EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000019219 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1707 bases
Position: chr2:17213896-17215602
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000028336	RVT_1	PF00078.27	6.1e-48	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000029004	-	1707	-	ENSACLP00000028336	453 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000019219	-	73	52.727	ENSACLG00000009848	-	75	52.727
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ENSACLG00000019219	-	66	32.039	ENSACLG00000022051	-	80	32.039
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ENSACLG00000019219	-	63	33.449	ENSPSIG00000000025	-	52	33.449	Pelodiscus_sinensis
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ENSACLG00000019219	-	60	30.282	ENSPSIG00000000719	-	87	30.282	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000019219	-	72	32.831	ENSPSIG00000001440	-	71	32.831	Pelodiscus_sinensis
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ENSACLG00000019219	-	58	34.221	ENSPSIG00000000039	-	72	34.221	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000019219	-	76	31.742	ENSPSIG00000000449	-	97	31.742	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000019219	-	67	36.570	ENSPMEG00000016465	-	75	36.570	Poecilia_mexicana
ENSACLG00000019219	-	51	35.897	ENSPMEG00000007569	-	60	35.897	Poecilia_mexicana
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ENSACLG00000019219	-	85	45.195	ENSPREG00000001108	-	99	45.195	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000019219	-	99	45.254	ENSPREG00000003521	-	99	45.254	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000019219	-	97	50.114	ENSPNYG00000010168	-	78	50.114	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000019219	-	96	45.000	ENSXMAG00000028454	-	99	45.000	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000019219	-	82	44.828	ENSXMAG00000023013	-	99	44.828	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000019219	-	99	47.357	ENSXMAG00000023609	-	56	47.357	Xiphophorus_maculatus