EuRBPDB

  • Home
  • Cancer
  • Family
  • Species
  • RBPredictor
  • Search
  • Download
  • Submit
  • Help
  • Contact

  • Description
  • RBDs
  • Transcripts
  • Gene Model
  • PPI
  • Orthologs
Description
Ensembl ID
ENSACLG00000019137 (Gene tree)
Gene ID
113016240
Gene Symbol
ftsj3
Alias
cb410|ftsj|sb:cb410|wu:fa08a09
Full Name
FtsJ RNA methyltransferase homolog 3
Gene Type
protein_coding
Species
Astatotilapia_calliptera
Status
putative
Strand
Minus strand
Length
9621 bases
Position
chr23:85546-95166
Accession
ZDB-GENE-030131-9828
RBP type
canonical RBP
Summary
-
RNA binding domains(RBDs)
Protein IDDomain Pfam IDE-value Domain number Total number
ENSACLP00000028262FtsJPF01728.192.5e-5711
ENSACLP00000028366FtsJPF01728.192e-3312
ENSACLP00000028366FtsJPF01728.192e-3322
Transcripts
Transcript IDNameLengthRefSeq ID Protein IDLengthRefSeq IDUniportKB ID
ENSACLT00000028923-2187-ENSACLP00000028262728 (aa)--
ENSACLT00000029035-2085-ENSACLP00000028366695 (aa)--
Gene Model
Click here to download ENSACLG00000019137's gene model file
Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACLG00000019137's network
Orthologs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy OrthologGene SymbolCoverageIdentiy Species
ENSACLG00000019137ftsj39768.539ENSG00000108592FTSJ310088.696Homo_sapiens
ENSACLG00000019137ftsj39175.410ENSAPOG00000005543ftsj39178.012Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000019137ftsj39769.663ENSAMEG00000003148FTSJ38469.663Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000019137ftsj39792.737ENSACIG00000012880ftsj39976.265Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000019137ftsj39987.766ENSAOCG00000023196ftsj39479.540Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000019137ftsj39986.170ENSAPEG00000004250ftsj38686.170Amphiprion_percula
ENSACLG00000019137ftsj38985.714ENSATEG00000010069ftsj39078.415Anabas_testudineus
ENSACLG00000019137ftsj39068.889ENSAPLG00000010362-8468.889Anas_platyrhynchos
ENSACLG00000019137ftsj38469.832ENSACAG00000017930FTSJ38369.832Anolis_carolinensis
ENSACLG00000019137ftsj39769.101ENSANAG00000033774FTSJ38469.101Aotus_nancymaae
ENSACLG00000019137ftsj39881.768ENSAMXG00000021571ftsj38281.768Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000019137ftsj39769.231ENSBTAG00000021060FTSJ38469.231Bos_taurus
ENSACLG00000019137ftsj38747.930WBGene00019168H06I04.37548.000Caenorhabditis_elegans
ENSACLG00000019137ftsj39767.978ENSCJAG00000019631FTSJ38467.978Callithrix_jacchus
ENSACLG00000019137ftsj39768.539ENSCAFG00000012770FTSJ38468.539Canis_familiaris
ENSACLG00000019137ftsj39768.539ENSCAFG00020026630FTSJ38468.539Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000019137ftsj39769.361ENSCHIG00000025676FTSJ38669.173Capra_hircus
ENSACLG00000019137ftsj39269.101ENSTSYG00000001393FTSJ38369.101Carlito_syrichta
ENSACLG00000019137ftsj37169.101ENSCAPG00000016654FTSJ38967.179Cavia_aperea
ENSACLG00000019137ftsj39769.101ENSCPOG00000011384FTSJ38469.101Cavia_porcellus
ENSACLG00000019137ftsj39769.101ENSCCAG00000023533-9768.668Cebus_capucinus
ENSACLG00000019137ftsj39768.972ENSCATG00000018510FTSJ38468.972Cercocebus_atys
ENSACLG00000019137ftsj39769.101ENSCLAG00000003222FTSJ38469.101Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000019137ftsj39768.797ENSCSAG00000003921FTSJ38468.797Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000019137ftsj39770.225ENSCPBG00000010032FTSJ39869.663Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000019137ftsj39769.173ENSCANG00000042921FTSJ38469.173Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000019137ftsj39769.101ENSCGRG00001018068FTSJ38469.101Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000019137ftsj39769.101ENSCGRG00000010648FTSJ38469.101Cricetulus_griseus_crigri
ENSACLG00000019137ftsj39887.363ENSCSEG00000013468ftsj38387.363Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000019137ftsj39885.687ENSCVAG00000007484ftsj38685.553Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000019137ftsj39882.418ENSDARG00000104938ftsj39574.648Danio_rerio
ENSACLG00000019137ftsj39768.539ENSDNOG00000002392FTSJ38468.539Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000019137ftsj39769.101ENSDORG00000004200Ftsj38469.101Dipodomys_ordii
ENSACLG00000019137ftsj37059.692FBgn0030720CG89396259.692Drosophila_melanogaster
ENSACLG00000019137ftsj39769.663ENSETEG00000019228FTSJ38369.663Echinops_telfairi
ENSACLG00000019137ftsj39859.887ENSEBUG00000007828ftsj38560.150Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000019137ftsj39768.539ENSEASG00005013565FTSJ39864.171Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000019137ftsj39769.101ENSECAG00000011995FTSJ38469.101Equus_caballus
ENSACLG00000019137ftsj39879.781ENSELUG00000013501ftsj38379.781Esox_lucius
ENSACLG00000019137ftsj39769.101ENSFCAG00000013983FTSJ38469.101Felis_catus
ENSACLG00000019137ftsj39768.324ENSFALG00000013635FTSJ38568.692Ficedula_albicollis
ENSACLG00000019137ftsj39768.609ENSFDAG00000010274FTSJ38468.421Fukomys_damarensis
ENSACLG00000019137ftsj39887.363ENSFHEG00000007639ftsj38587.363Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000019137ftsj35981.693ENSGMOG00000017184ftsj310080.778Gadus_morhua
ENSACLG00000019137ftsj39770.370ENSGALG00000032993FTSJ38670.370Gallus_gallus
ENSACLG00000019137ftsj35982.436ENSGACG00000009841ftsj310082.436Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000019137ftsj39869.850ENSGAGG00000006236FTSJ38569.850Gopherus_agassizii
ENSACLG00000019137ftsj39768.539ENSGGOG00000006794FTSJ38468.972Gorilla_gorilla
ENSACLG00000019137ftsj39898.502ENSHBUG00000022331ftsj38398.502Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000019137ftsj39768.045ENSHGLG00000012282FTSJ38468.045Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000019137ftsj39768.045ENSHGLG00100003578FTSJ38468.045Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000019137ftsj39887.363ENSHCOG00000018770ftsj38387.363Hippocampus_comes
ENSACLG00000019137ftsj39876.000ENSIPUG00000024942ftsj38476.000Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000019137ftsj39769.663ENSSTOG00000021265FTSJ38469.663Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACLG00000019137ftsj39768.539ENSJJAG00000012822Ftsj38568.539Jaculus_jaculus
ENSACLG00000019137ftsj39887.363ENSKMAG00000021997ftsj38487.363Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000019137ftsj39983.511ENSLBEG00000027142ftsj38483.925Labrus_bergylta
ENSACLG00000019137ftsj37870.270ENSLACG00000005523FTSJ38270.270Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000019137ftsj39874.535ENSLOCG00000008979ftsj38475.836Lepisosteus_oculatus
ENSACLG00000019137ftsj39768.539ENSLAFG00000003252FTSJ38468.539Loxodonta_africana
ENSACLG00000019137ftsj39768.105ENSMFAG00000003764FTSJ38468.856Macaca_fascicularis
ENSACLG00000019137ftsj39860.354ENSMMUG00000016768FTSJ39860.354Macaca_mulatta
ENSACLG00000019137ftsj39768.914ENSMNEG00000029254FTSJ38469.101Macaca_nemestrina
ENSACLG00000019137ftsj39768.293ENSMLEG00000029091FTSJ38469.288Mandrillus_leucophaeus
ENSACLG00000019137ftsj39778.169ENSMAMG00000006408ftsj39872.966Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000019137ftsj39898.876ENSMZEG00005001992ftsj38398.876Maylandia_zebra
ENSACLG00000019137ftsj39770.185ENSMGAG00000000953FTSJ38865.936Meleagris_gallopavo
ENSACLG00000019137ftsj39768.539ENSMAUG00000015688Ftsj38568.539Mesocricetus_auratus
ENSACLG00000019137ftsj39769.549ENSMICG00000045996FTSJ38469.549Microcebus_murinus
ENSACLG00000019137ftsj39769.101ENSMOCG00000017809Ftsj38569.101Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000019137ftsj39986.170ENSMMOG00000019522ftsj37986.170Mola_mola
ENSACLG00000019137ftsj310067.840ENSMODG00000009901FTSJ38470.225Monodelphis_domestica
ENSACLG00000019137ftsj39770.225MGP_CAROLIEiJ_G0017315Ftsj38470.225Mus_caroli
ENSACLG00000019137ftsj39770.787ENSMUSG00000020706Ftsj38470.787Mus_musculus
ENSACLG00000019137ftsj39769.663MGP_PahariEiJ_G0018445Ftsj38469.663Mus_pahari
ENSACLG00000019137ftsj39770.225MGP_SPRETEiJ_G0018159Ftsj38470.225Mus_spretus
ENSACLG00000019137ftsj39769.663ENSMPUG00000014911FTSJ38469.663Mustela_putorius_furo
ENSACLG00000019137ftsj39769.101ENSMLUG00000011667FTSJ38469.101Myotis_lucifugus
ENSACLG00000019137ftsj39768.539ENSNGAG00000005899Ftsj38568.609Nannospalax_galili
ENSACLG00000019137ftsj310099.137ENSNBRG00000017453ftsj39899.137Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000019137ftsj39768.045ENSNLEG00000004188FTSJ38468.480Nomascus_leucogenys
ENSACLG00000019137ftsj39770.455ENSMEUG00000013252FTSJ38470.455Notamacropus_eugenii
ENSACLG00000019137ftsj39769.663ENSOPRG00000014985FTSJ38469.663Ochotona_princeps
ENSACLG00000019137ftsj39769.101ENSODEG00000008167FTSJ38469.101Octodon_degus
ENSACLG00000019137ftsj39997.566ENSONIG00000001654ftsj38497.566Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000019137ftsj39770.225ENSOCUG00000004319FTSJ38470.225Oryctolagus_cuniculus
ENSACLG00000019137ftsj39985.106ENSORLG00000005910ftsj38485.106Oryzias_latipes
ENSACLG00000019137ftsj39985.106ENSORLG00020021255ftsj39778.655Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000019137ftsj39985.106ENSORLG00015018416ftsj38485.421Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000019137ftsj39087.634ENSOMEG00000014432ftsj39877.500Oryzias_melastigma
ENSACLG00000019137ftsj39768.233ENSOGAG00000032479FTSJ38468.293Otolemur_garnettii
ENSACLG00000019137ftsj39769.361ENSOARG00000013637FTSJ38469.173Ovis_aries
ENSACLG00000019137ftsj39768.539ENSPPAG00000027297FTSJ38468.785Pan_paniscus
ENSACLG00000019137ftsj39769.101ENSPPRG00000003042FTSJ38469.101Panthera_pardus
ENSACLG00000019137ftsj39769.101ENSPTIG00000012576FTSJ38569.101Panthera_tigris_altaica
ENSACLG00000019137ftsj39768.539ENSPTRG00000009524FTSJ38468.972Pan_troglodytes
ENSACLG00000019137ftsj39768.856ENSPANG00000020978FTSJ38469.043Papio_anubis
ENSACLG00000019137ftsj39779.888ENSPKIG00000012838ftsj39669.654Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000019137ftsj36785.000ENSPSIG00000004632FTSJ36982.979Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000019137ftsj39879.275ENSPMGG00000012959ftsj39973.217Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000019137ftsj39769.101ENSPEMG00000000248Ftsj38569.101Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACLG00000019137ftsj39770.225ENSPCIG00000009088FTSJ38470.225Phascolarctos_cinereus
ENSACLG00000019137ftsj39887.363ENSPFOG00000023101ftsj39578.490Poecilia_formosa
ENSACLG00000019137ftsj39887.363ENSPLAG00000003846ftsj39578.261Poecilia_latipinna
ENSACLG00000019137ftsj39887.363ENSPMEG00000012692ftsj39578.261Poecilia_mexicana
ENSACLG00000019137ftsj39885.714ENSPREG00000014874ftsj39578.330Poecilia_reticulata
ENSACLG00000019137ftsj39767.481ENSPPYG00000008532FTSJ38467.416Pongo_abelii
ENSACLG00000019137ftsj39767.978ENSPCAG00000002560FTSJ38568.750Procavia_capensis
ENSACLG00000019137ftsj39768.797ENSPCOG00000023921FTSJ38468.797Propithecus_coquereli
ENSACLG00000019137ftsj39768.539ENSPVAG00000000162FTSJ38468.539Pteropus_vampyrus
ENSACLG00000019137ftsj310099.283ENSPNYG00000005108ftsj310099.283Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000019137ftsj39480.571ENSPNAG00000022474ftsj38180.663Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000019137ftsj39769.663ENSRNOG00000009857Ftsj38569.663Rattus_norvegicus
ENSACLG00000019137ftsj39769.173ENSRBIG00000039259FTSJ38468.985Rhinopithecus_bieti
ENSACLG00000019137ftsj39769.173ENSRROG00000045002FTSJ38468.985Rhinopithecus_roxellana
ENSACLG00000019137ftsj39937.083YCL054W-7644.262Saccharomyces_cerevisiae
ENSACLG00000019137ftsj39769.663ENSSBOG00000031794FTSJ37869.663Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACLG00000019137ftsj39770.225ENSSHAG00000013062FTSJ38470.225Sarcophilus_harrisii
ENSACLG00000019137ftsj39880.663ENSSFOG00015018053ftsj38480.663Scleropages_formosus
ENSACLG00000019137ftsj39886.264ENSSMAG00000002863ftsj38486.264Scophthalmus_maximus
ENSACLG00000019137ftsj39988.830ENSSDUG00000003385ftsj38488.830Seriola_dumerili
ENSACLG00000019137ftsj39988.830ENSSLDG00000017970ftsj38488.830Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000019137ftsj39069.476ENSSPUG00000012959FTSJ38669.476Sphenodon_punctatus
ENSACLG00000019137ftsj39987.766ENSSPAG00000002390ftsj38587.766Stegastes_partitus
ENSACLG00000019137ftsj39768.539ENSSSCG00000017288FTSJ38468.539Sus_scrofa
ENSACLG00000019137ftsj39884.066ENSTRUG00000017550ftsj39381.121Takifugu_rubripes
ENSACLG00000019137ftsj39884.615ENSTNIG00000015549ftsj38584.615Tetraodon_nigroviridis
ENSACLG00000019137ftsj39767.669ENSTBEG00000010295FTSJ38467.669Tupaia_belangeri
ENSACLG00000019137ftsj39767.978ENSTTRG00000006973FTSJ38468.233Tursiops_truncatus
ENSACLG00000019137ftsj37886.139ENSUAMG00000007332FTSJ39672.346Ursus_americanus
ENSACLG00000019137ftsj39770.225ENSUMAG00000017450FTSJ38470.225Ursus_maritimus
ENSACLG00000019137ftsj39769.101ENSVVUG00000006106FTSJ38469.101Vulpes_vulpes
ENSACLG00000019137ftsj39469.101ENSXETG00000006939ftsj38269.101Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000019137ftsj39876.440ENSXCOG00000002999ftsj39676.312Xiphophorus_couchianus
ENSACLG00000019137ftsj39885.165ENSXMAG00000018139ftsj39478.719Xiphophorus_maculatus

Copyright © , Bioinformatics Center, Sun Yat-sen Memorial Hospital, Sun Yat-sen University, China. All Rights Reserved.

Any comment and suggestion, please contact us