EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000020021 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2646 bases
Position: chr6:41325768-41328413
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000029562	RVT_1	PF00078.27	2e-36	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000030256	-	2646	-	ENSACLP00000029562	817 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000020021	-	99	37.786	ENSACLG00000023597	-	65	37.786
ENSACLG00000020021	-	99	33.573	ENSACLG00000014342	-	59	33.573
ENSACLG00000020021	-	99	35.294	ENSACLG00000009895	-	65	35.294
ENSACLG00000020021	-	99	37.931	ENSACLG00000012503	-	65	38.415
ENSACLG00000020021	-	66	37.163	ENSACLG00000008786	-	69	37.163
ENSACLG00000020021	-	76	35.994	ENSACLG00000018473	-	71	35.994
ENSACLG00000020021	-	85	35.162	ENSACLG00000007324	-	74	35.162
ENSACLG00000020021	-	66	37.230	ENSACLG00000020885	-	69	37.230
ENSACLG00000020021	-	99	35.981	ENSACLG00000019734	-	66	35.981
ENSACLG00000020021	-	59	36.308	ENSACLG00000003896	-	89	36.308
ENSACLG00000020021	-	89	47.106	ENSACLG00000014178	-	79	46.825
ENSACLG00000020021	-	99	32.622	ENSACLG00000026023	-	77	32.622
ENSACLG00000020021	-	100	36.615	ENSACLG00000010561	-	77	36.615
ENSACLG00000020021	-	50	41.355	ENSACLG00000019432	-	95	41.355
ENSACLG00000020021	-	99	37.707	ENSACLG00000015440	-	76	38.186
ENSACLG00000020021	-	100	46.459	ENSACLG00000002748	-	70	46.459
ENSACLG00000020021	-	99	35.174	ENSACLG00000025597	-	68	35.174
ENSACLG00000020021	-	99	33.453	ENSACLG00000002829	-	62	33.453
ENSACLG00000020021	-	100	48.977	ENSACLG00000018177	-	73	48.977
ENSACLG00000020021	-	92	39.687	ENSACLG00000012223	-	74	39.896
ENSACLG00000020021	-	68	33.795	ENSACLG00000027045	-	69	33.795
ENSACLG00000020021	-	100	39.808	ENSACLG00000002299	-	65	39.808
ENSACLG00000020021	-	99	35.414	ENSACLG00000019378	-	56	35.414
ENSACLG00000020021	-	66	36.804	ENSACLG00000020106	-	71	36.804
ENSACLG00000020021	-	100	36.495	ENSACLG00000003800	-	66	36.495
ENSACLG00000020021	-	100	48.499	ENSACLG00000005466	-	65	48.499
ENSACLG00000020021	-	99	32.497	ENSACLG00000012298	-	66	32.497
ENSACLG00000020021	-	99	37.812	ENSACLG00000023207	-	65	38.295
ENSACLG00000020021	-	88	37.077	ENSACLG00000010059	-	81	37.077
ENSACLG00000020021	-	50	35.523	ENSACLG00000024620	-	100	35.523
ENSACLG00000020021	-	86	38.108	ENSACLG00000027433	-	74	38.108
ENSACLG00000020021	-	99	32.734	ENSACLG00000022582	-	58	32.734
ENSACLG00000020021	-	94	36.248	ENSACLG00000009410	-	82	36.248
ENSACLG00000020021	-	99	35.654	ENSACLG00000023216	-	56	35.654
ENSACLG00000020021	-	99	37.321	ENSACLG00000014673	-	65	37.575
ENSACLG00000020021	-	69	41.768	ENSACLG00000011463	-	69	41.768
ENSACLG00000020021	-	99	33.454	ENSACLG00000023850	-	66	33.454
ENSACLG00000020021	-	98	39.268	ENSACLG00000003130	-	90	39.268
ENSACLG00000020021	-	100	39.808	ENSACLG00000007947	-	76	39.808

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000020021	-	99	36.190	ENSAPOG00000013536	-	66	36.190	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000020021	-	100	37.754	ENSAPOG00000011184	-	74	37.754	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000020021	-	99	38.221	ENSAOCG00000019370	-	76	38.221	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000020021	-	85	35.634	ENSAOCG00000017045	-	62	35.634	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000020021	-	68	40.000	ENSAOCG00000013559	-	69	40.000	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000020021	-	53	34.590	ENSAOCG00000012592	-	97	34.590	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000020021	-	53	36.404	ENSAOCG00000014605	-	92	36.404	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000020021	-	99	35.569	ENSAOCG00000017326	-	63	35.569	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000020021	-	99	35.569	ENSAOCG00000021572	-	67	35.569	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000020021	-	99	34.491	ENSAOCG00000011998	-	76	34.491	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000020021	-	64	40.590	ENSAOCG00000022482	-	68	40.590	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000020021	-	99	35.867	ENSAPEG00000017325	-	91	35.867	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020021	-	87	35.262	ENSAPEG00000019256	-	73	35.262	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020021	-	99	34.458	ENSAPEG00000013213	-	66	34.458	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020021	-	68	37.005	ENSAPEG00000015961	-	71	37.005	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020021	-	99	34.495	ENSAPEG00000003616	-	66	34.495	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020021	-	99	35.449	ENSAPEG00000007540	-	70	35.449	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020021	-	99	35.689	ENSAPEG00000006674	-	67	35.689	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020021	-	99	35.867	ENSAPEG00000003065	-	97	35.867	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020021	-	100	36.611	ENSAPEG00000003655	-	58	36.611	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020021	-	99	35.808	ENSAPEG00000017003	-	67	35.808	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020021	-	67	36.637	ENSAPEG00000010007	-	68	36.637	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020021	-	99	37.634	ENSAPEG00000002768	-	59	37.634	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020021	-	99	35.449	ENSAPEG00000001971	-	67	35.449	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020021	-	99	35.867	ENSAPEG00000002696	-	97	35.867	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020021	-	86	30.567	ENSACAG00000028252	-	76	30.567	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000020021	-	97	30.281	ENSACAG00000029404	-	68	30.281	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000020021	-	99	38.089	ENSAMXG00000041150	-	81	38.089	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020021	-	99	31.084	ENSAMXG00000037256	-	66	31.084	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020021	-	80	37.574	ENSAMXG00000040121	-	79	37.574	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020021	-	100	35.971	ENSAMXG00000036146	-	66	35.971	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020021	-	64	40.556	ENSDARG00000086420	CABZ01046949.1	68	40.556	Danio_rerio
ENSACLG00000020021	-	97	33.622	ENSDARG00000103562	CU462878.2	92	33.622	Danio_rerio
ENSACLG00000020021	-	99	37.890	ENSDARG00000088493	si:ch211-149k12.3	66	37.890	Danio_rerio
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ENSACLG00000020021	-	76	56.897	ENSKMAG00000009272	-	78	56.897	Kryptolebias_marmoratus
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ENSACLG00000020021	-	100	36.830	ENSKMAG00000000167	-	76	36.830	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000020021	-	87	32.462	ENSKMAG00000006263	-	73	32.462	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000020021	-	99	36.772	ENSKMAG00000015152	-	65	36.893	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000020021	-	71	56.616	ENSKMAG00000014507	-	77	56.616	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000020021	-	87	32.462	ENSKMAG00000003480	-	72	32.462	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000020021	-	83	51.301	ENSKMAG00000014872	-	83	51.301	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000020021	-	74	81.481	ENSKMAG00000015838	-	71	81.481	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000020021	-	99	36.244	ENSKMAG00000000885	-	74	36.244	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000020021	-	100	81.588	ENSKMAG00000015935	-	72	81.588	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000020021	-	99	32.062	ENSKMAG00000008495	-	66	32.062	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000020021	-	71	36.545	ENSLBEG00000015758	-	89	36.545	Labrus_bergylta
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ENSACLG00000020021	-	86	34.254	ENSMZEG00005020294	-	63	34.254	Maylandia_zebra
ENSACLG00000020021	-	56	36.441	ENSMZEG00005012878	-	59	36.441	Maylandia_zebra
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ENSACLG00000020021	-	60	42.633	ENSMZEG00005017030	-	96	42.633	Maylandia_zebra
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ENSACLG00000020021	-	52	38.902	ENSNBRG00000012595	-	99	38.902	Neolamprologus_brichardi
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ENSACLG00000020021	-	59	37.576	ENSORLG00000027545	-	61	37.576	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020021	-	89	38.275	ENSORLG00000026511	-	74	38.275	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020021	-	86	36.453	ENSORLG00000023016	-	74	36.453	Oryzias_latipes
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ENSACLG00000020021	-	85	35.393	ENSORLG00000030529	-	74	35.393	Oryzias_latipes
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ENSACLG00000020021	-	73	36.438	ENSORLG00000025476	-	73	36.438	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020021	-	91	47.361	ENSORLG00000030415	-	94	47.361	Oryzias_latipes
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