EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000019424 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 37238 bases
Position: chr6:41010795-41048032
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSACLP00000028623	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-46	7	7
ENSACLP00000028646	zf-C2H2	PF00096.26	5.6e-14	1	2
ENSACLP00000028646	zf-C2H2	PF00096.26	5.6e-14	2	2
ENSACLP00000028634	zf-C2H2	PF00096.26	3.1e-13	1	2
ENSACLP00000028634	zf-C2H2	PF00096.26	3.1e-13	2	2
ENSACLP00000028623	zf-met	PF12874.7	3e-07	1	2
ENSACLP00000028623	zf-met	PF12874.7	3e-07	2	2

Transcripts

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000019424	-	99	42.667	ENSACLG00000022360	-	96	50.000
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ENSACLG00000019424	-	97	34.167	ENSACLG00000020579	znf319b	76	47.778
ENSACLG00000019424	-	96	38.576	ENSACLG00000015989	-	86	38.361
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ENSACLG00000019424	-	96	44.118	ENSACLG00000021045	-	92	47.541
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ENSACLG00000019424	-	96	48.936	ENSACLG00000018716	-	97	45.872
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ENSACLG00000019424	-	96	59.459	ENSVVUG00000002015	-	88	56.410	Vulpes_vulpes
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ENSACLG00000019424	-	97	35.362	ENSXMAG00000000617	-	73	35.276	Xiphophorus_maculatus