EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000020183 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2603 bases
Position: chr16:24330792-24333394
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000029785	RVT_1	PF00078.27	1.7e-45	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000030490	-	2603	-	ENSACLP00000029785	671 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000020183	-	73	31.440	ENSACLG00000023590	-	97	31.034
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Orthologs

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ENSACLG00000020183	-	71	47.599	ENSPREG00000000138	-	95	47.817	Poecilia_reticulata
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ENSACLG00000020183	-	91	46.470	ENSXMAG00000027958	-	93	46.470	Xiphophorus_maculatus