EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000019643 (Gene tree)
Gene ID: 113031680
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: ras-related protein Rab-13
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 14503 bases
Position: chr11:20746735-20761237
Accession: 113031680
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000028966	MMR_HSR1	PF01926.23	0.00011	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000029646	-	2092	XM_026183977	ENSACLP00000028966	200 (aa)	XP_026039761	UPI0003298088

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000019643	-	77	36.364	ENSACLG00000008646	rheb	83	36.364
ENSACLG00000019643	-	90	38.095	ENSACLG00000024502	-	91	38.095
ENSACLG00000019643	-	90	55.866	ENSACLG00000013668	rab1ba	87	55.866
ENSACLG00000019643	-	94	41.837	ENSACLG00000021547	rab33a	70	41.837
ENSACLG00000019643	-	85	38.857	ENSACLG00000004795	rab9b	78	38.857
ENSACLG00000019643	-	95	42.857	ENSACLG00000010251	rab25b	95	42.857
ENSACLG00000019643	-	97	37.500	ENSACLG00000013505	-	97	37.500
ENSACLG00000019643	-	89	56.180	ENSACLG00000013734	-	84	56.180
ENSACLG00000019643	-	99	54.545	ENSACLG00000003326	-	96	54.545
ENSACLG00000019643	-	81	32.370	ENSACLG00000019293	rasl11a	67	32.370
ENSACLG00000019643	-	98	32.161	ENSACLG00000009103	si:cabz01085950.1	95	32.161
ENSACLG00000019643	-	85	45.930	ENSACLG00000022893	-	81	45.930
ENSACLG00000019643	-	93	40.323	ENSACLG00000018262	rab25a	89	40.323
ENSACLG00000019643	-	87	38.983	ENSACLG00000021109	si:dkey-13a21.4	85	38.983
ENSACLG00000019643	-	94	35.644	ENSACLG00000005733	rab34b	76	35.644
ENSACLG00000019643	-	87	47.977	ENSACLG00000005420	rab11ba	79	47.977
ENSACLG00000019643	-	86	31.792	ENSACLG00000025632	rabl2	74	31.792
ENSACLG00000019643	-	81	37.423	ENSACLG00000001218	RAB17	71	37.423
ENSACLG00000019643	-	96	35.233	ENSACLG00000027677	KRAS	95	35.233
ENSACLG00000019643	-	93	45.699	ENSACLG00000001775	rab11a	92	41.538
ENSACLG00000019643	-	96	36.082	ENSACLG00000011249	rras	96	36.082
ENSACLG00000019643	-	81	42.236	ENSACLG00000002706	rab5c	73	42.236
ENSACLG00000019643	-	80	45.122	ENSACLG00000027006	zgc:101559	69	45.122
ENSACLG00000019643	-	82	33.333	ENSACLG00000016163	rasl11b	77	33.163
ENSACLG00000019643	-	79	45.570	ENSACLG00000026487	rab6bb	76	46.053
ENSACLG00000019643	-	88	51.977	ENSACLG00000007696	rab12	71	51.744
ENSACLG00000019643	-	87	47.977	ENSACLG00000005446	-	79	47.977
ENSACLG00000019643	-	73	44.371	ENSACLG00000010965	-	63	44.371
ENSACLG00000019643	-	88	56.000	ENSACLG00000026336	rab15	82	56.000
ENSACLG00000019643	-	90	44.865	ENSACLG00000011484	rab18a	88	44.865
ENSACLG00000019643	-	85	50.588	ENSACLG00000018721	si:dkey-16l2.16	81	50.588
ENSACLG00000019643	-	96	35.233	ENSACLG00000027515	KRAS	95	35.233
ENSACLG00000019643	-	84	42.012	ENSACLG00000007514	rab42a	78	42.012
ENSACLG00000019643	-	88	39.106	ENSACLG00000024456	-	85	39.106
ENSACLG00000019643	-	92	47.027	ENSACLG00000000860	-	83	47.027
ENSACLG00000019643	-	98	53.535	ENSACLG00000007644	rab1ab	98	53.535
ENSACLG00000019643	-	86	56.725	ENSACLG00000001646	-	81	56.725
ENSACLG00000019643	-	69	31.884	ENSACLG00000027139	arl3	72	31.884
ENSACLG00000019643	-	95	40.000	ENSACLG00000008615	-	88	40.000
ENSACLG00000019643	-	75	30.065	ENSACLG00000012519	-	80	30.065
ENSACLG00000019643	-	94	37.561	ENSACLG00000005093	rab34a	76	37.561
ENSACLG00000019643	-	86	48.538	ENSACLG00000023526	rab30	84	48.538
ENSACLG00000019643	-	87	47.977	ENSACLG00000007076	rab11bb	79	47.977
ENSACLG00000019643	-	56	37.168	ENSACLG00000014417	RAP2B	94	37.600
ENSACLG00000019643	-	78	40.123	ENSACLG00000008602	RAB29	98	40.123
ENSACLG00000019643	-	88	38.547	ENSACLG00000018847	RAB7A	86	38.547
ENSACLG00000019643	-	81	40.373	ENSACLG00000021470	rab22a	83	40.373
ENSACLG00000019643	-	85	45.930	ENSACLG00000027590	-	81	45.930
ENSACLG00000019643	-	85	39.891	ENSACLG00000005720	rab33ba	75	39.891
ENSACLG00000019643	-	86	45.087	ENSACLG00000009468	RAB39B	81	45.087
ENSACLG00000019643	-	92	42.487	ENSACLG00000018852	-	87	42.487
ENSACLG00000019643	-	84	44.910	ENSACLG00000006329	-	78	44.910
ENSACLG00000019643	-	82	40.476	ENSACLG00000006647	rab9a	83	40.476
ENSACLG00000019643	-	85	37.278	ENSACLG00000002819	rab23	77	37.017
ENSACLG00000019643	-	96	34.896	ENSACLG00000001181	hrasb	98	34.896
ENSACLG00000019643	-	95	43.590	ENSACLG00000015289	rab18b	93	43.590
ENSACLG00000019643	-	82	40.828	ENSACLG00000003898	rab32b	78	40.828
ENSACLG00000019643	-	79	44.937	ENSACLG00000019423	rab41	75	44.937
ENSACLG00000019643	-	95	40.104	ENSACLG00000018066	rab5aa	89	40.104
ENSACLG00000019643	-	84	37.647	ENSACLG00000007804	si:ch73-116o1.2	94	35.204
ENSACLG00000019643	-	84	42.775	ENSACLG00000025138	rab6ba	83	42.775
ENSACLG00000019643	-	97	44.059	ENSACLG00000010268	rab11al	94	44.059

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000019643	-	100	96.500	ENSAPOG00000001040	-	100	96.500	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000019643	-	100	67.164	ENSACIG00000003157	-	100	67.164	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000019643	-	100	96.500	ENSAOCG00000015908	-	100	96.500	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000019643	-	100	96.500	ENSAPEG00000004121	-	100	96.500	Amphiprion_percula
ENSACLG00000019643	-	100	91.500	ENSATEG00000023662	-	100	91.500	Anabas_testudineus
ENSACLG00000019643	-	100	92.500	ENSCVAG00000022649	-	100	92.500	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000019643	-	86	73.837	ENSDARG00000103934	megf8	99	73.837	Danio_rerio
ENSACLG00000019643	-	100	91.000	ENSGAFG00000014787	-	100	91.000	Gambusia_affinis
ENSACLG00000019643	-	100	99.500	ENSHBUG00000003728	-	100	99.500	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000019643	-	100	100.000	ENSMZEG00005015817	-	100	100.000	Maylandia_zebra
ENSACLG00000019643	-	100	94.000	ENSMMOG00000003924	-	100	94.000	Mola_mola
ENSACLG00000019643	-	100	94.000	ENSMALG00000020807	-	100	94.000	Monopterus_albus
ENSACLG00000019643	-	54	89.815	ENSOPRG00000014416	-	100	89.815	Ochotona_princeps
ENSACLG00000019643	-	100	91.000	ENSORLG00000025395	-	100	91.000	Oryzias_latipes
ENSACLG00000019643	-	100	91.000	ENSORLG00020009535	-	100	91.000	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000019643	-	100	91.500	ENSORLG00015015518	-	100	91.500	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000019643	-	100	87.562	ENSPKIG00000014528	-	100	87.562	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000019643	-	100	92.500	ENSPFOG00000014418	-	100	92.500	Poecilia_formosa
ENSACLG00000019643	-	100	92.500	ENSPLAG00000003181	-	100	92.500	Poecilia_latipinna
ENSACLG00000019643	-	100	92.500	ENSPMEG00000008020	-	100	92.500	Poecilia_mexicana
ENSACLG00000019643	-	100	92.500	ENSPMEG00000022988	-	100	92.500	Poecilia_mexicana
ENSACLG00000019643	-	100	98.500	ENSPNYG00000004681	-	100	98.500	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000019643	-	100	90.000	ENSSFOG00015021754	rab13	100	90.000	Scleropages_formosus
ENSACLG00000019643	-	100	67.633	ENSSMAG00000002569	-	100	67.633	Scophthalmus_maximus
ENSACLG00000019643	-	100	95.000	ENSSMAG00000016376	-	100	95.000	Scophthalmus_maximus
ENSACLG00000019643	-	100	96.500	ENSSDUG00000006307	-	100	96.500	Seriola_dumerili
ENSACLG00000019643	-	100	96.500	ENSSLDG00000015823	-	100	96.500	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000019643	-	100	96.500	ENSSPAG00000022440	-	100	96.500	Stegastes_partitus
ENSACLG00000019643	-	100	94.000	ENSTNIG00000018319	-	100	94.000	Tetraodon_nigroviridis
ENSACLG00000019643	-	100	91.500	ENSXMAG00000016094	-	100	91.500	Xiphophorus_maculatus