EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000020106 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2460 bases
Position: chr7:24798087-24800546
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000029662	RVT_1	PF00078.27	4e-47	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000030366	-	2460	-	ENSACLP00000029662	783 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000020106	-	99	34.268	ENSACLG00000019378	-	52	34.268
ENSACLG00000020106	-	51	86.352	ENSACLG00000010837	-	99	86.352
ENSACLG00000020106	-	97	37.032	ENSACLG00000011463	-	91	37.032
ENSACLG00000020106	-	100	87.867	ENSACLG00000007324	-	82	87.867
ENSACLG00000020106	-	100	97.446	ENSACLG00000008786	-	98	97.446
ENSACLG00000020106	-	93	37.284	ENSACLG00000015440	-	67	37.863
ENSACLG00000020106	-	99	36.763	ENSACLG00000012223	-	76	36.763
ENSACLG00000020106	-	52	86.978	ENSACLG00000024620	-	100	86.978
ENSACLG00000020106	-	97	34.917	ENSACLG00000014673	-	60	35.173
ENSACLG00000020106	-	97	34.070	ENSACLG00000002829	-	57	34.070
ENSACLG00000020106	-	97	34.447	ENSACLG00000010561	-	70	34.447
ENSACLG00000020106	-	78	34.510	ENSACLG00000026023	-	57	34.510
ENSACLG00000020106	-	100	87.739	ENSACLG00000018473	-	87	87.739
ENSACLG00000020106	-	66	85.798	ENSACLG00000009410	-	54	85.798
ENSACLG00000020106	-	75	40.504	ENSACLG00000007947	-	54	40.504
ENSACLG00000020106	-	97	36.526	ENSACLG00000012503	-	60	36.763
ENSACLG00000020106	-	96	35.209	ENSACLG00000023216	-	51	35.209
ENSACLG00000020106	-	97	32.946	ENSACLG00000005466	-	59	32.725
ENSACLG00000020106	-	97	36.526	ENSACLG00000023207	-	60	36.763
ENSACLG00000020106	-	71	36.804	ENSACLG00000020021	-	66	36.804
ENSACLG00000020106	-	70	97.645	ENSACLG00000003896	-	100	97.645
ENSACLG00000020106	-	97	35.504	ENSACLG00000027433	-	79	35.504
ENSACLG00000020106	-	55	44.749	ENSACLG00000019432	-	97	44.749
ENSACLG00000020106	-	97	34.070	ENSACLG00000014342	-	54	34.070
ENSACLG00000020106	-	70	42.908	ENSACLG00000003130	-	61	42.908
ENSACLG00000020106	-	96	31.160	ENSACLG00000023850	-	60	31.160
ENSACLG00000020106	-	97	34.961	ENSACLG00000003800	-	60	34.961
ENSACLG00000020106	-	99	35.623	ENSACLG00000019734	-	62	35.623
ENSACLG00000020106	-	87	35.320	ENSACLG00000018177	-	60	35.320
ENSACLG00000020106	-	60	85.867	ENSACLG00000010059	-	51	85.867
ENSACLG00000020106	-	99	31.519	ENSACLG00000012298	-	62	31.400
ENSACLG00000020106	-	97	37.032	ENSACLG00000002299	-	60	37.032
ENSACLG00000020106	-	97	33.420	ENSACLG00000022582	-	53	33.420
ENSACLG00000020106	-	100	98.084	ENSACLG00000009895	-	61	98.084
ENSACLG00000020106	-	97	36.000	ENSACLG00000023597	-	60	36.000
ENSACLG00000020106	-	53	30.000	ENSACLG00000011312	-	61	30.000
ENSACLG00000020106	-	97	31.824	ENSACLG00000027045	-	91	31.824
ENSACLG00000020106	-	100	87.867	ENSACLG00000020885	-	98	87.867
ENSACLG00000020106	-	97	32.383	ENSACLG00000002748	-	64	32.383
ENSACLG00000020106	-	100	88.123	ENSACLG00000025597	-	64	88.123
ENSACLG00000020106	-	55	40.230	ENSACLG00000005315	-	95	40.230

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000020106	-	97	35.687	ENSAPOG00000013536	-	61	35.687	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000020106	-	97	38.601	ENSAPOG00000011184	-	67	38.601	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000020106	-	97	36.957	ENSAOCG00000013559	-	92	36.957	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000020106	-	99	53.157	ENSAOCG00000017326	-	60	53.157	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000020106	-	99	52.845	ENSAOCG00000017045	-	69	52.845	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000020106	-	99	53.030	ENSAOCG00000021572	-	64	53.030	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000020106	-	95	36.506	ENSAOCG00000022482	-	94	36.506	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000020106	-	99	51.389	ENSAOCG00000011998	-	72	51.389	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000020106	-	99	35.331	ENSAOCG00000019370	-	71	35.331	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000020106	-	99	52.778	ENSAPEG00000010007	-	96	52.778	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020106	-	97	33.592	ENSAPEG00000019256	-	77	33.592	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020106	-	99	52.778	ENSAPEG00000001971	-	64	52.778	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020106	-	97	34.371	ENSAPEG00000003655	-	52	34.371	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020106	-	99	53.030	ENSAPEG00000006674	-	64	53.030	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020106	-	96	36.481	ENSAPEG00000002768	-	54	36.481	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020106	-	74	55.651	ENSAPEG00000002696	-	68	55.651	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020106	-	99	52.963	ENSAPEG00000007540	-	67	52.963	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020106	-	97	36.636	ENSAPEG00000003616	-	60	36.636	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020106	-	97	36.636	ENSAPEG00000013213	-	60	36.636	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020106	-	99	52.778	ENSAPEG00000017003	-	64	52.778	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020106	-	80	54.758	ENSAPEG00000017325	-	70	54.758	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020106	-	74	55.822	ENSAPEG00000003065	-	68	55.822	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020106	-	98	53.069	ENSAPEG00000015961	-	97	53.069	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020106	-	96	37.304	ENSAMXG00000036146	-	60	37.304	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020106	-	87	38.640	ENSAMXG00000041150	-	65	38.640	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020106	-	99	35.279	ENSAMXG00000037256	-	62	35.279	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020106	-	72	36.724	ENSDARG00000103562	CU462878.2	66	36.735	Danio_rerio
ENSACLG00000020106	-	96	38.401	ENSDARG00000088493	si:ch211-149k12.3	60	38.401	Danio_rerio
ENSACLG00000020106	-	94	38.153	ENSDARG00000086420	CABZ01046949.1	94	38.153	Danio_rerio
ENSACLG00000020106	-	54	31.442	ENSHBUG00000020853	-	55	31.442	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000020106	-	97	34.590	ENSKMAG00000015838	-	87	34.590	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000020106	-	81	32.925	ENSKMAG00000006263	-	64	32.925	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000020106	-	99	71.575	ENSKMAG00000000885	-	70	71.575	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000020106	-	98	37.387	ENSKMAG00000015028	-	96	37.387	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000020106	-	99	32.661	ENSKMAG00000000167	-	71	32.661	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000020106	-	97	34.681	ENSKMAG00000015935	-	66	34.681	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000020106	-	96	32.380	ENSKMAG00000008495	-	60	32.380	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000020106	-	96	32.380	ENSKMAG00000006247	-	60	32.380	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000020106	-	88	37.696	ENSKMAG00000014872	-	83	37.696	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000020106	-	81	32.925	ENSKMAG00000003480	-	63	32.925	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000020106	-	99	36.260	ENSKMAG00000015152	-	61	36.260	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000020106	-	96	38.076	ENSKMAG00000022168	-	60	38.076	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000020106	-	59	32.292	ENSLACG00000022376	-	99	32.292	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000020106	-	53	44.630	ENSMZEG00005011529	-	79	44.630	Maylandia_zebra
ENSACLG00000020106	-	97	34.200	ENSMZEG00005024554	-	53	34.200	Maylandia_zebra
ENSACLG00000020106	-	53	44.630	ENSMZEG00005017030	-	79	44.630	Maylandia_zebra
ENSACLG00000020106	-	97	34.070	ENSMZEG00005026873	-	52	34.070	Maylandia_zebra
ENSACLG00000020106	-	52	86.667	ENSMZEG00005006211	-	100	86.667	Maylandia_zebra
ENSACLG00000020106	-	97	34.026	ENSMZEG00005020294	-	66	34.026	Maylandia_zebra
ENSACLG00000020106	-	88	33.238	ENSMZEG00005012878	-	88	33.238	Maylandia_zebra
ENSACLG00000020106	-	100	87.612	ENSMZEG00005015509	-	99	87.612	Maylandia_zebra
ENSACLG00000020106	-	50	31.188	ENSONIG00000021275	-	53	31.188	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000020106	-	72	68.319	ENSORLG00000027405	-	65	66.554	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020106	-	99	59.795	ENSORLG00000029491	-	82	59.795	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020106	-	93	36.658	ENSORLG00000027244	-	71	36.792	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020106	-	57	39.278	ENSORLG00000024464	-	76	39.278	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020106	-	98	60.654	ENSORLG00000023575	-	97	60.654	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020106	-	99	60.051	ENSORLG00000030529	-	82	60.051	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020106	-	78	61.275	ENSORLG00000029928	-	93	61.275	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020106	-	99	60.051	ENSORLG00000021840	-	72	60.051	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020106	-	74	37.268	ENSORLG00000030415	-	73	37.268	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020106	-	96	60.904	ENSORLG00000025901	-	93	60.904	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020106	-	99	60.948	ENSORLG00000027515	-	72	60.948	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020106	-	99	59.539	ENSORLG00000029714	-	91	59.539	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020106	-	99	60.051	ENSORLG00000027031	-	72	60.051	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020106	-	99	59.667	ENSORLG00000027755	-	73	59.667	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020106	-	96	59.574	ENSORLG00000025476	-	91	59.574	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020106	-	93	35.904	ENSORLG00000024714	-	82	35.904	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020106	-	98	60.784	ENSORLG00000025260	-	97	60.784	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020106	-	99	60.691	ENSORLG00000024415	-	72	60.691	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020106	-	99	60.691	ENSORLG00000029308	-	86	60.691	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020106	-	99	34.712	ENSORLG00000026511	-	78	34.712	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020106	-	55	63.232	ENSORLG00000030126	-	98	63.232	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020106	-	99	60.691	ENSORLG00000025323	-	91	60.691	Oryzias_latipes
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ENSACLG00000020106	-	99	59.795	ENSORLG00000026318	-	91	59.795	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020106	-	99	59.923	ENSORLG00000026019	-	82	59.923	Oryzias_latipes
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ENSACLG00000020106	-	61	71.399	ENSORLG00000028706	-	97	71.399	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020106	-	99	59.539	ENSORLG00000025613	-	72	59.539	Oryzias_latipes
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ENSACLG00000020106	-	81	60.664	ENSORLG00000029071	-	94	60.664	Oryzias_latipes
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