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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSACLG00000019742 (Gene tree)
Gene ID: 113029366
Gene Symbol: ipo4
Alias: si:ch211-196f5.1
Full Name: importin 4
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10411 bases
Position: chr9:12037569-12047979
Accession: ZDB-GENE-041014-307
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000029182	RIX1	PF08167.12	1.8e-08	1	1
ENSACLP00000029182	IBN_N	PF03810.19	6.3e-14	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000029868	-	3159	-	ENSACLP00000029182	1052 (aa)	-	-

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Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000019742	ipo4	99	44.712	ENSG00000196497	IPO4	99	44.577	Homo_sapiens
ENSACLG00000019742	ipo4	100	81.530	ENSAPOG00000019018	ipo4	100	81.437	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000019742	ipo4	88	46.203	ENSAMEG00000016271	IPO4	85	42.989	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000019742	ipo4	100	84.551	ENSACIG00000004246	ipo4	100	84.551	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000019742	ipo4	100	82.385	ENSAOCG00000004773	ipo4	100	82.385	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000019742	ipo4	100	83.411	ENSAPEG00000002112	ipo4	100	83.411	Amphiprion_percula
ENSACLG00000019742	ipo4	92	86.646	ENSATEG00000017082	ipo4	97	86.646	Anabas_testudineus
ENSACLG00000019742	ipo4	86	45.963	ENSACAG00000003973	-	97	46.587	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000019742	ipo4	94	45.879	ENSANAG00000037973	IPO4	99	44.301	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000019742	ipo4	100	71.802	ENSAMXG00000037878	ipo4	100	71.802	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000019742	ipo4	95	45.526	ENSBTAG00000002707	IPO4	98	44.247	Bos_taurus
ENSACLG00000019742	ipo4	99	44.620	ENSCJAG00000006937	IPO4	99	44.528	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000019742	ipo4	94	46.574	ENSCAFG00000012049	IPO4	93	46.418	Canis_familiaris
ENSACLG00000019742	ipo4	94	46.238	ENSCAFG00020002873	IPO4	97	43.650	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000019742	ipo4	94	45.879	ENSCHIG00000009413	IPO4	94	44.621	Capra_hircus
ENSACLG00000019742	ipo4	94	45.978	ENSTSYG00000002643	IPO4	98	44.963	Carlito_syrichta
ENSACLG00000019742	ipo4	95	46.214	ENSCPOG00000014783	IPO4	93	46.018	Cavia_porcellus
ENSACLG00000019742	ipo4	99	44.145	ENSCCAG00000037929	IPO4	99	44.210	Cebus_capucinus
ENSACLG00000019742	ipo4	99	44.610	ENSCATG00000040395	IPO4	99	44.577	Cercocebus_atys
ENSACLG00000019742	ipo4	95	46.116	ENSCLAG00000012817	IPO4	93	46.026	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000019742	ipo4	93	46.294	ENSCPBG00000025757	IPO4	99	44.193	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000019742	ipo4	94	36.469	ENSCING00000008639	-	99	36.550	Ciona_intestinalis
ENSACLG00000019742	ipo4	95	36.750	ENSCSAVG00000011482	-	99	37.016	Ciona_savignyi
ENSACLG00000019742	ipo4	99	44.424	ENSCANG00000029513	IPO4	99	44.424	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000019742	ipo4	95	45.776	ENSCGRG00001001217	Ipo4	93	45.446	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000019742	ipo4	95	45.776	ENSCGRG00000014404	Ipo4	93	45.446	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACLG00000019742	ipo4	100	74.105	ENSCSEG00000009606	ipo4	100	73.462	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000019742	ipo4	99	70.718	ENSCVAG00000002281	ipo4	100	71.103	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000019742	ipo4	100	72.268	ENSDARG00000041493	ipo4	100	72.268	Danio_rerio
ENSACLG00000019742	ipo4	99	44.875	ENSDNOG00000000366	IPO4	99	44.506	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000019742	ipo4	94	46.276	ENSDORG00000009274	Ipo4	98	44.944	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000019742	ipo4	95	30.703	FBgn0042177	CG32164	93	30.221	Drosophila_melanogaster
ENSACLG00000019742	ipo4	95	45.933	ENSETEG00000018381	IPO4	99	43.981	Echinops_telfairi
ENSACLG00000019742	ipo4	92	46.193	ENSEASG00005011954	IPO4	96	45.998	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000019742	ipo4	95	45.919	ENSECAG00000009909	IPO4	98	44.579	Equus_caballus
ENSACLG00000019742	ipo4	100	73.670	ENSELUG00000020628	ipo4	100	73.670	Esox_lucius
ENSACLG00000019742	ipo4	95	46.608	ENSFCAG00000005587	IPO4	98	45.047	Felis_catus
ENSACLG00000019742	ipo4	95	42.549	ENSFDAG00000000725	IPO4	91	44.891	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000019742	ipo4	89	79.919	ENSFHEG00000009351	ipo4	98	78.658	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000019742	ipo4	100	76.909	ENSGMOG00000001801	ipo4	99	76.909	Gadus_morhua
ENSACLG00000019742	ipo4	100	77.544	ENSGAFG00000005601	ipo4	100	77.544	Gambusia_affinis
ENSACLG00000019742	ipo4	100	78.453	ENSGACG00000002276	ipo4	99	78.453	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000019742	ipo4	99	44.620	ENSGGOG00000016062	IPO4	99	44.485	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000019742	ipo4	100	97.561	ENSHBUG00000023269	ipo4	100	97.561	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000019742	ipo4	95	45.821	ENSHGLG00000002923	IPO4	93	45.829	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000019742	ipo4	95	45.624	ENSHGLG00100003725	IPO4	93	45.633	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000019742	ipo4	99	74.661	ENSHCOG00000016854	ipo4	99	74.661	Hippocampus_comes
ENSACLG00000019742	ipo4	100	71.823	ENSIPUG00000001185	ipo4	100	71.731	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000019742	ipo4	95	46.903	ENSSTOG00000002288	IPO4	99	44.885	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACLG00000019742	ipo4	96	46.033	ENSJJAG00000019002	Ipo4	99	44.291	Jaculus_jaculus
ENSACLG00000019742	ipo4	100	78.145	ENSKMAG00000004627	ipo4	100	78.053	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000019742	ipo4	100	80.865	ENSLBEG00000024952	ipo4	100	80.865	Labrus_bergylta
ENSACLG00000019742	ipo4	100	49.686	ENSLACG00000001428	IPO4	100	49.596	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000019742	ipo4	78	70.077	ENSLOCG00000001149	ipo4	82	69.054	Lepisosteus_oculatus
ENSACLG00000019742	ipo4	95	45.837	ENSLAFG00000015852	IPO4	94	45.402	Loxodonta_africana
ENSACLG00000019742	ipo4	99	44.703	ENSMFAG00000000743	IPO4	99	44.669	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000019742	ipo4	99	44.703	ENSMMUG00000012481	IPO4	99	44.669	Macaca_mulatta
ENSACLG00000019742	ipo4	99	44.703	ENSMNEG00000043531	IPO4	99	44.669	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000019742	ipo4	99	44.703	ENSMLEG00000042067	IPO4	99	44.669	Mandrillus_leucophaeus
ENSACLG00000019742	ipo4	100	80.018	ENSMAMG00000021976	ipo4	100	80.018	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000019742	ipo4	100	97.842	ENSMZEG00005017273	ipo4	100	97.842	Maylandia_zebra
ENSACLG00000019742	ipo4	99	44.199	ENSMAUG00000017565	Ipo4	99	44.128	Mesocricetus_auratus
ENSACLG00000019742	ipo4	94	45.978	ENSMICG00000001719	IPO4	98	44.860	Microcebus_murinus
ENSACLG00000019742	ipo4	98	43.377	ENSMOCG00000020462	Ipo4	99	43.186	Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000019742	ipo4	100	79.485	ENSMMOG00000005264	ipo4	100	79.577	Mola_mola
ENSACLG00000019742	ipo4	99	42.382	ENSMODG00000003337	IPO4	96	42.435	Monodelphis_domestica
ENSACLG00000019742	ipo4	100	79.136	ENSMALG00000001587	ipo4	100	79.320	Monopterus_albus
ENSACLG00000019742	ipo4	95	44.892	MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	45.264	Mus_caroli
ENSACLG00000019742	ipo4	95	44.499	ENSMUSG00000002319	Ipo4	99	44.772	Mus_musculus
ENSACLG00000019742	ipo4	95	44.936	MGP_PahariEiJ_G0030322	Ipo4	98	45.477	Mus_pahari
ENSACLG00000019742	ipo4	95	44.794	MGP_SPRETEiJ_G0020194	Ipo4	99	45.018	Mus_spretus
ENSACLG00000019742	ipo4	99	44.968	ENSMPUG00000005916	IPO4	99	44.885	Mustela_putorius_furo
ENSACLG00000019742	ipo4	95	45.231	ENSMLUG00000025277	IPO4	84	44.288	Myotis_lucifugus
ENSACLG00000019742	ipo4	95	46.214	ENSNGAG00000019340	Ipo4	98	44.757	Nannospalax_galili
ENSACLG00000019742	ipo4	100	93.534	ENSNBRG00000005870	ipo4	100	93.534	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000019742	ipo4	95	46.903	ENSOPRG00000016615	IPO4	93	46.804	Ochotona_princeps
ENSACLG00000019742	ipo4	95	46.706	ENSODEG00000002609	IPO4	93	46.320	Octodon_degus
ENSACLG00000019742	ipo4	100	92.634	ENSONIG00000014574	ipo4	100	92.634	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000019742	ipo4	95	46.358	ENSOCUG00000002881	IPO4	93	46.161	Oryctolagus_cuniculus
ENSACLG00000019742	ipo4	100	77.561	ENSORLG00000006457	ipo4	100	77.281	Oryzias_latipes
ENSACLG00000019742	ipo4	100	77.921	ENSORLG00020004286	ipo4	100	77.645	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000019742	ipo4	100	77.921	ENSORLG00015021856	ipo4	100	77.645	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000019742	ipo4	99	75.743	ENSOMEG00000016203	ipo4	100	75.482	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000019742	ipo4	94	45.034	ENSOGAG00000010642	IPO4	98	44.206	Otolemur_garnettii
ENSACLG00000019742	ipo4	94	45.165	ENSOARG00000019188	IPO4	97	43.886	Ovis_aries
ENSACLG00000019742	ipo4	99	44.620	ENSPPAG00000035476	IPO4	99	43.945	Pan_paniscus
ENSACLG00000019742	ipo4	95	46.804	ENSPPRG00000023607	IPO4	99	44.618	Panthera_pardus
ENSACLG00000019742	ipo4	95	46.706	ENSPTIG00000008720	IPO4	98	45.140	Panthera_tigris_altaica
ENSACLG00000019742	ipo4	99	44.434	ENSPTRG00000006200	IPO4	99	44.210	Pan_troglodytes
ENSACLG00000019742	ipo4	99	44.796	ENSPANG00000026278	IPO4	99	44.761	Papio_anubis
ENSACLG00000019742	ipo4	99	67.066	ENSPKIG00000007683	-	99	67.005	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000019742	ipo4	100	66.422	ENSPKIG00000007830	ipo4	100	66.758	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000019742	ipo4	99	73.734	ENSPMGG00000020871	ipo4	100	73.921	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000019742	ipo4	99	43.173	ENSPEMG00000016160	Ipo4	99	43.290	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACLG00000019742	ipo4	95	45.481	ENSPCIG00000010718	IPO4	97	45.348	Phascolarctos_cinereus
ENSACLG00000019742	ipo4	100	78.073	ENSPFOG00000009255	ipo4	100	78.073	Poecilia_formosa
ENSACLG00000019742	ipo4	100	78.165	ENSPLAG00000020556	ipo4	100	78.165	Poecilia_latipinna
ENSACLG00000019742	ipo4	100	78.073	ENSPMEG00000013102	ipo4	100	78.073	Poecilia_mexicana
ENSACLG00000019742	ipo4	100	78.165	ENSPREG00000017605	ipo4	100	77.798	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000019742	ipo4	99	44.898	ENSPPYG00000005688	IPO4	99	44.853	Pongo_abelii
ENSACLG00000019742	ipo4	98	46.038	ENSPCAG00000015669	IPO4	99	45.262	Procavia_capensis
ENSACLG00000019742	ipo4	94	45.283	ENSPCOG00000015319	IPO4	98	44.206	Propithecus_coquereli
ENSACLG00000019742	ipo4	94	45.879	ENSPVAG00000010755	IPO4	98	45.140	Pteropus_vampyrus
ENSACLG00000019742	ipo4	100	96.472	ENSPNYG00000021414	ipo4	100	96.472	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000019742	ipo4	100	73.941	ENSPNAG00000027964	ipo4	100	74.125	Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000019742	ipo4	95	44.739	ENSRNOG00000019553	Ipo4	99	43.107	Rattus_norvegicus
ENSACLG00000019742	ipo4	99	44.424	ENSRBIG00000027704	IPO4	99	44.424	Rhinopithecus_bieti
ENSACLG00000019742	ipo4	99	44.712	ENSRROG00000011492	IPO4	99	44.577	Rhinopithecus_roxellana
ENSACLG00000019742	ipo4	99	43.309	ENSSBOG00000020162	IPO4	99	43.199	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACLG00000019742	ipo4	95	45.535	ENSSHAG00000002619	IPO4	96	43.974	Sarcophilus_harrisii
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ENSACLG00000019742	ipo4	99	66.758	ENSSFOG00015012267	ipo4	99	67.186	Scleropages_formosus
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ENSACLG00000019742	ipo4	100	82.228	ENSSLDG00000003869	ipo4	100	82.228	Seriola_lalandi_dorsalis
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