EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000019420 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1656 bases
Position: chr4:10756956-10758611
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000028606	RVT_1	PF00078.27	6.2e-46	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000029281	-	1656	-	ENSACLP00000028606	501 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
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Orthologs

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ENSACLG00000019420	-	50	56.452	ENSPNAG00000013203	-	93	57.692	Pygocentrus_nattereri
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ENSACLG00000019420	-	64	39.198	ENSSFOG00015008653	-	82	39.198	Scleropages_formosus
ENSACLG00000019420	-	64	40.683	ENSSFOG00015016391	-	91	40.798	Scleropages_formosus
ENSACLG00000019420	-	63	61.006	ENSSDUG00000000707	-	100	61.006	Seriola_dumerili
ENSACLG00000019420	-	79	36.139	ENSSPAG00000002518	-	80	36.139	Stegastes_partitus
ENSACLG00000019420	-	51	57.874	ENSTRUG00000025266	-	88	56.911	Takifugu_rubripes
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ENSACLG00000019420	-	94	50.636	ENSXMAG00000020915	-	85	50.636	Xiphophorus_maculatus