EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000020245 (Gene tree)
Gene ID: 113008151
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1959 bases
Position: chr16:24617947-24619905
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000029900	MMR_HSR1	PF01926.23	8.8e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000030606	-	564	-	ENSACLP00000029900	187 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000020245	-	94	38.068	ENSACLG00000008835	arl3l2	92	38.068
ENSACLG00000020245	-	87	33.333	ENSACLG00000024227	arl13b	71	33.140
ENSACLG00000020245	-	90	39.881	ENSACLG00000005705	arf5	91	39.881
ENSACLG00000020245	-	90	32.222	ENSACLG00000005011	-	89	32.222
ENSACLG00000020245	-	86	31.288	ENSACLG00000011996	arl8a	84	31.288
ENSACLG00000020245	-	90	42.012	ENSACLG00000024971	arf3b	91	42.012
ENSACLG00000020245	-	96	42.541	ENSACLG00000000787	arl8	98	42.541
ENSACLG00000020245	-	97	41.209	ENSACLG00000019945	arl5a	98	41.209
ENSACLG00000020245	-	90	31.667	ENSACLG00000014649	sar1b	89	31.667
ENSACLG00000020245	-	95	38.418	ENSACLG00000012519	-	95	38.418
ENSACLG00000020245	-	76	41.958	ENSACLG00000022869	-	88	41.958
ENSACLG00000020245	-	90	42.012	ENSACLG00000017387	-	92	42.012
ENSACLG00000020245	-	89	30.726	ENSACLG00000013053	sar1ab	88	30.726
ENSACLG00000020245	-	86	38.037	ENSACLG00000015415	-	77	38.037
ENSACLG00000020245	-	90	42.012	ENSACLG00000006072	-	91	42.012
ENSACLG00000020245	-	87	41.818	ENSACLG00000008188	arl1	87	41.818
ENSACLG00000020245	-	90	34.286	ENSACLG00000024991	arl4d	83	34.286
ENSACLG00000020245	-	87	34.706	ENSACLG00000011811	-	82	34.706
ENSACLG00000020245	-	97	41.758	ENSACLG00000004123	-	96	41.758
ENSACLG00000020245	-	97	39.011	ENSACLG00000027139	arl3	98	39.011
ENSACLG00000020245	-	95	37.853	ENSACLG00000021338	arl2	93	37.853
ENSACLG00000020245	-	91	36.158	ENSACLG00000014218	arl4cb	88	36.158
ENSACLG00000020245	-	97	81.768	ENSACLG00000024656	ARL6	97	81.768
ENSACLG00000020245	-	88	38.012	ENSACLG00000016659	-	83	38.012
ENSACLG00000020245	-	96	39.106	ENSACLG00000000922	arl5c	98	39.521
ENSACLG00000020245	-	86	30.061	ENSACLG00000013597	arl8ba	85	30.061
ENSACLG00000020245	-	86	30.061	ENSACLG00000021872	arl8bb	85	30.061
ENSACLG00000020245	-	90	42.012	ENSACLG00000022124	arf2b	91	42.012
ENSACLG00000020245	-	90	41.667	ENSACLG00000025604	-	91	41.667
ENSACLG00000020245	-	84	31.481	ENSACLG00000026984	arl14	78	31.481
ENSACLG00000020245	-	87	43.558	ENSACLG00000009822	-	84	43.558
ENSACLG00000020245	-	88	32.370	ENSACLG00000002442	arfrp1	83	32.370
ENSACLG00000020245	-	87	34.320	ENSACLG00000014159	-	85	34.320

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000020245	-	98	82.065	ENSG00000113966	ARL6	100	83.471	Homo_sapiens
ENSACLG00000020245	-	99	82.162	ENSAPOG00000024515	ARL6	97	82.873	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000020245	-	97	92.308	ENSAPOG00000016893	-	99	92.308	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000020245	-	96	85.475	ENSAMEG00000013671	ARL6	98	85.475	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000020245	-	97	81.768	ENSACIG00000022050	ARL6	77	81.768	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000020245	-	97	97.253	ENSACIG00000000945	-	99	97.253	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000020245	-	97	82.873	ENSAOCG00000003575	ARL6	97	82.873	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000020245	-	97	92.818	ENSAOCG00000008262	-	99	92.818	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000020245	-	97	82.873	ENSAPEG00000020063	ARL6	97	82.873	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020245	-	97	92.265	ENSAPEG00000012838	-	94	92.265	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020245	-	97	92.857	ENSATEG00000001425	-	97	92.857	Anabas_testudineus
ENSACLG00000020245	-	97	82.873	ENSAPLG00000004069	ARL6	97	82.873	Anas_platyrhynchos
ENSACLG00000020245	-	97	82.320	ENSACAG00000009179	ARL6	93	82.320	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000020245	-	98	81.522	ENSANAG00000032648	-	99	81.522	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000020245	-	98	77.717	ENSANAG00000031061	-	99	77.717	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000020245	-	100	84.492	ENSAMXG00000035902	ARL6	97	85.635	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020245	-	98	82.065	ENSBTAG00000010091	ARL6	99	82.065	Bos_taurus
ENSACLG00000020245	-	97	43.407	WBGene00000193	arl-6	96	43.407	Caenorhabditis_elegans
ENSACLG00000020245	-	98	80.435	ENSCJAG00000008542	ARL6	100	82.390	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000020245	-	98	83.152	ENSCAFG00000009111	ARL6	99	83.152	Canis_familiaris
ENSACLG00000020245	-	98	83.152	ENSCAFG00020009819	ARL6	99	83.152	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000020245	-	97	82.967	ENSCHIG00000017792	ARL6	98	82.967	Capra_hircus
ENSACLG00000020245	-	98	84.239	ENSTSYG00000001257	ARL6	99	84.239	Carlito_syrichta
ENSACLG00000020245	-	88	84.146	ENSCAPG00000007819	ARL6	88	84.146	Cavia_aperea
ENSACLG00000020245	-	97	83.425	ENSCPOG00000005344	ARL6	97	83.425	Cavia_porcellus
ENSACLG00000020245	-	99	81.183	ENSCATG00000031356	ARL6	99	81.522	Cercocebus_atys
ENSACLG00000020245	-	97	82.873	ENSCLAG00000011788	ARL6	97	82.873	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000020245	-	98	81.522	ENSCSAG00000005966	ARL6	99	81.522	Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000020245	-	97	83.516	ENSCPBG00000005852	ARL6	94	83.516	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000020245	-	98	66.304	ENSCING00000015355	-	99	66.304	Ciona_intestinalis
ENSACLG00000020245	-	90	59.412	ENSCING00000004657	-	91	59.412	Ciona_intestinalis
ENSACLG00000020245	-	98	62.766	ENSCSAVG00000000015	-	99	62.766	Ciona_savignyi
ENSACLG00000020245	-	98	66.304	ENSCANG00000029903	ARL6	99	66.304	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000020245	-	97	84.530	ENSCGRG00001021791	Arl6	99	83.152	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000020245	-	97	84.530	ENSCGRG00000002022	Arl6	99	83.152	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACLG00000020245	-	96	72.067	ENSCSEG00000013136	-	87	72.067	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000020245	-	96	81.564	ENSCSEG00000005784	ARL6	97	80.110	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000020245	-	97	82.873	ENSCVAG00000015183	ARL6	97	82.873	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000020245	-	86	84.000	ENSCVAG00000016249	ARL6	92	84.000	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000020245	-	97	84.530	ENSDARG00000032056	arl6	97	84.530	Danio_rerio
ENSACLG00000020245	-	98	83.152	ENSDNOG00000032833	ARL6	99	83.152	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000020245	-	98	81.522	ENSDORG00000009252	Arl6	99	81.522	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000020245	-	95	53.933	FBgn0034446	Arl6	89	53.933	Drosophila_melanogaster
ENSACLG00000020245	-	97	54.144	ENSEBUG00000011004	arl6	97	54.144	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000020245	-	99	81.622	ENSEASG00005010902	ARL6	99	82.065	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000020245	-	61	87.826	ENSEEUG00000005325	ARL6	62	87.826	Erinaceus_europaeus
ENSACLG00000020245	-	97	83.425	ENSELUG00000002496	-	97	83.425	Esox_lucius
ENSACLG00000020245	-	97	77.368	ENSELUG00000000269	ARL6	97	76.842	Esox_lucius
ENSACLG00000020245	-	98	81.522	ENSFCAG00000023205	ARL6	99	81.522	Felis_catus
ENSACLG00000020245	-	96	83.799	ENSFALG00000001644	ARL6	84	83.799	Ficedula_albicollis
ENSACLG00000020245	-	97	83.978	ENSFDAG00000013592	ARL6	97	83.978	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000020245	-	97	91.209	ENSFHEG00000009562	-	92	91.209	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000020245	-	97	83.425	ENSFHEG00000000850	ARL6	97	83.425	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000020245	-	97	81.768	ENSGMOG00000002486	-	97	81.768	Gadus_morhua
ENSACLG00000020245	-	95	86.517	ENSGMOG00000007007	ARL6	94	86.517	Gadus_morhua
ENSACLG00000020245	-	97	82.967	ENSGALG00000019215	ARL6	98	82.967	Gallus_gallus
ENSACLG00000020245	-	85	82.386	ENSGAFG00000011077	-	99	82.386	Gambusia_affinis
ENSACLG00000020245	-	97	81.215	ENSGAFG00000012355	ARL6	97	81.215	Gambusia_affinis
ENSACLG00000020245	-	97	83.425	ENSGACG00000015382	ARL6	97	83.425	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000020245	-	98	91.848	ENSGACG00000006779	-	98	91.848	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000020245	-	97	83.516	ENSGAGG00000010966	ARL6	98	83.516	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000020245	-	99	82.258	ENSGGOG00000005474	ARL6	99	82.258	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000020245	-	100	100.000	ENSHBUG00000002834	-	100	100.000	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000020245	-	85	84.277	ENSHBUG00000002695	ARL6	93	84.277	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000020245	-	96	85.000	ENSHGLG00000001077	ARL6	97	83.978	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000020245	-	96	85.000	ENSHGLG00100014402	ARL6	97	83.978	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000020245	-	99	88.172	ENSHCOG00000019844	-	95	88.172	Hippocampus_comes
ENSACLG00000020245	-	96	81.006	ENSHCOG00000003724	ARL6	91	81.006	Hippocampus_comes
ENSACLG00000020245	-	96	75.978	ENSIPUG00000024239	ARL6	92	75.978	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000020245	-	98	83.696	ENSSTOG00000028777	ARL6	99	83.696	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACLG00000020245	-	98	82.609	ENSJJAG00000014206	Arl6	99	82.609	Jaculus_jaculus
ENSACLG00000020245	-	97	82.873	ENSKMAG00000000362	ARL6	97	82.873	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000020245	-	97	91.160	ENSKMAG00000000815	-	94	91.160	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000020245	-	97	82.873	ENSLBEG00000010881	ARL6	94	82.873	Labrus_bergylta
ENSACLG00000020245	-	97	91.160	ENSLBEG00000027842	-	88	91.160	Labrus_bergylta
ENSACLG00000020245	-	98	72.826	ENSLACG00000016480	-	99	72.826	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000020245	-	96	84.916	ENSLOCG00000010419	arl6	99	84.916	Lepisosteus_oculatus
ENSACLG00000020245	-	96	85.000	ENSLAFG00000011730	ARL6	93	85.000	Loxodonta_africana
ENSACLG00000020245	-	99	81.183	ENSMFAG00000035901	ARL6	99	81.522	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000020245	-	98	81.522	ENSMMUG00000038349	ARL6	100	82.645	Macaca_mulatta
ENSACLG00000020245	-	99	81.183	ENSMNEG00000032712	ARL6	99	81.522	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000020245	-	99	81.183	ENSMLEG00000044308	ARL6	99	81.522	Mandrillus_leucophaeus
ENSACLG00000020245	-	100	82.500	ENSMAMG00000018088	-	99	82.500	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000020245	-	97	82.873	ENSMAMG00000002718	ARL6	97	82.873	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000020245	-	97	81.768	ENSMZEG00005002556	ARL6	97	81.768	Maylandia_zebra
ENSACLG00000020245	-	100	100.000	ENSMZEG00005010769	-	100	100.000	Maylandia_zebra
ENSACLG00000020245	-	96	84.358	ENSMGAG00000014417	ARL6	96	84.358	Meleagris_gallopavo
ENSACLG00000020245	-	98	82.609	ENSMAUG00000016932	Arl6	99	82.609	Mesocricetus_auratus
ENSACLG00000020245	-	96	85.000	ENSMICG00000048962	ARL6	98	85.000	Microcebus_murinus
ENSACLG00000020245	-	98	83.152	ENSMOCG00000022581	Arl6	99	83.152	Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000020245	-	97	90.055	ENSMMOG00000005765	-	86	90.055	Mola_mola
ENSACLG00000020245	-	96	83.240	ENSMMOG00000017848	ARL6	93	83.240	Mola_mola
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ENSACLG00000020245	-	97	92.308	ENSORLG00015004725	-	94	92.308	Oryzias_latipes_hsok
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ENSACLG00000020245	-	97	90.608	ENSPLAG00000012234	-	92	90.608	Poecilia_latipinna
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ENSACLG00000020245	-	96	92.179	ENSPMEG00000014418	-	91	92.179	Poecilia_mexicana
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ENSACLG00000020245	-	97	90.608	ENSXMAG00000003438	-	92	90.608	Xiphophorus_maculatus
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