EuRBPDB

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RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000020048 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4395 bases
Position: chr1:11876651-11881045
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000029584	RVT_1	PF00078.27	4.6e-25	1	1

Transcripts

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ENSACLT00000030281	-	4395	-	ENSACLP00000029584	1464 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000020048	-	80	30.172	ENSACLG00000015360	-	55	33.643
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ENSACLG00000020048	-	50	33.933	ENSACLG00000007343	-	86	33.933
ENSACLG00000020048	-	58	33.333	ENSACLG00000016581	-	68	33.071
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ENSACLG00000020048	-	63	37.475	ENSACLG00000027627	-	73	36.842
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ENSACLG00000020048	-	51	33.097	ENSACLG00000004748	-	80	32.957
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ENSACLG00000020048	-	69	30.252	ENSACLG00000016676	-	59	33.196
ENSACLG00000020048	-	84	32.987	ENSACLG00000002182	-	86	33.067
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ENSACLG00000020048	-	60	32.207	ENSACLG00000002180	-	56	32.207
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ENSACLG00000020048	-	56	35.333	ENSACLG00000014619	-	51	35.333
ENSACLG00000020048	-	72	37.372	ENSACLG00000013947	-	94	37.372
ENSACLG00000020048	-	84	35.111	ENSACLG00000003361	-	82	34.952
ENSACLG00000020048	-	61	38.791	ENSACLG00000000373	-	76	38.791
ENSACLG00000020048	-	99	60.465	ENSACLG00000013171	-	99	60.679
ENSACLG00000020048	-	57	60.096	ENSACLG00000021355	-	100	59.976
ENSACLG00000020048	-	59	33.610	ENSACLG00000017161	-	55	33.610
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ENSACLG00000020048	-	84	33.067	ENSACLG00000019658	-	86	33.147
ENSACLG00000020048	-	52	33.790	ENSACLG00000008738	-	66	33.790
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ENSACLG00000020048	-	51	31.423	ENSACLG00000015817	-	50	31.423
ENSACLG00000020048	-	58	33.514	ENSACLG00000018325	-	63	33.514
ENSACLG00000020048	-	56	32.468	ENSACLG00000000499	-	51	32.468
ENSACLG00000020048	-	59	34.400	ENSACLG00000019876	-	53	34.400
ENSACLG00000020048	-	58	34.924	ENSACLG00000026879	-	52	34.924
ENSACLG00000020048	-	89	34.740	ENSACLG00000003852	-	86	36.456
ENSACLG00000020048	-	62	34.725	ENSACLG00000008224	-	58	34.725
ENSACLG00000020048	-	88	32.051	ENSACLG00000004344	-	74	37.243
ENSACLG00000020048	-	56	32.475	ENSACLG00000002243	-	57	32.475
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ENSACLG00000020048	-	98	53.347	ENSACLG00000013669	-	98	53.347
ENSACLG00000020048	-	80	38.119	ENSACLG00000006945	-	82	38.119
ENSACLG00000020048	-	52	34.599	ENSACLG00000004561	-	66	34.599
ENSACLG00000020048	-	75	55.517	ENSACLG00000008010	-	99	55.430
ENSACLG00000020048	-	74	40.429	ENSACLG00000014688	-	89	40.429
ENSACLG00000020048	-	54	30.224	ENSACLG00000027304	-	51	30.224
ENSACLG00000020048	-	59	32.600	ENSACLG00000027730	-	74	32.600
ENSACLG00000020048	-	69	37.561	ENSACLG00000018454	-	83	37.561
ENSACLG00000020048	-	99	60.679	ENSACLG00000001555	-	99	60.745
ENSACLG00000020048	-	61	34.004	ENSACLG00000002238	-	61	34.004
ENSACLG00000020048	-	84	35.032	ENSACLG00000013455	-	82	34.873
ENSACLG00000020048	-	51	33.074	ENSACLG00000005847	-	100	33.074
ENSACLG00000020048	-	89	33.955	ENSACLG00000012963	-	80	33.832
ENSACLG00000020048	-	60	34.624	ENSACLG00000002701	-	56	34.624
ENSACLG00000020048	-	86	34.472	ENSACLG00000009118	-	86	34.370
ENSACLG00000020048	-	82	36.237	ENSACLG00000027747	-	77	36.043
ENSACLG00000020048	-	71	31.439	ENSACLG00000009628	-	57	31.771
ENSACLG00000020048	-	80	30.172	ENSACLG00000012239	-	55	33.643
ENSACLG00000020048	-	86	34.574	ENSACLG00000001282	-	85	34.523
ENSACLG00000020048	-	69	34.893	ENSACLG00000000384	-	63	34.893

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000020048	-	91	34.677	ENSAPOG00000011081	-	85	34.677	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000020048	-	89	34.838	ENSAPOG00000005387	-	81	34.290	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000020048	-	99	52.628	ENSAPOG00000000887	-	98	52.362	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000020048	-	89	34.028	ENSAPOG00000022647	-	85	34.028	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000020048	-	73	76.190	ENSAPOG00000015320	-	95	76.190	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000020048	-	80	33.389	ENSAPEG00000015779	-	75	33.389	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020048	-	89	34.545	ENSAPEG00000024442	-	81	34.017	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020048	-	84	36.313	ENSAPEG00000002424	-	85	36.234	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020048	-	80	33.389	ENSAPEG00000015494	-	86	33.223	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020048	-	51	39.117	ENSAPEG00000002572	-	76	39.117	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020048	-	56	33.615	ENSATEG00000019692	-	62	33.615	Anabas_testudineus
ENSACLG00000020048	-	63	55.889	ENSATEG00000006997	-	98	55.782	Anabas_testudineus
ENSACLG00000020048	-	56	33.615	ENSATEG00000008091	-	52	33.615	Anabas_testudineus
ENSACLG00000020048	-	69	37.879	ENSATEG00000018698	-	86	38.095	Anabas_testudineus
ENSACLG00000020048	-	63	36.143	ENSATEG00000016298	-	95	33.731	Anabas_testudineus
ENSACLG00000020048	-	59	31.798	ENSAMXG00000037247	-	54	31.798	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020048	-	89	33.830	ENSAMXG00000043312	-	82	34.185	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020048	-	74	39.201	ENSAMXG00000038338	-	78	39.201	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020048	-	51	45.921	ENSAMXG00000041114	-	80	45.921	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020048	-	78	36.992	ENSAMXG00000044052	-	70	36.733	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020048	-	65	44.821	ENSAMXG00000030479	-	67	44.821	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020048	-	50	40.544	ENSAMXG00000041896	-	97	40.544	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020048	-	82	36.032	ENSAMXG00000030747	-	59	35.951	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020048	-	89	33.983	ENSAMXG00000032330	-	86	33.534	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020048	-	51	68.598	ENSAMXG00000043821	-	98	68.598	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020048	-	89	33.979	ENSAMXG00000038997	-	82	34.335	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020048	-	53	33.962	ENSAMXG00000030761	-	99	34.168	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020048	-	81	57.960	ENSAMXG00000030908	-	99	57.868	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020048	-	72	40.191	ENSAMXG00000043385	-	77	40.191	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020048	-	70	30.865	ENSAMXG00000032559	-	87	30.473	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020048	-	89	35.569	ENSAMXG00000033629	-	71	35.789	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020048	-	98	55.639	ENSAMXG00000039912	-	97	55.874	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020048	-	50	38.070	ENSAMXG00000038480	-	99	38.267	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020048	-	73	38.436	ENSAMXG00000037864	-	88	40.590	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020048	-	63	41.121	ENSAMXG00000036113	-	79	43.523	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020048	-	63	40.234	ENSAMXG00000041369	-	77	40.234	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020048	-	80	35.810	ENSAMXG00000034382	-	91	41.379	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020048	-	58	31.458	ENSAMXG00000043631	-	85	34.384	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020048	-	57	37.099	ENSAMXG00000035923	-	97	36.980	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020048	-	66	37.143	ENSAMXG00000039473	-	82	36.837	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020048	-	67	38.889	ENSAMXG00000033912	-	78	38.889	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020048	-	70	39.923	ENSAMXG00000032783	-	73	39.827	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020048	-	86	36.128	ENSAMXG00000038531	-	89	38.652	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020048	-	69	39.303	ENSAMXG00000030022	-	81	39.303	Astyanax_mexicanus
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