EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000019674 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 83004 bases
Position: chr9:11866540-11949543
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSACLP00000029009	zf-C2H2	PF00096.26	4.5e-42	4	8
ENSACLP00000029009	zf-C2H2	PF00096.26	4.5e-42	5	8
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ENSACLP00000029009	zf-C2H2	PF00096.26	4.5e-42	7	8
ENSACLP00000029009	zf-C2H2	PF00096.26	4.5e-42	8	8
ENSACLP00000029024	zf-C2H2	PF00096.26	6.7e-31	1	7
ENSACLP00000029024	zf-C2H2	PF00096.26	6.7e-31	2	7
ENSACLP00000029024	zf-C2H2	PF00096.26	6.7e-31	3	7
ENSACLP00000029024	zf-C2H2	PF00096.26	6.7e-31	4	7
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ENSACLP00000029024	zf-C2H2	PF00096.26	6.7e-31	7	7
ENSACLP00000029009	zf-met	PF12874.7	4.4e-06	1	2
ENSACLP00000029009	zf-met	PF12874.7	4.4e-06	2	2
ENSACLP00000029024	zf-met	PF12874.7	7.1e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
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Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000019674	-	93	45.455	ENSACLG00000015843	-	88	47.826
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ENSACLG00000019674	-	92	62.617	ENSACLG00000006528	-	97	62.617
ENSACLG00000019674	-	88	42.512	ENSACLG00000026538	-	83	40.777
ENSACLG00000019674	-	90	47.534	ENSACLG00000017329	-	82	47.826
ENSACLG00000019674	-	89	46.296	ENSACLG00000017321	-	80	42.949
ENSACLG00000019674	-	94	44.872	ENSACLG00000018746	-	97	37.383
ENSACLG00000019674	-	94	37.975	ENSACLG00000027692	-	71	38.554
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ENSACLG00000019674	-	93	42.222	ENSACLG00000024957	-	95	43.902
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ENSACLG00000019674	-	89	43.415	ENSSLDG00000006288	-	95	40.789	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000019674	-	91	49.020	ENSSPAG00000008865	-	87	43.182	Stegastes_partitus
ENSACLG00000019674	-	95	42.029	ENSSSCG00000038009	-	86	43.961	Sus_scrofa
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ENSACLG00000019674	-	88	43.137	ENSTNIG00000003479	-	98	41.667	Tetraodon_nigroviridis
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ENSACLG00000019674	-	94	42.922	ENSXETG00000030307	-	100	42.927	Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000019674	-	99	39.286	ENSXETG00000010512	-	100	39.286	Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000019674	-	89	40.789	ENSXMAG00000000617	-	71	40.789	Xiphophorus_maculatus