00000018852	-	76	47.619	ENSACLG00000013734	-	79	47.619
ENSACLG00000018852	-	73	34.337	ENSACLG00000009103	si:cabz01085950.1	82	34.337
ENSACLG00000018852	-	77	38.636	ENSACLG00000004795	rab9b	78	38.636
ENSACLG00000018852	-	82	64.088	ENSACLG00000010251	rab25b	87	64.088
ENSACLG00000018852	-	80	37.989	ENSACLG00000027006	zgc:101559	76	37.989
ENSACLG00000018852	-	82	65.934	ENSACLG00000018262	rab25a	86	65.934
ENSACLG00000018852	-	76	40.936	ENSACLG00000009468	RAB39B	80	40.936
ENSACLG00000018852	-	87	42.487	ENSACLG00000019643	-	92	42.487
ENSACLG00000018852	-	75	43.373	ENSACLG00000011484	rab18a	81	43.373
ENSACLG00000018852	-	75	32.164	ENSACLG00000021109	si:dkey-13a21.4	82	32.164
ENSACLG00000018852	-	86	44.271	ENSACLG00000007644	rab1ab	95	44.271
ENSACLG00000018852	-	70	34.161	ENSACLG00000008602	RAB29	97	34.161
ENSACLG00000018852	-	80	49.432	ENSACLG00000013505	-	82	49.432
ENSACLG00000018852	-	73	33.133	ENSACLG00000027677	KRAS	93	34.270
ENSACLG00000018852	-	73	43.827	ENSACLG00000026336	rab15	76	43.827
ENSACLG00000018852	-	79	41.808	ENSACLG00000027590	-	83	41.808
ENSACLG00000018852	-	75	44.578	ENSACLG00000015289	rab18b	80	44.578
ENSACLG00000018852	-	92	88.177	ENSACLG00000005446	-	93	88.177
ENSACLG00000018852	-	76	37.059	ENSACLG00000011249	rras	84	37.059
ENSACLG00000018852	-	85	41.711	ENSACLG00000023526	rab30	92	41.711
ENSACLG00000018852	-	71	38.650	ENSACLG00000018847	RAB7A	78	38.650
ENSACLG00000018852	-	76	42.604	ENSACLG00000001218	RAB17	74	42.604
ENSACLG00000018852	-	82	38.172	ENSACLG00000024456	-	87	38.172
ENSACLG00000018852	-	71	35.669	ENSACLG00000025138	rab6ba	75	35.669
ENSACLG00000018852	-	71	30.061	ENSACLG00000004019	dnajc27	60	30.061
ENSACLG00000018852	-	71	37.267	ENSACLG00000006647	rab9a	79	37.267

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000018852	-	92	87.685	ENSG00000185236	RAB11B	100	91.304	Homo_sapiens
ENSACLG00000018852	-	92	86.408	ENSAMEG00000004955	RAB11B	93	86.408	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000018852	-	85	85.561	ENSACIG00000024374	rab11ba	77	85.561	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000018852	-	92	89.163	ENSAOCG00000018050	rab11ba	93	89.163	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000018852	-	92	88.670	ENSAPEG00000009177	rab11ba	93	88.670	Amphiprion_percula
ENSACLG00000018852	-	92	89.655	ENSATEG00000023730	rab11ba	93	89.655	Anabas_testudineus
ENSACLG00000018852	-	92	87.685	ENSANAG00000037616	RAB11B	95	89.412	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000018852	-	87	77.720	WBGene00004274	rab-11.1	91	77.720	Caenorhabditis_elegans
ENSACLG00000018852	-	92	87.685	ENSCJAG00000010778	RAB11B	95	89.412	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000018852	-	92	87.685	ENSCAFG00000032060	RAB11B	93	87.685	Canis_familiaris
ENSACLG00000018852	-	92	87.685	ENSCAFG00020022184	RAB11B	93	87.685	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000018852	-	92	87.685	ENSTSYG00000014758	RAB11B	93	87.685	Carlito_syrichta
ENSACLG00000018852	-	92	87.685	ENSCPOG00000030154	RAB11B	93	87.685	Cavia_porcellus
ENSACLG00000018852	-	92	87.685	ENSCCAG00000031042	RAB11B	94	89.412	Cebus_capucinus
ENSACLG00000018852	-	92	87.685	ENSCLAG00000003207	RAB11B	93	87.685	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000018852	-	92	87.685	ENSCSAG00000008024	RAB11B	93	87.685	Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000018852	-	92	74.384	ENSCHOG00000013525	RAB11B	93	74.384	Choloepus_hoffmanni
ENSACLG00000018852	-	92	79.310	ENSCING00000009526	-	94	79.310	Ciona_intestinalis
ENSACLG00000018852	-	92	87.685	ENSCANG00000040517	RAB11B	93	87.685	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000018852	-	92	87.685	ENSCGRG00001013827	Rab11b	93	87.685	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000018852	-	92	87.685	ENSCGRG00000010967	Rab11b	93	87.685	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACLG00000018852	-	92	88.670	ENSCSEG00000007121	rab11ba	79	88.670	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000018852	-	97	83.871	ENSDARG00000041878	rab11ba	99	83.871	Danio_rerio
ENSACLG00000018852	-	92	87.685	ENSDNOG00000014618	RAB11B	90	87.685	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000018852	-	92	86.207	ENSDNOG00000004134	-	93	86.207	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000018852	-	92	87.685	ENSDORG00000006304	Rab11b	93	87.685	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000018852	-	97	82.028	ENSEBUG00000011775	rab11ba	98	82.028	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000018852	-	97	72.685	ENSEBUG00000015447	-	99	72.685	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000018852	-	65	90.210	ENSEEUG00000009165	-	100	90.210	Erinaceus_europaeus
ENSACLG00000018852	-	88	84.021	ENSELUG00000019240	-	99	84.021	Esox_lucius
ENSACLG00000018852	-	92	87.685	ENSFCAG00000015216	RAB11B	93	87.685	Felis_catus
ENSACLG00000018852	-	92	87.685	ENSFDAG00000019872	RAB11B	93	87.685	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000018852	-	92	88.177	ENSFHEG00000022642	rab11ba	93	88.177	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000018852	-	92	87.192	ENSGMOG00000007390	rab11ba	93	87.192	Gadus_morhua
ENSACLG00000018852	-	92	88.670	ENSGAFG00000005679	rab11ba	93	88.670	Gambusia_affinis
ENSACLG00000018852	-	92	88.670	ENSGAGG00000012557	-	93	88.670	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000018852	-	92	87.685	ENSHGLG00000014984	RAB11B	93	87.685	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000018852	-	92	87.685	ENSHGLG00100003638	RAB11B	93	87.685	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000018852	-	92	87.685	ENSSTOG00000031571	RAB11B	93	87.685	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACLG00000018852	-	92	87.685	ENSJJAG00000018891	Rab11b	93	87.685	Jaculus_jaculus
ENSACLG00000018852	-	92	89.163	ENSKMAG00000006082	-	93	89.163	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000018852	-	97	83.796	ENSLBEG00000006087	rab11ba	99	83.796	Labrus_bergylta
ENSACLG00000018852	-	77	90.000	ENSLACG00000016974	RAB11B	99	90.000	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000018852	-	92	87.685	ENSLAFG00000013598	RAB11B	93	87.685	Loxodonta_africana
ENSACLG00000018852	-	92	87.685	ENSMNEG00000039759	-	93	87.685	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000018852	-	92	88.670	ENSMAMG00000018556	rab11ba	93	88.670	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000018852	-	100	100.000	ENSMZEG00005019251	-	100	100.000	Maylandia_zebra
ENSACLG00000018852	-	92	90.640	ENSMZEG00005010947	rab11ba	93	90.640	Maylandia_zebra
ENSACLG00000018852	-	92	87.685	ENSMAUG00000021579	Rab11b	93	87.685	Mesocricetus_auratus
ENSACLG00000018852	-	92	87.685	ENSMOCG00000012667	Rab11b	93	87.685	Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000018852	-	92	85.714	ENSMALG00000021949	rab11ba	93	85.714	Monopterus_albus
ENSACLG00000018852	-	92	87.685	MGP_CAROLIEiJ_G0021415	Rab11b	97	89.655	Mus_caroli
ENSACLG00000018852	-	92	87.685	ENSMUSG00000077450	Rab11b	97	89.655	Mus_musculus
ENSACLG00000018852	-	92	87.685	MGP_PahariEiJ_G0020420	Rab11b	93	87.685	Mus_pahari
ENSACLG00000018852	-	92	87.685	MGP_SPRETEiJ_G0022327	Rab11b	97	89.655	Mus_spretus
ENSACLG00000018852	-	92	87.685	ENSMPUG00000007263	RAB11B	93	87.685	Mustela_putorius_furo
ENSACLG00000018852	-	92	84.466	ENSMLUG00000002308	-	93	84.466	Myotis_lucifugus
ENSACLG00000018852	-	92	87.685	ENSNGAG00000015757	Rab11b	93	87.685	Nannospalax_galili
ENSACLG00000018852	-	92	91.133	ENSNBRG00000023898	rab11ba	78	91.133	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000018852	-	92	87.685	ENSNLEG00000001733	RAB11B	93	87.685	Nomascus_leucogenys
ENSACLG00000018852	-	92	87.685	ENSODEG00000011371	RAB11B	93	87.685	Octodon_degus
ENSACLG00000018852	-	92	90.640	ENSONIG00000002535	rab11ba	93	90.640	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000018852	-	71	90.446	ENSOCUG00000028208	RAB11B	64	88.820	Oryctolagus_cuniculus
ENSACLG00000018852	-	92	88.177	ENSORLG00000015307	rab11ba	93	88.177	Oryzias_latipes
ENSACLG00000018852	-	92	88.177	ENSORLG00020020816	rab11ba	93	88.177	Oryzias_latipes_hni
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ENSACLG00000018852	-	92	88.177	ENSOMEG00000002581	rab11ba	93	88.177	Oryzias_melastigma
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