EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000020127 (Gene tree)
Gene ID: 113032496
Gene Symbol: prpf3
Alias: HPRP3|wu:fa11f05
Full Name: PRP3 pre-mRNA processing factor 3 homolog (yeast)
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10608 bases
Position: chr11:20958036-20968643
Accession: ZDB-GENE-040823-3
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000029759	PRP3	PF08572.10	2.2e-76	1	1
ENSACLP00000029828	PRP3	PF08572.10	5.9e-75	1	1
ENSACLP00000029828	PWI	PF01480.17	1.7e-11	1	1
ENSACLP00000029759	PWI	PF01480.17	1.9e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000030463	-	2843	-	ENSACLP00000029759	731 (aa)	-	-
ENSACLT00000030532	-	2046	-	ENSACLP00000029828	681 (aa)	-	-

Gene Model

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.006	ENSG00000117360	PRPF3	100	72.294	Homo_sapiens
ENSACLG00000020127	prpf3	100	87.784	ENSAPOG00000015584	prpf3	100	88.210	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.150	ENSAMEG00000001630	PRPF3	100	72.439	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000020127	prpf3	100	90.171	ENSACIG00000007876	prpf3	100	90.741	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000020127	prpf3	100	87.624	ENSAOCG00000011449	prpf3	100	88.051	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000020127	prpf3	100	89.398	ENSATEG00000023583	prpf3	100	89.398	Anabas_testudineus
ENSACLG00000020127	prpf3	99	73.121	ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	73.121	Anas_platyrhynchos
ENSACLG00000020127	prpf3	99	71.388	ENSACAG00000003176	PRPF3	100	72.950	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.006	ENSANAG00000026138	PRPF3	100	72.294	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000020127	prpf3	100	81.259	ENSAMXG00000007306	prpf3	100	80.699	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.006	ENSBTAG00000013946	PRPF3	100	72.294	Bos_taurus
ENSACLG00000020127	prpf3	81	39.502	WBGene00010844	prp-3	95	36.405	Caenorhabditis_elegans
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.006	ENSCJAG00000009926	PRPF3	100	72.294	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.006	ENSCAFG00000011820	PRPF3	100	72.294	Canis_familiaris
ENSACLG00000020127	prpf3	80	71.813	ENSCAFG00020019653	PRPF3	100	72.352	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.006	ENSCHIG00000015434	PRPF3	100	72.294	Capra_hircus
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.294	ENSTSYG00000001383	PRPF3	100	72.583	Carlito_syrichta
ENSACLG00000020127	prpf3	93	63.422	ENSCAPG00000017812	PRPF3	95	63.736	Cavia_aperea
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.150	ENSCPOG00000008068	PRPF3	100	72.439	Cavia_porcellus
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.006	ENSCCAG00000026380	PRPF3	100	72.294	Cebus_capucinus
ENSACLG00000020127	prpf3	99	59.456	ENSCATG00000041778	PRPF3	100	59.742	Cercocebus_atys
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.150	ENSCLAG00000015009	PRPF3	100	72.439	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000020127	prpf3	76	81.022	ENSCHOG00000011645	PRPF3	76	80.657	Choloepus_hoffmanni
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.543	ENSCPBG00000008216	PRPF3	100	72.832	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000020127	prpf3	60	60.048	ENSCING00000003312	-	99	60.048	Ciona_intestinalis
ENSACLG00000020127	prpf3	80	54.693	ENSCSAVG00000008720	-	94	54.874	Ciona_savignyi
ENSACLG00000020127	prpf3	99	71.429	ENSCANG00000036769	PRPF3	100	71.717	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.006	ENSCGRG00001019100	Prpf3	100	72.294	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.006	ENSCGRG00000007322	Prpf3	100	72.294	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACLG00000020127	prpf3	100	85.552	ENSCSEG00000002532	prpf3	100	85.836	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000020127	prpf3	100	87.338	ENSCVAG00000009318	prpf3	100	87.338	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000020127	prpf3	100	81.402	ENSDARG00000086425	prpf3	100	81.402	Danio_rerio
ENSACLG00000020127	prpf3	99	68.786	ENSDNOG00000005904	PRPF3	100	68.642	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000020127	prpf3	93	72.205	ENSDORG00000008664	Prpf3	100	72.516	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000020127	prpf3	80	51.916	FBgn0036915	Prp3	99	52.065	Drosophila_melanogaster
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.006	ENSETEG00000019124	PRPF3	100	72.439	Echinops_telfairi
ENSACLG00000020127	prpf3	100	60.940	ENSEBUG00000011680	prpf3	100	60.805	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000020127	prpf3	99	71.861	ENSEASG00005001566	PRPF3	100	72.150	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.006	ENSECAG00000019840	PRPF3	100	72.294	Equus_caballus
ENSACLG00000020127	prpf3	84	71.946	ENSEEUG00000007338	PRPF3	85	71.719	Erinaceus_europaeus
ENSACLG00000020127	prpf3	100	76.657	ENSELUG00000013624	prpf3	100	77.168	Esox_lucius
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.006	ENSFCAG00000013940	PRPF3	100	72.294	Felis_catus
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.150	ENSFDAG00000010365	PRPF3	100	72.439	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000020127	prpf3	100	87.500	ENSFHEG00000021746	prpf3	100	87.500	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000020127	prpf3	100	82.077	ENSGMOG00000008535	prpf3	100	82.077	Gadus_morhua
ENSACLG00000020127	prpf3	99	73.266	ENSGALG00000028205	PRPF3	100	73.266	Gallus_gallus
ENSACLG00000020127	prpf3	100	85.632	ENSGAFG00000012671	prpf3	100	85.632	Gambusia_affinis
ENSACLG00000020127	prpf3	100	84.158	ENSGACG00000011792	prpf3	100	84.158	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.543	ENSGAGG00000013765	PRPF3	100	74.955	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000020127	prpf3	85	76.471	ENSGGOG00000013174	PRPF3	100	76.176	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000020127	prpf3	100	99.453	ENSHBUG00000003493	prpf3	100	99.453	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.150	ENSHGLG00000016569	PRPF3	100	72.439	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000020127	prpf3	99	53.869	ENSHGLG00000016033	-	100	53.723	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.150	ENSHGLG00100007590	PRPF3	100	72.439	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000020127	prpf3	99	53.723	ENSHGLG00100008951	-	100	53.577	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000020127	prpf3	100	80.687	ENSHCOG00000014058	prpf3	100	80.830	Hippocampus_comes
ENSACLG00000020127	prpf3	100	81.429	ENSIPUG00000000902	PRPF3	100	80.857	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.006	ENSSTOG00000001889	PRPF3	100	72.294	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACLG00000020127	prpf3	100	86.383	ENSKMAG00000001390	prpf3	100	87.249	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000020127	prpf3	100	87.412	ENSLBEG00000026310	prpf3	100	87.977	Labrus_bergylta
ENSACLG00000020127	prpf3	93	68.210	ENSLACG00000010541	PRPF3	100	68.056	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.006	ENSLAFG00000004713	PRPF3	100	72.294	Loxodonta_africana
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.006	ENSMFAG00000039791	PRPF3	100	72.294	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000020127	prpf3	91	71.677	ENSMMUG00000016301	PRPF3	97	73.183	Macaca_mulatta
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.006	ENSMNEG00000038161	PRPF3	100	72.294	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000020127	prpf3	85	76.471	ENSMLEG00000040609	PRPF3	100	76.176	Mandrillus_leucophaeus
ENSACLG00000020127	prpf3	98	49.706	ENSMLEG00000041065	-	97	49.559	Mandrillus_leucophaeus
ENSACLG00000020127	prpf3	100	86.771	ENSMAMG00000014968	prpf3	100	86.771	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000020127	prpf3	100	95.056	ENSMZEG00005015970	prpf3	100	95.056	Maylandia_zebra
ENSACLG00000020127	prpf3	99	73.266	ENSMGAG00000000707	PRPF3	100	73.266	Meleagris_gallopavo
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.006	ENSMAUG00000017112	Prpf3	100	72.294	Mesocricetus_auratus
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.006	ENSMICG00000015386	PRPF3	100	74.460	Microcebus_murinus
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.006	ENSMOCG00000000242	Prpf3	100	72.294	Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000020127	prpf3	100	83.143	ENSMMOG00000016131	prpf3	100	83.857	Mola_mola
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.504	ENSMODG00000018774	PRPF3	100	72.793	Monodelphis_domestica
ENSACLG00000020127	prpf3	100	86.127	ENSMALG00000007257	prpf3	100	86.957	Monopterus_albus
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.150	MGP_CAROLIEiJ_G0025354	Prpf3	100	72.439	Mus_caroli
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.150	ENSMUSG00000015748	Prpf3	100	72.439	Mus_musculus
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.294	MGP_PahariEiJ_G0026798	Prpf3	100	72.583	Mus_pahari
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.150	MGP_SPRETEiJ_G0026298	Prpf3	100	72.439	Mus_spretus
ENSACLG00000020127	prpf3	99	70.622	ENSMPUG00000005080	PRPF3	100	71.056	Mustela_putorius_furo
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.046	ENSMLUG00000004646	-	100	72.334	Myotis_lucifugus
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.006	ENSNGAG00000000910	Prpf3	100	72.294	Nannospalax_galili
ENSACLG00000020127	prpf3	100	95.359	ENSNBRG00000003462	prpf3	100	95.359	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000020127	prpf3	90	72.698	ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	73.183	Nomascus_leucogenys
ENSACLG00000020127	prpf3	82	63.675	ENSMEUG00000008733	PRPF3	89	64.957	Notamacropus_eugenii
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.150	ENSOPRG00000010139	PRPF3	100	72.439	Ochotona_princeps
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.294	ENSODEG00000011363	-	100	72.583	Octodon_degus
ENSACLG00000020127	prpf3	99	54.232	ENSODEG00000014412	-	100	54.376	Octodon_degus
ENSACLG00000020127	prpf3	100	94.350	ENSONIG00000006394	prpf3	100	94.350	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000020127	prpf3	99	55.669	ENSOANG00000015441	PRPF3	100	55.669	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.006	ENSOCUG00000011760	PRPF3	100	72.294	Oryctolagus_cuniculus
ENSACLG00000020127	prpf3	100	85.694	ENSORLG00000010330	prpf3	100	85.265	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020127	prpf3	100	85.694	ENSORLG00020009054	prpf3	100	85.265	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000020127	prpf3	100	85.694	ENSORLG00015015016	prpf3	100	85.265	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000020127	prpf3	100	86.409	ENSOMEG00000000940	prpf3	100	86.409	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000020127	prpf3	99	68.208	ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	68.497	Otolemur_garnettii
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.006	ENSOARG00000020798	PRPF3	100	72.294	Ovis_aries
ENSACLG00000020127	prpf3	98	55.441	ENSPPAG00000043769	-	99	54.853	Pan_paniscus
ENSACLG00000020127	prpf3	99	71.861	ENSPPAG00000030983	PRPF3	100	72.150	Pan_paniscus
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.006	ENSPPRG00000000731	PRPF3	100	72.294	Panthera_pardus
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.006	ENSPTIG00000005516	PRPF3	100	72.294	Panthera_tigris_altaica
ENSACLG00000020127	prpf3	98	54.559	ENSPTRG00000047819	-	99	53.971	Pan_troglodytes
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.006	ENSPTRG00000001254	PRPF3	100	72.294	Pan_troglodytes
ENSACLG00000020127	prpf3	99	71.861	ENSPANG00000000499	PRPF3	100	72.150	Papio_anubis
ENSACLG00000020127	prpf3	100	81.108	ENSPKIG00000010501	prpf3	100	80.682	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.793	ENSPSIG00000014877	PRPF3	100	72.793	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000020127	prpf3	100	77.126	ENSPMGG00000007776	prpf3	100	76.833	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.006	ENSPEMG00000011672	Prpf3	100	72.294	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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