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Description
Ensembl ID
ENSACLG00000020011 (Gene tree)
Gene ID
113020226
Gene Symbol
rbfox3b
Alias
rbfox3l|si:ch73-322f21.1
Full Name
RNA binding fox-1 homolog 3b
Gene Type
protein_coding
Species
Astatotilapia_calliptera
Status
putative
Strand
Minus strand
Length
421682 bases
Position
chr4:2853059-3274740
Accession
ZDB-GENE-091204-46
RBP type
canonical RBP
Summary
-
RNA binding domains(RBDs)
Protein IDDomain Pfam IDE-value Domain number Total number
ENSACLP00000029544Fox-1_CPF12414.81.1e-4311
ENSACLP00000029576Fox-1_CPF12414.81.1e-4311
ENSACLP00000029607Fox-1_CPF12414.81.1e-4311
ENSACLP00000029528Fox-1_CPF12414.81.5e-4311
ENSACLP00000029638Fox-1_CPF12414.81.7e-4311
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ENSACLP00000029544RRM_1PF00076.221.7e-1811
ENSACLP00000029576RRM_1PF00076.221.7e-1811
ENSACLP00000029607RRM_1PF00076.221.7e-1811
ENSACLP00000029638RRM_1PF00076.221.7e-1811
Transcripts
Transcript IDNameLengthRefSeq ID Protein IDLengthRefSeq IDUniportKB ID
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ENSACLT00000030223-1685-ENSACLP00000029528310 (aa)--
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ENSACLT00000030340-4006-ENSACLP00000029638377 (aa)--
ENSACLT00000030240-5011-ENSACLP00000029544379 (aa)--
Gene Model
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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy ParalogGene SymbolCoverageIdentiy
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ENSACLG00000020011rbfox3b7072.124ENSACLG00000021394rbfox1l10054.499
ENSACLG00000020011rbfox3b10082.484ENSACLG00000025552-10082.834
Orthologs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy OrthologGene SymbolCoverageIdentiy Species
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ENSACLG00000020011rbfox3b9770.861ENSAPOG00000015658-9269.811Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000020011rbfox3b9577.673ENSAMEG00000014170RBFOX39973.008Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000020011rbfox3b9570.288ENSACIG00000003768-9071.296Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000020011rbfox3b10094.249ENSACIG00000010817rbfox3b10093.987Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000020011rbfox3b9779.459ENSAOCG00000010786-9880.000Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000020011rbfox3b10098.722ENSAOCG00000012358rbfox3b10098.913Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000020011rbfox3b10086.901ENSAPEG00000019081rbfox3b10088.889Amphiprion_percula
ENSACLG00000020011rbfox3b9573.981ENSAPEG00000015891-9470.789Amphiprion_percula
ENSACLG00000020011rbfox3b9579.264ENSATEG00000023101-9779.495Anabas_testudineus
ENSACLG00000020011rbfox3b10088.630ENSATEG00000019945rbfox3b10088.150Anabas_testudineus
ENSACLG00000020011rbfox3b10082.222ENSACAG00000016093RBFOX39980.672Anolis_carolinensis
ENSACLG00000020011rbfox3b9581.667ENSANAG00000023457RBFOX310081.847Aotus_nancymaae
ENSACLG00000020011rbfox3b9782.895ENSAMXG00000037246rbfox3a10084.677Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020011rbfox3b10086.943ENSAMXG00000042841rbfox3b10084.507Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020011rbfox3b8780.364ENSBTAG00000006280RBFOX310063.712Bos_taurus
ENSACLG00000020011rbfox3b9577.000ENSCJAG00000009563RBFOX310070.670Callithrix_jacchus
ENSACLG00000020011rbfox3b8085.141ENSCAFG00000005547RBFOX310079.570Canis_familiaris
ENSACLG00000020011rbfox3b9569.942ENSCAFG00020008126RBFOX310072.533Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000020011rbfox3b9569.741ENSCHIG00000009124RBFOX310072.533Capra_hircus
ENSACLG00000020011rbfox3b9568.300ENSTSYG00000029617RBFOX310071.031Carlito_syrichta
ENSACLG00000020011rbfox3b9569.143ENSCPOG00000021703RBFOX310071.429Cavia_porcellus
ENSACLG00000020011rbfox3b9581.667ENSCCAG00000028450RBFOX310081.847Cebus_capucinus
ENSACLG00000020011rbfox3b9582.000ENSCATG00000018349RBFOX310082.166Cercocebus_atys
ENSACLG00000020011rbfox3b9569.540ENSCLAG00000006449RBFOX310071.809Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000020011rbfox3b9582.000ENSCSAG00000002355RBFOX310082.166Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000020011rbfox3b9581.605ENSCPBG00000010904RBFOX310083.067Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000020011rbfox3b9582.000ENSCANG00000043120RBFOX310082.166Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000020011rbfox3b9566.763ENSCGRG00001019476Rbfox310071.618Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000020011rbfox3b9566.763ENSCGRG00000003268Rbfox310071.618Cricetulus_griseus_crigri
ENSACLG00000020011rbfox3b10076.582ENSCSEG00000020606RBFOX310076.486Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000020011rbfox3b10080.707ENSCSEG00000015567RBFOX39880.054Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000020011rbfox3b10098.722ENSCVAG00000006882rbfox3b10098.913Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000020011rbfox3b9683.827ENSDARG00000010083rbfox3a10085.714Danio_rerio
ENSACLG00000020011rbfox3b10078.344ENSDARG00000074310rbfox3b9779.556Danio_rerio
ENSACLG00000020011rbfox3b8268.874ENSDNOG00000039391RBFOX310058.442Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000020011rbfox3b9563.188ENSDORG00000005352Rbfox310066.307Dipodomys_ordii
ENSACLG00000020011rbfox3b10069.512ENSEBUG00000002129RBFOX39969.209Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000020011rbfox3b8558.696ENSEBUG00000013559RBFOX38854.167Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000020011rbfox3b9579.470ENSEASG00005005059RBFOX310082.278Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000020011rbfox3b9579.139ENSECAG00000023811RBFOX310081.962Equus_caballus
ENSACLG00000020011rbfox3b8476.056ENSEEUG00000013974RBFOX37688.000Erinaceus_europaeus
ENSACLG00000020011rbfox3b6163.731ENSELUG00000009807-6457.466Esox_lucius
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ENSACLG00000020011rbfox3b9581.000ENSFCAG00000002555RBFOX310082.317Felis_catus
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ENSACLG00000020011rbfox3b9796.721ENSGAFG00000005025rbfox3b10091.848Gambusia_affinis
ENSACLG00000020011rbfox3b9569.054ENSGACG00000002138-10071.429Gasterosteus_aculeatus
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ENSACLG00000020011rbfox3b10082.398ENSIPUG00000012010rbfox3a10084.143Ictalurus_punctatus
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ENSACLG00000020011rbfox3b6181.443ENSMGAG00000005600RBFOX38380.365Meleagris_gallopavo
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ENSACLG00000020011rbfox3b9566.859ENSMOCG00000015373Rbfox310070.745Microtus_ochrogaster
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ENSACLG00000020011rbfox3b9578.738MGP_PahariEiJ_G0018614Rbfox39689.928Mus_pahari
ENSACLG00000020011rbfox3b9578.667MGP_SPRETEiJ_G0018331Rbfox39689.209Mus_spretus
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ENSACLG00000020011rbfox3b10098.722ENSONIG00000009549rbfox3b10098.913Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000020011rbfox3b10082.484ENSONIG00000007282-9980.826Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000020011rbfox3b7264.662ENSOCUG00000014217RBFOX37465.414Oryctolagus_cuniculus
ENSACLG00000020011rbfox3b10098.168ENSORLG00000000905rbfox3b7997.541Oryzias_latipes
ENSACLG00000020011rbfox3b10098.168ENSORLG00020018030rbfox3b9997.541Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000020011rbfox3b10098.083ENSORLG00015009200rbfox3b10098.370Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000020011rbfox3b8292.401ENSOMEG00000014677rbfox3b8692.401Oryzias_melastigma
ENSACLG00000020011rbfox3b9581.605ENSOGAG00000029595RBFOX39875.477Otolemur_garnettii
ENSACLG00000020011rbfox3b8958.056ENSOARG00000002908RBFOX310057.143Ovis_aries
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ENSACLG00000020011rbfox3b9582.000ENSPANG00000019837RBFOX310082.166Papio_anubis
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