EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000020009 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1764 bases
Position: chr15:31037323-31039086
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000029523	RVT_1	PF00078.27	8.1e-44	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000030218	-	1764	-	ENSACLP00000029523	587 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000020009	-	51	32.026	ENSACLG00000021583	-	73	32.026
ENSACLG00000020009	-	100	97.109	ENSACLG00000007650	-	57	97.109
ENSACLG00000020009	-	62	31.099	ENSACLG00000007654	-	78	31.099
ENSACLG00000020009	-	60	63.533	ENSACLG00000000505	-	99	63.533
ENSACLG00000020009	-	77	53.863	ENSACLG00000020849	-	69	53.863
ENSACLG00000020009	-	66	30.227	ENSACLG00000012352	-	77	30.227
ENSACLG00000020009	-	59	97.965	ENSACLG00000016956	-	62	97.965
ENSACLG00000020009	-	98	52.265	ENSACLG00000013374	-	66	52.265
ENSACLG00000020009	-	77	53.201	ENSACLG00000027577	-	73	53.201
ENSACLG00000020009	-	59	63.663	ENSACLG00000009848	-	78	63.663
ENSACLG00000020009	-	77	50.442	ENSACLG00000005509	-	100	50.773
ENSACLG00000020009	-	98	62.653	ENSACLG00000004427	-	70	62.653
ENSACLG00000020009	-	65	30.867	ENSACLG00000014642	-	62	30.867
ENSACLG00000020009	-	92	51.571	ENSACLG00000001102	-	70	51.571
ENSACLG00000020009	-	98	51.916	ENSACLG00000002312	-	57	51.916
ENSACLG00000020009	-	78	55.991	ENSACLG00000000579	-	69	55.991
ENSACLG00000020009	-	84	98.384	ENSACLG00000019498	-	70	98.384
ENSACLG00000020009	-	65	61.358	ENSACLG00000017241	-	64	61.358
ENSACLG00000020009	-	77	30.769	ENSACLG00000006988	-	65	30.769
ENSACLG00000020009	-	79	52.278	ENSACLG00000007954	-	68	52.278
ENSACLG00000020009	-	86	52.485	ENSACLG00000001858	-	70	52.485
ENSACLG00000020009	-	98	61.431	ENSACLG00000021942	-	84	61.431
ENSACLG00000020009	-	81	31.866	ENSACLG00000007200	-	67	31.866
ENSACLG00000020009	-	78	52.723	ENSACLG00000005489	-	68	52.723
ENSACLG00000020009	-	98	60.384	ENSACLG00000001773	-	76	60.384
ENSACLG00000020009	-	56	35.119	ENSACLG00000016231	-	56	35.119
ENSACLG00000020009	-	51	58.586	ENSACLG00000008551	-	54	58.586
ENSACLG00000020009	-	100	54.082	ENSACLG00000027127	-	79	54.082
ENSACLG00000020009	-	100	53.741	ENSACLG00000016551	-	58	53.741
ENSACLG00000020009	-	98	61.257	ENSACLG00000017200	-	56	61.257
ENSACLG00000020009	-	51	32.680	ENSACLG00000027256	-	75	32.680
ENSACLG00000020009	-	98	98.604	ENSACLG00000018002	-	67	98.604
ENSACLG00000020009	-	62	30.400	ENSACLG00000025851	-	94	30.400
ENSACLG00000020009	-	56	35.119	ENSACLG00000004613	-	79	35.119
ENSACLG00000020009	-	52	32.476	ENSACLG00000013932	-	57	32.476
ENSACLG00000020009	-	94	30.714	ENSACLG00000009813	-	63	30.714
ENSACLG00000020009	-	100	53.741	ENSACLG00000003707	-	71	53.741
ENSACLG00000020009	-	100	53.741	ENSACLG00000008988	-	64	53.741
ENSACLG00000020009	-	58	64.706	ENSACLG00000008558	-	72	64.706
ENSACLG00000020009	-	100	96.599	ENSACLG00000018778	-	58	96.599
ENSACLG00000020009	-	51	98.339	ENSACLG00000023788	-	59	98.339

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000020009	-	52	56.106	ENSAPEG00000014494	-	66	56.106	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020009	-	51	35.082	ENSCPBG00000015885	-	88	35.082	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000020009	-	50	33.333	ENSCPBG00000024353	-	58	33.333	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000020009	-	56	36.446	ENSCPBG00000003199	-	95	36.446	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000020009	-	56	35.119	ENSCPBG00000002205	-	90	35.119	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000020009	-	58	31.609	ENSCPBG00000001489	-	59	31.609	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000020009	-	59	35.775	ENSCPBG00000013338	-	91	35.775	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000020009	-	57	36.070	ENSCPBG00000001455	-	90	36.070	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000020009	-	50	31.333	ENSCPBG00000010408	-	58	31.333	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000020009	-	56	33.533	ENSCPBG00000006651	-	87	33.533	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000020009	-	57	34.615	ENSCPBG00000004450	-	90	34.615	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000020009	-	50	32.776	ENSCPBG00000011561	-	76	32.776	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000020009	-	73	30.045	ENSGAGG00000025872	-	65	30.045	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000020009	-	79	49.364	ENSKMAG00000004644	-	68	49.364	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000020009	-	56	34.132	ENSKMAG00000020993	-	79	34.132	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000020009	-	63	31.522	ENSLBEG00000007826	-	92	31.522	Labrus_bergylta
ENSACLG00000020009	-	61	63.889	ENSLBEG00000008627	-	64	63.889	Labrus_bergylta
ENSACLG00000020009	-	78	64.410	ENSLBEG00000018374	-	69	64.410	Labrus_bergylta
ENSACLG00000020009	-	87	62.157	ENSLBEG00000009271	-	100	62.157	Labrus_bergylta
ENSACLG00000020009	-	99	61.644	ENSLBEG00000015802	-	81	61.644	Labrus_bergylta
ENSACLG00000020009	-	61	64.722	ENSLBEG00000007558	-	93	64.722	Labrus_bergylta
ENSACLG00000020009	-	52	32.353	ENSLACG00000015198	-	52	32.353	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000020009	-	52	31.699	ENSLACG00000017681	-	56	31.699	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000020009	-	52	31.250	ENSLACG00000022282	-	56	31.250	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000020009	-	56	30.746	ENSLACG00000022113	-	58	30.746	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000020009	-	74	54.817	ENSMZEG00005026189	-	66	54.817	Maylandia_zebra
ENSACLG00000020009	-	59	98.837	ENSMZEG00005018243	-	94	98.837	Maylandia_zebra
ENSACLG00000020009	-	60	53.693	ENSMALG00000018226	-	62	53.693	Monopterus_albus
ENSACLG00000020009	-	53	57.605	ENSMALG00000009608	-	69	57.605	Monopterus_albus
ENSACLG00000020009	-	50	57.627	ENSMALG00000000456	-	80	57.627	Monopterus_albus
ENSACLG00000020009	-	51	57.285	ENSMALG00000003303	-	59	57.285	Monopterus_albus
ENSACLG00000020009	-	97	51.670	ENSMALG00000007417	-	74	51.670	Monopterus_albus
ENSACLG00000020009	-	60	53.276	ENSMALG00000008286	-	62	53.276	Monopterus_albus
ENSACLG00000020009	-	60	53.846	ENSMALG00000021030	-	62	53.846	Monopterus_albus
ENSACLG00000020009	-	85	52.008	ENSMALG00000020948	-	70	52.008	Monopterus_albus
ENSACLG00000020009	-	51	58.278	ENSMALG00000018635	-	60	58.609	Monopterus_albus
ENSACLG00000020009	-	60	53.846	ENSMALG00000007425	-	62	53.846	Monopterus_albus
ENSACLG00000020009	-	91	54.887	ENSONIG00000020746	-	97	54.887	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000020009	-	86	51.176	ENSONIG00000021263	-	66	51.176	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000020009	-	51	66.779	ENSORLG00000026969	-	56	66.779	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020009	-	56	36.585	ENSORLG00000025054	-	56	36.585	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020009	-	76	60.356	ENSORLG00000030445	-	66	60.356	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020009	-	95	31.514	ENSORLG00000023054	-	50	31.514	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020009	-	88	30.210	ENSORLG00000024294	-	88	30.210	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020009	-	96	30.256	ENSORLG00000030276	-	59	30.256	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020009	-	100	55.102	ENSORLG00000028049	-	57	55.102	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020009	-	95	30.159	ENSORLG00000024201	-	51	30.159	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020009	-	96	59.786	ENSORLG00000026858	-	66	59.786	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020009	-	95	30.159	ENSORLG00000025129	-	51	30.159	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020009	-	51	66.779	ENSORLG00000025899	-	56	66.779	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020009	-	63	60.870	ENSORLG00000022703	-	59	60.870	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020009	-	96	59.964	ENSORLG00000023570	-	57	59.964	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020009	-	90	54.356	ENSORLG00000030053	-	72	54.356	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020009	-	94	30.144	ENSORLG00020003695	-	57	30.144	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000020009	-	51	66.779	ENSORLG00020019661	-	56	66.779	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000020009	-	95	30.756	ENSORLG00020002955	-	72	30.756	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000020009	-	88	30.344	ENSORLG00020013338	-	63	30.344	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000020009	-	70	31.796	ENSORLG00015020629	-	63	31.796	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000020009	-	96	31.283	ENSORLG00015005330	-	87	31.283	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000020009	-	100	49.073	ENSOMEG00000004858	-	57	49.073	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000020009	-	100	49.241	ENSOMEG00000013089	-	57	49.241	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000020009	-	92	36.131	ENSOMEG00000012000	-	97	36.131	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000020009	-	94	31.341	ENSOMEG00000015999	-	50	31.341	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000020009	-	58	56.891	ENSOMEG00000008180	-	61	56.891	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000020009	-	52	33.333	ENSPKIG00000020548	-	80	33.333	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000020009	-	50	33.559	ENSPKIG00000019910	-	67	33.559	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000020009	-	57	36.283	ENSPSIG00000001440	-	72	36.283	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000020009	-	57	35.988	ENSPSIG00000001186	-	79	35.988	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000020009	-	50	37.374	ENSPSIG00000000480	-	69	37.374	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000020009	-	54	35.185	ENSPSIG00000001849	-	98	35.185	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000020009	-	62	34.225	ENSPSIG00000000799	-	62	34.225	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000020009	-	73	31.050	ENSPSIG00000001709	-	95	31.050	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000020009	-	51	36.928	ENSPSIG00000001926	-	89	36.928	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000020009	-	53	36.825	ENSPSIG00000000039	-	87	36.825	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000020009	-	57	36.283	ENSPSIG00000001250	-	77	36.283	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000020009	-	57	35.103	ENSPSIG00000000884	-	80	35.103	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000020009	-	76	31.947	ENSPSIG00000000025	-	81	31.947	Pelodiscus_sinensis
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ENSACLG00000020009	-	57	35.988	ENSPSIG00000001439	-	58	35.988	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000020009	-	55	36.111	ENSPSIG00000000628	-	91	36.111	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000020009	-	59	63.953	ENSPNYG00000010168	-	61	63.953	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000020009	-	90	48.113	ENSXMAG00000024044	-	75	48.113	Xiphophorus_maculatus
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ENSACLG00000020009	-	100	47.878	ENSXMAG00000029300	-	81	47.878	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000020009	-	88	48.748	ENSXMAG00000026064	-	71	48.748	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000020009	-	100	47.708	ENSXMAG00000023391	-	59	47.708	Xiphophorus_maculatus