EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000019916 (Gene tree)
Gene ID: 113011875
Gene Symbol: syf2
Alias: hm:zeh0031|zeh0031|zgc:113871|zgc:92835
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11718 bases
Position: chr19:8842641-8854358
Accession: 113011875
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000029379	SYF2	PF08231.12	2.5e-54	1	1
ENSACLP00000029411	SYF2	PF08231.12	3.6e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000030070	-	4465	-	ENSACLP00000029379	222 (aa)	-	-
ENSACLT00000030104	-	4054	-	ENSACLP00000029411	238 (aa)	XP_026007476	UPI000E415E5E

Gene Model

Click here to download ENSACLG00000019916's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACLG00000019916's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000019916	syf2	91	82.407	ENSG00000117614	SYF2	90	81.279	Homo_sapiens
ENSACLG00000019916	syf2	100	91.597	ENSAPOG00000001174	syf2	100	91.597	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000019916	syf2	82	81.538	ENSAMEG00000010134	-	100	81.538	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000019916	syf2	94	79.821	ENSAMEG00000010115	-	91	79.821	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000019916	syf2	99	94.043	ENSACIG00000023688	syf2	94	94.043	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000019916	syf2	93	90.045	ENSAOCG00000010912	syf2	69	90.045	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000019916	syf2	100	90.756	ENSAOCG00000022046	syf2	95	91.928	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000019916	syf2	100	90.756	ENSAPEG00000018858	syf2	92	90.756	Amphiprion_percula
ENSACLG00000019916	syf2	100	93.277	ENSATEG00000007745	syf2	100	93.277	Anabas_testudineus
ENSACLG00000019916	syf2	84	83.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	83.000	Anas_platyrhynchos
ENSACLG00000019916	syf2	71	67.296	ENSACAG00000026777	-	100	67.066	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000019916	syf2	86	81.373	ENSACAG00000013653	-	100	81.373	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000019916	syf2	91	82.870	ENSANAG00000032473	SYF2	90	81.735	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000019916	syf2	100	83.193	ENSAMXG00000004051	syf2	100	83.193	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000019916	syf2	97	78.112	ENSBTAG00000001651	SYF2	94	81.081	Bos_taurus
ENSACLG00000019916	syf2	87	50.476	WBGene00019402	syf-2	90	49.763	Caenorhabditis_elegans
ENSACLG00000019916	syf2	91	82.870	ENSCJAG00000046570	SYF2	90	81.735	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000019916	syf2	91	81.481	ENSCAFG00000012895	-	90	79.821	Canis_familiaris
ENSACLG00000019916	syf2	91	76.389	ENSCAFG00000030331	-	92	76.389	Canis_familiaris
ENSACLG00000019916	syf2	91	81.481	ENSCAFG00020021091	-	90	79.821	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000019916	syf2	72	78.125	ENSCAFG00020021094	-	95	72.527	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000019916	syf2	99	76.667	ENSCHIG00000020874	SYF2	92	80.631	Capra_hircus
ENSACLG00000019916	syf2	99	77.083	ENSTSYG00000005114	SYF2	91	79.730	Carlito_syrichta
ENSACLG00000019916	syf2	83	81.818	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	81.818	Cavia_aperea
ENSACLG00000019916	syf2	99	77.637	ENSCPOG00000005326	SYF2	90	81.735	Cavia_porcellus
ENSACLG00000019916	syf2	91	82.870	ENSCCAG00000022459	SYF2	90	81.735	Cebus_capucinus
ENSACLG00000019916	syf2	100	76.050	ENSCATG00000026917	SYF2	90	80.365	Cercocebus_atys
ENSACLG00000019916	syf2	99	78.723	ENSCLAG00000008474	SYF2	91	81.081	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000019916	syf2	100	75.630	ENSCSAG00000000948	SYF2	90	80.365	Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000019916	syf2	72	61.494	ENSCHOG00000005273	-	91	62.651	Choloepus_hoffmanni
ENSACLG00000019916	syf2	94	81.333	ENSCPBG00000025073	SYF2	91	81.333	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000019916	syf2	98	52.766	ENSCING00000003017	-	89	56.808	Ciona_intestinalis
ENSACLG00000019916	syf2	89	52.113	ENSCSAVG00000006627	-	97	52.113	Ciona_savignyi
ENSACLG00000019916	syf2	100	67.227	ENSCANG00000037322	SYF2	89	70.776	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000019916	syf2	99	78.243	ENSCGRG00001020733	Syf2	92	81.081	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000019916	syf2	82	82.653	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	82.828	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACLG00000019916	syf2	92	88.991	ENSCSEG00000000117	syf2	93	88.739	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000019916	syf2	100	90.795	ENSCVAG00000019543	syf2	100	90.795	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000019916	syf2	100	86.555	ENSDARG00000004706	syf2	100	86.555	Danio_rerio
ENSACLG00000019916	syf2	99	78.390	ENSDNOG00000047605	SYF2	91	80.631	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000019916	syf2	99	78.481	ENSDORG00000001274	Syf2	91	81.532	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000019916	syf2	90	56.481	FBgn0033556	CG12343	94	56.481	Drosophila_melanogaster
ENSACLG00000019916	syf2	94	65.471	ENSETEG00000015729	SYF2	90	67.633	Echinops_telfairi
ENSACLG00000019916	syf2	83	58.376	ENSEBUG00000015402	syf2	95	58.376	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000019916	syf2	100	76.327	ENSEASG00005004224	-	89	81.735	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000019916	syf2	99	68.750	ENSEASG00005004232	-	92	72.072	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000019916	syf2	95	79.476	ENSECAG00000010440	-	92	81.735	Equus_caballus
ENSACLG00000019916	syf2	95	79.913	ENSECAG00000012023	-	91	81.081	Equus_caballus
ENSACLG00000019916	syf2	74	66.480	ENSEEUG00000015084	SYF2	88	69.565	Erinaceus_europaeus
ENSACLG00000019916	syf2	100	83.613	ENSELUG00000003465	syf2	93	86.937	Esox_lucius
ENSACLG00000019916	syf2	99	77.500	ENSFCAG00000010324	-	76	81.735	Felis_catus
ENSACLG00000019916	syf2	98	77.778	ENSFCAG00000043095	-	89	80.822	Felis_catus
ENSACLG00000019916	syf2	86	80.882	ENSFALG00000000460	SYF2	89	79.091	Ficedula_albicollis
ENSACLG00000019916	syf2	99	77.021	ENSFDAG00000008310	SYF2	90	81.279	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000019916	syf2	95	77.434	ENSFHEG00000007238	syf2	99	77.578	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000019916	syf2	90	88.837	ENSGMOG00000019138	syf2	96	88.837	Gadus_morhua
ENSACLG00000019916	syf2	95	80.176	ENSGALG00000013639	SYF2	88	81.532	Gallus_gallus
ENSACLG00000019916	syf2	100	89.916	ENSGAFG00000019435	syf2	100	89.916	Gambusia_affinis
ENSACLG00000019916	syf2	93	90.991	ENSGACG00000007305	syf2	93	90.991	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000019916	syf2	94	81.778	ENSGAGG00000010670	SYF2	91	81.778	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000019916	syf2	91	82.407	ENSGGOG00000012796	SYF2	90	81.279	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000019916	syf2	100	99.580	ENSHBUG00000020477	syf2	100	99.580	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000019916	syf2	93	71.171	ENSHGLG00000004304	-	93	71.622	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000019916	syf2	100	76.639	ENSHGLG00000014393	SYF2	91	81.081	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000019916	syf2	100	76.639	ENSHGLG00100014722	SYF2	91	81.081	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000019916	syf2	100	89.916	ENSHCOG00000012904	syf2	78	89.916	Hippocampus_comes
ENSACLG00000019916	syf2	100	84.100	ENSIPUG00000019859	syf2	93	86.547	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000019916	syf2	61	76.027	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	76.027	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACLG00000019916	syf2	84	82.412	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	82.412	Jaculus_jaculus
ENSACLG00000019916	syf2	100	92.017	ENSKMAG00000013856	syf2	100	91.597	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000019916	syf2	100	91.176	ENSLBEG00000014425	syf2	100	91.176	Labrus_bergylta
ENSACLG00000019916	syf2	93	80.090	ENSLACG00000012064	SYF2	93	80.090	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000019916	syf2	100	83.193	ENSLOCG00000002728	syf2	95	83.193	Lepisosteus_oculatus
ENSACLG00000019916	syf2	77	54.348	ENSLAFG00000030814	-	100	54.348	Loxodonta_africana
ENSACLG00000019916	syf2	100	76.327	ENSLAFG00000023150	-	91	81.532	Loxodonta_africana
ENSACLG00000019916	syf2	100	76.050	ENSMFAG00000041831	SYF2	90	80.365	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000019916	syf2	91	81.481	ENSMMUG00000002968	SYF2	90	80.365	Macaca_mulatta
ENSACLG00000019916	syf2	100	76.050	ENSMNEG00000030180	SYF2	90	80.365	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000019916	syf2	100	76.050	ENSMLEG00000030248	SYF2	90	80.365	Mandrillus_leucophaeus
ENSACLG00000019916	syf2	100	92.017	ENSMAMG00000010403	syf2	98	92.017	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000019916	syf2	100	99.580	ENSMZEG00005006429	syf2	100	99.580	Maylandia_zebra
ENSACLG00000019916	syf2	84	82.915	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	82.915	Meleagris_gallopavo
ENSACLG00000019916	syf2	100	78.099	ENSMAUG00000018974	Syf2	92	81.982	Mesocricetus_auratus
ENSACLG00000019916	syf2	84	82.412	ENSMICG00000016191	SYF2	100	82.412	Microcebus_murinus
ENSACLG00000019916	syf2	100	77.686	ENSMOCG00000022938	Syf2	92	81.532	Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000019916	syf2	97	87.879	ENSMMOG00000002396	syf2	93	89.640	Mola_mola
ENSACLG00000019916	syf2	93	76.786	ENSMODG00000013951	-	98	76.786	Monodelphis_domestica
ENSACLG00000019916	syf2	100	89.627	ENSMALG00000010706	syf2	100	89.627	Monopterus_albus
ENSACLG00000019916	syf2	100	78.099	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	92	81.982	Mus_caroli
ENSACLG00000019916	syf2	100	78.099	ENSMUSG00000028821	Syf2	92	81.982	Mus_musculus
ENSACLG00000019916	syf2	100	78.099	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	92	81.982	Mus_pahari
ENSACLG00000019916	syf2	100	78.099	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	92	81.982	Mus_spretus
ENSACLG00000019916	syf2	91	81.481	ENSMPUG00000015802	-	89	80.365	Mustela_putorius_furo
ENSACLG00000019916	syf2	92	80.455	ENSMPUG00000015801	-	89	80.455	Mustela_putorius_furo
ENSACLG00000019916	syf2	99	76.667	ENSMLUG00000001885	SYF2	91	80.631	Myotis_lucifugus
ENSACLG00000019916	syf2	100	76.050	ENSNGAG00000007912	Syf2	90	80.631	Nannospalax_galili
ENSACLG00000019916	syf2	100	87.190	ENSNBRG00000010720	syf2	99	87.190	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000019916	syf2	91	82.407	ENSNLEG00000035185	SYF2	90	81.279	Nomascus_leucogenys
ENSACLG00000019916	syf2	99	77.872	ENSOPRG00000012870	SYF2	91	80.180	Ochotona_princeps
ENSACLG00000019916	syf2	98	76.923	ENSODEG00000017664	-	93	79.730	Octodon_degus
ENSACLG00000019916	syf2	99	68.511	ENSODEG00000014338	-	92	70.721	Octodon_degus
ENSACLG00000019916	syf2	100	98.319	ENSONIG00000008213	syf2	100	98.319	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000019916	syf2	85	81.683	ENSOANG00000009552	SYF2	100	81.683	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACLG00000019916	syf2	91	82.870	ENSOCUG00000013050	SYF2	91	81.081	Oryctolagus_cuniculus
ENSACLG00000019916	syf2	98	89.700	ENSORLG00000028820	syf2	95	92.342	Oryzias_latipes
ENSACLG00000019916	syf2	100	89.076	ENSORLG00020018333	syf2	100	89.076	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000019916	syf2	100	89.496	ENSORLG00015014665	syf2	100	89.496	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000019916	syf2	100	90.336	ENSOMEG00000013911	syf2	100	90.336	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000019916	syf2	99	79.149	ENSOGAG00000009962	SYF2	91	81.532	Otolemur_garnettii
ENSACLG00000019916	syf2	95	78.355	ENSOARG00000006348	-	91	79.911	Ovis_aries
ENSACLG00000019916	syf2	82	55.385	ENSOARG00000006269	-	100	55.385	Ovis_aries
ENSACLG00000019916	syf2	91	82.407	ENSPPAG00000036579	SYF2	90	81.279	Pan_paniscus
ENSACLG00000019916	syf2	99	77.731	ENSPPRG00000001638	-	89	81.735	Panthera_pardus
ENSACLG00000019916	syf2	98	77.778	ENSPPRG00000001651	-	89	80.822	Panthera_pardus
ENSACLG00000019916	syf2	98	77.778	ENSPTIG00000007036	-	89	80.822	Panthera_tigris_altaica
ENSACLG00000019916	syf2	91	82.870	ENSPTIG00000005711	-	80	82.110	Panthera_tigris_altaica
ENSACLG00000019916	syf2	91	82.407	ENSPTRG00000000352	SYF2	90	81.279	Pan_troglodytes
ENSACLG00000019916	syf2	100	76.050	ENSPANG00000008139	SYF2	90	80.365	Papio_anubis
ENSACLG00000019916	syf2	100	82.773	ENSPKIG00000008130	syf2	94	86.878	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000019916	syf2	97	79.149	ENSPSIG00000011816	SYF2	86	81.532	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000019916	syf2	97	88.745	ENSPMGG00000008755	syf2	86	91.855	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000019916	syf2	100	77.273	ENSPEMG00000008283	Syf2	92	81.081	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACLG00000019916	syf2	93	80.631	ENSPCIG00000014235	SYF2	89	80.631	Phascolarctos_cinereus
ENSACLG00000019916	syf2	100	88.285	ENSPFOG00000004116	syf2	92	91.928	Poecilia_formosa
ENSACLG00000019916	syf2	98	89.700	ENSPLAG00000006691	syf2	96	91.480	Poecilia_latipinna
ENSACLG00000019916	syf2	100	87.395	ENSPMEG00000011684	syf2	100	87.395	Poecilia_mexicana
ENSACLG00000019916	syf2	100	90.336	ENSPREG00000003009	syf2	100	90.336	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000019916	syf2	100	76.471	ENSPPYG00000001713	SYF2	90	81.279	Pongo_abelii
ENSACLG00000019916	syf2	99	54.468	ENSPCOG00000027011	SYF2	88	55.405	Propithecus_coquereli
ENSACLG00000019916	syf2	98	71.245	ENSPVAG00000005841	SYF2	91	72.523	Pteropus_vampyrus
ENSACLG00000019916	syf2	100	100.000	ENSPNYG00000004979	syf2	100	100.000	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000019916	syf2	100	84.454	ENSPNAG00000015570	syf2	100	84.454	Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000019916	syf2	100	78.099	ENSRNOG00000060597	Syf2	92	81.982	Rattus_norvegicus
ENSACLG00000019916	syf2	100	73.950	ENSRBIG00000042970	SYF2	90	78.082	Rhinopithecus_bieti
ENSACLG00000019916	syf2	100	76.050	ENSRROG00000001347	SYF2	90	80.365	Rhinopithecus_roxellana
ENSACLG00000019916	syf2	91	82.407	ENSSBOG00000020184	SYF2	90	81.279	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACLG00000019916	syf2	93	79.730	ENSSHAG00000015630	-	89	79.730	Sarcophilus_harrisii
ENSACLG00000019916	syf2	86	81.553	ENSSHAG00000007152	-	100	81.553	Sarcophilus_harrisii
ENSACLG00000019916	syf2	97	84.052	ENSSFOG00015023647	syf2	93	87.330	Scleropages_formosus
ENSACLG00000019916	syf2	100	88.235	ENSSMAG00000009867	syf2	100	88.235	Scophthalmus_maximus
ENSACLG00000019916	syf2	100	89.916	ENSSDUG00000013072	syf2	100	89.916	Seriola_dumerili
ENSACLG00000019916	syf2	100	89.916	ENSSLDG00000012677	syf2	100	89.916	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000019916	syf2	99	59.336	ENSSARG00000012889	SYF2	91	61.712	Sorex_araneus
ENSACLG00000019916	syf2	99	79.661	ENSSPUG00000005251	SYF2	88	81.982	Sphenodon_punctatus
ENSACLG00000019916	syf2	100	90.336	ENSSPAG00000009626	syf2	100	90.336	Stegastes_partitus
ENSACLG00000019916	syf2	93	80.995	ENSSSCG00000037481	SYF2	90	80.995	Sus_scrofa
ENSACLG00000019916	syf2	63	52.318	ENSTGUG00000001126	SYF2	81	53.333	Taeniopygia_guttata
ENSACLG00000019916	syf2	100	85.833	ENSTRUG00000001499	syf2	90	88.789	Takifugu_rubripes
ENSACLG00000019916	syf2	93	90.090	ENSTNIG00000016912	syf2	99	90.090	Tetraodon_nigroviridis
ENSACLG00000019916	syf2	100	57.563	ENSTBEG00000017370	SYF2	89	59.459	Tupaia_belangeri
ENSACLG00000019916	syf2	97	74.897	ENSTTRG00000003550	SYF2	91	80.180	Tursiops_truncatus
ENSACLG00000019916	syf2	98	77.350	ENSUAMG00000002897	SYF2	90	79.821	Ursus_americanus
ENSACLG00000019916	syf2	91	81.019	ENSUMAG00000013108	SYF2	90	79.372	Ursus_maritimus
ENSACLG00000019916	syf2	99	76.349	ENSVPAG00000005705	SYF2	91	80.180	Vicugna_pacos
ENSACLG00000019916	syf2	91	81.481	ENSVVUG00000027175	-	90	79.821	Vulpes_vulpes
ENSACLG00000019916	syf2	86	80.976	ENSVVUG00000027181	-	90	79.372	Vulpes_vulpes
ENSACLG00000019916	syf2	97	78.017	ENSXETG00000022797	syf2	89	80.180	Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000019916	syf2	100	89.076	ENSXMAG00000022698	syf2	100	89.076	Xiphophorus_maculatus